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R语言ggplot2分组箱线图添加误差线的简单小例子

ggplot2 更改图例的顺序 箱线图添加误差线这个自己老是记不住,每次作图都得现查,今天的推文记录一下实现代码,方便自己以后查看。...收下是读取数据 df<-read.csv("iris.csv") head(df) 宽格式转换为长格式 reshape2::melt(df,id.vars="Species") -> dfa 基本箱线图...0.5)+ scale_fill_material_d()+ theme_bw()+ guides(fill=guide_legend(reverse = T)) image.png 分组箱线图...image.png 这里还有一个疑问是 箱线图中间的线好像是中位数,如何把这个线更改为平均值呢?...暂时没有想明白 今天推文的示例数据和代码可以直接留言20210929获取 欢迎大家关注我的公众号 小明的数据分析笔记本 小明的数据分析笔记本 公众号 主要分享:1、R语言和python做数据分析和数据可视化的简单小例子

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R语言ggplot2分组的小提琴图加箱线图简单小例子

作图是用groups做x轴,type填充颜色,每个group分为A,B两组 作图的时候和普通的箱线图小提琴图是一样的 代码 ggplot(data = df, aes(x = groups, y =...image.png 箱线图的宽度有点大,盖住了背后的小提琴图,把宽度设置的小一点,需要加width参数 ggplot(data = df, aes(x = groups, y = value, fill...欢迎大家关注我的公众号小明的数据分析笔记本 另外还遇到一个问题是 R语言ggplot2作图如果文字标签包含罗马数字,如何输出pdf呢?...image.png 罗马数字就是显示不出来 windows 10 下的字符映射表 win+R快捷键 输入 charmap ?...image.png 写代码有时候还挺无聊的,找一些有意思的代码自娱自乐一下,上面的视频是一个 玫瑰花的代码,大家感兴趣可以自己试一下呀!大家记得关注我的视频号呀!

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  • 您找到你想要的搜索结果了吗?
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    答读者问~ggplot2画图添加拟合方程的R2并且在右上角添加星号表示显著性;只有分位数和中位数数据画箱线图

    简单的小例子 library(extrafont) fonts() ggplot(df,aes(x=A,y=B,color=D))+ geom_point(aes(shape=D),size=10)...+ theme_bw()+ theme(legend.position = "none")+ annotate(geom = "text",x=3,y=8.5,label="小明的数据分析笔记本...image.png 添加拟合方程的R2的写法 ggplot(df,aes(x=A,y=B,color=D))+ geom_point(size=5)+ annotate("text",x=3,y...=7.5, label="atop(R^2==0.9^'***')", parse=T,size=10)+ theme_bw()+ theme(legend.position...image.png 公众号一位读者留言问 自己的数据是经过计算的的只有分位数和中位数的数据,应该如何画箱线图?我自己能想到的一个办法是利用annotate()函数画线段,将其组合成为一个箱子。

    1.3K20

    单变量分析 — 简介和实施

    IQR是Q1和Q3之间的距离,如下所示。 让我们看看一些示例。 问题8: 创建一个箱线图,比较三个培育品种之间的酒精分布。...问题9: 创建一个名为“malic_acid_level”的新列,将“malic_acid”列的值分解为以下三个段落: 从最小值到第33百分位数 从第33百分位数到第66百分位数 从第66百分位数到最大值...然后在每个分层的酒精分布中创建一组箱线图。...问题10: 创建与上一个问题类似的箱线图,但适用于每个培育品种。...作为单变量分析的一部分,我们学会了如何实施频率分析,如何将数据汇总到各种子集/分层中,以及如何利用直方图和箱线图等可视化工具来更好地了解数据的分布。

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    【数据可视化包Matplotlib】Matplotlib基本绘图方法

