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R语言贝叶斯MCMC:用rstan建立线性回归模型分析汽车数据和可视化诊断|附代码数据

Stan与最流行的数据分析语言,RPython、shell、MATLAB、Julia和Stata的接口。我们将专注于在R中使用Stan。rstanrstan允许R用户实现贝叶斯模型。...在这里,我们指定目标变量具有正态分布,其平均值为α+X*β,标准差为sigma。在这个,你还可以指定参数的先验分布。默认情况下,参数被赋予平坦的(非信息性)先验。...GIBBS 吉布斯采样器估计变点指数分布分析过程车站等待时间R语言马尔可夫MCMC的METROPOLIS HASTINGS,MH算法抽样(采样)法可视化实例python贝叶斯随机过程:马尔可夫链...线性回归、Metropolis Hastings与Gibbs采样算法实例R语言贝叶斯Poisson-正态分布模型分析职业足球比赛进球数R语言用Rcpp加速Metropolis-Hastings抽样估计贝叶斯逻辑回归模型的参数...Python贝叶斯回归分析住房负担能力数据集R语言实现贝叶斯分位数回归、lasso和自适应lasso贝叶斯分位数回归分析Python用PyMC3实现贝叶斯线性回归模型R语言用WinBUGS 软件对学术能力测验建立层次

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R语言非线性回归和广义线性模型:、伽马、逻辑回归、Beta回归分析机动车事故、小鼠感染、蛤蜊数据、补剂钠摄入数据|数据分享

GLM是一种灵活的统计模型,适用于各种数据类型和分布,包括二项分布分布和负二项分布等非正态分布。...部分原因是这里的响应变量在残差不是正态分布的,而是分布,因为它是计数数据。 回归 具有误差的广义线性模型通常具有对数链接,尽管也可以具有恒等链接。...R plotRes_bin) R summary(moglm) R r2(mouse_glm) 注意,离散参数为1,就像分布一样。...Python的Lasso回归之最小角算法LARS r语言中对LASSO回归,Ridge岭回归和弹性网络Elastic Net模型实现 r语言中对LASSO回归,Ridge岭回归和Elastic...Net模型实现 R语言实现LASSO回归——自己编写LASSO回归算法 R使用LASSO回归预测股票收益 python使用LASSO回归预测股票收益

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连载 | 概率论与数理统计(3) – 一维离散型随机变量及其Python实现

上面的介绍没有提到stats模块,这个模块包含了概率论及统计相关的函数。...分布 ---- 日常生活,大量事件的发生是有固定频率的。例如某医院平均每小时出生3个婴儿,某网站平均每分钟有2次访问等。...从下图中可以非常直观的看到两者的关系: 图4-1:同一个分布与参数不同的二项分布的比较 图4-1,上面的图中二项分布的参数$n$比较小,$p$比较大,与参数为$\mu = np$的分布差异很大...mu: 分布的参数,保持mu不变 5 :param n1: 第一个二项分布的实验次数,n比较小 6 :param n2: 第二个二项分布的实验次数,n比较大 7 :return...对于这个现象也很好解释:我们从原分布取到的样本越多,收集到的样本集也就越能代表原来真实的分布

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广义线性模型应用举例之回归及R计算

广义线性模型应用举例之回归及R计算 在前文“广义线性模型”,提到广义线性模型(GLM)可概括为服务于一组来自指数分布族的响应变量的模型框架,正态分布、指数分布、伽马分布、卡方分布、贝塔分布、伯努利分布...某些计数型变量可以通过正态分布进行近似,并可以使用一般线性回归进行合理建模。但更普遍做法是使用广义线性模型,回归或负二项回归,它们都是应用于计数型(非负整数)响应变量的回归模型。...因此,对于后续分析R. cataractae丰度的环境因子关系的回归模型选择,就可以初步考虑广义线性模型回归实现。...在这个示例数据,观察到响应变量R. cataractae丰度分布右偏而大致呈现分布,提示使用回归(广义线性模型)可能比线性回归(一般线性模型)更有效。...为了确认这一点,接下来就使用回归实现R. cataractae丰度和环境因子关系的建模。

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R语言和Python过程扩展:霍克斯过程Hawkes Processes分析比特币交易数据订单到达自激过程时间序列|附代码数据

