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广义线性模型应用举例之回归R计算

广义线性模型应用举例之回归R计算 在前文“广义线性模型,提到广义线性模型(GLM)可概括为服务于一组来自指数分布族响应变量模型框架,正态分布、指数分布、伽马分布、卡方分布、贝塔分布、伯努利分布...某些计数型变量可以通过正态分布进行近似,并可以使用一般线性回归进行合理建模。但更普遍做法是使用广义线性模型回归或负二项回归,它们都是应用于计数型(非负整数)响应变量回归模型。...因此,对于后续分析R. cataractae丰度环境因子关系回归模型选择,就可以初步考虑广义线性模型回归实现。...在这个示例数据,观察到响应变量R. cataractae丰度分布右偏而大致呈现分布,提示使用回归(广义线性模型)可能比线性回归(一般线性模型)更有效。...如前文“广义线性模型概述”中提到,R语言中拟合广义线性模型函数有很多,各自特点也不同(大多是对基础功能拓展,包括考虑时间序列模型,用于0时较多时零膨胀模型,当数据存在离群点强影响点时有用稳健模型

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R语言逻辑回归回归模型对发生交通事故概率建模

利用过程模型,我们可以获得 这意味着在一年前六个月中没有索赔概率是一年没有索赔平方根。...例如对数线性模型(Logistic回归算法)。...如果将回归(仍为红色)对数二项式模型与泰勒展开进行比较,我们得到 ---- 参考文献 1.R语言多元Logistic逻辑回归 应用案例 2.面板平滑转移回归(PSTR)分析案例实现 3.matlab...偏最小二乘回归(PLSR)主成分回归(PCR) 4.R语言Poisson回归模型分析案例 5.R语言回归Hosmer-Lemeshow拟合优度检验 6.r语言中对LASSO回归,Ridge...岭回归Elastic Net模型实现 7.在R语言中实现Logistic逻辑回归 8.python用线性回归预测股票价格 9.R语言如何在生存分析与Cox回归中计算IDI,NRI指标

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R语言Poisson回归模型预测人口死亡率期望寿命

为了模拟qx,t演化,我们可以从Lee&Carter(1992)模型获得启发,该模型 假设log (qx,t)= Ax + Bx⋅Kt。...为了估计参数A,BK,我们尝试使用二项式模型。B(Ex,t,qx,t),这是人寿保险基本模型。这里Dx,t〜B(Ex,t,exp [ Ax + Bx⋅Kt])。...另一个线索是使用小数定律,即如果概率低(一年死亡概率就是这种情况),则二项式定律可以近似由分布。我们在这里用到了Poisson回归,其解释变量为年龄x,年t暴露量为偏移变量。...唯一问题是它不是线性回归。我们这里有非线性模型,因为E [ Dx,t] =(exp[log(Ex,t)+ Ax + Bx⋅Kt])。...这个想法是Lee&Carter(1992)初衷,我们可以尝试指数模型线性模型(在1950年以后原始K ^序列上) lm(log(Kt[idx])~ann[idx])futur=2016:2125

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R语言线性模型臭氧预测: 加权回归,普通最小二乘,加权负二项式模型

p=11386  在这篇文章,我将从一个基本线性模型开始,然后从那里尝试找到一个更合适线性模型。...回归 为了防止出现负估计,我们可以使用假定为分布而非正态分布广义线性模型(GLM): plot.linear.model(pois.model, pois.preds, ozone$Ozone...[testset])   [R2[R2值0.616表示回归比普通最小二乘(0.604)稍好。...加权回归 p.w.pois  如我们所见,该模型结合了使用回归(非负预测)使用权重(低估离群值)优势。确实,[R2[R2该模型最低价(截断线性模型为0.652 vs 0.646)。...为了解决模型过度分散问题,我们制定了加权负二项式模型。尽管此模型表现不如加权Poisson模型([R2= 0.638 ),则在进行推理时可能会更好。

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R语言非线性回归广义线性模型、伽马、逻辑回归、Beta回归分析机动车事故、小鼠感染、蛤蜊数据、补剂钠摄入数据|数据分享

