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Python解析psiBlast输出的JSON文件结果

中解析JSON是通过如下代码完成的 import json file_fh = open("test2.json") ajsonD = json.load(file_fh) ajsonD {'公众号':...Python解析PSIBLAST的JSON输出结果 BLAST的输出结果可以有多种,在线的配对比较结果,线下常用的表格输出,这次尝试的是JSON的输出,运行命令如下 psiblast -db nr -out...Known_CPS.CUI.mfa.psiblast -evalue 0.0001 -outfmt 13 -num_threads 10 -num_iterations 0 -in_msa Known_CPS.CUI.mfa 这次编程的目的是通过解析输出的...JSON结果获取匹配的蛋白的名字和序列,JSON文件解析的关键是知道关注的信息在哪个关键字下可以找到,然后需要怎么操作进入到关键字所在数据层,具体操作见如下视频,视频中一步步尝试如何不断试错,解析JSON...文件,获得想要的Python脚本和解析结果。

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python之 print()函数的输出学问(函数解析以及格式化输出)

本篇主要针对print()函数的输出进行说明,所以不会构建长篇大论的大标题小标题。简洁明了! 你是怎样用python的输出语句呢? 是这样吗? 下面展示一些 内联代码片。...看下面 print("你好"+"世界","hello",sep=",") 输出结果如下 2:对end参数的解析 #我们先这样输出 print("十年生死两茫茫")#end参数一般会默认\n,就是换行的意思...参数一般会默认\n,就是换行的意思,改变end参数的值观察输出效果 print("不思量,自难忘") 输出结果: 3:对file参数的解析 通常我们的输出会直接输出到终端,那么我现在要把我想要输出的内容直接输出到我的文件中...建立一个文件作为输出目标 我们现在要输出内容到这里面,看代码 File = open("D:\\python\\pydoc\\jgdabc_666\\1.txt",'w',encoding="...()函数的解析就到这里,我们常用的就是这些,当然还有其它的输出函数形式。

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    自然语言处理之词全解和Python实战!

    本文全面探讨了词在自然语言处理(NLP)中的多维角色。从词的基础概念、形态和词性,到词语处理技术如规范化、切分和词性还原,文章深入解析了每一个环节的技术细节和应用背景。...特别关注了词在多语言环境和具体NLP任务,如文本分类和机器翻译中的应用。文章通过Python和PyTorch代码示例,展示了如何在实际应用中实施这些技术。 关注TechLead,分享AI全维度知识。...语言特异性 形态丰富性 像芬兰语和土耳其语这样的形态丰富的语言,单一的词可以表达一个完整的句子在其他语言中需要的信息。这需要更为复杂的形态分析算法。...在这一节中,我们将重点介绍序列到序列(Seq2Seq)模型在机器翻译中的应用,并讨论词如何在这一过程中发挥作用。...任务解析 在机器翻译任务中,输入是源语言的一段文本(通常为一句话或一个短语),输出是目标语言的等效文本。这里,词嵌入用于捕获源语言和目标语言中词的语义信息,并作为序列到序列模型的输入。

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    提升求职竞争力的利器:招聘信息分析与求职信生成器

    招聘信息如下: 招聘岗位:Python开发工程师 招聘企业:某知名互联网公司 招聘要求: 本科及以上学历,计算机相关专业,2年以上Python开发经验; 熟悉Python语言及常用框架,如Django...我熟悉Python语言及常用框架,如Django、Flask等,能够独立完成Web后端开发。我也熟悉MySQL、MongoDB等数据库的使用和优化,有大数据处理经验。...() print(letter) 输出结果: 张经理: 您好!...在过去的工作中,我主要负责了Web后端开发和大数据处理的相关任务。我熟悉Python语言及常用框架,如Django、Flask等,能够独立完成Web后端开发。...以下是我的简历中与招聘要求相关的一些关键词和短语: Python Django Flask MySQL MongoDB Linux Git 爬虫 数据分析 机器学习 我对贵公司的发展和业务非常感兴趣,希望能够加入贵公司的优秀团队

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    如何在R中操作非结构化数据?

