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使用Julia进行统计绘图

从技术上讲,VegaLite采取了完全不同的方法:虽然Gadfly完全是用Julia编写的,但VegaLite更像是Vega-Lite图形包的语言接口(注意其名称中的破折号,与Julia包VegaLite...在VegaLite中,所有图表都是使用@vlplot命令创建的。在下面的代码中,使用了Julia的流水线语法(|>),将regions_cum-DataFrame指定为@vlplot的输入。...在VegaLite中,标题属性用于标签以及图表标题,轴属性用于更改柱状标签的方向,配置用于一般属性,如背景颜色(与Gadfly中的主题相对应)。...为此,我们可以使用Julia对subregions_cum-DataFrame进行排序(与在Gadfly示例中所做的一样),但VegaLite提供了使用sort属性在图形引擎中对数据进行排序的可能性。...不幸的是,这并没有给我们想要的结果:图表将在此范围内绘制,但图表本身仍然使用整个范围,直到20万美元,因此部分绘制在图表外部: 在VegaLite中获得大致相似的结果的唯一方法是使用过滤表达式将数据限制在

21010

《Julia 数据科学应用》总结

Julia Julia 入门 ---- 数据类型在 Julia 中特别重要,使用数据类型,可以使我们开发出的程序和函数具有更好的性能,并在表达上更加精确。...在定义一个使用通用类型或抽象类型输入的函数时,你必须事先定义好输入类型(一般在函数的输入参数之前)。...其中最重要的是描述性统计(可以由 StatsBase 扩展包实现)、绘制统计图(Gadfly 扩展包)和假设形成与检验(HypothesisTests 扩展包)。...统计图 在 Julia 中,有好几种扩展包可以绘制统计图,其中最重要的是:Gadfly、Plotly、Bokeh、Winston 和 Vega。...在使用 Gadfly 创建可视化产品之前,最好将所有的变量保存在数据框中。 在所有的 Gadfly 统计图中,你可以在 plot()函数中使用如下参数为统计图做标记。

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    Julia(函数)

    上面演示的传统函数声明语法等效于以下紧凑的“赋值形式”: julia> f(x,y) = x + y f (generic function with 1 method) 在赋值形式中,函数的主体必须是单个表达式...> f(2,3) 5 julia> g(2,3) 6 当然,在像这样的纯线性函数体中g,的使用return是没有意义的,因为x + y永远不会对表达式进行求值,我们可以简单地x * y在函数中创建最后一个表达式并忽略...因此,您也可以使用带括号的参数列表来应用它们,就像您将执行其他任何功能: julia> 1 + 2 + 3 6 julia> +(1,2,3) 6 中缀形式与功能应用程序形式完全等效-实际上,前者被解析为内部产生函数调用...匿名函数 Julia中的函数是一类对象:可以将它们分配给变量,并使用已分配给变量的标准函数调用语法对其进行调用。它们可以用作参数,也可以作为值返回。...关键字参数 一些函数需要大量的参数,或具有大量的行为。记住如何调用此类函数可能很困难。关键字参数可以通过名称而不是位置来标识,从而使这些复杂的界面更易于使用和扩展。 例如,考虑plot绘制线的函数。

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    基于梯度下降算法的线性回归拟合(附pythonmatlabjulia代码)

    补充:导数和微分的区别   导数是函数在某一点处的斜率,是Δy和Δx的比值;而微分是指函数在某一点处的切线在横坐标取得增量Δx以后,纵坐标取得的增量,一般表示为dy。   ...最常见的代价函数是均方误差函数,即 ? 其中, m为训练样本的个数 ? 表示估计值,表达式如下 ? y是原训练样本中的值   我们需要做的就是找到θ的值,使得J(θ)最小。...,为了方便矩阵表示,我们给x增加一维,这一维的值都是1,并将会乘到 ? 上。那么cost function的矩阵形式为: ?   ...julia二元函数的梯度下降程序 这个图的text死活标不上,希望知道的朋友可以告知一下。...再多说一句,虽然我之前出了个Julia的教程,里面也包含4种绘图工具(Plots,GR,Gadfly & PyPlot),但没有画过3维的图形,今天为了画这个图可真是费尽周折,Julia官网上的3D绘图的程序基本没有一个可以直接使用的