描述事件计数到达的最基本方法,例如上面的时间序列,是过程 ,有一个参数λ。在过程,每单位时间的预期事件数由一个参数定义。这种方法被广泛使用,因为它非常适合大量数据,例如呼叫中心的电话到达。...另一方面,简单的过程没有考虑事件的历史。下图中绘制了霍克斯过程的示例实现。...一种是通过比较AIC同质模型的值,如上面的 R 总结中所示,我们的霍克斯模型更适合数据。检验模型与数据拟合程度的另一种方法是评估残差。...----本文摘选 《 R语言和Python过程扩展:霍克斯过程Hawkes Processes分析比特币交易数据订单到达自激过程时间序列 》 ,点击“阅读原文”获取全文完整资料。...:广义帕累托分布GPD使用极大似然估计、轮廓似然估计、Delta法R语言中实现马尔可夫链蒙特卡罗MCMC模型matlab贝叶斯隐马尔可夫hmm模型实现R语言如何做马尔科夫转换模型markov switching

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R语言Poisson回归的拟合优度检验

虽然我们希望我们的模型预测接近观察到的结果,但即使我们的模型被正确指定,它们也不会相同 - 毕竟,模型给出了观察所遵循的分布的预测平均值。...因此,为了将偏差用作拟合优度检验,我们需要弄清楚,假设我们的模型是正确的,在假设下,我们在预测均值周围观察到的结果中会有多少变化。...如果我们提出的模型具有参数,这意味着将偏差与参数的卡方分布进行比较。 在R执行拟合优度测试 现在看看如何在R执行拟合优度测试。...首先我们将模拟一些简单的数据,具有均匀分布的协变量x和结果y: set.seed(612312) n < - 1000 x < - runif(n) y < - rpois(n,mean)...对于每一个,我们将拟合(正确的)模型,并收集拟合p值的偏差良好性。

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数据分析方法论-统计学内容学习

最初学习数据分析只是出于兴趣,自学了Python。最近才生出转行数据分析的想法,目前已经辞职,准备全身心地投入到学习。...看了一些相关教程之后,觉得PythonR、SQL这些都只是工具,要转行数据分析,最需要培养的是数据分析思维。遂决定从统计学入手。 第一个礼拜,一边办离职手续、处理工作交接事宜,一边看书。...分布 试验 满足以下条件的试验成为试验: 在任意两个相等长度的区间上,事件发生的概率相等; 事件在某一区间上是否发生与事件在其他区间上是否发生所独立的。...连续型概率分布 注意:对于连续性概率分布Python也会采取生成离散点的形式实现 均匀分布 概念:在任意相同长度间隔内分布概率相等的概率分布。...指数分布 指数分布分布类似,分布描述了每一个区间内事件发生的次数,而指数分布描述了事件发生的事件间隔长度。

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Python之二项分布分布

在数据分析,二项分布分布是我们经常用到的两个分布,今天小编将会先简单介绍二项分布基础:伯努利试验、n重伯努利试验以及两点分布,接着咱们讲解二项分布分布的概念,完事之后,咱们讲解一下二项分布转换分布求解的条件...,最后通过python来看一下,为什么二项分布在某种条件下可以转换成分布近似求解。...我们以医院在一天内将会有多少婴儿出生的问题(这个问题就服从分布)为例来看: 我们可以将这一天的时间采用极限的思想,无限细分成n个小的时间段,每一个小的时间段内,是不是只有两种结果出现:婴儿出生和婴儿不出生...所以简单来讲,在n很大,p很小的情况下,二项分布就是分布分布就是二项分布,当然也就可以近似替代了。 接下来,我们通过计算机来实现这种结果的模拟。...01 python实现 当n为10,p=0.5时,根据上边条件,我们得知:二项分布应该不能使用分布近似替代,下图显示,n为10,p=0.5时,二项分布分布也明显不同(具体代码参见下文) ?

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分布 二项分布 正态分布之间的联系,与绘制高斯分布

1.如果 np 存在有限极限 λ,则这列二项分布就趋于参数为 λ 的 分布。...2.实际运用当 n 很大时一般都用正态分布来近似计算二项分布,但是如果同时 np 又比较小(比起 n来说很小),那么用分布近似计算更简单些,毕竟分布跟二项分布一样都是离散型分布。...一、分布 日常生活,大量事件是有固定频率的。...分布就是描述某段时间内,事件具体的发生概率。 ?        上面就是分布的公式。...在python画正态分布直方图 通过numpy构造正太分布数据,之后画图,可以通过size大小来调节数据的正太分布效果 import numpy as np import matplotlib.mlab

