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如何在MPI-Python中收集每个内核的输出并保存为.npy文件?

在MPI-Python中,可以使用MPI的通信机制来收集每个内核的输出并保存为.npy文件。以下是一个示例代码:

代码语言:python
复制
from mpi4py import MPI
import numpy as np

comm = MPI.COMM_WORLD
rank = comm.Get_rank()
size = comm.Get_size()

# 模拟每个内核的输出
output = np.array([rank])

# 收集每个内核的输出
outputs = comm.gather(output, root=0)

if rank == 0:
    # 将收集到的输出保存为.npy文件
    np.save('output.npy', np.concatenate(outputs))

在这个示例中,首先导入mpi4py库,并创建一个MPI通信的comm对象。然后获取当前内核的rank和总的内核数size。

接下来,模拟每个内核的输出,这里使用了一个简单的示例,即将每个内核的rank作为输出。

然后,使用comm.gather()函数将每个内核的输出收集到rank为0的内核中。这个函数的第一个参数是要收集的数据,第二个参数是收集的目标,即rank为0的内核。

最后,只有rank为0的内核需要保存收集到的输出。使用np.save()函数将收集到的输出保存为.npy文件,文件名为'output.npy'。

这样,每个内核的输出就被收集并保存为.npy文件了。

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