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    iOS学习——Quartz2D学习之UIKit绘制

    iOS学习——Quartz2D学习之UIKit绘制 1、总述   在IOS中绘图技术主要包括:UIKit、Quartz 2D、Core Animation和OpenGL ES。...一旦drawRect:方法被调用,就可以使用任何的UIKit、Quartz 2D、OpenGL ES等技术对视图的内容进行绘制了。   ...绘图过程中除了使用了drawRect:方法,还有setNeedsDisplay和setNeedsDisplayInRect:。...通过绘制方法的最后一个属性withAttributes来设置文字属性,它要求传入的是一个字典.它是通过字典的key和Value的形式来设置文字样式.。...在前面我们学会了如何在自定义view中绘制文本信息,其实绘制图片的方法绘制文本的方法非常类似,所以基本步骤如下: 导入素材 在DrawRect加载图片  UIImage *image = [UIImage

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    生信爱好者周刊(第 26 期):CRISPR的专利权

    据统计,目前 Julia 的全球总用户量已超过一百万,有一万多家公司和一千五百多所高校下载和使用了 Julia。...此外,一些世界名校,如北京大学,MIT、Stanford 和 Berkeley 等,已经在教学中使用 Julia 语言。...包括 6 个模块,支持有监督和无监督模型的训练和部署,分别是分类、回归、聚类、异常检测、自然语言处理和关联规则挖掘。每个模块封装特定的机器学习算法和不同模块均可以使用的函数。...工具 1、abess: Fast Best-Subset Selection in Python and R[5] abess 库的目标是解决一般的最佳子集选择,即找到预测器的一个小子集,这样得到的模型预期具有最高的准确性...(以管道友好的方式) 为绘制函数提供统计表达式(预先格式化的文本内统计结果)。

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    有了Julia语言,深度学习框架从此不需要计算图

    Julia 用于此任务的一个关键优势是它可用于实现基本数值计算库,如微分方程求解器或优化库;这巧妙地解决了机器学习社区不断增长的需求,研究人员通过高性能代码(如光线追踪和物理引擎)进行反向传播,但求梯度仍必须在...相比之下,Julia 中的 GPU 编程一直是一流的 CUDA 内核(可以很好地编写并从脚本或 notebook 中运行)。...(事实上,这只是 Julia 一般编译过程的简单扩展,它在将程序发送到 LLVM 之前从程序中提取最大的「静态子图」。)...这使我们可以充分利用 Julia 语言的表现力,包括控制流、递归、多调度、高阶函数、强大的数据结构和抽象、自定义数值类型,以及现有的包,如微分方程求解器和线性代数例程。...通过从这项工作中汲取灵感,我们在 Julia 中实现了相同的变换,为标量 SIMD 单元和模型级批处理提供 SPMD 编程。

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    有了Julia语言,深度学习框架从此不需要计算图

    Julia 用于此任务的一个关键优势是它可用于实现基本数值计算库,如微分方程求解器或优化库;这巧妙地解决了机器学习社区不断增长的需求,研究人员通过高性能代码(如光线追踪和物理引擎)进行反向传播,但求梯度仍必须在...相比之下,Julia 中的 GPU 编程一直是一流的 CUDA 内核(可以很好地编写并从脚本或 notebook 中运行)。...(事实上,这只是 Julia 一般编译过程的简单扩展,它在将程序发送到 LLVM 之前从程序中提取最大的「静态子图」。)...这使我们可以充分利用 Julia 语言的表现力,包括控制流、递归、多调度、高阶函数、强大的数据结构和抽象、自定义数值类型,以及现有的包,如微分方程求解器和线性代数例程。...通过从这项工作中汲取灵感,我们在 Julia 中实现了相同的变换,为标量 SIMD 单元和模型级批处理提供 SPMD 编程。

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    Julia(数字原语)

    整数和浮点值是算术和计算的基本构建块。这种值的内置表示形式称为数字原语,而整数和浮点数的表示形式作为代码中的立即值称为数字文字。...它们彼此相等,但是具有不同的二进制表示形式,如使用bits函数可以看到的: julia> 0.0 == -0.0 true julia> bits(0.0) "0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000..." 此示例突出了一般原理,即相邻的可表示浮点数也具有相邻的二进制整数表示形式。...另外,精度或舍入只能在特定代码块的执行中通过与do块使用相同的函数来更改: julia> setrounding(BigFloat, RoundUp) do BigFloat(1)...julia> 2^2x 64 数字文字系数的优先级与一元运算符(如取反)的优先级相同。