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R语言从入门到精通:Day13

图5展示了一部分数据的分布特征。从图中可以清楚地看到因变量的偏倚特性以及可能的离群点。同时,药物治疗下癫痫发病数似乎变小了,且方差也变小了(分布,较小的方差伴随着较小的均值)。...同样,还需要评价模型的过度离势。分布的方差和均值相等。当响应变量观测的方差比依据分布预测的方差大时,回归可能发生过度离势。...同样的poisson回归也有很多扩展的形式,时间段变化的poisson回归(需要使用glm()函数的offset选项)、零膨胀的回归(pscl包的函数zeroinfl()可做零膨胀回归)、...稳健回归(robust包的函数glmRob()可以拟合稳健广义线性模型,包含稳健回归,当存在离群点和强影响点时,该方法会很有效。)。...小结&预告 到目前为止,R基本统计分析就告一段落了,后面会介绍一些高级的数据挖掘分析,主成分分析和聚类分析等等,在这些统计分析,将看看处理潜变量的统计模型,即那些你坚信存在并能解释可观测变量的、无法被观测到的

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R语言小数定律的保险业应用:分布模拟索赔次数

更准确地说,如果自付额   变得非常大(和 ),我们将获得极值理论的阈值点以上模型:如果   有一个分布,并在有条件的 ,   是独立同分布的广义帕累托随机变量,然后  具有广义的极值分布...通常用下表来总结此属性, 上表的对角线非常有趣。似乎在某种程度上趋向极限值(此处为63.2%)。在n年内观察到的事件数量具有二项式分布,其概率为 ,将收敛到参数为1的分布。...解决这个问题的另一种方法是基于以下思想:鉴于在对全球450座反应堆进行的45年观察(,观察到了三起重大事故,包括“三哩岛”(1979年)和“福岛”(2011年),即两次事故之间的平均时间估计为16年。...也, 即 > [1] 0.4262466 ---- 参考文献 1.R语言Poisson回归模型分析案例 2.R语言进行数值模拟:模拟回归模型 3.r语言回归分析 4.R语言对布丰投针(蒲丰投针...)实验进行模拟和动态可视化 5.用R语言模拟混合制排队随机服务排队系统 6.GARCH(1,1),MA以及历史模拟法的VaR比较 7.R语言做复杂金融产品的几何布朗运动的模拟 8.R语言进行数值模拟:模拟回归模型

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R语言进阶之广义线性回归

今天我会以逻辑回归和回归为例,讲解如何在R语言中建立广义线性模型。...在这里我主要和大家讲解一下逻辑(logistic)回归和(poisson)回归这两个模型。...fit <-glm(type~Sepal.Length+Sepal.Width+Petal.Length+Petal.Width,data=mydata,family=binomial())# 指定分布为二项分布...从输出结果来看,花瓣长度是可以较好区分这两类鸢尾花的,但是这个模型是原始和粗糙的,我们应该通过回归诊断的方式来修正此模型,使之更加精确,关于回归诊断请参见R语言入门之线性回归,这里就不赘述。...第二部分 回归 回归主要用于因变量(y)是计数资料而自变量(x)是连续型变量的时候,当然自变量(x)也可以是分类变量。

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R语言逻辑回归和回归模型对发生交通事故概率建模

利用过程模型,我们可以获得 这意味着在一年的前六个月中没有索赔的概率是一年没有索赔的平方根。...coefficients(regreff))(Intercept) 0.06776376 可与逻辑回归比较, > 1-exp(param)/(1+exp(param))[1] 0.06747777 但是与模型有很大的不同...如果将回归(仍为红色)和对数二项式模型与泰勒展开进行比较,我们得到 ---- 参考文献 1.R语言多元Logistic逻辑回归 应用案例 2.面板平滑转移回归(PSTR)分析案例实现 3.matlab...的偏最小二乘回归(PLSR)和主成分回归(PCR) 4.R语言Poisson回归模型分析案例 5.R语言回归中的Hosmer-Lemeshow拟合优度检验 6.r语言中对LASSO回归,Ridge...岭回归和Elastic Net模型实现 7.在R语言中实现Logistic逻辑回归 8.python用线性回归预测股票价格 9.R语言如何在生存分析与Cox回归中计算IDI,NRI指标

