在CakePHP 3.x中，可以使用FormHelper来创建复选框，并将PHP变量与复选框关联起来。下面是一个示例代码：

// 在控制器中设置变量
$this->set('fruits', ['apple', 'banana', 'orange']);

// 在视图中使用FormHelper创建复选框
echo $this->Form->input('selected_fruits', [
    'type' => 'select',
    'multiple' => 'checkbox',
    'options' => $fruits,
    'value' => $selectedFruits // 通过控制器传递的变量
]);

上述代码中，首先在控制器中设置了一个名为fruits的变量，它包含了一组水果名称。然后，在视图中使用FormHelper的input方法创建了一个复选框。通过设置type为select，multiple为checkbox，可以生成一个复选框列表。options参数接受一个数组，其中包含了复选框的选项。value参数用于指定已选中的选项，可以将控制器中的变量$selectedFruits传递给它。

这样，当视图被渲染时，将会显示一个包含水果选项的复选框，并且已选中的选项将与$selectedFruits变量关联起来。

CakePHP提供了强大的表单处理功能，可以轻松地处理各种表单元素和数据验证。更多关于CakePHP的信息和文档可以在腾讯云的官方网站上找到：CakePHP。