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    国外程序员整理的机器学习资源

    Julia 通用机器学习 PGM—Julia 实现的概率图模型框架。 DA—Julia 实现的正则化判别分析包。 Regression—回归分析算法包(如线性回归和逻辑回归)。...Clustering—数据聚类的基本函数:k-means, dp-means 等。 SVM—Julia 下的支持向量机。...Stats—Julia 编写的统计测试函数包 RDataSets —读取R语言中众多可用的数据集的 Julia 函数包。 DataFrames —处理表格数据的 Julia 库。...的信号处理工具 Images—Julia 的图片库 Lua 通用机器学习 Torch7 cephes —Cephes 数学函数库,包装成 Torch 可用形式。...这个环境包括强大高效的库,如线性代数、数据可视化,可供任何 .NET 语言使用,还为快速开发提供了功能丰富的交互式 shell。

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    Julia中的数据分析入门

    当我们想要绘制每个国家的数据时,我们必须聚合数据。我们将通过执行split — apply — combine来做到这一点。首先,我们使用groupby函数按国家分割数据。...然后我们对每组(即每个国家)的所有日期列应用一个求和函数,因此我们需要排除第一列“国家/地区”。最后,我们将结果合并到一个df中。...我们的df现在(在写入时)有320列。但是,我们希望一列显示日期,另一列显示我们称之为“case”的值。换句话说,我们要把数据帧从宽格式转换成长格式,这里就需要使用堆栈函数。...savefig(joinpath(pwd(), "daily_cases_US.svg")) 总结 在本文中,我们介绍了使用Julia进行数据分析的基础知识。根据我的经验,Julia很像python。...两者都是开源的。我喜欢Julia的原因是它的高性能以及它与其他编程语言(如Python)的互操作性。我喜欢Python的地方在于它庞大的包集合和庞大的在线社区。

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    为什么都2022年了还有人用Java写GUI?

    在本编程教程中,开发人员将学习如何使用Graphics2D类和Shape接口在Java中渲染几何2D图形。...如何在Java中创建形状 在Java中创建2D几何图形的第一步是向paint()函数提供Graphics参数。在paint(Graphics g)函数中,您可以调用特定2D对象的类。...以下部分描述了程序员如何使用Java绘制常见的几何图形。 如何在Java中画一条线 您可以使用drawLine(int x1,int y1,int x2,int y2)方法创建一条简单的直线。...如何在Java中绘制矩形 要在Java应用程序中绘制矩形,需要使用drawRect(int x,int y,int width,int height)方法。...例如: drawArc(45, 75, 150, 150, 0, 360) 如何在Java中绘制椭圆 drawOval(int x,int y,int width,int height)方法允许您绘制绑定在给定宽度和高度的矩形中的椭圆

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    【开源工具】国外程序员整理的机器学习资源大全

    Julia 通用机器学习 PGM—Julia实现的概率图模型框架。 DA—Julia实现的正则化判别分析包。 Regression—回归分析算法包(如线性回归和逻辑回归)。...Stats—Julia编写的统计测试函数包 RDataSets —读取R语言中众多可用的数据集的Julia函数包。 DataFrames —处理表格数据的Julia库。...的信号处理工具 Images—Julia的图片库 Lua 通用机器学习 Torch7 cephes —Cephes数学函数库,包装成Torch可用形式。...这个环境包括强大高效的库,如线性代数、数据可视化,可供任何.NET语言使用,还为快速开发提供了功能丰富的交互式shell。...Python 计算机视觉 SimpleCV—开源的计算机视觉框架,可以访问如OpenCV等高性能计算机视觉库。使用Python编写,可以在Mac、Windows以及Ubuntu上运行。

    1.9K91

    程序员为什么爱用Julia语言?这里有五点理由

    Julia是一种免费的现代高级编程语言,于2012年正式发布。作为编程语言大家族中的年轻一员,Julia提供了许多令人眼前一亮的功能和特性。 作为程序员,为什么选择使用Julia?...但是,这实际上可能偏离了使用Python的主要目的。Python应该是一种简单易用的语言。在编程中混合使用其他语言可能破坏了这种“味道”。...Julia附带LLVM编译器,可将Julia应用程序编译为适用多个平台的本地代码。 确实,Julia编译器不需要知道用户使用的变量类型,但它知道如何在用户调用函数时提前做好规划。...在Julia中,当用户调用函数时,参数是已知的。编译器会仔细观察函数,找出特定参数所需的必要CPU指令。 一旦精确的指令被映射出来,Julia就可以很快执行。...这有助于生成高效的代码,并允许对函数参数类型的方法调度与语言深度集成。 为了使其更具表现力,Julia还在以前的“无类型”代码中引入了显式类型注释。

