因为R4.1做了大更新，之前的Rstudio对R4.1新增加的特性没有支持到位。在最新的Rstudio已经到位了。如果本来打算使用R4.1的同学们，现在可以下载最新的Rstudio用起来了。
每一位初学者接触R，想必都是从RStudio开始的，甚至将RStudio当作R本身的也不在少数。尽管RStudio是一个非常受欢迎的R编程环境，但它也有一些缺点。
1写在前面 最近遇到一个大名鼎鼎的包叫Scanpy，用于单细胞测序的分析，不过需要在Python中运行。🫠 于是，我就研究了一下如何在Rstudio中调用这个神包。👀 这里和大家分享一下如何在Rstudio中调用python吧。🥰 2安装Python 2.1 方法一 你可以选择在官网直接下载安装，地址如下：https://www.python.org/downloads/ , 按照自己的操作系统下载即可。🤨 随后再配置环境。😁 📷 2.2 方法二（推荐） 我们输入以下代码，如果是从来没有进行过操作的，Rst
Anaconda：https://www.anaconda.com/（此处请留意安装路径）
R语言的工作空间其实就是你当下R语言的工作环境，它包括任何你已经定义了的对象。当一个R进程结束时，用户可以将当前的工作空间保存下来，在下次启动R时就会自动加载，非常方便省事。R语言是一个交互式界面，上翻和下翻键可以用来查看历史指令。这里我建议大家使用RStudio，因为RStudio提供非常强大的R语言高度可视化操作界面，你可以在RStudio里写R代码，也可以写Python代码，同时可以使用Rmarkdown来写自己的文档。
现如今，R语言是统计领域广泛使用的工具，是属于GNU系统的一个自由、免费、源代码开放的软件，是用于统计计算和统计绘图的优秀工具。而RStudio是R的集成开发环境，用它进行R编程的学习和实践会更加轻松和方便。下面就教大家如何下载并安装R和RStudio，比较简单。R的维护工作由一个国际化的开发者团队负责。R软件的官方下载页面叫作The Comprehensive R Archive Network，即CRAN。
Rstudio Server 是Rstudio开发的基于R语言的网页版（只能在Linux），你在手机上都可以运行R，还是挺方便的。就是配置起来有点麻烦。 官方下载链接：https://www.rstudio.com/products/rstudio/download-server/
从Python、R等编程语言到以Git为例的版本控制系统甚至Unix Shell等命令行工具，数据科学家的武器库现在越来越丰富了，在个人计算机上同时使用这些武器可能会对新入门的数据科学家们造成不小的困扰，本文就将带你学习这些数据科学武器的配置方法。
新学期新学了门课程COMP226 Computer-Based Trading in Financial Markets 用到了R语言 学习R语言第一天安装了R, RStudio 后 运行RStudio立马就看到了警告信息
Shiny是一个R包，允许用户将R代码转换为交互式网页。Shiny server是RStudio提供的服务器，可用于托管和管理Web上的Shiny应用程序。除了托管Shiny应用程序，Shiny Server还可以托管交互式R降价文档。Shiny Server既有免费的开源版本，也有付费专业版，包含更多功能。
我仔细看了一下，原来Rstudio新建的脚本，默认的是R脚本，如果想要运行Python，需要新建Python脚本。
相信大家都用过本地版的 Rstudio，也时常被电脑卡死所困扰，也有用自己笔记本处理单细胞数据内存不够的 error，怎么解决？
下面具体看看这些新的特性，我只介绍重点，详情大家可以仔细阅读发布博客：https://blog.rstudio.com/2021/01/19/announcing-rstudio-1-4/
reticulate可以实现R与python的相互切换,即在R里面调用python的脚本、模块等。
SCP的完整安装分为两个部分，一个是R包安装，另一个是内部的python环境构建。