    # 创建自己的Figure对象,相当于自定义画布 #(通过注释下条语句,观察使用自己的Figure对象的效果) fig = plt.figure(figsize=(12,8)) # 指定画板的宽和高分别为...usermedians:指定中位数的位置,可以是一个数组或者列表,用于指定每个箱线图的中位数位置。...QL称为下四分位数,表示全部观察值中有四分之一的数据取值比它小。 QU称为上四分位数,表示全部观察值中有四分之一的数据取值比它大。...IQR称为四分位数间距,是上四分位数QU与下四分位数QL之差,其间包含了全部观察值的一半。...箱线图依据实际数据绘制,真实、直观地表现出了数据分布的本来面貌,且没有对数据做任何限制性要求,其判断异常值的标准以四分位数和四分位数间距为基础。

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    Matplotlib可视化没那么难:7种常用图表最全绘制攻略来了!

    s:标记大小,可自定义 c:标记颜色,可自定义 marker:标记样式,可自定义 我们通过matplotlib.pyplot模块画一个散点图,如代码清单1所示。...▲图3 折线图 04 饼图 饼图常用于统计学模块中。用于显示一个数据系列中各项的大小与各项总和的比例。饼图中的数据点显示为整个饼图的百分比,饼图的主要参数及其说明如下。...:是否显示异常值 vert:是否需要将箱线图垂直摆放 boxprops:设置箱体的属性,如边框色,填充色等 whis:指定上下须与上下四分位的距离 labels:为箱线图添加标签 positions:指定箱线图的位置...filerprops:设置异常值的属性 widths:指定箱线图的宽度 medianprops:设置中位数的属性 patch_artist:是否填充箱体的颜色 meanprops:设置均值的属性 meanline...▲图7 水平箱形图 07 组合图 前面介绍的都是在figure对象中创建单独的图像,有时候我们需要在同一个画布中创建多个子图或者组合图,此时可以用add_subplot创建一个或多个subplot来创建组合图

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    1行代码完成可视化:Seaborn3个常用方法示例

    数据可视化基本上是数据的图形表示。在探索性数据分析中,可以使用数据可视化来理解变量之间的关系,还可以通过视化数据揭示底层结构或了解数据信息。 有多种工具可以帮助我们创建数据可视化。...只需一行 Seaborn 代码,我们就能够创建最常用的绘图并对其进行自定义,这是我们将在本文中重点介绍的内容。...本文中将使用 Seaborn 的来创建以下绘图: 散点图 折线图 直方图 箱形图 但是,我们将介绍的功能不仅限于这些图,还可以用于创建其他几种图,例如 kde 图、条形图和小提琴图。...箱形图 箱线图是一个分类分布图,显示变量在中位数和四分位数方面的分布。Seaborn 的 catplot 函数可以创建箱形图。...当所有值按升序排序时: 第一个四分位数是找到 25% 数据点的值。 中位数是中间的点。 第三个四分位数是找到 75% 数据点的值。 较高的箱线图表明这些值更加分散。

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    ggplot2|从0开始绘制箱线图

    继续“一图胜千言”系列,箱线图通过绘制观测数据的五数总括,即最小值、下四分位数、中位数、上四分位数以及最大值,描述了变量值的分布情况。...箱线图能够显示出离群点(outlier),通过箱线图能够很容易识别出数据中的异常值。 ? 本文利用R语言的ggplot2包,从头带您绘制各式各样的箱线图。...一 绘制基本的箱线图 载入数据及函数包 library(ggplot2) library(RColorBrewer) dose数值 变成因子变量 ToothGrowth$dose <- as.factor...二 颜色设置 aes(color=)函数为每个箱线图设置一个颜色,划分箱线图之后,可以使用scale_color_*()函数自定义颜色。...三 图例,标题设置 1)设置legeng Legend是对箱线图的解释性描述,默认的位置是在画布的右侧中间位置,可以通过theme()函数修改Legend的位置 p + theme(legend.position

