首页
学习
活动
专区
工具
TVP
发布
精选内容/技术社群/优惠产品,尽在小程序
立即前往

如何在R中使用bootstrap来估计线性模型的预测标准差

在R中使用bootstrap来估计线性模型的预测标准差,可以通过以下步骤实现:

  1. 首先,加载所需的R包,包括bootlmtest。这些包提供了进行bootstrap估计和线性模型的功能。
代码语言:txt
复制
library(boot)
library(lmtest)
  1. 接下来,准备数据集。假设我们有一个名为data的数据框,其中包含自变量和因变量。
代码语言:txt
复制
data <- data.frame(x = c(1, 2, 3, 4, 5), y = c(2, 4, 6, 8, 10))
  1. 定义一个函数来拟合线性模型并返回预测标准差。这个函数将在每个bootstrap样本上被调用。
代码语言:txt
复制
lm_pred_sd <- function(data, indices) {
  fit <- lm(y ~ x, data = data[indices, ])
  pred <- predict(fit, newdata = data[-indices, ], se.fit = TRUE)
  return(pred$se.fit)
}
  1. 使用boot()函数进行bootstrap估计。设置R参数为1000,表示进行1000次bootstrap采样。
代码语言:txt
复制
boot_result <- boot(data, lm_pred_sd, R = 1000)
  1. 最后,可以使用boot.ci()函数计算bootstrap估计的置信区间。
代码语言:txt
复制
boot_ci <- boot.ci(boot_result)

这样,我们就可以得到使用bootstrap估计线性模型的预测标准差,并计算出置信区间。

请注意,以上答案中没有提及任何特定的云计算品牌商,因为问题与云计算领域无关。如果您需要了解与云计算相关的内容,请提供相关问题。

页面内容是否对你有帮助?
有帮助
没帮助

相关·内容

R语言使用bootstrap和增量法计算广义线性模型(GLM)预测置信区间

因此,我们要导出预测的置信区间,而不是观测值,即下图的点 > r=glm(dist~speed,data=cars,family=poisson)> P=predict(r,type="response...+1.96*P2$se.fit)1173.9341> P1$fit+1.96*P1$se.fit1172.9101 bootstrap技术 第三种方法是使用bootstrap技术基于渐近正态性(仅50个观测值...我们的想法是从数据集中取样,并对这些新样本进行log-Poisson回归,并重复很多次数, ---- 参考文献 1.用SPSS估计HLM层次线性模型模型 2.R语言线性判别分析(LDA),二次判别分析...(QDA)和正则判别分析(RDA) 3.基于R语言的lmer混合线性回归模型 4.R语言Gibbs抽样的贝叶斯简单线性回归仿真分析 5.在r语言中使用GAM(广义相加模型)进行电力负荷时间序列分析 6....使用SAS,Stata,HLM,R,SPSS和Mplus的分层线性模型HLM 7.R语言中的岭回归、套索回归、主成分回归:线性模型选择和正则化 8.R语言用线性回归模型预测空气质量臭氧数据 9.R语言分层线性模型案例

1.5K31

R语言基于Bootstrap的线性回归预测置信区间估计方法分析汽车制动距离|数据分享

幸运的是,有一种方法几乎可以用于计算各种参数的置信区间,这就是Bootstrap 法。 相关视频 本文使用BOOTSTRAP来获得预测的置信区间。...当我们想给预测一个置信区间时,预测的置信区间取决于参数估计误差。...R语言Bootstrap、百分位Bootstrap法抽样参数估计置信区间分析通勤时间和学生锻炼数据 01 02 03 04 预测置信区间 让我们从预测的置信区间开始 > for(s in 1:500)...显然,我们不能假设高斯残差,因为有更大的正值,而不是负值。考虑到数据的性质,这是有意义的(制动距离不能是负数)。 然后开始讨论在供应中使用回归模型。...克劳斯·施密特(Klaus Schmidt)和安吉拉·温什(Angela Wünsche)于1998年在链式梯度法、边际和最大似然估计中建立了与最小偏差方法的联系。

