数据框数据框的创建数据框来源主要包括用代码新建(data.frame)，由已有数据转换或处理得到(取子集、运算、合并等操作)，读取表格文件(read.csv,read.table等)及R语言内置数据函数...data.frame生成指定数据框的列名及列的内容，如代码所示，此时列名不需添加""，df1为变量名，格式为列名=列的向量*matrix矩阵与向量一样只允许同一种数据类型，否则会被转换，可以理解为二维的向量...#取子集方法同数据框t(m) #转置行与列，数据框转置后为矩阵as.data.frame(m) #将矩阵转换为数据框列表列表内有多个数据框或矩阵，可通过list函数将其组成一个列表l <- list(m1...不支持l$m1 #取出名为m1的成分变量的删除rm(l) #删除列表lrm(df1,df2) #删除变量df1与df2rm(list = ls()) #清空所有变量附作业答案及解释# 练习3-1# 1...2倍的标准差，并写出用户使用该函数的代码 。
前文我们讲到R处理数据面对的6种对象：向量，矩阵，数组，因子，列表，数据框。 A. 那我们就得好好给大家介绍一下这位能者的6个对象都长什么样子了。...许多R的内置函数计算结果不仅仅是一个向量，因此以列表的形式返回结果。可以理解为二维不规则数据。...· 6.数据框 · 到最后一个对象了，在其他统计软件包中，数据框被称为“数据矩阵”或“数据集”，他是一系列等长度的向量和/或因子，交叉相关，很适合数据收集的类型。...，可以直接使用变量名如： > d$age [1] 42 38 26 #Tips：数据框的感觉就像每一行代表一个单位，每一列代表一项属性，因此每列内部数据类型一致，而列间数据类型可能不同。...· 之前我们提到数据框提取向量，使用d$age来提取d中的age变量。
数据框 data.frame 数据框 约等于表格：1.数据框不是一个具体文件，只是R语言内部的一个数据；2.数据框每一列只能有一种数据类型 图片 新建和读取数据框 #新建和读取数据框 df1 <- data.frame...df1) #输出行名 colnames(df1) #输出列名 数据框取子集 数据主要操作为按列取子集，取出来的为向量；按行去子集取出的仍为数据框。..."r2","r3","r4") #只修改某一行/列的名 colnames(df1)[2] <- "CHANGE" # | 或符号前后不可以连接字符，只能用于数字，逻辑值 两个数据框的连接 test1 <...= matrix(1:9, nrow = 3), m2 = matrix(2:9, nrow = 2)) l l[[2]] #列表取子集 l$m1 #列表中的元素有名字，可以用...(scores)[scores>60] 删除变量 rm(l) #删除一个变量 rm(df1,df2) #删除多个变量 rm(list = ls()) #删除全部变量 图片
安装R和RStudio R的安装 从R project网站的CRAN中找到MacOS版本下载链接下载安装包。...R语言汇集大量函数和软件，可以提供强大的功能，在生信数据分析中应用最为广泛，是生信工作者需要掌握的最基本的编程语言。..._ rnorm(n, mean=x, sd=y)#生成n个平均数为x，标准差为y的随机数 runif(n, min=x, max=y)#生成n个x(最小数)到y(最大数)的服从均匀分布的随机数 boxplot...(iris$Sepal.Length~iris$Species,col = c("lightblue","lightyellow","lightpink")) 作箱线图，iris是R自带的示例数据框。...iris$Sepal.Length表示iris数据框的Sepal.Length这一列数据。另外可设置箱体的颜色。 内容参考微信公众号 生信星球，自己实践总结。
）R语言的命令提示符是 “>” 集成开发环境 图形界面（给简陋的R语言披上了好看的外衣） 开源免费 1.3 如何在R Studio中新建项目（管理工作目录的最佳方式，setwd也可以，但是这个更简单）...1.4 新建脚本（一个装代码的文件） 步骤：file > new file > R script 1.5 RStudio 介绍 脚本编辑器、控制台（代码运行和结果显示）、environment（对象/变量列表...批量的数据如何组织？了解数据结构的概念 1.1 数据结构包括四类：向量，数据框，矩阵，列表 注意： （1）数据框约等于”表格“，不是完全等于表格。...因为数据框不是电脑上的一个真实文件，并且要求每一列只能有一种数据类型。但是数据框可以导出，可以导出为一个表格。 ...（2）数据框单独拿出的一列是向量（也是一串同一个类型的数据），视为一个整体。 （3）一个向量只能有一种数据类型，可以有重复值。
