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Rust一些科学计算相关经验(稀疏矩阵计算相关生态仍有很大欠缺)

与显式动力学不同是,隐式动力学通常要求解线性方程组[K']{u} = {F'},其中稀疏矩阵矩阵[K]通常不为主对角矩阵稀疏矩阵矩阵通常是密集矩阵,导致计算量大增。...刚度矩阵[K]为五对角矩阵。五对角线上元素均不为0。主对角线上除了首尾元素均相等,偏移量为1与-1对角线上除了尾元素均相等,偏移量为2与-2对角线上元素均相等。...计算逆矩阵时先转化为nalgebraDMatrix并求逆,结果再转化回ndarray矩阵格式。逆矩阵整个过程中只计算一次。所以只需要来回转化一轮,来回各一次。...所以大概是触发了什么奇怪优化吧? 大概是五对角矩阵矩阵仍有一定稀疏性,或是Python稀疏矩阵迭代法速度过快,python使用逆矩阵法也有很高速度优势。...Python建模大概花了0.5~1秒,而Rust建模时间几乎可以忽略不计。纯Rust性能还是非常可靠。Rust离动力学基础科学计算距离其实就差了一个稀疏矩阵求解Ax=B。但这个确实又很难。

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C++ 特殊矩阵压缩算法

如下图所示: 对称矩阵以主对角线为分界线,把整个矩阵分成 2 个三角区域,主对角线之上称为上三角,主对角线之下区域称为下三角。...注意,主对角线上元素是需要单独存储,主对角线上数据个数为 n。 所以真正所需要存储空间应该:(理论上所需要存储单位-主对角线上数据所需单元) / 2 +主对角线上数据所需单元。...并且n阶矩阵和一维数组之间满足如下位置对应关系: i>=j表示矩阵 下三角区域(包含主对角线上数据)。 i<j表示矩阵上三角区域。...先来一个图示,直观上了解一下A稀疏矩阵压缩前后差异性。...: 压缩之后,则要思考,如何在三元组表基础上实现矩阵转置。

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Python实现所有算法-雅可比方法(Jacobian)

Python实现所有算法-二分法 Python实现所有算法-力系统是否静态平衡 Python实现所有算法-力系统是否静态平衡(补篇) Python实现所有算法-高斯消除法 Python实现所有算法...在数学中,如果对于矩阵每一行,一行中对角线条目的大小大于或等于所有其他(非对角线)大小之和,则称方阵为对角占优该行中条目。...更准确地说,矩阵A是对角占优,如果: 定义给出来了 多说无疑,你可以参考这个学习对角占优矩阵 所以这里A是指非奇异大规模稀疏矩阵。 什么是稀疏矩阵???毕竟一开始就写了。...注意:求解此类系数矩阵若使用Gauss消元法常常会破坏矩阵稀疏性,另分解过程中出现大量非零元素。 再插一个: 什么是非奇异阵呢?非奇异矩阵是行列式不为 0 矩阵,也就是可逆矩阵。...还缺了一个,迭代次数至少为1次 我们这里要把系数和常数矩阵连在一起,后面的参数在前面的文章里有解释 靓仔记得我上面写对角占优事情吗?

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数组和广义表 原

矩阵中,如果有规律可寻,只要存储其中一部分,而另外一部分存储地址可以通过相应算法将它计算出来,从而占有较少存储空间达到存储整个矩阵目的。...对角矩阵是指矩阵所有非零元素都集中在以主对角线为中心带状区域中,即除了主对角线上和直接在主对角线上、下方若干条对角线上元素之外,其余元素皆为零。...3.稀疏矩阵稀疏矩阵很难下一个确切定义,它只是一个凭人们直觉来理解概念。 一般认为,一个较大矩阵中,零元素个数相对于整个矩阵元素总个数所占比例较大时,该矩阵就是一个稀疏矩阵。...稀疏矩阵压缩存储采用三元组方法实现。其存储规则是每一个非零元素占有一行,每行中包含非零元素所在行号、列号、非零元素数值。 为完整描述稀疏矩阵,一般在第一行描述矩阵行数、列数和非零元素个数。...首先应该将稀疏矩阵转换为三元组存储,然后再利用三元组存储,实现对矩阵各种运算。