GLM是一种灵活统计模型,适用于各种数据类型分布,包括二项分布、分布负二项分布等非正态分布。...通过GLM,我们可以对非正态数据进行建模预测,并且能够处理计数数据,客户购买数量、网站点击次数等。GLM还允许引入自变量线性效应,从而更好地拟合与响应变量之间复杂关系。...这使得GLM成为处理非正态数据线性关系强大工具。 回归伽马回归 - 探索联系 如果我们查看火车与机动车碰撞数据(查看文末了解数据免费获取方式),我们会发现一个有趣模式。...部分原因是这里响应变量在残差不是正态分布,而是分布,因为它是计数数据。 回归 具有误差广义线性模型通常具有对数链接,尽管也可以具有恒等链接。...PythonLasso回归之最小角算法LARS r语言中对LASSO回归,Ridge岭回归弹性网络Elastic Net模型实现 r语言中对LASSO回归,Ridge岭回归Elastic

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R语言中回归、套索回归、主成分回归线性模型选择正则化

p=9913 ---- 概述定义 在本课程,我们将考虑一些线性模型替代拟合方法,除了通常  普通最小二乘法。这些替代方法有时可以提供更好预测准确性模型可解释性。...这适用于其他类型模型选择,例如逻辑回归,但我们根据选择选择得分会有所变化。对于逻辑回归,我们将使用  偏差  而不是RSSR ^ 2。...选择最佳模型 上面提到三种算法每一种都需要我们手动确定哪种模型效果最好。如前所述,使用训练误差时,具有最多预测值模型通常具有最小RSS最大R ^ 2。...解释高维结果 我们必须始终谨慎对待报告获得模型结果方式,尤其是在高维设置。在这种情况下,多重共线性问题非常严重,因为模型任何变量都可以写为模型中所有其他变量线性组合。...我们可以使用内置绘图功能来绘制RSS,adj R ^ 2,  C p,AICBIC。 注意:上面显示拟合度是(除R ^ 2以外)所有测试误差估计。

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R语言用Poisson回归、GAM样条曲线模型预测骑自行车者数量

p=18550 我根据Poisson回归、GAM样条曲线模型对一个十字路口骑自行车者数量进行预测, str(base) 'data.frame': 214 obs. $ 日期 : chr...以及下面的降雨量曲线,最大观测值(3)与之前观测值(1.8)之间线性平滑 ?...我们还可以回归最小温度,以及最大和最小温度之间温差(在线性模型模型是等效,但是通过非线性变换,可以更简单地给出差异) ? 现在,我们可以比较这四个模型及其预测。...例如,对于线性模型(虚拟变量表示没有下雨), predict(reg,newdata=newbase,type="response se.fit=TRUE 对于星期一,我们获得λ95%置信区间...换句话说,通过更改模型,我们对预测置信区间进行了更改(有时区间完全不相交)。 ---- ?

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广义线性模型glm回归lasso、弹性网络分类预测学生考试成绩数据交叉验证

广义线性模型交叉验证lasso正则化 从模型构建数据,并使用 lasso确定重要预测变量 。 创建具有 20 个预测变量数据。仅使用三个预测变量加上一个常数来创建因变量。...rng % 用于重现性 randn exp(X)*weights + 1 构建数据回归模型交叉验证lasso正则化。 检查交叉验证图以查看Lambda 正则化参数效果 。...rng default % 设置可重复性种子 Xi = X(iTain,:); yran = yBinom yTe = yBinom 对训练数据进行 3 折交叉验证,对广义线性模型回归执行lasso正则化...假设 值 y 是二项分布。选择对应于Lambda 最小预期偏差模型系数 。...然而,该函数错误地预测了1名学生获得B或以上成绩,4名学生获得B以下成绩。 本文摘选《Matlab广义线性模型glm回归lasso、弹性网络正则化分类预测考试成绩数据交叉验证可视化》

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R语言用线性模型进行臭氧预测: 加权回归,普通最小二乘,加权负二项式模型,多重插补缺失值

p=11386 在这篇文章,我将从一个基本线性模型开始,然后尝试找到一个更合适线性模型。...回归 为了防止出现负估计,我们可以使用假定为分布而非正态分布广义线性模型(GLM): plot.linear.model(pois.model, pois.preds, ozone$Ozone...R2值0.616表示回归比普通最小二乘(0.604)稍好。但是,其性能并不优于将负值为0.646模型。...如我们所见,该模型结合了使用回归(非负预测)使用权重(低估离群值)优势。...为了解决模型过度分散问题,我们建立了加权负二项式模型。尽管此模型表现不如加权Poisson模型R2= 0.638 ),则在进行推理时可能会更好。