6400
  • 广义估计方程和混合线性模型在R和python中的实现

    广义估计方程和混合线性模型在R和python中的实现欢迎大家关注全网生信学习者系列:WX公zhong号:生信学习者Xiao hong书:生信学习者知hu:生信学习者CDSN:生信学习者2介绍针对某个科学问题...有些控制变量可以通过实验操作加以控制(如照明、室温等),也称为无关变量;而另一些控制变量由于受实验设计等因素的限制,只能借助统计技术来加以控制,即成了统计分析中的协变量,因而属于统计概念。...OddRatio:风险值,一般用于逻辑回归,可以通过对系数估计进行指数化来计算比值几率。比值几率表示单位预测变量变化时响应变量的几率的乘性变化。在本例中,不适合。...OddRatio:风险值,一般用于逻辑回归,可以通过对系数估计进行指数化来计算比值几率。比值几率表示单位预测变量变化时响应变量的几率的乘性变化。在本例中,不适合。...- 实例操作及结果解读(R、Python、SPSS实现)混合线性模型介绍--Wiki广义估计方程中工作相关矩阵的选择及R语言代码在Rstudio 中使用pythonAn Introduction to

    45400

    R语言使用bootstrap和增量法计算广义线性模型(GLM)预测置信区间|附代码数据

    p=15062 最近我们被客户要求撰写关于广义线性模型(GLM)预测置信区间的研究报告,包括一些图形和统计输出。...考虑简单的泊松回归 我们要导出预测的置信区间,而不是观测值,即下图的点 > r=glm(dist~speed,data=cars,family=poisson) > P=predict(r,type="...渐近地,我们知道 因此,方差矩阵的近似将基于通过插入参数的估计量而获得。 然后,由于作为渐近多元分布,参数的任何线性组合也将是正态的,即具有正态分布。所有这些数量都可以轻松计算。...我们可以使用一个程序包来计算该方法,而不是在理论上再次写一些东西, > P1 $fit 1 155.4048 $se.fit 1 8.931232 $residual.scale [1] 1 增量法使我们具有...(P2$fit+1.96*P2$se.fit) 1 173.9341 > P1$fit+1.96*P1$se.fit 1 172.9101 bootstrap技术 第三种方法是使用bootstrap技术基于渐近正态性

    47810

    R语言使用bootstrap和增量法计算广义线性模型(GLM)预测置信区间|附代码数据

    我们的想法是从数据集中取样,并对这些新样本进行log-Poisson回归,并重复很多次数, ---- ---- 本文选自《R语言使用bootstrap和增量法计算广义线性模型(GLM)预测置信区间.../嵌套)模型GLMM、逻辑回归分析教育留级影响因素数据R语言估计多元标记的潜过程混合效应模型(lcmm)分析心理测试的认知过程 R语言因子实验设计nlme拟合非线性混合模型分析有机农业施氮水平 R语言非线性混合效应...的贝叶斯分层混合模型的诊断准确性研究 R语言如何解决线性混合模型中畸形拟合(Singular fit)的问题 基于R语言的lmer混合线性回归模型 R语言用WinBUGS 软件对学术能力测验建立层次(分层...)贝叶斯模型 R语言分层线性模型案例 R语言用WinBUGS 软件对学术能力测验(SAT)建立分层模型 使用SAS,Stata,HLM,R,SPSS和Mplus的分层线性模型HLM R语言用WinBUGS...软件对学术能力测验建立层次(分层)贝叶斯模型 SPSS中的多层(等级)线性模型Multilevel linear models研究整容手术数据 用SPSS估计HLM多层(层次)线性模型模型