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数据结构与算法 -数组

如下图便是一个5阶对称矩阵。 ? 对称矩阵元素在主对角线上是对称关系,故只要存储矩阵中上三角或下三角中元素,让每两个对称元素共享一个存储空间,这样能节约近一半存储空间。...因此,我们可以按图中箭头所指次序将这些元素存放在一个 一维数组s[1...n(n+1)/2]中,为了便于访问对称矩阵a中元素 ,我们必须在 a[i][j] 和 s[k] 之间找一个对应关系,即下标变换公式...三角矩阵 以主对角线划分,三角矩阵有上三角和下三角两种。 上三角矩阵如图所示,它下三角(不包括主对角线) 中元素均为常数。下三角矩阵正好相反,它对角线上方均为常数。...三角矩阵重复元素c可共享一个存储空间,其余元素正好有n(n+1)/2个,因此,三角矩阵可压缩存储到向量s[0..n(n+1)/2]中,其中c存放在向量最后一个分量中。...稀疏矩阵压缩存储只存储稀疏矩阵非零元素。

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Google && 耶鲁 | 提出HyperAttention,使ChatGLM2-32K 推理速度 提升50%!

这一过程输出结果如下: 这里,矩阵 A := exp (QK^T) 被定义为 QK^T 元素指数。D 是一个 n×n 对角矩阵,由 A 各行之和导出, 这里 。...更具体地说,他们目标是找到一个具有有限行数 采样矩阵 以及一个对角矩阵 ,从而满足误差算子规范以下约束: 研究者表明,通过基于 V 行规范定义采样矩阵 S,可以高效解决公式 (1) 中注意力近似问题矩阵乘法部分...首先,使用植根于 Hamming 排序 LSH 算法来识别注意力矩阵主要条目定义 1 所示。第二步是随机选择一小部分 K。...算法 1 返回一个稀疏掩码,旨在隔离注意力矩阵主要条目。给定该掩码后,研究员在算法 2 中计算矩阵 D 近似值,该近似值满足公式 (2) 中频谱保证。...这个掩码可以使用 sortLSH 算法(算法 1)生成,也可以是一个预定义掩码,类似于 [7] 中方法。研究者假定大条目掩码 M^H 在设计上是稀疏,而且其非零条目数是有界

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全新近似注意力机制HyperAttention:对长上下文友好、LLM推理提速50%

这一过程输出结果如下: 这里,矩阵 A := exp (QK^T) 被定义为 QK^T 元素指数。D 是一个 n×n 对角矩阵,由 A 各行之和导出, 这里 。...更具体地说,他们目标是找到一个具有有限行数 采样矩阵 以及一个对角矩阵 ,从而满足误差算子规范以下约束: 研究者表明,通过基于 V 行规范定义采样矩阵 S,可以高效解决公式 (1) 中注意力近似问题矩阵乘法部分...首先,使用植根于 Hamming 排序 LSH 算法来识别注意力矩阵主要条目定义 1 所示。第二步是随机选择一小部分 K。...算法 1 返回一个稀疏掩码,旨在隔离注意力矩阵主要条目。给定该掩码后,研究员在算法 2 中计算矩阵 D 近似值,该近似值满足公式 (2) 中频谱保证。...这个掩码可以使用 sortLSH 算法(算法 1)生成,也可以是一个预定义掩码,类似于 [7] 中方法。研究者假定大条目掩码 M^H 在设计上是稀疏,而且其非零条目数是有界

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盘一盘 Python 特别篇 20 - SciPy 稀疏矩阵

,一般创建成功之后可以转化成其他格式稀疏矩阵 ( CSR, CSC) 进行转置、矩阵乘法等操作,或者转成转成 LIL 做切片。...稀疏矩阵使用 offsets 和 data 两个矩阵来表示,其中offsets 表示 data 中每一行数据在原始稀疏矩阵对角线位置 k: k > 0, 对角线往右上方移动 k 个单位 k < 0,...3 个单位 offset 2 对应数据 [11,12,13,14,15] 在对角线上右上方移动 2 个单位 用 dia_matrix() 语法用来创建矩阵,注意产出矩阵格式是 DIAgonal。...A plt.spy(A); 此外,在 sp.sparse 模块里还有一些直接创建稀疏矩阵函数: eye 生成稀疏单位对角阵 diags 构建稀疏对角阵 spdiags 构建稀疏对角阵 假设我们想生成一个方阵...,主对角线上面是 -2,上下次对角线上值为 1。

