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第一R- 生信配置文件大全

简介 configr 是我上传到CRAN第一个R,主要功能是解析和生成配置文件(json/ini/yaml/toml),分别用到了jsonlite,ini, yaml和RcppTOML。...configr是一个整合并且进行了解析扩展R(开发动机主要是我比较烦记函数,另外解析配置文件之后很多参数还要做进一步处理),本教程将介绍常见几种配置文件格式,以及configr基本用法。...:配置文件格式识别、配置文件读取、配置文件格式转换、配置文件扩展解析 格式识别 # 获取Rconfigr内置四种配置文件library(configr)config.json #echo bash#<#,它可以将这一部分替换为系统终端命令运行结果. glue.parse使用Rglue进行相关解析,它会替换 !!

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何在SSH连接linux情况下使用wireshark抓TSINGSEE青犀视频云边端架构产品问题?

而大多数开发者用户都会使用linux版本进行安装。 ? 对于安装部署出现问题,TSINGSEE青犀视频团队研发经常为客户远程调试,通常都会通过抓取网络方式进行排查。...当我们在使用SSH连接远程客户服务器时候可以有两种方式进行抓,分别是: 通过tcpdump进行抓,对于tcpdump抓,保存到服务器,在拷贝到本地进行分析。...通过wireshark进行抓,对于ssh连接后,如何使用wireshark? 本文我们就简单介绍一下如何在SSH连接linux情况,使用wireshark进行抓。...6、在Xshell对创建SSH会话进行如下设置:“连接>SSH>隧道”“X11转移”,勾选“X DISPLAY”,参数无需修改。 此时通过SSH连接出现以下错误: ?...7、需要修改SSH配置,SSH开启X11Forwarding Linux下/etc/ssh/sshd_config,添加 X11Forwarding yes,以及 Uselogin no ?

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生信分析流程构建几大流派

R inst/bin下面的文件。...以 npm 形式开发相应 R 命令行程序,参见正在开发 ngsjs ,初期目标是开发、收集 200+ 和数据分析相关命令行程序。...配置文件流(和 CWL 不冲突)主要是基于 JSON、YAML、TOML 等类型配置文件,然后开发相应解析解析和执行流程。...比如其中我开发两个项目 configr、BioInstaller: 图九 configr 说明文档 图十 BioInstaller 项目主页 相关 R : blogdown:辅助个人博客创建和维护...我在这里设想了一个 R markdown 应用场景: 用户使用 R markdown 并通过连接数据库、访问网页 APIs 方式提交数据分析任务; 构建文档即重新检查数据分析进程和状态、生成相应运行状态可视化

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何在服务器上安装OpenLDAP

请返回他们全名,电子邮件,头衔和简述。 在本教程,我们将讨论如何在Ubuntu 16.04上安装和配置OpenLDAP服务器。...此外,由于我们将在Web界面输入密码,因此我们应该使用SSL加密来保护Apache。您需要SSL证书,如何设置此证书取决于你是否拥有可解析该服务器域名。...您可以在这里输入任何内容,并将有机会在短时间内更新它。 即使我们刚刚安装了软件,我们还需继续重新配置它。slapd软件能够提出许多重要配置问题,但默认情况下会在安装过程跳过这些问题。...第四步、配置SSL LDAP加密 虽然我们已经加密了我们Web界面,但外部LDAP客户端仍然连接到服务器并以纯文本形式传递信息。让我们使用腾讯云SSL证书为我们LDAP服务器添加密。...提交申请后验证身份 提交申请成功后弹窗提示如下,需要前往【证书详情页】获取CName记录添加解析: 获取CName记录Tips显示,需要尽快成功添加解析,方可通过CA机构审核: 复制腾讯云加密证书

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何在CDH5.15安装CDSW1.4

在CDH5.13版本以后支持CDSWParcel安装,本篇文章就主要讲述如何通过CM5.15使用Parcel安装CDSW1.4。...,《如何在Windows Server2012搭建DNS服务并配置泛域名解析》,《如何在RedHat6上使用Bind搭建DNS服务》和《如何在RedHat7上使用Bind搭建DNS服务》,CDSW1.4...DNS服务并配置CDSW节点泛域名解析 5.CDSW节点已经通过CM加入到集群 2.部署CDSW Parcel ---- 1.下载CDSWParcel,下载地址如下 https://archive.cloudera.com...8.测试CDSW功能 ---- 1.Fayson使用是AWS环境,访问CDSW需要用内网Windows机器,我们这里先配置Windows机器连接到我们刚配置DNS服务。 ?...》,《如何利用Dnsmasq构建小型集群本地DNS服务器》,《如何在Windows Server2012搭建DNS服务并配置泛域名解析》,《如何在RedHat6上使用Bind搭建DNS服务》和《如何在