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    R可视化:不一样的ggplot2箱线图

    箱线图(Boxplot)是一种用于展示一组数据分布特征的图形,它能够提供以下信息:中位数:箱线图中的中位线表示数据的中位数。...四分位数:箱线图的箱子部分表示数据的四分位数范围,即25%和75%分位数,这可以展示数据的中间50%的分布情况。异常值:箱线图通常会用点来表示异常值,即那些远离数据主体的值。...最小值和最大值:在某些箱线图中,除了四分位数之外,还会展示最小值和最大值(不包括异常值)。数据的偏斜性:箱线图的形状可以揭示数据的偏斜性。...网格状箱线图patternplot 是一个 R 包,它提供了创建网格状箱线图的功能,这种图表通常用于展示多个组别或条件下的数据分布。...stat_boxplot(geom = "errorbar", width = 0.15):添加一个箱线图的统计变换,这里使用 errorbar 几何对象,宽度设置为 0.15,这可能是用来表示箱线图的中位数线或四分位数范围的误差条

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    箱线图的生物学含义

    ”指标(如均数、中位数、标准差、四分位数等),还得关注原始数据的分布形式。...2.箱线图的组成 箱形图使用第25,50和75百分位数(也称为下四分位数(Q1),中位数(m或Q2)和上四分位数(Q3),以及四分位数范围(IQR = Q3-Q1,涵盖50%的中央数据)来反映样本的分布...其次,一些软件如R使用铰链hinges而非四分位数来作为箱边界,下铰链和上铰链分别是数据下半部分和上半部分的中位值,这种箱线图与基于四分位数的箱线图略有不同。...图b是直方图和箱线图、几种类箱线图可视化的比较,条形图通常仅展示了平均值和标准差,箱线图从下往上,依次展示了数据集的五个指标:最小值,小四分位数,中位数,上四分位数和最大值。...箱线图利用摘要统计指标(中位数和四分位数)和主要数据(四分位数内的50%的数据)的分布。箱形图可以展示任何数据集的最小值,下四分位数,中位数,上四分位数和最大值,可以反映数据集的分布和差异。

    4.1K60

    这3个Seaborn函数可以搞定90%的可视化任务

    Relplot relplot函数用于创建关系图,即线图和散点图。这些图提供了变量之间关系的概述。 让我们首先创建单位价格和总数列的散点图。我们指定数据和列名。kind参数用于选择绘图类型。...现在我们可以创建直线图了。...我们可以使用displot函数创建直方图,kde图,ecdf图和rugplots。 直方图将数值变量的取值范围划分为离散的容器,并计算每个容器中的数据点(即行)的数量。...Catplot 使用catplot函数创建分类图,如箱形图、条形图、带状图、小提琴图等。总共有8个不同的分类图可以使用catplot函数生成。 箱形图用中位数和四分位数表示变量的分布。...“width”参数调整框的宽度。 以下是箱形图的结构: ? 中位数是所有点都排序后的中间点。Q1(第一或下四分位数)是下半部分的中位数,Q3(第三或上四分位数)是上半部分的中位数。

    1.3K20

    可视化之为什么要使用箱线图?

    统计图就是用把数据映射到几何形状如点、线、柱的美学属性如颜色、大小、形状上。这是理解图的关键,也是画图的关键。 对于箱线图也是如此 。 箱线图,顾明思义,是形状像箱子并展示一组或多组数据分布的统计图。...通常从箱线图可以直观看出一组数据的四分位数。...以下面水平箱线图为例(如果是垂直箱线图,则把下图逆时针旋转90度): 首先看箱体: 左边线代表下四分位数(第一四分位数,Q1),表示整体数据中有25%的数据少于该值; 右边线代表上四分位数(第三四分位数...但第一组数据和第四组数据因为四分位数的统计值相当,仅用箱线图看不出来两组数据的分布是否差别很大; 小提琴图(Violin plot)展示数据分布的概率密度。...箱线图绘制方法 R语言学习 - 箱线图(小提琴图、抖动图、区域散点图) R语言 - 箱线图一步法 ggplot2高效实用指南 (可视化脚本、工具、套路、配色) 推荐使用功能强大的在线绘图网站-ImageGP