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Matlab矩阵基本操作(定义,运算)

二、矩阵简单操作 1.获取矩阵元素 可以通过下标(行列索引)引用矩阵元素, Matrix(m,n)。 也可以采用矩阵元素序号来引用矩阵元素。...3、特殊矩阵 (1) 魔方矩阵魔方矩阵一个有趣性质,其每行、每列及两条对角线上元素和都相等。对于n阶魔方阵,其元素由1,2,3,…,n2共n2个整数组成。...四、矩阵分析 1、对角阵 (1) 对角阵只有对角线上有非0元素矩阵称为对角矩阵对角线上元素相等对角矩阵称为数量矩阵对角线上元素都为1对角矩阵称为单位矩阵。...(1) 提取矩阵对角线元素设A为m*n矩阵,diag(A)函数用于提取矩阵A主对角线元素,产生一个具有min(m,n)个元素列向量。...(2) 构造对角矩阵设V为具有m个元素向量,diag(V)将产生一个m*m对角矩阵,其主对角线元素即为向量V元素。

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深度学习图原理

任何对GNNs重要其他概念将会随着它们出现而进行解释,但与此同时,还有一个关于图最后一个主题我们需要涵盖。我们必须学会如何在计算中表达图。...在任何情况下,A都可以按照以下规则构建: 无向图邻接矩阵因此在其对角线上是对称,从左上角对象到右下角: 有向图邻接矩阵只覆盖对角线线一侧,因为有向图边只朝一个方向。...D本质上是一个对角矩阵,其中对角线每个值都是其对应节点度数。 各种类型图和矩阵(由欧洲生物信息学研究所提供) 不要忘记度数只是邻接矩阵每一行总和。...然后,这些度数被放在矩阵对角线上(邻接矩阵对称线)。...,关联矩阵,但绝大多数应用于图类型数据GNN应用都使用这三个矩阵一个、两个或全部。

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matlab 稀疏矩阵 乘法,Matlab 矩阵运算

reshape(A,m,n),它在矩阵总元素保持不变前提下,将矩阵A重新排成m*n二维矩阵。 二、矩阵拆分 1.矩阵元素 可以通过下标(行列索引)引用矩阵元素, Matrix(m,n)。...3、特殊矩阵 (1) 魔方矩阵 魔方矩阵一个有趣性质,其每行、每列及两条对角线上元素和都相等。对于n阶魔方阵,其元素由1,2,3,…,n2共n2个整数组成。...四、矩阵分析 1、对角阵 (1) 对角阵 只有对角线上有非0元素矩阵称为对角矩阵对角线上元素相等对角矩阵称为数量矩阵对角线上元素都为1对角矩阵称为单位矩阵。...(1) 提取矩阵对角线元素 设A为m*n矩阵,diag(A)函数用于提取矩阵A主对角线元素,产生一个具有min(m,n)个元素列向量。...(2) 构造对角矩阵 设V为具有m个元素向量,diag(V)将产生一个m*m对角矩阵,其主对角线元素即为向量V元素。

2.8K30

R语言多元动态条件相关DCC-MVGARCH、常相关CCC-MVGARCH模型进行多变量波动率预测

我们应该使用准确术语是 "方差-协方差矩阵",因为该矩阵对角线上方差元素和非对角线上协方差元素组成。...如果我们对协方差条目进行单独建模,并将它们 "修补 "成一个矩阵,将每个成对协方差放在正确位置(例如,变量1和变量3之间协方差在条目 和  ,不能保证我们最终得到一个非负定矩阵。...这类条件相关模型关键切入点是要认识到  (4)  是一个矩阵对角线上是各个序列波动率(现在单独估计),对角线外是零。这只是以矩阵形式对我们开始时常规方程进行了处理。  ,因为 。...我们需要它们,它们位于对角线矩阵 对角线上。我们用重尾不对称GARCH来估计它们。...samp_cor <- cor(ret) # 在整个循环过程中会保持不变 wind <- 60 # 大概三个月时间 for (i in (w+1):TT) (volatilitfit[i,])*diag