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【愚公系列】软考高级-架构设计师 023-常见网络协议

欢迎 点赞✍评论⭐收藏前言网络协议是一组规则和标准,用于定义电子设备(计算机、路由器、交换机等)如何在网络交换信息。...核心功能数据格式化:定义数据在传输和接收时结构,确保发送方构造数据可以被接收方正确解析。地址分配:确定如何给网络设备分配地址,并指定数据发送目的地。...它为数据提供逻辑地址(即IP地址),使得数据能够在复杂网络中找到正确路径。特性:无连接:IP协议不建立持久连接,每个数据独立处理。...HTTP (HyperText Transfer Protocol)功能:HTTP 用于在Web服务器和客户端浏览器之间传输网页内容文本、图像和其他类型多媒体文件。...特点:动态配置,减少手动配置错误和地址冲突。DNS (Domain Name System)功能:将域名( www.example.com)解析为IP地址,使得用户可以通过易于记忆域名访问网站。

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0586-5.16.1-如何在CDH5.16.1安装CDSW1.5

CDSW需要DNS服务和泛域名解析,可以参考Fayson以前文章《如何在Windows Server2008搭建DNS服务并配置泛域名解析》、《如何利用Dnsmasq构建小型集群本地DNS服务器》、...《如何在Windows Server2012搭建DNS服务并配置泛域名解析》,《如何在RedHat6上使用Bind搭建DNS服务》或《如何在RedHat7上使用Bind搭建DNS服务》,CDSW1.5新功能可以参考...DNS服务并配置CDSW节点泛域名解析 5.CDSW节点已经通过CM加入到集群 2 部署CDSW Parcel 1.下载CDSWParcel,下载地址如下 https://archive.cloudera.com...8 测试CDSW功能 1.Fayson使用是AWS环境,访问CDSW需要用内网Windows机器,我们这里先配置Windows机器连接到我们刚配置DNS服务。 ?...《如何利用Dnsmasq构建小型集群本地DNS服务器》、《如何在Windows Server2012搭建DNS服务并配置泛域名解析》,《如何在RedHat6上使用Bind搭建DNS服务》或《如何在RedHat7

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0478-如何在CDH5.16.1安装CDSW1.4.2

CDH5.13版本以后支持CDSWParcel安装,本篇文章Fayson就主要讲述如何通过CM5.16使用Parcel安装CDSW1.4.2。...《如何在Windows Server2012搭建DNS服务并配置泛域名解析》,《如何在RedHat6上使用Bind搭建DNS服务》或《如何在RedHat7上使用Bind搭建DNS服务》,CDSW1.4.2...DNS服务并配置CDSW节点泛域名解析 5.CDSW节点已经通过CM加入到集群 2 部署CDSW Parcel 1.下载CDSWParcel,下载地址如下 https://archive.cloudera.com...8 测试CDSW功能 1.Fayson使用是AWS环境,访问CDSW需要用内网Windows机器,我们这里先配置Windows机器连接到我们刚配置DNS服务。 ?...、《如何利用Dnsmasq构建小型集群本地DNS服务器》、《如何在Windows Server2012搭建DNS服务并配置泛域名解析》,《如何在RedHat6上使用Bind搭建DNS服务》或《如何在RedHat7

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0600-6.1.0-如何在CDH6.1安装CDSW1.5