Stan与最流行的数据分析语言，如R、Python、shell、MATLAB、Julia和Stata的接口。我们将专注于在R中使用Stan。rstanrstan允许R用户实现贝叶斯模型。...一个包含公式中变量的数据框。此外，还有一个可选的先验参数，它允许你改变默认的先验分布。stan()函数读取和编译你的stan代码，并在你的数据集上拟合模型。stan()函数有两个必要参数。文件。...包含你的Stan程序的.stan文件的路径。data。一个命名的列表，提供模型的数据。例子作为一个简单的例子来演示如何在这些包中指定一个模型，我们将使用汽车数据来拟合一个线性回归模型。...在这里，我们指定目标变量具有正态分布，其平均值为α+X*β，标准差为sigma。在这个块中，你还可以指定参数的先验分布。默认情况下，参数被赋予平坦的（非信息性）先验。...stan()函数要求将数据作为一个命名的列表传入，其中的元素是你在数据块中定义的变量。对于这个程序，我们创建一个元素为N、K、X和Y的列表。
2.Rstudio的基本设置设置字体大小图片图片创建工作目录(Rproject)图片图片图片图片3.R语言基础显示文件列表dir() 或 list.files()图片基本运算图片赋值R语言的赋值符号为<...初级绘图R语言的基础绘图系统主要由基础包graphics提供，它包含了各式的图形绘制函数，如折线图、直方图、箱形图等。其中plot()函数主要用于绘制散点图和折线图。...，y可以省略x相当于自变量，y相当于因变量；y没缺省时，必须和x同长度，类型是可以向量化的数据结构，如向量、矩阵的行或列、数组的元素、数据框的列、列表的元素等；y缺省时，x为单列时，y默认为c(1:n)...，其中n为x的长度，x为y轴；y缺省时，x为两列的矩阵或数据框，则该矩阵或数据框的第一、二列分别对应自变量和因变量；y缺省时，x为三列及以上的矩阵时，则该矩阵的第一、二列分别对应自变量和因变量，其他列忽略...；y缺省时，x为三列及以上的数据框时，则绘制各列两两之间的关系。
rnorm(50): 这部分代码生成了一个包含50个随机数的向量，这些随机数来自标准正态分布（均值为0，标准差为1）。 plot(...): plot 函数在R语言中用于绘制图形。...iris是一个R语言自带的数据框，通常用作示例。iris$Sepal.Length表示iris数据框的Sepal.Length这一列数据。...小心得：作图说简单也简单，只需要知道图的名字，知道用的什么R包即可自行探索；说难也难，别人的代码套在自己的数据上，需要一定的R语言功底和解决报错的能力。...（2）打开project 在文件夹中找到这个R project，双击打开即可。...2、显示文件列表 dir()orlist.files() 3、基本运算 赋值<-或者按键Alt加上减号 x<- 1+2 意思是把1+2的运算结果赋值给x，赋值后，x会显示在右上角的框（Environment
，后续的参数是条件，这些条件是需要同时满足的，另外，条件中取 缺失值的观测自动放弃，这一点与直接在数据框的行下标中用逻辑下标有所不同，逻辑下标中有缺失值会在结果中 产生缺失值。...2.8 mutate 可以为数据框计算新变量，返回含有新变量以及原变量的新数据框： mutate(test, new = Sepal.Length * Sepal.Width) > head(test,...比如，需要对 cancer 数据集中 v0 和 v1 两个变量同时计算平均值和标准差: 显然，如果有许多变量要计算不止一个统计量，就需要人为地将每一个变量的每一个统计量单独命名。...nest 与unnest 对于数据框，我们可以使用split 将数据框按某列拆分为多个数据框，并储存在列表中。...实际上，tibble 允许存在数据类型是列表 (list) 的列，子数据框就是以列表数据类型保存在 tibble 的一列中的。
Sepal.Length的平均值和标准差 先按照Species分组，计算每组Sepal.Length的平均值和标准差 group_by(test, Species) summarise(group_by...最终的结果将是一个新的数据框，其中包含了每个不同Species值的平均Sepal.Length和标准差Sepal.Length。...数据框是R语言中类似于表格的二维数组结构，每一列包含了一个变量的值，每一行包含了每个变量的一个值集。...test1 <-: 这是R语言中的赋值操作符，用于将data.frame()函数创建的数据框赋值给变量test1。...结果将是一个新的数据框，其中包含了test1中那些在test2中找到匹配项的行，而不包含在test2中找不到匹配项的行。这种操作通常用于数据集的筛选，以保留与另一个数据集相关的数据。