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R语言从入门到精通:Day13

广义线性模型就包含了非正态因变量分析,本次教程主要内容就是关于广义线性模型中流行模型:Logistic回归(因变量为类别型)回归(因变量为计数型)。...图6,poisson回归分析结果 ? 同样,还需要评价模型过度离势。分布方差均值相等。当响应变量观测方差比依据分布预测方差大时,回归可能发生过度离势。...同样poisson回归也有很多扩展形式,时间段变化poisson回归(需要使用glm()函数offset选项)、零膨胀回归(pscl包函数zeroinfl()可做零膨胀回归)、...稳健回归(robust包函数glmRob()可以拟合稳健广义线性模型,包含稳健回归,当存在离群点强影响点时,该方法会很有效。)。...小结&预告 到目前为止,R基本统计分析就告一段落了,后面会介绍一些高级数据挖掘分析,主成分分析聚类分析等等,在这些统计分析,将看看处理潜变量统计模型,即那些你坚信存在并能解释可观测变量、无法被观测到

1.6K20

数据分享|R语言零膨胀回归ZERO-INFLATED POISSON(ZIP)模型分析露营钓鱼数据实例估计IRROR

因此,zip模型有两个部分,计数模型用于预测多余零点 logit 模型。 零膨胀回归示例 示例 。野生动物生物学家想要模拟公园渔民捕获了多少鱼。...列出一些方法是相当合理,而另一些方法要么失宠,要么有局限性。 零膨胀回归。 零膨胀负二项式回归——负二项式回归在分散数据时表现更好,即方差远大于平均值。 普通计数模型 。...零膨胀回归 summary(m1) 输出看起来非常像 R 两个 OLS 回归输出。在模型调用下方,您会发现一个输出块,其中包含每个变量回归系数以及标准误差、z 分数 p 值系数。...vuong(p, m) Vuong 检验将零膨胀模型与普通回归模型进行比较。在这个例子,我们可以看到我们检验统计量是显着,表明零膨胀模型优于标准模型。...由于 zip 同时具有计数模型 logit 模型,因此这两个模型每一个都应该具有良好预测器。

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R语言贝叶斯MCMC:用rstan建立线性回归模型分析汽车数据可视化诊断|附代码数据

GIBBS 吉布斯采样器估计变点指数分布分析过程车站等待时间R语言马尔可夫MCMCMETROPOLIS HASTINGS,MH算法抽样(采样)法可视化实例python贝叶斯随机过程:马尔可夫链...Hastings采样贝叶斯回归Poisson模型Matlab用BUGS马尔可夫区制转换Markov switching随机波动率模型、序列蒙特卡罗SMC、M H采样分析时间序列R语言RSTAN...R语言Metropolis Hastings采样贝叶斯回归Poisson模型R语言贝叶斯MCMC:用rstan建立线性回归模型分析汽车数据可视化诊断R语言贝叶斯MCMC:GLM逻辑回归、Rstan...线性回归、Metropolis Hastings与Gibbs采样算法实例R语言贝叶斯Poisson-正态分布模型分析职业足球比赛进球数R语言用Rcpp加速Metropolis-Hastings抽样估计贝叶斯逻辑回归模型参数...R语言贝叶斯线性回归多元线性回归构建工资预测模型R语言贝叶斯推断与MCMC:实现Metropolis-Hastings 采样算法示例R语言stan进行基于贝叶斯推断回归模型R语言中RStan贝叶斯层次模型分析示例

1.9K00

R语言进阶之广义线性回归

广义线性回归是一类常用统计模型,在各个领域都有着广泛应用。今天我会以逻辑回归回归为例,讲解如何在R语言中建立广义线性模型。...在R语言中我们通常使用glm()函数来构建广义线性模型,glm实际上是generalized linear model(广义线性模型首字母缩写,它具体形式如下所示: glm(formula, family...在这里我主要和大家讲解一下逻辑(logistic)回归(poisson)回归这两个模型。...从输出结果来看,花瓣长度是可以较好区分这两类鸢尾花,但是这个模型是原始粗糙,我们应该通过回归诊断方式来修正此模型,使之更加精确,关于回归诊断请参见R语言入门之线性回归,这里就不赘述。...第二部分 回归 回归主要用于因变量(y)是计数资料而自变量(x)是连续型变量时候,当然自变量(x)也可以是分类变量。

