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R包reshape2 |轻松实现长、宽数据表格转换

长数据矩阵中一列代表变量类型，另外一列表示对用的变量值。...用month + day ~ variable告诉dcast月份和日期是变量，转换成的长数据与原始数据除了变量列的序号不一样，其他都一致。...蓝色阴影表示我们想要表示的各个行的ID变量，红色表示想要转换成列名的变量名，灰色表示要在单元格中填充的数据。...使用dplyr进行数据操作30例 交集intersect、并集union、找不同setdiff R包reshape2，轻松实现长、宽数据表格转换 1数据类型（向量、数组、矩阵、 列表和数据框） 2读写数据所需的主要函数...、与外部环境交互 3数据筛选——提取对象的子集 4向量、矩阵的数学运算 5控制结构 6函数及作用域 7认识循环函数lapply和sapply 8分解数据框split和查看对象str 9模拟—随机数、抽样

10.7K12

R语言的数据结构与转换

下面介绍 R 中用于存储数据的多种数据结构。 R 的数据结构 在大多数情况下，结构化的数据是一个由很多行和很多列组成的数据集。在 R 中，这种数据集被称为数据框。...名义型变量是没有顺序关系的分类变量，例如人的性别、血型、民族等。而有序型变量是有层级和顺序关系的分类变量，如患者的病情（较差、好转、很好）。名义型变量和有序型变量在 R 中称为因子（factor）。...常见的矩阵运算都可以在R 中实现，如矩阵加法、矩阵乘法、求逆矩阵、矩阵转置、求方阵的行列式、求方阵的特征值和特征向量等。...数据框与 Excel、SAS 和SPSS 中的数据集类似。数据框看起来与矩阵很相似，而且矩阵的很多操作也适用于数据框，如子集的选择。...，要显示或使用数据框的某一变量（列），可以使用 $ 符号加上变量名。

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Day5-橙子

R语言中的数据框可以理解为表格；表格在R语言中称为数据框函数/命令：不要机械复制，理解才会用；?read.table调出对应文档，example部分 ?+函数名称 如 save() ?...或 字符串（chr）标量：一个元素组成的变量向量：多个元素组成的变量 #一个向量作为数据框中的一列x<- c(1,2,3) #常用的向量写法，意为将x定义为由元素1，2，3组成的向量。...RData时的加载命令在R中，像a这样的变量可以表示各种类型的数据结构，包括但不限于：数据框(Data Frames)：如你的例子所示，a是一个数据框，它是一种具有行和列的表格数据结构。...当你使用save()将a保存到文件时，R会将整个对象a以及其结构和数据保存到文件中，无论a是数据框、矩阵、列表或任何其他受支持的数据类型。...（优秀写法，支持Tab自动补全，不过只能提取一列）直接使用数据框中的变量iris是R语言的内置数据，可以直接使用。

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Day4：R语言课程（向量和因子取子集）

2.检查数据结构 R有很多基本函数可用于检查数据并对其进行汇总。以测试数据metadata为例。 输入变量名metadata，回车来查看数据框; 变量中包含样本信息。...数据框和矩阵变量： `dim()`：返回数据集的维度 `nrow()`：返回数据集中的行数 `ncol()`：返回数据集中的列数 `rownames()`：返回数据集中的行名称 `colnames()`...数据框或矩阵只是组合在一起的向量集合。因此，从向量开始，学习如何访问不同的元素，然后将这些概念扩展到数据框。...编程语言如Fortran，MATLAB和R从1开始计数，符合人类的思维模式。C系列中的语言（包括C ++，Java，Perl和Python）从0开始计算，因为这对计算机来说更简单。...仍以age向量为例： age 想知道age向量中的每个元素是否大于50，可以使用： age > 50 返回的是具有与age相同长度的逻辑值的向量，其中TRUE和FALSE值指示向量中的每个元素是否大于