①当处理分组数据的时候，你会希望得到一些按组别分类计算的不同统计量，比如均值和标准差等形成的一张表格。这里可以使用tapply()函数。...前一个类似tapply()，只是它对整个数据框操作并且把结果作为一个数据框显示。同时显示多个变量是很有用的。...列表元素的名称通常作为输出结果列的名称。由于函数应用于整个数据框，所以可以选择数据框的子集进行运算，这里是选择了数值变量。...#Tips：其中list()里等号左边的sex只是命名，可以省去，并且分组参数，可以使用juul[“sex”]来代替list(sex=juul$sex)，效果是一样的。数据框类似于列表。...by()函数也是类似的，不同之处在于函数by()只能把整个数据框作为它的变量，不能使用mean，sd等函数，但是可以通过不同分组汇总。
一、安装R（基础）和Rstudio（人性化一些的界面）1、按要求安装R和Rstudio二、练习1、练习plot(rnorm(50))生成一个散点图，其中的数据是由函数rnorm(50)生成的。...rnorm(50)函数会生成 50个符合标准正态分布（均值为 0，标准差为 1）的随机数。...2、练习boxplot(iris$Sepal.Length~iris$Species,col = c("lightblue","lightyellow","lightpink"))注：iris是一个R语言自带的数据框...iris$Sepal.Length表示iris数据框的Sepal.Length这一列数据。以此类推。...+6】意思是把6+6的运算结果赋值给x， 赋值后，x会显示在右上角的框，Environment里的Value列表里 4、删除变量【rm()]5、历史命令【history()】6、清空控制台
factor(ht, labels = c("no", "yes")), ui = factor(ui, labels = c("no", "yes"))) str(birthwt) 获取数据框里每个变量的常用统计量是一种快速探索数据集的方法...对于数值型变量，如 age、lwt、plt、ftv 和 bwt，函数 summary( )给出最小值、下四分位数、中位数、均值、上四分位数和最大值；对于分类变量，如 low、race、smoke、ht...epiDisplay 包的函数 summ( )作用于数据框可以得到另一种格式的汇总输出，它将变量按行排列，把最小值和最大值放在最后两列以方便查看数据的全距。...( )同时计算数据框中多个变量的指定统计量。...例如，计算数据框 cont.vars 中各个变量的样本标准差： sapply(cont.vars, sd) 基本包中没有提供计算偏度和峰度的函数，我们可以根据公式自己计算，也可以调用其他包里的函数计算，
数据统计描述与列联表分析是数据分析人员需要掌握的基础核心技能，R语言与Python作为优秀的数据分析工具，在数值型数据的描述，类别型变量的交叉分析方面，提供了诸多备选方法。...这里根据我们平时对于数据结构的分类习惯，按照数值型和类别型变量分别给大家盘点一下R与Python中那些简单使用的分析函数。...以上透视表是针对数值型变量的分组聚合，那么针对类别型变量则需要使用pandas中的交叉表函数进行列表分析。...事实上，crosstab似乎同时也能兼容透视表的完整功能，但是奇怪的是透视表提供了数据框名称参数，指定参数时无需声明数据框名称，而且行列字段都可指定列表对象（二维以上，指定多个 字段），但是交叉表则没有给出数据框名称向量...，这样 内部参数又限定在数组和序列、列表内，因而指定参数时，只能带着数据框前缀，指定单个序列，对此不是很理解。
dplyr示例数据test % select(1:3)# 筛选iris数据集的第一到第三列...2：count统计某列的unique值count(test,Species)分类变量每个变量值的频数dplyr处理关系数据将2个表进行连接1.內连inner_join,取交集inner_join(test1..., test2, by = "x")满足两个条件：有相同变量名，相同变量名的列里有相同元素；2.左连left_join列表书写顺序决定了最终合成列表中列的顺序left_join(test1, test2...= 'x')6.简单合并bind_rows(test1,test2)函数需要两个表格列数相同bind_cols(test1,test2)函数则需要两个数据框有相同的行数思维导图生信星球打卡任务，菜鸟一枚