    加之,近年来 Redis、MongoDB、ELK等非结构化数据库的繁荣,MySQL 5.7之后也已经添加了对JSON格式的原生支持(之前可以用blob、longtext等格式存储),非结构化数据更是在数据处理中变得流行...本文将从非结构化数据的转化、处理以及可视化三个方面讨论如何在R中操作非结构化数据。...在实际处理字符串中,一定要注意的就是R中字符串的转义问题。比如\\表示\,\"表示"等等。我曾经因为Python和R中的双层JSON解析多次遇到转义符号的问题。...rjson rjson 和 jsonlite最大不同之处在于,rjson将json转化为一个list,而list是R语言中非结构化数据的事实标准,类似 python 中的 dict,或者 matlab...rlist与高阶函数 rlist 是支持高阶函数表达式的,借鉴了Python、Scala等语言中的MapReduce模型,rlist也为list提供了map、filter、reduce、group、join

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    Python基础教程(十二):模块

    使用import ... as ...语句为模块指定别名 五、案例分析:利用模块实现简单的日志记录功能 六、 使用Python标准库中的模块 七、总结 结束语 一、引言 在Python编程中,模块(Module...本文将详细介绍Python模块的基本概念、创建模块的方法、导入模块的不同方式,并通过具体的案例来展示如何在实际项目中应用模块。...二、Python模块解析 Python模块是扩展名为.py的文件,其中包含了Python代码和定义(函数、类、变量等)。模块可以包含执行代码,但通常仅包含函数定义、类定义等可重用的代码。...Python标准库包含大量预定义的模块,如os、sys、math等,这些模块提供了许多内置的函数和类,用于执行各种常见的任务。此外,Python程序员还可以编写自定义模块,以满足特定项目的需求。...在本文中,我们介绍了Python模块的基本概念、创建模块的方法、导入模块的不同方式,并通过具体的案例展示了如何在实际项目中应用模块。希望这些内容能够帮助您更好地理解和使用Python模块。----

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    左手用R右手Python系列之——noSQL基础与mongodb入门

    今天这一篇粗浅的聊一聊非结构化数据存储,以及R语言和Python与mongoDB之间的通讯。...mongo数据库的数据对象是bson,这种数据结构相当于json标准的扩展,R语言中的list可以与json互转,Python中的dict本身就与json高度兼容。..., 但是并未改变其内容,仅仅是添加了一个类,同时输出的外观优化了下。...与json高度兼容(并不代表一模一样),而bson结构又是基于json的扩展,所以在Python中可以直接将dict插入mongodb数据库,而基本无需做类型转换,这一点儿Python完胜R语言。...以上便是R语言、Python与mongodb数据库通讯的基础操作,如果想要了解更为详细的高阶查询操作,可以参考关于mongodb的专业技术书籍及资料。

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    FloatingPointError: Floating Point Exception 完美解决方法

    FloatingPointError: Floating Point Exception 完美解决方法 摘要 大家好,我是默语,一位专注于全栈开发、运维和人工智能技术的博主。...这是Python和其他语言中处理浮点数运算时常见的问题,导致代码意外终止。本文将通过实例、代码分析和最佳实践,帮助你完美解决这一问题。...它不仅仅会出现在 Python 中,很多编程语言如 C/C++ 也会遇到类似的问题。解决这个问题需要理解浮点数的精度限制和如何编写防御性代码来避免异常情况。...a = 0.1 + 0.2 print(a == 0.3) # 输出 False,精度丢失 深入解析 FloatingPointError 的解决方案 1....通过增加位数或者使用专用的高精度库(如 decimal 模块)可以减少误差。

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    Python语言学习基础:魔术方法的定义、迭代器与生成器、常用魔术方法及其分类型介绍