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R语言入门系列之一

在R中对象（object）是指可以赋值给变量（variable）的任何事物，在R语言中使用对象来存储数据也即储存变量，对象类型有标量、向量、矩阵、数组、数据框、列表。...1.2矩阵与数组 矩阵（matrix）是一个二维数组，矩阵内所有元素必须具有相同的模式（数值型、字符型、逻辑型），矩阵可以使用向量、数据框等数据赋值转换，方法如下所示： matrix(vector, nrow...数据框元素索引有三种方法，第一种为通过列的序号索引，第二种通过列名字索引，第三种通过$变量名索引，如下所示： 可以使用attach()函数来将数据框添加到当前平台，这样就可以直接使用列名字或变量名来调用数据框中的数据...类别（名义型）变量和有序变量在R中称为因子（factor）。...由于因子的存在，数据分组信息等都可以转换为一个变量，从而使得数据框可以存储远多于矩阵的数据。 1.4列表 列表（list）是R中最复杂的一种数据类型。

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（数据科学学习手札58）在R中处理有缺失值数据的高级方法

一、简介 　　在实际工作中，遇到数据中带有缺失值是非常常见的现象，简单粗暴的做法如直接删除包含缺失值的记录、删除缺失值比例过大的变量、用0填充缺失值等，但这些做法会很大程度上影响原始数据的分布或者浪费来之不易的数据信息...中的matshow，VIM包中的matrixplot将数据框或矩阵中数据的缺失及数值分布以色彩的形式展现出来，下面是利用matrixplot对R中自带的airquality数据集进行可视化的效果： rm...如上图所示，通过marginplot传入二维数据框，这里选择airquality中包含缺失值的前两列变量，其中左侧对应变量Solar.R的红色箱线图代表与Ozone缺失值对应的Solar.R未缺失数据的分布情况...，若m=1，则唯一的矩阵就是插补的结果； method: 这个参数控制了传入数据框中每一个变量对应的插补方式，无缺失值的变量对应的为空字符串，带有缺失值的变量默认方法为"pmm"，即均值插补 predictorMatrix...前面mice函数输出的结果 action: 当只希望从合成出的m个数据框中取得某个单独的数据框时，可以设置action参数，如action=3便代表取得m个数据框中的第3个 mild: 逻辑型变量，当为

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R语言入门

R语言中的基本数据类型（模式）包括数值型、字符型、逻辑型（TRUE/FALSE）、复数型（虚数）和原生型（字节）。 R拥有许多用于存储数据的对象类型，包括标量、向量、矩阵、数组、数据框和列表。...如上所示，创建了一个4行5列的矩阵，矩阵中的元素按照行填充，分表定义了行名、列名。 我们可以使用下标和方括号来选择矩阵中的行、 列或元素。...像矩阵一样，数组中的数据也只能拥有一种数据类型。 4、数据框 数据框可用来存储下图格式，不同的列可以包含不同的数据。数据框是R中最常处理的数据结构。...可以使用（如矩阵中的）下标记号，亦可直接指定列名，或是使用$符号，如下例： 5、因子 变量可归结为名义型、有序型或连续型变量。名义型变量是没有顺序之分的类别变量。...连续型变量可以呈现为某个范围内的任意值，并同时表示了顺序和数量。年龄Age就是一个连续型变量。 类别（名义型）变量和有序类别（有序型）变量在R中称为因子（factor）。

2.1K30

生信星球学习小组-Day4学习笔记--R语言基础

-x <- 1 + 4 # 将1+4的值赋值给变量 x输入后会在Rstudio右上角框框Environment中显示，在控制台中输入x，回车后就会显示1+4的值，即5。...初级绘图R语言的基础绘图系统主要由基础包graphics提供，它包含了各式的图形绘制函数，如折线图、直方图、箱形图等。其中plot()函数主要用于绘制散点图和折线图。...分别是绘图点的横纵坐标，y可以省略x相当于自变量，y相当于因变量；y没缺省时，必须和x同长度，类型是可以向量化的数据结构，如向量、矩阵的行或列、数组的元素、数据框的列、列表的元素等；y缺省时，x为单列时...，y默认为c(1:n)，其中n为x的长度，x为y轴；y缺省时，x为两列的矩阵或数据框，则该矩阵或数据框的第一、二列分别对应自变量和因变量；y缺省时，x为三列及以上的矩阵时，则该矩阵的第一、二列分别对应自变量和因变量...Sepal.Length这一列数据，iris$Species则表示iris数据框的Species这一列数据iris$Sepal.Length~iris$Species意思就是Species这一列数据中不同类别数据对应的