    80400

    R语言贝叶斯MCMC:用rstan建立线性回归模型分析汽车数据和可视化诊断|附代码数据

    本文将谈论Stan以及如何在R中使用rstan创建Stan模型尽管Stan提供了使用其编程语言的文档和带有例子的用户指南,但对于初学者来说,这可能是很难理解的。...rstanrstan允许R用户实现贝叶斯模型。你可以使用熟悉的公式和data.frame语法(如lm())来拟合模型。通过为常用的模型类型提供预编译的stan代码来实现这种更简单的语法。...例子作为一个简单的例子来演示如何在这些包中指定一个模型,我们将使用汽车数据来拟合一个线性回归模型。我们的因变量是mpg,所有其他变量是自变量。mtcars %>%  head()首先,我们将拟合模型。...(分层)贝叶斯模型R语言Gibbs抽样的贝叶斯简单线性回归仿真分析R语言和STAN,JAGS:用RSTAN,RJAG建立贝叶斯多元线性回归预测选举数据R语言基于copula的贝叶斯分层混合模型的诊断准确性研究...R语言贝叶斯线性回归和多元线性回归构建工资预测模型R语言贝叶斯推断与MCMC:实现Metropolis-Hastings 采样算法示例R语言stan进行基于贝叶斯推断的回归模型R语言中RStan贝叶斯层次模型分析示例

    2.1K00

    R语言广义线性混合模型(GLMM)bootstrap预测置信区间可视化

    对于广义线性混合模型(GLMM),预测函数不允许推导标准误差,原因是:“没有计算预测标准误差的选项,因为很难定义一种有效的方法来将方差参数中的不确定性纳入其中”。...这意味着目前没有办法将拟合的随机效应标准差的估计(其估计值可能或多或少准确)纳入预测值标准误差的计算中。不过,我们仍然可以推导置信区间或预测区间,但需要注意,我们可能会低估估计值的不确定性。...并使用bootMer函数进行了自助法(bootstrap)来估计置信区间。...通常,我们会使用自助法(bootstrap)或者基于模型的近似方法来估计这些区间。...在R中,可以使用bootMer函数(来自lme4包)或predictInterval函数(来自merTools包)来近似计算这些区间。

    25410

    【视频讲解】非参数重采样bootstrap逻辑回归Logistic应用及模型差异Python实现

    视频 逻辑回归在传统线性回归基础上引入 sigmoid 函数,通过假设数据服从特定分布并运用极大似然估计进行参数估计。在众多领域如金融、医学、市场营销和网络安全中,逻辑回归都有着重要应用。...使用 R 语言的 glm 函数,令 link = "logit"。 四、模型结果 thalach 和 oldpeak 在连续型变量中的相关系数最高,均大于 0.4。 模型中的自变量均显著。...(二)缺点 容易受到异常值影响,可能导致参数估计偏差较大。 无法处理复杂的非线性关系。 容易出现过拟合,尤其是在数据量较小或特征较多时。 七、结论 本文深入研究了逻辑回归模型在心脏病预测中的应用。...分析其中一个参数的抽样分布,发现抽样分布的平均值接近使用原始数据集估计的参数,标准差接近 StatsModels 计算的标准误差。...综上所述,在实际应用中应根据具体情况选择合适的方法来计算逻辑回归参数的抽样分布。

    11810

    机器学习集成算法——袋装法和随机森林

    在这篇文章中,您将学习使用袋装集成算法和随机森林算法建立预测模型。阅读这篇文章后,您将学到: 用自助法从样本中估计统计量。 用自助集成算法从单个训练数据集中训练多个不同的模型。...自助法是一种用于从数据样本中估计某个量的强大的统计方法。我们假设这个量是描述性的统计数据,如平均值或标准差。这样有助于我们理解它。 假设我们有一个100个样本值(x),我们希望估计样本均值。...我们可以使用自助法来进行更准确的估计: 多次(如1000次)从数据集中随机采样子样本,各次采样之间是有放回的(可以多次选择相同的值)。 计算每个子样本的均值。...这个方法也可以用来估计其他的统计量,如标准差。它甚至可以估计机器学习算法中的量,如算法学到的系数。 自助集成(袋装法) 自助集成(简称袋装法)是一种简单而强大的集成算法。...您掌握了: 如何从一个数据样本估计统计量。 如何使用袋装法集成来自多个高方差模型的预测。 如何在袋装时调整决策树的结构以降低各预测间的相关性,即随机森林。