    目录 前言 魔术方法的定义 迭代器与生成器 常用魔术方法 按类型介绍魔术方法 结束语 参考文献 摘要:本文就来详细介绍Python语言中的魔术方法,其中包括魔术方法的定义、迭代器与生成器的概念、常用的魔术方法以及按类型分类介绍...本文就来详细介绍Python语言中的魔术方法,其中包括魔术方法的定义、迭代器与生成器的概念、常用的魔术方法以及按类型分类介绍,通过介绍和学习这些基础知识,让大家能够更好地理解和使用Python语言,分享给有需要的小伙伴...魔术方法的定义 先来了解魔术方法,在Python语言中魔术方法是以双下划线(__)开头和结尾的特殊方法,这些方法在对象的创建、操作和销毁等过程中被自动调用,从而实现对对象的控制和定制。...而且魔术方法具有特殊的命名规则,如__init__用于对象的初始化,__str__用于对象的字符串表示等。通过定义和实现这些魔术方法,我们可以自定义对象的行为和特性。...结束语 通过本文对Python语言中的魔术方法的定义、迭代器与生成器的概念、常用的魔术方法以及按类型分类的详细介绍,魔术方法可以让我们在对象的创建、操作和销毁等过程中实现自定义的行为和特性,通过理解和掌握这些基础知识

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    Python与NoSQL数据库(MongoDB、Redis等)面试问答

    在现代软件开发中,NoSQL数据库(如MongoDB、Redis等)因其灵活的数据模型和高并发性能被广泛应用。...准备一些使用示例,如MongoDB的aggregate()方法或编写简单的Redis Lua脚本。5....缓存策略与数据一致性面试官可能询问您如何在Python应用中利用Redis实现数据缓存,以及如何处理缓存与数据库间的数据一致性问题。...过度依赖低效查询:了解如何在MongoDB中编写高效的查询(如使用索引、投影),以及如何在Redis中合理组织数据结构以提高访问效率。...结语熟练掌握Python与NoSQL数据库(如MongoDB、Redis)的交互,不仅有助于提升日常开发效率,也是面试环节中的加分项。

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    Python 全栈工程师必备面试题 300 道(2020 版)

    Python 面试不仅需要掌握 Python 基础知识和高级语法,还会涉及网络编程、web 前端后端、数据库、网络爬虫、数据解析、数据分析和数据可视化等各方面的核心知识。...1.1.5 python中的DocStrings(解释文档)有什么作用? 1.1.6 Python 3 中的类型注解有什么好处?如何使用? 1.1.7 Python 语言中的命名规范有哪些?...5.3.18 在 MongoDB 中什么是索引? 5.3.19 什么是聚合? 5.3.20 写一个 Python 连接操作 MongoDB 数据库实例? 6....6.3.9 BeautifulSoup4 输出文档的编码格式是什么? 7. 网络爬虫 7.1 网络爬虫是什么?它有什么特征? 7.2 Python 中常用的爬虫模块和框架有哪些?它们有什么优缺点?...8.10 Matplotlib 中如何在一张图上面画多张图? 8.11 使用直方图展示多部电影 3 天的票房情况? 8.12 描述一下 NumPy array 对比 Python list 的优势?

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    ️ TypeError: argument of type ‘NoneType‘ is not iterable - NoneType类型的参数不可迭代完美解决方法

    ️ TypeError: argument of type ‘NoneType’ is not iterable - NoneType类型的参数不可迭代完美解决方法 摘要 大家好,我是默语,擅长全栈开发...本文将详细分析此错误的根源,提供有效的解决方案,并探讨如何在日常开发中避免类似错误的发生。通过学习这些技巧,开发者可以提高代码的健壮性,提升调试效率。...的变量,我们可以在代码中提供一个合理的默认值(如空列表或空字典),以避免错误的发生。...实战案例 4.1 解析用户输入 假设我们需要处理用户输入的数据,用户可能未提供某些信息(如地址)。我们可以通过对输入值进行合理的 None 检查来避免错误。...默语的博客 通过技术博客、社区分享,帮助开发者更好地解决问题,提升编程技能!

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    探索 Java JDK 21 的新特性:一场深度解析之旅

    探索 Java JDK 21 的新特性:一场深度解析之旅 博主 默语带您 Go to New World....✍ 个人主页—— 默语 的博客 《java 面试题大全》 惟余辈才疏学浅,临摹之作或有不妥之处,还请读者海涵指正。...引言 Java JDK 21 的发布为 Java 生态系统带来了令人振奋的变革。本文将带您深入了解这些新特性,并为您展示如何在实际项目中应用它们。...无论您是一名经验丰富的 Java 开发者还是初学者,都会从这些特性中获益匪浅。 正文 新特性概览 1. 模式匹配的魅力 JDK 21 引入了模式匹配,这是 Java 语言中的一项重大改进。...模式匹配的实战应用 ‍♂️ 通过实际代码示例,我们将演示如何在现实项目中应用模式匹配,包括使用模式匹配简化数据解析和转换,以及改进异常处理。 2.