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R语言 数据框、矩阵、列表的创建、修改、导出

data.frame生成指定数据框的列名及列的内容，如代码所示，此时列名不需添加""，df1为变量名，格式为列名=列的向量*matrix矩阵与向量一样只允许同一种数据类型，否则会被转换，可以理解为二维的向量...，data.frame数据框允许不同列不同的数据类型，但同一列只允许一种数据类型*数据框中括号内行在列前df1 <- data.frame(gene = paste0("gene",1:4),...2的元素赋值修改数据框的连接merge函数可连接两个数据框，通过指定公共列使具有相同元素的行的列合并*merge函数可支持更复杂的连接，但通过inner_join等更为简便，后述test1 <- data.frame...= ls())load(file = "soft.Rdata") #使Rdata中的向量出现在环境内，本身有名称，无需赋值矩阵和列表矩阵矩阵内所有元素数据类型必须相同*警惕因数据类型不同导致矩阵强制转换引起报错...#取子集方法同数据框t(m) #转置行与列，数据框转置后为矩阵as.data.frame(m) #将矩阵转换为数据框列表列表内有多个数据框或矩阵，可通过list函数将其组成一个列表l <- list(m1

7.6K00

day5-向量+数据框

数据框非常适合用来进行数据分析，它的每一列可以代表数据的每个变量或属性，每一行可以代表一个样本。...shareByChannel=link 向量和矩阵有什么区别 大小和结构 向量（vector）是一个具有单一轴向的数据结构，它由一系列有序排列的数值组成，通常呈现为一列或多行的形式。...向量的长度是固定的，即它的维度是有限的。 矩阵（matrix）则是一个多维度的数据结构，它有行和列之分，类似于一个矩形的表格。矩阵中每个元素的值都依赖于它所在的行和列的位置。...矩阵的尺寸可以是任意的，既可以是行数和列数相等，也可以不相等。 在数学上，向量和矩阵之间存在转换关系。...：区别seq(), sep() 数据框 1.读取本地数据 2.查看行名和列名，行数和列数 3.数据框的导出 4.变量的保存与重新加载 5.提取元素 6.直接使用数据框中的变量 问题： save(a,file

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【R的极客理想系列文章】RHadoop培训 之 R基础课

列表为统计计算的结果返回提供了一种便利的方法。 数据框（data frame）是和矩阵类似的一种结构。在数据框中，列可以是不同的对象。...可以把数据框看作是一个行表示观测个体并且（可能）同时拥有数值变量和分类变量的`数据矩阵’ 。许多实验数据都可以很好的用数据框描述：处理方式是分类变量而响应值是数值变量。...这包括一个和M 列空间一致的正交列U 的矩阵，一个和M 行空间一致的正交列V 的矩阵，以及一个正元素D 的对角矩阵，如M = U %*% D %*% t(V)。D 实际上以对角元素向量的形式返回。...对于可能属于数据框的列表对象有下面一些限制条件， 分量必须是向量(数值, 字符, 逻辑)，因子，数值矩阵，列表或者其他数据框; 矩阵，列表和数据框为新的数据框提供了尽可能多的变量，因为它们各自拥有列，元素或者变量...数据框常常会被看作是一个由不同模式和属性的列构成的矩阵。