    2.7K31

    Python数据清洗--异常值识别与处理01

    异常值的识别 通常,异常值的识别可以借助于图形法(如箱线图、正态分布图)和建模法(如线性回归、聚类算法、K近邻算法),在本期内容中,将分享两种图形法,在下一期将分享基于模型识别异常值的方法。...箱线图法 箱线图技术实际上就是利用数据的分位数识别其中的异常点,该图形属于典型的统计图形,在学术界和工业界都得到广泛的应用。箱线图的形状特征如下图所示: ?...(r'C:\Users\Administrator\Desktop\sunspots.csv') # 绘制箱线图(1.5倍的四分位差,如需绘制3倍的四分位差,只需调整whis参数) plt.boxplot...如上图所示,利用matplotlib子模块pyplot中的boxplot函数可以非常方便地绘制箱线图,其中左图的上下须设定为1.5倍的四分位差,右图的上下须设定为3倍的四分位差。...尽管基于箱线图的分位数法和基于正态分布的参考线法都可以实现异常值和极端异常值的识别,但是在实际应用中,需要有针对性的选择。

    10.4K32

    Python 数据可视化入门-使用 Matplotlib 绘制基础与高级图表

    Python 数据可视化入门-使用 Matplotlib 绘制基础与高级图表数据可视化是数据分析中至关重要的一部分。通过可视化,我们可以更直观地理解数据中的模式、趋势和异常。...3.1 箱线图箱线图用于展示数据分布的统计特性,例如中位数、四分位数和异常值。它特别适用于比较多个数据集的分布情况。...5.3 交互式小部件使用 matplotlib.widgets 模块,我们可以创建交互式小部件(如滑块、按钮)来控制图表的显示。...总结在这篇文章中,我们探讨了如何使用 Matplotlib 创建各种类型的基本数据可视化图表,从简单的折线图到复杂的动态和交互式图表。...直方图: 用于展示数据的分布情况。密度图: 用于展示数据的分布密度。高级图表类型:箱线图: 显示数据的分布特性,如中位数、四分位数和异常值。热力图: 展示矩阵数据的强度或密度。

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    Python-matplotlib 箱线图绘制

    箱线图基本介绍 箱线图,又称箱形图(boxplot)或盒式图,不同于一般的折线图、柱状图或饼图等图表,其包含一些统计学的均值、分位数、极值等统计量,该图信息量较大,不仅能够分析不同类别数据平均水平差异...(以上图来源于网络,如侵权,望告知,删除) 03. matplotlib绘制 Matplotlib 中绘制箱线图的函数为 boxplot (),但要想进行定制化绘制需求,则需设置较多的绘图参数,boxplot...whis 指定上下须与上下四分位的距离 positions 指定箱线图的位置 widths...设置中位数的属性 meanprops 设置均值的属性 capprops 设置箱线图顶端和末端线条的属性 whiskerprops 设置须的属性 2.1 数据...总结 本期推文就箱线图(boxplot)进行了matplotlib和seaborn的绘制推文介绍,当然,在添加误差等绘图特征时,可能可R还有一定差距。本人能力有限,如发现错误,后台告知或加群讨论啊