《如何在Windows Server2012搭建DNS服务并配置泛域名解析》,《如何在RedHat6上使用Bind搭建DNS服务》或《如何在RedHat7上使用Bind搭建DNS服务》,CDSW1.5新功能可以参考...DNS服务并配置CDSW节点泛域名解析 5.CDSW节点已经通过CM加入到集群 2 部署CDSW Parcel 1.下载CDSWParcel,下载地址如下 https://archive.cloudera.com...5.修改/etc/resolv.conf文件配置,在nameserver增加创建DNS服务器IP地址,Fayson这里是将cdsw本机配置为dns服务器,所以将cdsw这台机器内网IP地址配置到该文件...8 测试CDSW功能 1.Fayson使用是AWS环境,访问CDSW需要用内网Windows机器,我们这里先配置Windows机器连接到我们刚配置DNS服务。 ?...如何利用Dnsmasq构建小型集群本地DNS服务器》、《如何在Windows Server2012搭建DNS服务并配置泛域名解析》,《如何在RedHat6上使用Bind搭建DNS服务》或《如何在RedHat7

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R语言里面的文本文件操作技巧合辑

从底层函数到成熟R到个性化自定义函数 偏底层函数 常规需求是文本文件交互,比如 文件打开、文件写入、文件内容刷新等等,如果默认文件没有规则仅仅是里面有内容,就需要使用比较底层函数: 打开文件...有规则文本文件读入 但是绝大部分情况下,我们文本文件其实是规则,在R语言中,有许多函数可以用来读取结构化文本文件,CSV文件、TSV文件或其他形式表格数据。...在R,你可以使用readLines()函数读取GMT文件,然后使用字符串处理函数来解析每一行。...在R,你可以使用BioconductorShortRead来读取FASTQ文件,并将其转换为FASTA格式。以下是一个示例: # 首先,你需要安装Bioconductor和ShortRead。...使用readr读取大文件:readr提供了一些函数,read_csv(), read_tsv()等,这些函数比基础R函数更快,更容易处理大文件。

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360高级java面试真题

在Java实现TCP粘和拆处理涉及到网络编程数据传输和解析问题。...使用特殊分隔符 另一种常见处理方法是在消息末尾使用特殊分隔符来标识消息结束,比如换行符\n或者回车符\r。接收端可以根据分隔符来分割消息,从而得到完整消息内容。...总之,在Java处理TCP粘和拆问题通常涉及到设计消息格式、消息长度表示以及消息解析等方面。...合理地设计消息格式并使用合适方法来解析消息,可以有效地避免TCP粘和拆导致数据解析错误。 描述JavaSelector机制及其在非阻塞IO应用。...在非阻塞 I/O ,Selector 可以帮助我们实现高性能网络编程,特别适用于需要处理大量连接服务器端程序。 如何在Java中使用SSL/TLS建立安全网络通信?

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Java程序员必备技能《上》

java.sql:提供了 JDBC(Java Database Connectivity)用于与数据库进行交互。 java.text:用于处理文本格式化和解析。...开发工具 maven maven 是 Java 开发中常用项目管理工具和构建工具,Java 程序员需要掌握以下关键内容来有效地使用 maven: 项目构建: POM 文件:理解和配置项目对象模型(POM...插件管理: 内置插件:熟悉常用内置插件, compiler、surefire 等,可以配置这些插件以定制构建过程。 自定义插件:了解如何编写和使用自定义 Maven 插件,以满足特定需求。...Profile 和属性: 使用 Maven Profile 定制不同环境下构建配置开发环境、测试环境、生产环境。 熟悉如何在 POM 文件中使用属性来提取配置信息,使构建过程更灵活。...集成其他工具: 与 IDE 整合:掌握如何在常见集成开发环境 IntelliJ IDEA、Eclipse 中使用 Maven。

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基于STM32智能天气预报系统

那么,我们该怎么从这一堆JSON格式数据解析出冒号后面的字符串呢?并且,这个系统是基于单片机天气预报系统。而单片机使用C语言进行编程开发,所以我们得使用C语言对这些JSON天气数据进行解析。...其实,有一个专门解析JSON数据第三方C语言库。...解析结果冒号后面的数据就是我们可以选择使用数据。这是解析当天天气实况数据,解析未来几天天气数据或是其它天气数据方法都是类似的。...URL几个参数是可以设置: key:你API密钥 location:所查询地点 language:语言 unit:单位 在SocketTool工具中发送GET请求(首先先得点击连接按钮进行连接...其与单片机通信方式为串口通信。向该模块发送以下格式数据: 5字节帧头+文本+1字节校验,文本字节数小于等于200字节 即可合成语音。