    5K60

    入门 | 从PCC到MIC,一文教你如何计算变量之间的相关性

    观察到的相关性可能是由于隐藏的第三个变量的影响,或者完全是偶然的。 也就是说,相关性确实允许基于另一个变量来预测一个变量。有几种方法可以用来估计线性和非线性数据的相关性。我们来看看它们是如何工作的。...皮尔逊相关系数(PCC, 或者 Pearson's r)是一种广泛使用的线性相关性的度量,它通常是很多初级统计课程的第一课。...顺便说一下,一个定义两个向量的 PCC 的更酷的方法来自线性代数。 首先,我们通过从向量各自的值中减去其均值的方法来「集中」向量。...距离相关性不是根据它们与各自平均值的距离来估计两个变量如何共同变化,而是根据与其他点的距离来估计它们是如何共同变化的,从而能更好捕捉变量之间非线性依赖关系。...为了建立 MIC 估计值的置信区间,你可以简单地使用一个像我们之前介绍过的 bootstrap 函数。

    4K60

    空间回归与地理加权_时空地理加权回归对样本量要求

    Local R2 局部的R2,与全局R2的意义是一样的,范围在 0.0 与 1.0 之间,表示局部回归模型与观测所得 y 值的拟合程度。如果值非常低,则表示局部模型性能不佳。...对 Local R2进行地图可视化,可以查看哪些位置 GWR 预测较准确和哪些位置不准确。以便为获知可能在回归模型中丢失的重要变量提供相关线索。...从上面的可视化结果可以看出,采用GWR分析的出来的结果,R2的值相当的高。而且出现的明显的聚集趋势。 Predicted 对因变量的预测值:这些值是由 GWR 计算所得的估计(或拟合)y 值。...不是标准差,标准差的英文是:standard deviation):衡量的是我们在用样本统计量去推断相应的总体参数(常见如均值、方差等)的时候,一种估计的精度。...在这里,这些值用于衡量每个系数估计值的可靠性。标准误与实际系数值相比较小时,这些估计值的可信度会更高。较大标准误差可能表示局部多重共线性存在问题。 Std.

    1.1K20

    R语言混合效应逻辑回归(mixed effects logistic)模型分析肺癌数据|附代码数据

    我们可以使用SE来获得粗略的区间估计。...对于大型数据集或复杂的模型,每个模型的运行需要几分钟,在成千上万的样本上进行估计,很容易需要几个小时或几天。在本页的例子中,我们使用了非常少的样本,但在实践中你会使用更多的样本。...就像在常规的R公式中一样,我们使用+运算符来 "添加 "一个效应。...)和线性混合模型(LMM)R语言基于copula的贝叶斯分层混合模型的诊断准确性研究R语言如何解决线性混合模型中畸形拟合(Singular fit)的问题基于R语言的lmer混合线性回归模型R语言用WinBUGS...软件对学术能力测验建立层次(分层)贝叶斯模型R语言分层线性模型案例R语言用WinBUGS 软件对学术能力测验(SAT)建立分层模型使用SAS,Stata,HLM,R,SPSS和Mplus的分层线性模型

    81900

    R语言混合效应逻辑回归(mixed effects logistic)模型分析肺癌数据|附代码数据

    我们可以使用SE来获得粗略的区间估计。...对于大型数据集或复杂的模型,每个模型的运行需要几分钟,在成千上万的样本上进行估计,很容易需要几个小时或几天。在本页的例子中,我们使用了非常少的样本,但在实践中你会使用更多的样本。...就像在常规的R公式中一样,我们使用+运算符来 "添加 "一个效应。...)和线性混合模型(LMM)R语言基于copula的贝叶斯分层混合模型的诊断准确性研究R语言如何解决线性混合模型中畸形拟合(Singular fit)的问题基于R语言的lmer混合线性回归模型R语言用WinBUGS...软件对学术能力测验建立层次(分层)贝叶斯模型R语言分层线性模型案例R语言用WinBUGS 软件对学术能力测验(SAT)建立分层模型使用SAS,Stata,HLM,R,SPSS和Mplus的分层线性模型