    4.3K10

    从箱线图到统计指标表

    箱线图是一种用于显示一组数据分散情况资料的统计图,包括最大值、最小值、中位数、上四分位数(Q3,75th percentile)和下四分位数(Q1,25th percentile)。...在基因表达分析中,箱线图可以用来显示不同组(例如,疾病组和对照组)中基因的表达水平。箱线图的中位线表示基因在每个组中的中位表达水平,箱子的上下边界表示上四分位数和下四分位数,即表达水平的分布范围。...在比较两组数据时,我们通常关注的是中位数(即箱线图的中线)是否有显著差异,以及数据的分布是否不同。如果两个组的箱线图有显著的差异,这可能表明基因在这两个组中的表达有显著差异。...因此,在评估模型性能时,通常需要结合其他指标,如精确率、召回率、F1分数等,来进行全面的评估。 ---- 起码从R的角度来说,箱线图直接到ROC曲线,顺便计算得到AUC值是很容易的。...同样的,我也是让chatGPT做了一下:使用R代码举例一个差异分析,并且绘制ROC曲线和表达量差异箱线图 ---- 以下是一个使用R进行差异分析、绘制ROC曲线和箱线图的示例。

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    【科研猫·绘图】优雅版·小提琴图(带R代码分享)

    课前准备,R语言的安装和配置都OK了吗?生物信息系列课程-R语言入门;挖掘GEO速成SCI文章系列教程(3)-R语言基础。...小板凳排排坐,飞飞老师要开课~ 上次教程中,我们从最常用的一个图形入手:箱线图。给大家讲解并绘制了箱线图,画出来的图是这样子的。 ?...昨天的箱线图出来后,很多同学觉得还不够过瘾,想知道有没有更炫酷的画法来表征不同组别间的统计数据呢,当然有! 今天就教大家来画一种非常知性优雅(一眼万年那种的~)的图形:小提琴图。...解读:小提琴图是【箱线图】与【核密度图】的结合,箱线图展示了分位数的位置,核密度图则展示了任意位置的密度,通过小提琴图可以知道哪些位置的数据点聚集的较多,因其形似小提琴而得名。...如下图所示,其外围的曲线宽度代表数据点分布的密度,中间的箱线图则和普通箱线图表征的意义是一样的,代表着中位数、上下分位数、极差等。 ?

    5.3K12

    R基础知识及快速检阅你的数据

    A:R中的包是一些为了便于分发而封装在一起的函数,数据的集合。安装包就可以扩展R的功能。...ggplot2创建绘图对象,将数据框传递给该函数,并设置x,y #第二部分geom_point()对图像中加一层点 2.2绘制折线图 Q: 如何绘制折线图?...boxplot:当箱线图分布值长度为奇数时,箱线图的下,上边缘分别为一分位和三分位。若为偶数则有余数决定。只有任意n/4的余数为1或者2,那么分位数等于观察值,否则则为两观察值的中间数。...et al (1978, p. 16) ggplot:箱线图的下边缘与上边缘分别对应着一分位与三分位(25%,75%)。...异常值为大于以及小于箱线图上下边缘IQR*1.5的位置。若notch = TRUE则更重视中位数之间的比较,公式为: 2.6绘制函数图像 Q: 如何绘制函数图像?

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    利用箱线图巧剔异常值

    每个研究生都盼望着“天天有数据,年年发文章”,但有时候我们会发现实验数据中存在一些不合理的值。剔除这些异常值的办法有很多,在这里小编教大家使用箱线图剔除异常值。...使用箱线图剔除异常值的标准很简单,超出箱线图上限和下限的值即为异常值。 那什么是箱线图的上限和下限呢?首先让我们来理解几个概念。 上四分位数(Q1):所有数值由小到大排列后位于第75%位置的数字。...下四分位数(Q3):所有数值由小到大排列后位于第25%位置的数字。 四分位间距(IQR):上四分位数减下四分位数。(Q1-Q3) ? 上限即为非异常值范围内的最大值。...(Q1+1.5*IQR) 下限即为非异常值范围内的最小值。(Q3-1.5*IQR) 根据上述箱形图剔除异常值的标准,小编写了一个脚本,可以快速去除异常值。...输入文件为以“tab”为分隔符的文本文件。第一列为样本名称,第二列为数值。 ? ## 该脚本须在Linux环境下使用,并安装有Python及R语言 sh ./run_pipline.sh .

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