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R语言逻辑回归、方差分析 、伪R平方分析

p值 标准化残差图 绘制模型 Logistic回归示例 模型拟合 系数指数系数 方差分析 伪R平方 模型整体p值 标准化残差图 绘制模型 Logistic回归示例 ---- 怎么做测试 Logistic...回归可以使用glm  (广义线性模型)函数在R执行  。...该函数使用链接函数来确定要使用哪种模型,例如逻辑模型,概率模型模型。  假设条件 广义线性模型假设少于大多数常见参数检验。观测值仍然需要独立,并且需要指定正确链接函数。...因此,例如应该了解何时使用回归以及何时使用逻辑回归。但是,不需要数据或残差正态分布。...伪R平方 对于广义线性模型(glm),R不产生r平方值。pscl  包  pR2  可以产生伪R平方值。 测试p值 检验逻辑对数或回归p值使用卡方检验。方差分析  来测试每一个系数显着性。

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R语言使用Metropolis-Hastings采样算法自适应贝叶斯估计与可视化

1)定义模型(即概率先验)。在此示例,让我们构建一个简单线性回归模型(对数)。...贝叶斯隐马尔可夫hmm模型实现 贝叶斯线性回归多元线性回归构建工资预测模型 Metropolis Hastings采样贝叶斯回归Poisson模型 贝叶斯分位数回归、lasso自适应lasso...、前列腺癌数据 R语言JAGS贝叶斯回归模型分析博士生延期毕业完成论文时间 R语言Metropolis Hastings采样贝叶斯回归Poisson模型 Python决策树、随机森林、朴素贝叶斯...Hastings与Gibbs采样算法实例 R语言贝叶斯Poisson-正态分布模型分析职业足球比赛进球数 随机森林优化贝叶斯预测分析汽车燃油经济性 R语言逻辑回归、Naive Bayes贝叶斯...R语言贝叶斯线性回归多元线性回归构建工资预测模型 R语言贝叶斯推断与MCMC:实现Metropolis-Hastings 采样算法示例 R语言stan进行基于贝叶斯推断回归模型 R语言中RStan

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R语言和Python用过程扩展:霍克斯过程Hawkes Processes分析比特币交易数据订单到达自激过程时间序列|附代码数据

描述事件计数到达最基本方法,例如上面的时间序列,是过程 ,有一个参数λ。在过程,每单位时间预期事件数由一个参数定义。这种方法被广泛使用,因为它非常适合大量数据,例如呼叫中心电话到达。...然而,就我们目的而言,这太简单了,因为我们需要一种方法来解释聚类均值回归。霍克斯过程(Hawkes Processes),是基本过程扩展,旨在解释这种聚类。...这导致大量交易(在同一秒内)失去订单,这可能会影响跳跃大小。拟合优度评估拟合优度方法有很多种。一种是通过比较AIC同质模型值,如上面的 R 总结中所示,我们霍克斯模型更适合数据。...EVT分析R语言混合正态分布极大似然估计EM算法R语言多项式线性模型:最大似然估计二次曲线R语言Wald检验 vs 似然比检验R语言GARCH-DCC模型DCC(MVT)建模估计R语言非参数方法:使用核回归平滑估计...K-NN(K近邻算法)分类预测心脏病数据matlab实现MCMC马尔可夫转换ARMA - GARCH模型估计R语言基于Bootstrap线性回归预测置信区间估计方法R语言随机搜索变量选择SSVS估计贝叶斯向量自回归

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PYTHON用时变马尔可夫区制转换(MARKOV REGIME SWITCHING)自回归模型分析经济时间序列|附代码数据

,MH采样算法可视化Python贝叶斯推断Metropolis-Hastings(M-H)MCMC采样算法实现Metropolis Hastings采样贝叶斯回归Poisson模型Matlab用...R语言BUGS序列蒙特卡罗SMC、马尔可夫转换随机波动率SV模型、粒子滤波、Metropolis Hasting采样时间序列分析R语言Metropolis Hastings采样贝叶斯回归Poisson...Poisson-正态分布模型分析职业足球比赛进球数R语言用Rcpp加速Metropolis-Hastings抽样估计贝叶斯逻辑回归模型参数R语言逻辑回归、Naive Bayes贝叶斯、决策树、随机森林算法预测心脏病...自适应lasso贝叶斯分位数回归分析Python用PyMC3实现贝叶斯线性回归模型R语言用WinBUGS 软件对学术能力测验建立层次(分层)贝叶斯模型R语言Gibbs抽样贝叶斯简单线性回归仿真分析R...语言和STAN,JAGS:用RSTAN,RJAG建立贝叶斯多元线性回归预测选举数据R语言基于copula贝叶斯分层混合模型诊断准确性研究R语言贝叶斯线性回归多元线性回归构建工资预测模型R语言贝叶斯推断与