    1.8K50

    R语言线性混合效应模型(固定效应&随机效应)和交互可视化3案例|附代码数据

    在本文中,我们将用R语言对数据进行线性混合效应模型的拟合,然后可视化你的结果 线性混合效应模型是在有随机效应时使用的,随机效应发生在对随机抽样的单位进行多次测量时。...混合效应的线性模型在R命令lme4和lmerTest包中实现。另一个选择是使用nmle包中的lme方法。lme4中用于计算近似自由度的方法比nmle包中的方法更准确一些,特别是在样本量不大的时候。...请注意鱼与鱼之间的预测值是多么的相似。这表明在这项研究中,个体鱼之间的估计差异非常小。 *** 一般来说,在方差分析表中只测试固定效应。使用测试随机效应中没有方差的无效假设是可能的。...在每个实验和持续时间水平的组合中没有很多数据点,所以按组画条形图可能比按组画箱形图更好。 添加线段来连接成对的点。 拟合一个线性混合效应模型 使用的是什么类型的实验设计?...来估计所有固定效应组合的模型拟合平均值。 生成固定效应的方差分析表。哪些项在统计学上是显著的? 默认情况下,lmerTest将使用Type 3的平方和来测试模型项,而不是按顺序(Type 1)。

    1.2K30

    【斯坦福CS229】一文横扫机器学习要点:监督学习、无监督学习、深度学习

    预测类型—下表归纳了不同类型的预测模型 模型类型—下表归纳了不同的模型 符号和概念 假设—记一个假设为 hθ,且是我们选择的一个模型。给定一组输入数据x(i),则模型预测输出为hθ(x(i))。...,那么这类分布可以叫做指数族,也称作正则参数或连结函数,如下所示: 下表是常见的一些指数分布: 广义线性模型的假设—广义线性模型旨在预测一个随机变量y,作为x∈Rn+1的函数,并且以来于以下3个假设:...我们一般不需要知道XX的显式映射,只需要知道K(x,z)的值即可 拉格朗日—我们定义拉格朗日L(w,b)为: 生成学习 生成模型首先尝试通过估计P(x|y)来了解数据是如何生成的,而后我们可以用贝叶斯规则来估计...Boosting—其思想就是结合多个弱学习器,形成一个较强的学习器。 随机森林—在样本和所使用的特征上采用Bootstrap,与决策树不同的是,其可解释性较弱。...结构—关于神经网络架构的描述如下图所示: 记i为网络中的第i层,j为一个层中第j个隐含单元,这有: 激活函数—在隐含单元的末端使用激活函数向模型引入非线性复杂性。

    75310

    【斯坦福CS229】一文横扫机器学习要点:监督学习、无监督学习、深度学习

    预测类型—下表归纳了不同类型的预测模型 模型类型—下表归纳了不同的模型 符号和概念 假设—记一个假设为 hθ,且是我们选择的一个模型。给定一组输入数据x(i),则模型预测输出为hθ(x(i))。...,那么这类分布可以叫做指数族,也称作正则参数或连结函数,如下所示: 下表是常见的一些指数分布: 广义线性模型的假设—广义线性模型旨在预测一个随机变量y,作为x∈Rn+1的函数,并且以来于以下3个假设:...我们一般不需要知道XX的显式映射,只需要知道K(x,z)的值即可 拉格朗日—我们定义拉格朗日L(w,b)为: 生成学习 生成模型首先尝试通过估计P(x|y)来了解数据是如何生成的,而后我们可以用贝叶斯规则来估计...Boosting—其思想就是结合多个弱学习器,形成一个较强的学习器。 随机森林—在样本和所使用的特征上采用Bootstrap,与决策树不同的是,其可解释性较弱。...结构—关于神经网络架构的描述如下图所示: 记i为网络中的第i层,j为一个层中第j个隐含单元,这有: 激活函数—在隐含单元的末端使用激活函数向模型引入非线性复杂性。