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    程序员为什么爱用Julia语言?这里有五点理由

    Julia是一种免费的现代高级编程语言,于2012年正式发布。作为编程语言大家族中的年轻一员,Julia提供了许多令人眼前一亮的功能和特性。 作为程序员,为什么选择使用Julia?...但是,这实际上可能偏离了使用Python的主要目的。Python应该是一种简单易用的语言。在编程中混合使用其他语言可能破坏了这种“味道”。...Julia附带LLVM编译器,可将Julia应用程序编译为适用多个平台的本地代码。 确实,Julia编译器不需要知道用户使用的变量类型,但它知道如何在用户调用函数时提前做好规划。...在Julia中,当用户调用函数时,参数是已知的。编译器会仔细观察函数,找出特定参数所需的必要CPU指令。 一旦精确的指令被映射出来,Julia就可以很快执行。...这有助于生成高效的代码,并允许对函数参数类型的方法调度与语言深度集成。 为了使其更具表现力,Julia还在以前的“无类型”代码中引入了显式类型注释。

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    这个Julia工具包真得学了...

    AlgebraOfGraphics-Julia版的ggplot2 上一篇推文给大家介绍了Julia语言中的主要可视化工具Makie,没想到受到很多同学的喜欢,今天这篇推文继续介绍Julia语言中,小编认为比较适合科研绘图的统计可视化工具...定义图层:您可以使用layer函数来创建一个图层,并指定该图层所要显示的数据、绘图元素以及其他属性。...定义坐标轴和标尺:您可以使用xaxis和yaxis函数来定义坐标轴,并使用title函数为坐标轴添加标题。您还可以使用guide函数来定义标尺的显示方式。...组合图层:您可以使用+运算符将多个图层组合在一起,形成一个复杂的图形(这和ggplot2非常像)。 显示图形:最后,使用draw函数将图形显示在屏幕上或保存为图像文件。...此外,AoG还提供了许多其他功能和选项,例如调整图形的大小和比例、添加图例、应用主题等。它还支持各种绘图元素和统计变换,如线条、矩形、柱状图、直方图、箱线图等。

    30110

    Julia-BioStructures

    如果需要第一个子元素,则可以先使用。例如,first(struc [1])获取模型1中的第一条链。由于定义了元素的顺序,因此可以使用sort函数。...Selectors 是作为附加参数传递给这些函数的函数。仅保留传递给所有选择器时返回true的元素。...omegaangle and phiangle函数测量给定序号的残基与序号之前的残基之间的角度。psiangle 函数测量给定序号的残基与序号之后的残基之间的角度。...该对象显示基于指定距离的元素之间的接触。可以给ContactMap两个结构元素作为参数,在这种情况下,将返回一个非对称的2D数组显示接触。...计算NMR结构中两个模型的重(非氢)原子之间的RMSD和位移: julia> downloadpdb("1SSU") julia> struc_nmr = read("1SSU.pdb", PDB

    2.1K10

    你知道几种前端动画的实现方式?

    随着互联网的持续发展,H5 页面作为与用户直接交互的表现层越来越复杂,呈现的形式也越来越丰富,从而也要求 H5 页面具有更多的花样性及动画效果。...1、性能对比 从结果中可见,当需要执行大量绘制任务时,WebGL的性能远远超越了Canvas 2D Api,达到了后者的数10倍。...动画又可以从维度上细分,3D动画一般采用诸如Three.js的渲染引擎或者别的游戏引擎来实现,2D动画也有非常优秀的引擎支持。...(2)Pixi.js 一般来说,WebGL 的渲染速度都会比 Canvas 快,这是由俩者的绘制路径决定的。...然而,Pixi 也有不足的地方,Pixi 对于动画的支持是比较缺乏的,在实际开发中,常常需要引进额外的动画库,如 GSAP。

    3.9K20

    单细胞数据分析新选择(基于Julia编程语言)

    2023年Elisabeth Roesch等人在文章Julia for Biologists中为生物学家使用Julia的方方面做了一个较为详尽的概述,从一个宏观的角度推动生物计算开发者尝试这门拥有多种特性的编程语言...结果 在ASCT中,目前暂时只支持使用最多的Cellranger结果的读取,同时一个函数既可以读取传统的matrix.mtx目录,也可以读取单一的h5格式文件。...(pbmc) 接下来用户可以使用DrawQC这个函数来绘制单细胞数据的质控图(对于ASCT的目标来说,其实用户已经没有绘制质控图的必要了)。...降维聚类 接下来ASCT使用NormalizeData!和SelectHVG!来进行数据的标准化和高变基因的选取,这两个步骤一般也不需要用户进行参数的调整。ASCT的PCA!...数据交换 在Julia中,推荐用户使用JLD2来将计算过程的变量保存到基于HDF5的JLD2文件中,可以实现快速的保存和读取,以方便随时恢复当前的分析进度。

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