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开发者必读:计算机科学中线性代数

我们假定读者具备线性代数基础(例如,向量内积和叉积,基本矩阵运算加法、标量乘法、转置、上/下三角矩阵矩阵-向量乘法,矩阵乘法,矩阵迹等)。...其中 U ∈ R^m×m 和 V ∈ R^n×n 分别是包含 A 左、右奇异向量正交矩阵,Σ ∈ R^m×n 是对角矩阵,其中 A 奇异值在主对角线上递减。...其中 U ∈ R^m×ρ和 V ∈ R^n×ρ是包含对应于非零奇异值左、右奇异向量两两正交列(即 U^TU = I 且 V^TV = I)矩阵;Σ ∈ R^ρ×ρ是 A 非零奇异值在对角线上递减对角矩阵...A 底部ρ-k 个奇异值对角矩阵。...给定一个秩为ρ m×n 阶矩阵 A,它稀疏奇异值分解可以表示为: ? 它 Moore-Penrose 伪逆 A† 稀疏奇异值分解可以表示为: ?

1.2K70

开发者必读:计算机科学中线性代数(附论文)

给定一个矩阵 A ∈ R^m×n,我们定义全 SVD 为: 其中 U ∈ R^m×m 和 V ∈ R^n×n 分别是包含 A 左、右奇异向量正交矩阵,Σ ∈ R^m×n 是对角矩阵,其中 A 奇异值在主对角线上递减...= I 且 V^TV = I)矩阵;Σ ∈ R^ρ×ρ是 A 非零奇异值在对角线上递减对角矩阵。...让 A = UΣV^⊤ ∈ R^m×n 作为 A 稀疏 SVD;设 k < rank(A) = ρ为整数,让 随后, 换句话说,上述定理指出,如果我们寻找一个矩阵 A k 秩近似,使得"误差"矩阵...A 底部ρ-k 个奇异值对角矩阵。...形式上来说,若给定 m×n 阶矩阵 A,那么如果矩阵 A† 满足以下属性,它就是矩阵 A Moore-Penrose 伪逆: 给定一个秩为ρ m×n 阶矩阵 A,它稀疏奇异值分解可以表示为: 它

2.2K100

数据结构 第9讲 数组与广义表

把多个相同元素分配一个存储空间,元素为0不分配空间。 什么样矩阵能够压缩? 一些特殊矩阵:对称矩阵对角矩阵,三角矩阵稀疏矩阵等。 什么叫稀疏矩阵?...矩阵中非零元素个数较少,怎样才算是较少呢?一般认为非零元素个数小于5%矩阵稀疏矩阵。...首先找到aii存储位置,因为aii是对角线上元素,以对角线为中心,左右两侧都是d个元素,如图16所示。因此aii之前有i-1行,每行L个元素,aii所在行左侧有d个元素,如图15所示。...稀疏矩阵 稀疏矩阵是指非零元素个数较少,且分布没有规律可言,那么少到什么程度才算稀疏呢?一般认为非零元素小于5%时,属于稀疏矩阵,当然也没那么绝对噢。如图19所示。 ?...图19 稀疏矩阵 稀疏矩阵如何存储呢? 为了节省空间,只需要记录每个非零元素行、列和数值即可。这就是三元组存储法。如图20所示。 ?

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新颖研究 | 长期投资与三角形可视化邂逅(附代码)

今天公众号为大家介绍一个基于三角形图Python项目,用于可视化长期投资指标! 摘要 1、我们引入了三角形图,用于可视化长期投资指标。...并且可以在对角线上返回三角形中找到,索引Xn,n对应于矩阵位置。为了解释收益三角形功能,我们在1999年1月到2019年3月之间生成了一个市场投资组合,大约20年数据。...在第一上对角线中,收益值对应于目标频率两个周期长度间隔。这意味着收益三角形一个对角线上条目可以获得为,对于 ? ?...因此,在图1对角线上所有条目对应于一年保持期,并且在第一个对角线上,所有条目对应于两年保持期等,依此类推。这意味着通过向右上角移动(,进一步向右和/或进一步向顶部),投资期限是增加。...对于动量因子图10,它非常相似,在20世纪30年代初投资时只有一个例外区域。图9规模因子三角形包含更多红色表现不佳条目,其中一个条目甚至高于50年投资期限对角线。 ?