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PYTHON用时变马尔可夫区制转换(MARKOV REGIME SWITCHING)自回归模型分析经济时间序列|附代码数据

,MH采样算法可视化Python贝叶斯推断Metropolis-Hastings(M-H)MCMC采样算法实现Metropolis Hastings采样贝叶斯回归Poisson模型Matlab用...R语言BUGS序列蒙特卡罗SMC、马尔可夫转换随机波动率SV模型、粒子滤波、Metropolis Hasting采样时间序列分析R语言Metropolis Hastings采样贝叶斯回归Poisson...Poisson-正态分布模型分析职业足球比赛进球数R语言用Rcpp加速Metropolis-Hastings抽样估计贝叶斯逻辑回归模型参数R语言逻辑回归、Naive Bayes贝叶斯、决策树、随机森林算法预测心脏病...自适应lasso贝叶斯分位数回归分析Python用PyMC3实现贝叶斯线性回归模型R语言用WinBUGS 软件对学术能力测验建立层次(分层)贝叶斯模型R语言Gibbs抽样贝叶斯简单线性回归仿真分析R...语言和STAN,JAGS:用RSTAN,RJAG建立贝叶斯多元线性回归预测选举数据R语言基于copula贝叶斯分层混合模型诊断准确性研究R语言贝叶斯线性回归多元线性回归构建工资预测模型R语言贝叶斯推断与

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Matlab建立SVM,KNN朴素贝叶斯模型分类绘制ROC曲线

使用逻辑回归模型概率估计值作为得分。 perfcurve 将阈值存储在数组。 显示曲线下面积。 AUCAUC = 0.7918 曲线下面积为0.7918。最大AUC为1,对应于理想分类器。...计算后验概率(分数) [~,score_nb] = resubPredict(mdlNB); 使用朴素贝叶斯分类分数计算标准ROC曲线。 将ROC曲线绘制同一图上。...将第一象限第三象限点标记为属于正类别,而将第二象限第二象限点标记为负类。...2.面板平滑转移回归(PSTR)分析案例实现 3.matlab偏最小二乘回归(PLSR)主成分回归(PCR) 4.R语言Poisson回归模型分析案例 5.R语言回归Hosmer-Lemeshow...拟合优度检验 6.r语言中对LASSO回归,Ridge岭回归Elastic Net模型实现 7.在R语言中实现Logistic逻辑回归 8.python用线性回归预测股票价格 9.R语言如何在生存分析与

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群组变量选择、组惩罚group lasso套索模型预测新生儿出生体重风险因素数据交叉验证、可视化|附代码数据

p=25158 最近我们被客户要求撰写关于lasso研究报告,包括一些图形统计输出。 本文介绍具有分组惩罚线性回归、GLMCox回归模型正则化路径。...、弹性网络elastic net分析基因数据 Python高维变量选择:SCAD平滑剪切绝对偏差惩罚、Lasso惩罚函数比较 R使用LASSO回归预测股票收益 广义线性模型glm回归lasso、弹性网络分类预测学生考试成绩数据交叉验证...glm回归lasso、弹性网络分类预测学生考试成绩数据交叉验证 贝叶斯分位数回归、lasso自适应lasso贝叶斯分位数回归分析免疫球蛋白、前列腺癌数据 R语言RSTAN MCMC:NUTS采样算法用...R语言惩罚logistic逻辑回归(LASSO,岭回归)高维变量选择分类模型案例 PythonLasso回归之最小角算法LARS r语言中对LASSO回归,Ridge岭回归弹性网络Elastic...glmnet岭回归 R语言中回归、套索回归、主成分回归线性模型选择正则化 PythonARIMA模型、SARIMA模型SARIMAX模型对时间序列预测 R语言arima,向量自回归(VAR

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