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​常见的8个概率分布公式和可视化

a 和 b 之间连续均匀分布的概率密度函数 (PDF) 如下: 让我们看看如何在 Python 对它们进行编码: import numpy as np import matplotlib.pyplot...分布以法国数学家西蒙·丹尼斯·的名字命名。...这是一个离散的概率分布,这意味着它计算具有有限结果的事件——换句话说,它是一个计数分布。因此,分布用于显示事件在指定时期内可能发生的次数。...我们可以使用分布来计算 9 个客户在 2 分钟内到达的概率。 下面是概率质量函数公式: λ 是一个时间单位的事件率——在我们的例子,它是 3。k 是出现的次数——在我们的例子,它是 9。...指数分布点过程事件之间时间的概率分布

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​常见的8个概率分布公式和可视化

a 和 b 之间连续均匀分布的概率密度函数 (PDF) 如下: 让我们看看如何在 Python 对它们进行编码: import numpy as np import matplotlib.pyplot...分布以法国数学家西蒙·丹尼斯·的名字命名。...这是一个离散的概率分布,这意味着它计算具有有限结果的事件——换句话说,它是一个计数分布。因此,分布用于显示事件在指定时期内可能发生的次数。...我们可以使用分布来计算 9 个客户在 2 分钟内到达的概率。 下面是概率质量函数公式: λ 是一个时间单位的事件率——在我们的例子,它是 3。k 是出现的次数——在我们的例子,它是 9。...指数分布点过程事件之间时间的概率分布

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Python用 PyMC3 贝叶斯推理案例研究:抛硬币和保险索赔发生结果可视化

分布由下式给出: 其中 lambda λ 是事件的“速率”,由事件总数 (k) 除以数据的单位数 (n) 给出 (λ = k/n)。...在分布分布的期望值 E(Y)、均值 E(X) 和方差 Var(Y) 相同; 例如,E(Y) = E(X) = Var(X) = λ。 请注意,如果方差大于均值,则称数据过于分散。...这在具有大量零的保险索赔数据很常见,并且最好由负二项式和零膨胀模型( ZIP 和 ZINB)处理。...,或任何类似于观察到的λ数据形状的分布,但是伽马最适合: 可以取任何正数到无穷大(0,∞),而β或均匀是[0-100]。...结论: 在这篇文章,PyMC3 被应用于对两个示例进行贝叶斯推理:使用 β-二项分布的抛硬币偏差,以及使用 gamma-分布的保险索赔发生。

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Python实现 8 个概率分布公式及可视化

a 和 b 之间连续均匀分布的概率密度函数 (PDF) 如下: 让我们看看如何在 Python 对它们进行编码: import numpy as np import matplotlib.pyplot...分布以法国数学家西蒙·丹尼斯·的名字命名。...这是一个离散的概率分布,这意味着它计算具有有限结果的事件——换句话说,它是一个计数分布。因此,分布用于显示事件在指定时期内可能发生的次数。...我们可以使用分布来计算 9 个客户在 2 分钟内到达的概率。 下面是概率质量函数公式: λ 是一个时间单位的事件率——在我们的例子,它是 3。k 是出现的次数——在我们的例子,它是 9。...指数分布点过程事件之间时间的概率分布

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R语言使用Metropolis-Hastings采样算法自适应贝叶斯估计与可视化

当σ接近目标分布的标准偏差时,将发生有效混合(链收敛到目标分布)。当我们不知道这个值时。我们可以允许σ根据到目前为止的链历史记录进行调整。在上面的示例,将σ更新为链某些先验点的标准偏差值。...贝叶斯隐马尔可夫hmm模型实现 贝叶斯线性回归和多元线性回归构建工资预测模型 Metropolis Hastings采样和贝叶斯回归Poisson模型 贝叶斯分位数回归、lasso和自适应lasso...、前列腺癌数据 R语言JAGS贝叶斯回归模型分析博士生延期毕业完成论文时间 R语言Metropolis Hastings采样和贝叶斯回归Poisson模型 Python决策树、随机森林、朴素贝叶斯...Hastings与Gibbs采样算法实例 R语言贝叶斯Poisson-正态分布模型分析职业足球比赛进球数 随机森林优化贝叶斯预测分析汽车燃油经济性 R语言逻辑回归、Naive Bayes贝叶斯...:贝叶斯估计与模型比较 R语言实现MCMC的Metropolis–Hastings算法与吉布斯采样 R语言贝叶斯推断与MCMC:实现Metropolis-Hastings 采样算法示例 R语言使用

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