R语言是一个属于GNU操作系统的开源软件，在数据统计与分析、可视化等方面具有优秀的表现；而RStudio则是R语言的集成开发环境（IDE），可以帮助我们更好地编辑、调试R语言的代码。这二者的关系有点类似于Python与Spyder的关系——我们可以只下载R语言，用其自带的原生编辑窗口来完成代码的撰写与运行等工作；而如果想提高代码的撰写、调试效率，就可以通过RStudio来完成。
R 语言官网：https://cran.r-project.org/，进入 R 语言官网，Downloade R for Windows。
一直以来我们学习、测试python都会提到 Pycharm，不仅好用，还支持使用 R 语言。
R 语言是为数学研究工作者设计的一种数学编程语言，主要用于统计分析、绘图、数据挖掘。
两三个月前，有幸拿到了云筏的一个 4 核 16G，1TB硬盘，300M带宽位于欧洲的云服务器，自带的开箱即用的 RStudio Server 也非常给力，但最近这两天在升级 R 的时候遇上了不少问题，也懒得去折腾了，于是想把 RStudio Server 替换成自己比较熟悉的 JupyterLab Server，这是一些折腾的笔记记录。
号外号外，Rstudio最近在9月底更新了！！提供了很多实用的新功能，对于这些新功能你又知道了解多少呢？据说万众期待的支持可视化的Markdown编辑的功能已经上线了，下面让我带大家一起来具体了解了解。
新版本的Rstudio, 需要R包:reticulate在1.10以上, 如果是1.09会报错, 而如果你的R是microsoftR是老版本的话, CRAN不是默认的镜像, 安装不成1.10版本. 解决方法: 使用github安装:
从RStudio官网下载MacOS版本RStudio安装包。对于MacOS，安装选择默认路径即可。
自从上一次服务器重装系统之后，总感觉缺少了一些东西，安装R包很多依赖库报错，也可以解决，但总是存在，烦。
众所周知我们一直有一个共享服务器的产品，详见：生物信息学江湖的开创性产品-共享服务器 。目前已经给大多数共享服务器的公共R包库中的seurat4升级到了seurat5。而且我们也写了一些seurat5相关的使用教程，见：
R语言是用于统计分析，图形表示和报告的编程语言和软件环境；Rstudio是编辑、运行R语言的最为理想的工具之一。
现如今，R语言是统计领域广泛使用的工具，是属于GNU系统的一个自由、免费、源代码开放的软件，是用于统计计算和统计绘图的优秀工具。而RStudio是R的集成开发环境，用它进行R编程的学习和实践会更加轻松和方便。下面就教大家如何下载并安装R和RStudio，比较简单。R的维护工作由一个国际化的开发者团队负责。R软件的官方下载页面叫作The Comprehensive R Archive Network，即CRAN。 一、官网下载R安装包 下载地址为：https://cran.r-project.org
RStudio是一种R语言的集成开发环境(IDE)，其亮点是出色的界面设计及编程辅助工具。它可以在多种平台上运行，包括windows，Mac，Ubuntu，以及网页版。另外这个软件是免费和开源的!可以在官方网页：
今天是我们的系统教程《R语言从入门到精通》的第一讲，前面的背景讲解中《从今天开始，每天学点R语言~》，已经深入探讨过R语言的重要性以及学习R语言的必要性，今天我们就按照课表来讲解：如何在自己的PC中安装R语言的运行环境。还没有领取《学习R》书籍教材的同学，赶紧联系文末的客服小姐姐吧~
R是用于统计分析、绘图的语言和操作环境。R是属于GNU系统的一个自由、免费、源代码开放的软件，它是一个用于统计计算和统计制图的优秀工具。简单来说，R是一门统计计算语言，是一套开源的数据分析解决方案。
这个是R语言的控制台，Console的名词意思就是操作台、控制台，我们在Source里面写好的命令，点击运行后，都会在这个窗口中运行命令，并且显示结果。
图 1 R软件下载页面 下载之后是.exe执行文件，不是zip压缩格式文件，可以直接点击安装。
安装R和Rstuido软件 R语言是用于统计分析，图形表示和报告的编程语言和软件环境；Rstudio是编辑、运行R语言的最为理想的工具之一。