    95020

    线性回归模型使用技巧

    线性回归是统计学中最基础且广泛使用的预测模型之一。它通过找到最佳拟合直线(或超平面)来描述因变量(目标变量)与自变量(预测因子)之间的关系。...系数估计:使用梯度下降法或正规方程(当自变量个数较少时)来求解最小化问题,得到最佳的权重β。在掌握线性回归的基础之后,我们可以探索一些高阶使用技巧,以提高模型的准确性和泛化能力。1....集成模型的权重调整在融合模型中,可以为每个子模型分配不同的权重,以强调某些模型的预测结果。...预测区间估计线性回归模型可以提供点预测,但有时我们需要知道预测的不确定性。...结论线性回归模型简单易用,但需注意模型假设、共线性和异常值等问题。在实际应用中,理解这些概念并学会识别和处理潜在问题,将有助于构建更准确的预测模型。

    19610

    R语言线性混合效应模型(固定效应&随机效应)和交互可视化3案例|附代码数据

    在本文中,我们将用R语言对数据进行线性混合效应模型的拟合,然后可视化你的结果 线性混合效应模型是在有随机效应时使用的,随机效应发生在对随机抽样的单位进行多次测量时。...混合效应的线性模型在R命令lme4和lmerTest包中实现。另一个选择是使用nmle包中的lme方法。lme4中用于计算近似自由度的方法比nmle包中的方法更准确一些,特别是在样本量不大的时候。...请注意鱼与鱼之间的预测值是多么的相似。这表明在这项研究中,个体鱼之间的估计差异非常小。 *** 一般来说,在方差分析表中只测试固定效应。使用测试随机效应中没有方差的无效假设是可能的。...在每个实验和持续时间水平的组合中没有很多数据点,所以按组画条形图可能比按组画箱形图更好。 添加线段来连接成对的点。 拟合一个线性混合效应模型 使用的是什么类型的实验设计?...来估计所有固定效应组合的模型拟合平均值。 生成固定效应的方差分析表。哪些项在统计学上是显著的? 默认情况下,lmerTest将使用Type 3的平方和来测试模型项,而不是按顺序(Type 1)。

    1.7K00

    R语言时变向量自回归(TV-VAR)模型分析时间序列和可视化|附代码数据

    对于这种依赖关系,最简单和最流行的模型是一阶向量自回归(VAR)模型,其中当前时间点的每个变量都是由前一个时间点的所有变量(包括其本身)预测的(线性函数)。...所有的局部模型加在一起就构成了时变模型。对于 "局部 "模型,我们的意思是,这些模型主要是基于接近研究时间点的时间点。这是通过在参数估计过程中对观测值进行相应的加权来实现的。...在这里介绍的方法中,我们使用了一个高斯加权函数(也称为核),它是由其标准差(或带宽)定义的。我们将在下面讨论如何选择一个好的带宽参数。...估计的稳定性 与标准模型类似,可以使用bootstrap采样分布来评估时变参数的稳定性。 是否有时间变化? 在某些情况下,可能需要决定一个VAR模型的参数是否具有可靠的时变性。...最后,介绍了如何通过bootstrap法评估估计值的稳定性,以及如何进行假设检验,人们可以用它来选择标准的和时变的VAR模型。

    71810

    R语言线性混合效应模型(固定效应&随机效应)和交互可视化3案例

    p=23050 在本文中,我们将用R语言对数据进行线性混合效应模型的拟合,然后可视化你的结果。 线性混合效应模型是在有随机效应时使用的,随机效应发生在对随机抽样的单位进行多次测量时。...混合效应的线性模型在R命令lme4和lmerTest包中实现。另一个选择是使用nmle包中的lme方法。lme4中用于计算近似自由度的方法比nmle包中的方法更准确一些,特别是在样本量不大的时候。...请注意鱼与鱼之间的预测值是多么的相似。这表明在这项研究中,个体鱼之间的估计差异非常小。 *一般来说,在方差分析表中只测试固定效应。使用测试随机效应中没有方差的无效假设是可能的。...在每个实验和持续时间水平的组合中没有很多数据点,所以按组画条形图可能比按组画箱形图更好。 添加线段来连接成对的点。 拟合一个线性混合效应模型 使用的是什么类型的实验设计?...来估计所有固定效应组合的模型拟合平均值。 生成固定效应的方差分析表。哪些项在统计学上是显著的? 默认情况下,lmerTest将使用Type 3的平方和来测试模型项,而不是按顺序(Type 1)。

    8.8K61
    领券