2.8K20

基本操作包的移动向量矩阵数组数据框列表因子NA字符串

x <<- 5#<<-表示赋值给全局变量 ls()#查看已经定义的变量 ls.str()#查看已经定义的变量及详细信息（ls和str的组合） str(x)#列出x的详细信息 rm(x)#删除x rm(...-3#把向量x中的第1个数改为3 四.矩阵（矩阵的四则运算需要行列一致） 4.1创建矩阵 m <- matrix(1:20,4,5) # 4行5列，按列填充，遵循循环补齐原则 m <- matrix(1...] m["R1","C1"] 4.4 矩阵的运算 m+1#矩阵m中每一个元素都加1 colSums(m)#每一列的总和 rowSums(m) colMeans(m) rowMeans(m) 4.5 矩阵中的函数...中选择age大于等于30的观测值，并只选择name和age两列 数据框的更改 transform(women, height = height*2.54) transform(women, cm = height...b 九.NA(未知值) NaN(不存在的值，如0/0) Inf(无穷大或无穷小，不可能的值，如1/0) a <- c(NA,1:49) is.na(a)#测试向量a里面含元素NA吗 sum(a,na.rm

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R语言快速入门：数据结构+生成数据+数据引用+读取外部数据

二维数组具有行列的概念 #矩阵用法 matrix(data = NA, nrow = 1, ncol = 1, byrow = FALSE,dimnames = NULL) #表示生成1行，1列的一个矩阵...= 3 定义2x3的2行3列矩阵 #byrow = TRUE 是控制矩阵中的数据c(1,2,3, 11,12,13)按照行的顺序排列，默认按照列排列 #dimnames = list(c("row1"...1.3 数据框 ? 主要用于向量/矩阵合并，可以将不通类型的以向量以及矩阵，按照一定结构存储在数据框中。...如行值或列值仅1个数字，表示仅引用该行或列的数据 > iris[1,] #引用第1行数据 Sepal.Length Sepal.Width Petal.Length Petal.Width Species...如行值或列值为组合数据，则表示引用组合行列交叉位置的数据 > iris[1:5,1:3] Sepal.Length Sepal.Width Petal.Length 1 5.1

1.7K20

R语言笔记完整版

R的基本数据类型有数值型（numeric）、字符型（character）、复数型（complex）和逻辑型（logical），对象类型有向量、因子、数组、矩阵、数据框、列表、时间序列。.../RData")——加载目录中的*.RData，把文档-词项矩阵从磁盘加载到内存中 数据查看 通用对象 R是一种基于对象（Object）的语言，对象具有很多属性（Attribute），其中一种重要的属性就是类...(Data)] <- 0——数据框多维变量中给NA值赋值为0 apply（A，Margin，FUN，...）...详情参见例子 R语言利器之ddply transform(x，y)——将x和y的列转换成·一个数据框。...>)[，1]——把数据框转化为矩阵后，再去提取列向量 na和NULL的区别 is.na()——判断na值存在，na是指该数值缺失但是存在。

4.1K41

R In Action|创建数据集

简单的介绍数据的对象类型及文件的读入，输出。 一、对象类型： 包括标量、向量、矩阵、数组、数据框和列表。 1)向量(vector)：用于存储数值型、字符型或逻辑型数据的一维数组。...5)因子(factor)：类别(名义型)变量和有序类别(有序型)变量在R中称为因子（factor），绘图时候重要。 6)列表(list)是R的数据类型中最为复杂的一种。...1)向量：a[2];d[1] 2)矩阵：使用下标和方括号来选择矩阵中的行、 列或元素。X[i,]指矩阵X中的第i 行，X[,j]指第j 列， X[i, j]指第i 行第j 个元素。...选择多行或多列时，下标i 和j 可为数值型向量。 3)数组：从数组中选取元素的方式与矩阵相同 4)数据框：可以使用前述（如矩阵中的）下标记号，亦可直接指定列名。...) #检查搜索路径中的数据框，以定位到这个变量plot(mpg, disp)detach(mtcars) #函数detach()将数据框从搜索路径中移除 with(mtcars, {nokeepstats