本文介绍基于R语言中的GD包，依据栅格影像数据，实现自变量最优离散化方法选取与执行，并进行地理探测器（Geodetector）操作的方法。 ...其中，geodetector包是地理探测器模型的原作者团队开发的，其需要保证输入的自变量数据已经全部为类别数据；其具体操作方法大家可以参考栅格数据实现地理探测器：基于R语言geodetector包。...2 数据读取与预处理 接下来，我们需要读取栅格图像数据，并将其转为GD包可以识别的数据框（Data Frames）格式。 ...5类、6类，以此类推，一直到10类，从其中找到最优结果对应的类别数量。 ...+相连接；第二个参数表示自变量中的连续变量，程序将自动对这些连续变量加以离散化方法寻优与执行；第三个参数表示存储自变量与因变量数据的数据框（Data Frames）格式的变量；最后两个变量，即为前面我们选择的离散化方法与类别数量
数据框要求每一列只能有一种数据类型，且数据框只是R语言内部的一个数据，不是一个文件。- 数据框单独拿出来的一列是一个向量，视为一个整体。一个向量可以出自数据框的一列，也可以用代码生成。...见R_01项目中02_exercise.R练习第6题。> # 6.向量g中有多少个元素在向量s中存在(要求用函数计算出具体个数)？...），如：boxplot(y~g1:g2)。...每列只允许一种数据类型，各列间的数据类型可以不相同。I.数据框的来源用代码新建由已有的数据转换或处理得到读取表格文件R语言内置数据什么是热图？热图是用颜色的深浅来表示数值的大小。...如上例中，取出的子集是矩阵。若用1个中括号，取出来的子集数据结构仍然是列表，内容虽然一致。
library(dplyr）dplyr五个基础函数mutate(),新增列——mutate(test, new = Sepal.Length*Sepal.Width)要修改的数据框的名称将创建的新变量的名称将分配给新变量的值...%in% c("setosa","versicolor"))#筛选test中有"setosa","versicolor"的行arrange(),按某1列或某几列对整个表格进行排序arrange(test...分组并汇总summarise(group_by(test,Species),mean(Sepal.Length),sd(Sepal.Length))#按照Species分组，计算每组Sepal.Length的平均值和标准差并汇总...) %>% summarise(mean(Sepal.Length), sd(Sepal.Length))count统计某列的unique值count(test,Species)dplyr处理关系数据...test2, y = test1, by = 'x')简单合并bind_rows()函数需要两个表格列数相同bind_cols()函数则需要两个数据框有相同的行图片
下面介绍 R 中用于存储数据的多种数据结构。 R 的数据结构 在大多数情况下，结构化的数据是一个由很多行和很多列组成的数据集。在 R 中，这种数据集被称为数据框。...名义型变量是没有顺序关系的分类变量，例如人的性别、血型、民族等。而有序型变量是有层级和顺序关系的分类变量，如患者的病情（较差、好转、很好）。名义型变量和有序型变量在 R 中称为因子（factor）。...1.6 数据框 数据框（dataframe）是一个由行和列组成的二维结构，其中行表示观测（observation）或记录（record），列表示变量（variable）或指标（indicator）。...数据框与 Excel、SAS 和SPSS 中的数据集类似。数据框看起来与矩阵很相似，而且矩阵的很多操作也适用于数据框，如子集的选择。...，要显示或使用数据框的某一变量（列），可以使用 $ 符号加上变量名。
问题 如何使用R软件计算下列统计量：均值、中位数、标准差、方差、协方差和相关系数。...R软件中，用简单的函数便能完成标准差和其他基本统计量的计算。...对于R软件返回的结果你应该慎重地考虑：数据中的缺失值是否会严重影响统计结果？...) [1] 1.4 > sd(x, na.rm=TRUE) [1] 1.140175 mean函数和sd函数能巧妙地处理数据框数据，自动将数据框中的每一列认为是不同的变量，并对每列数据分别进行计算。...（一般地，R软件会以一个包含三个元素的向量返回结果，其中每个元素的names属性由数据框中各个列的名称得来）。
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