这篇文章旨在为R语言的新手铺砖引路，行文相对基础，希望对在R语言安装上有问题的小伙伴提供帮助和指引。
点击下方公众号，回复资料分享，收获惊喜 简介 最近电脑电池坏了，拿到店里维修了，自己也没有备用机。要不是有 ddl，小编就会以此为借口放个小长假 ?。玩笑可以开，但是活还是要干的。 所以就打算用图书馆
R 语言已经广泛的应用与生物信息分析中，包括 RNAseq，单细胞，生物统计，绘图等都要用到 R 语言。R 语言是生物信息分析平台重要的组成部分。本章节中我们将在服务器中配置完整的 R 语言分析环境。
介绍：R和Java、Python一样，是一种计算机语言；Rstudio是为R提供的一个人性化界面。
可重复的生信分析一直是未来的趋势。如果实现可重复的生信分析，关键在于分析软件版本的控制，一致的环境设置还有良好的分析流程的记录。最近发现一篇关于这方面很好的教程。改教程主要分三个方面:Docker的介绍,Conda的介绍还有Workflowr的教程。通过使用这几个不同的工具实现上面提到的要素，进而进行可重复的生信分析。今天先讲第一部分 Docker的介绍。
在用R/Rstudio本地处理数据时，数据量很大时往往难以处理，其实在服务器上也可以装Rstudio，服务器版本的Rstudio-server是可以通过服务器的ip地址远程连接的,但是需要管理员权限。
RStudio Server是网页版的RStudio，部署在服务器上后，能够在从Web浏览器访问的Linux服务器上运行RStudio,可随时随地完成R语言的工作,并且能很方便的完成R项目的部署调试。使将RStudio IDE的强大功能和工作效率带到基于服务器的集中式环境中。
shiny是R中专门用于开发轻量级web应用的框架，在本地写一个shiny应用并调用非常方便，但如果你希望你的shiny应用能够以远程的方式提供给更多人来使用，就需要将写好的shiny应用部署到服务器上，主要有两种方式，第一种是将shiny应用发布在shinyapps上，第二种是将你的shiny应用部署到自己租用的服务器上，前者比较方便但遇到一些R包环境或中文显示等问题时几乎是无解的，而后者虽然麻烦，但更为自由，且从0开始自己动手的过程又何尝不是一种极大的乐趣呢，本文就将针对在ubuntu 16.04服务器上部署shiny server的流程进行详细的说明；
在前面我们介绍了R和RStudio的安装教程，也简单介绍R的GUI的使用，包括包的安装，加载等进行简单的介绍，然而并不详细，对于初学者来说，可能很难理解，原因在于我们实际分析数据或者开发的时候，一般不用GUI，而是RStudio。对RStudio怎么使用却没有介绍，今天RStudio的使用教程。
上一期我们讲解了如何使用谢益辉写的xaringan包[1]制作幻灯片，推文在这：R沟通｜用xaringan包制作幻灯片。但是最后留了一个小尾巴，如果你不喜欢最原始版本的主题的话。你可以把内部的css进行设置，这时你得需要一些javascript的知识。
有时候各位使用R的用户不知道会不会有这样的感觉，visual studio和Rstudio由于负载过重，在打开或者加载R script时会出现加载过慢的情况，但对于很多数据工作者来说，variable inspector和data view这类的数据可视化功能必不可少，而visual studio和Rstudio在这方面做得可以说是非常完善。在这时候笔者就想到了visual studio code，毕竟作为宇宙最强IDE的减配和开源版本（这里形容可能不太准确），各种语言相应的开发插件众多。更加让笔者惊喜的是，目前vscode-R一直处于开发阶段，并且在最近的1.2.0版本结合了vscode关于web view的API，添加了R session watcher——一个集成的数据可视化构架，并且在1.21中完善了windows系统下的extension的bug。我们来看看集成的viewer会有什么样的效果：
有一些基础R包是不能清除的。想重新安装，把我们给学员准备工作的代码从第一行开始运行即可。
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