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Python 数学应用(一)

整个集合稀疏矩阵算法,可以在矩阵确实足够稀疏情况下大大提高性能。 稀疏矩阵出现在许多应用程序中,并且通常遵循某种模式。...sparse中还有三个额外稀疏矩阵类,包括dia_matrix,它有效地存储非零条目沿对角线带出现矩阵。 来自 SciPy sparse模块包含用于创建和处理稀疏矩阵例程。...(A) 如果您手动生成稀疏矩阵,该矩阵可能遵循某种模式,例如以下三对角矩阵: 在这里,非零条目出现在对角线上以及对角线两侧,并且每行中非零条目遵循相同模式。...这个矩阵是三对角,这意味着非零条目出现在或邻近主对角线上。我们使用 SciPy sparse模块中diag例程,这是一种定义这种矩阵实用程序。这与本章中解方程配方中描述过程非常相似。...我们首先创建对角线条目对角线上下方条目,然后我们使用diags例程创建稀疏矩阵矩阵应该有N+1*行和列,以匹配网格点数量,并且我们将数据类型设置为双精度浮点数和 CSR 格式。

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深度学习图原理

任何对GNNs重要其他概念将会随着它们出现而进行解释,但与此同时,还有一个关于图最后一个主题我们需要涵盖。我们必须学会如何在计算中表达图。...在任何情况下,A都可以按照以下规则构建: 无向图邻接矩阵因此在其对角线上是对称,从左上角对象到右下角: 有向图邻接矩阵只覆盖对角线线一侧,因为有向图边只朝一个方向。...D本质上是一个对角矩阵,其中对角线每个值都是其对应节点度数。 各种类型图和矩阵(由欧洲生物信息学研究所提供) 不要忘记度数只是邻接矩阵每一行总和。...然后,这些度数被放在矩阵对角线上(邻接矩阵对称线)。...,关联矩阵,但绝大多数应用于图类型数据GNN应用都使用这三个矩阵一个、两个或全部。

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机器学习降维算法汇总!

假如D维空间中数据每一维均值为0,即 ,那么两边乘上 得到降维后数据每一维均值也是0,考虑一个矩阵 ,这个矩阵是这组D维数据协方差矩阵,可以看出对角线上值是D维中某一维内方差,非对角线元素是...那么针对降维后d维数据协方差矩阵 ,如果希望降维后点尽可能分开,那么就希望B对角线上值即每一维方差尽可能大,方差大说明这些维上数据具有非常好区分性,同时希望d每一维都是正交,它们正交就会使得两个维是无关...这种情况下B非对角线上值全部为0。又由于可以推导得出 这个式子实际上就是表示了线性变换矩阵W在PCA算法中作用是让原始协方差矩阵C对角化。...输入:N个D维向量 ,降维到d维 输出:投影矩阵 ,其中每一个 都是D维列向量 目标:投影降维后数据尽可能分开, (这里迹是因为上面提到B对角线元素都是0,而对角线上元素恰好都是每一维方差...error传递到整个网络 6.将分别对 W 和 梯度求和然后更新W 7.重复3~6至收敛或者完成迭代次数T 4.小结 本文主要重点放在算法流程是什么,每一步具体做了什么,有的地方可能理论阐述还不够清晰

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《深入浅出Python机器学习》读书笔记 第二章 基于Python语言环境配置

安装命令如下 pip3 install numpy scipy matplotlib ipython pandas scikit-learn 1 numpy Nump y 是一个Python 中非常基础用于进行科学计算库...Python 中用于进行科学计算工具集,它有很多功能,计算统计学分布、信号处理、计算线性代数方程等。...案例: import numpy as np from scipy import sparse # 创建一个对角矩阵 matrix = np.eye(6) # 把对角矩阵转换为稀疏矩阵 sparse_matrix...= sparse.csr_matrix(matrix) # 输出对角矩阵 print("对角矩阵:\n{}".format(matrix)) # 输出稀疏矩阵 print("sparse存储矩阵:\...发现本站有涉嫌侵权/违法违规内容, 请发送邮件至 举报,一经查实,本站将立刻删除。

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