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    Python 小白的晋级之路 - 第十三部分:创建函数

    2、定义函数 在 Python 中,使用def关键字来定义函数。...在以上示例中,我们定义了一个函数greet(),它不接收任何参数,函数体内输出一条简单的问候语。 3、使用参数 函数可以接收参数,以便传递数据给函数。在函数定义时,我们可以指定参数的名称和类型。...我们可以将返回值赋给一个变量,如sum_result = add(3, 4),或者直接在输出语句中使用print(add(3, 4))来打印函数的返回值。...你可以尝试编写更多的函数来加深理解,并尝试处理其他类型的异常情况。 8、总结 我们了解到了函数的概念以及如何在 Python 中定义函数、使用参数和返回值、处理全局变量以及异常处理。...通过学习函数的相关概念和用法,你可以更好地组织和重用代码,并能够优雅地处理异常情况。继续实践和探索更多的函数概念将有助于你在 Python 编程中更加熟练和自信。

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    前50个Python面试问题(最受欢迎)

    答: For循环通常用于遍历各种集合类型的元素,例如List,Tuple,Set和Dictionary。 While循环是任何其他编程语言中使用的实际循环功能。...根据分配给变量的值,Python存储适当的数据类型。对于整数,浮点数等数字,数据长度是无限的。 #10)如何在Python中使用数组? 答: Python不支持数组。...#12)在Python中解析字符串和查找模式的最佳方法是什么? 答: Python内置支持使用正则表达式模块解析字符串。导入模块并使用函数查找子字符串,替换字符串的一部分等。...#13)Python支持哪些数据库? 答: MySQL(结构化)和MongoDB(非结构化)是Python本身支持的著名数据库。导入模块并开始使用功能与数据库进行交互。...6s'%a) 答:输出应为:python #31)编写命令以读取: 一种。文件中的“ 10”个字符 b。读取整个文件 c。一起执行两个命令后写输出。

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    python学习历程之----基础篇(二)

    )或者3.5(小数),或者是“hello,world”(字符串)等等,在c语言中,变量(一个可以变化的量)是需要实现定义才可以使用,但是Python里面就比较简单,可以直接使用,举个例子:C语言中,如果你要定义一个变量...在C语言中,我们定义变量a=5的正确步骤如下 # int a; # a=5; 然而在Python中你就不需要这样了,可以简称为,赋值即定义,详见如下 Python中,常见的数据类型有以下几种 整型:...如0b100,换算成十进制是4)、八进制(如0o100,换算成十进制是64)、十进制(100)和十六进制(0x100,换算成十进制是256)的表示法。...浮点型:浮点数也就是小数,之所以称为浮点数,是因为按照科学记数法表示时,一个浮点数的小数点位置是可变的,浮点数除了数学写法(如123.456)之外还支持科学计数法(如1.23456e2)。...它就是一个函数,功能就是显示括号里面的内容在屏幕上,而现在我们来学习一下它的对头函数,有打印(输出)肯定有输入函数啊,于是,input()函数诞生了,语法很简单,请看下面的代码实践: input()函数里面可以输入提示语

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    BSON及mongoDB数据类型

    而近几年崛起的mongDB则采用了类JSON的数据格式,在JSON之上进行了丰富和增强,使得mongoDB可以处理及报错更大的数据类型。本文就2者进行描述同时给出mongoDB支持的数据类型。...JSON采用完全独立于语言的文本格式,但也使用了类似于C语言家族的习惯(包括C、C++、C#、Java、JavaScript、Perl、Python等)。...这些特性使JSON成为理想的数据交换语言。 易于人阅读和编写,同时也易于机器解析和生成(一般用于提升网络传输速率)。...(A collection of name/value pairs),在不同的编程语言中有不同的描述 如:对象(object),纪录(record),结构(struct...在大部分语言中,它被实现为数组(array),矢量(vector),列表(list),序列(sequence) 二、BSON特性 1、什么是BSON BSON()是一种类json的一种二进制形式的存储格式

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