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何在CDSW定制Docker镜像

在学习本章知识前,你可能需要了解以下知识: 《如何在Windows Server2008搭建DNS服务并配置泛域名解析》 《如何利用Dnsmasq构建小型集群本地DNS服务器》 《如何在Windows...Server2012搭建DNS服务并配置泛域名解析》 《如何在CDH5.13安装CDSW1.2》 《如何在CDSW中使用R绘制直方图》 《如何使用CDSW在CDH集群通过sparklyr提交RSpark...作业》 内容概述 1.配置Python和R私有源地址 2.预装Python和R依赖 3.定制Docker镜像及自定义镜像在CDSW中使用 4.测试及总结 测试环境 1.RedHat7.2 2.CDSW1.2.2...5.配置R私有源 ---- 需要使用R环境,在内网环境下也需要考虑配置R私有源地址,这样可以方便使用install.packages命令来安装我们需要依赖。...在新建Project时候就可以选择该定制化Docker,已经预安装好了一些R和Python依赖,在开发具体算法工程时,就不用再去连接公有/私有源下载。

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Linux 基础入门:掌握必备命令行技能

以上是文件内容查看与编辑基本命令,cat和less适合查看文件内容,而vi则适合编辑文本文件。在使用vi编辑器时,需要注意切换不同模式,并保存文件后退出编辑器。...在这一部分,我们将深入解析与文件权限和用户管理相关命令,帮助读者理解如何在Linux系统中进行权限设置和用户管理。...对于每一类用户,都有分别对应权限设置。 权限符号 在Linux使用符号表示文件权限。常见权限符号如下: - `r`:表示读权限(可读取文件内容)。 - `w`:表示写权限(可修改文件内容)。...例如: ping www.example.com 该命令将发送ICMP数据到www.example.com,并显示目标主机响应时间和丢率。这对于检查网络是否正常连接以及定位网络问题非常有用。...7.2 ifconfig命令 ifconfig命令用于查看和配置网络接口信息。通过执行ifconfig命令,可以查看当前系统网络接口信息,IP地址、子网掩码、MAC地址等。

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apache与tomcat整合

Apache和Tomcat区别: Apache只是一个Web服务器,可以作为独立web服务器来运行,不过只支持静态网页,(asp,php,cgi,jsp)等动态网页就显得无能为力。...由于Apache解释静态页面要比tomcat快速而且稳定, 基于以上原因,一个现实网站使用一个Apache作为Web服务器,为网站静态页面请求提供服务; 并使用Tomcat服务器作为一个Servlet...Apache主要用来解析静态文本,html,tomcat虽然也有此功能,但apache能大大提高效率,对于并发数较大企业级应用,能更好显示apache高效率; 2....Tomcat用来解析jsp,servlet等,所有的客户请求首先会发送到Apache,如果请求是静态文本则由apache解析,并把结果返回给客户端,如果是动态请求,jsp,apache会把解析工作交给.../jdk.sh 配置环境变配置环境变量 #vi /etc/profile 在profile文件 追加 export JAVA_HOME=/usr/java/jdk1.8.0_20 export JAVA_BIN

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最全Python数据工具箱:标准库、第三方库和外部工具都在这里了

这些库需要先进行安装(部分可能需要配置),具体方法参考“1.2.3 Python第三方库”,然后通过import方法导入便可使用其中方法。...Soup是网页数据解析和格式化处理工具,通常配合Pythonurllib、urllib2等库一起使用 ★★★ 03 数据库连接 数据库连接可用于连接众多数据库以及访问通用数据库接口,可用于数据库维护...bsddb模块需要使用dbhash ★★ adodb [第三方库] ADOdb是一个数据库抽象库,支持常见数据和数据库接口并可自行进行数据库扩展,该库可以对不同数据库语法进行解析和差异化处理,具有很高通用性...Pandas提供用于进行结构化数据分析二维表格型数据结构DataFrame,类似于R数据框,能提供类似于数据库切片、切块、聚合、选择子集等精细化操作,为数据分析提供了便捷 ★★★ statsmodels...)、机器学习(向量空间模型、分类模型等)、图形化网络分析模型 ★★★ gensim [第三方库]Gensim是一个专业主题模型(发掘文字隐含主题一种统计建模方法)Python工具,用来提供可扩展统计语义

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