1.5K40

R语言实战.2

与其他标准统计软件（如SAS、SPSS和Stata）中的数据集类似，数据框（data frame）是R中用于存储数据的一种结构：列表示变量，行表示观测。...在同一个数据框中可以存储不同类型（如数值型、字符型）的变量。数据框将是你用来存储数据集的主要数据结构。 因子（factor）是名义型变量或有序型变量。它们在R中被特殊地存储和处理。...由于不同的列可以包含不同模式（数值型、字符型等）的数据，数据框的概念较矩阵来说更为一般。它与你通常在SAS、SPSS和Stata中看到的数据集类似。数据框将是你在R中最常处理的数据结构。 ?...类别（名义型）变量和有序类别（有序型）变量在R中称为因子（factor）。因子在R中非常重要，因为它决定了数据的分析方式以及如何进行视觉呈现。 ? ? ? $是用来选取一个变量时用的符号 ?...各水平的赋值将为1=Poor、2=Improved、3=Excellent。请保证指定的水平与数据中的真实值相匹配，因为任何在数据中出现而未在参数中列举的数据都将被设为缺失值。

1.7K30

R语言入门之相关性

今天这一期的内容主要是如何在R中进行数据之间的相关性分析，其实这一部分的内容和独立性检验的有点类似，大家可以对比着学习！ 1....相关性度量的assocstats()函数 在这里，我想和大家简单介绍一下如何度量列联表里分类变量之间的相关性。...nonsmoker",24)) # 创建变量C mydata <- data.frame(A,B,C) # 利用以创建的变量构建数据框 library(vcd) #加载R包 mytable 0.3，P值小于0.05）。由于数据的问题，女性没有计算出结果来，因为表格里有数据是0。 2....其简单使用如下： cor(x,use=, method= )，这里x是矩阵或者数据框，参数use=是用来指定缺失值的处理方法，而method=则是用来指定计算方法，默认的是计算Pearson相关系数。

1.3K10

R3数据结构和文件读取

[]前面是数据框或矩阵，[[]]前面是列#3单个向量4种操作：#（1）赋值加输出（2）数学计算，（3）条件判断生成的是逻辑值，生成长度相等的逻辑值（x==y，向量不一样长时，谁长取谁，（4）初级统计,（...（1）按照逻辑值（[]里面是逻辑值，与x对应，不必由x生成）：中括号里是与x等长且一一对应的逻辑值向量（13个彩色球取出蓝色和绿色，x[x%in%y]，13个数取>7,x[x>7]）；（2）按照位置：中括号里是由...2.数据框要求每列数据的类型相同3.数据框单独拿出一列是向量，降维，#1.数据框data.frame来源# （1）用代码新建，，变量 <- data.frame（）# （2）由已有数据转换或处理得到，变量...改行名和列名rownames(df1) <- c("r1","r2","r3","r4")#只修改某一行/列的名colnames(df1)[2] <- "CHANGE"#6.两个数据框的连接，mergetest1...);y[,1]，此时赋值不成功，因为y[,1]还是代表矩阵第一列，而矩阵只会允许一种数据类型，要改除非整个矩阵一起改## [1] 40.66667#如果要把矩阵中的字符都转换成数字,需改成数据框class

2.7K00

Jelys Note之生信入门class3

2.向量是一维的【r语言的一个数据，可以被赋值】=是被装进变量里的东西，是固定的 eg.数字1：5、字符串“a”、“b”、逻辑值“T”“F”“T” 3....正确处理：只有你所要读取的目的文件在你开着的R.project的同个文件夹中才能运行代码打开 3.数据框的属性【这个属性是指数据框中黑色加粗的字体，不属于表格内容！只是表格的属性！...df1中的数据，c（1，3)是取第一行和第三行的数据，逗号表示维度的分割，1：2是取第一列与第二列的数据 eg....取出来的是符合条件的子集】 筛选score > 0的基因 > df1[df1$score > 0,]内容写在逗号前取子集是按行来取子集 取df1数据框中score那一列大于0的df1值如第一行、第二行...(test[,1]) 10.筛选test中，Species列的值为a或c的行 反选和列出所有条件 test[test$Species!

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