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何在linux创建虚拟环境

命令,须配置环境变量: # 1、创建目录用来存放虚拟环境 mkdir $HOME/.virtualenvs # 2、打开~/.bashrc文件,并添加如下: export WORKON_HOME=$...HOME/.virtualenvs source /usr/local/bin/virtualenvwrapper.sh # 3、运行 source ~/.bashrc 创建虚拟环境的命令 :   提示...:如果不指定python版本,默认安装的是python2的虚拟环境     在python2创建虚拟环境 mkvirtualenv 虚拟环境名称 例 : mkvirtualenv py_flask...  在python3创建虚拟环境 mkvirtualenv -p python3 虚拟环境名称 例 : mkvirtualenv -p python3 py3_flask ?...提示 : 创建虚拟环境需要联网 创建成功后, 会自动工作在这个虚拟环境上 工作在虚拟环境上, 提示符最前面会出现 “虚拟环境名称”   查看虚拟环境: workon 两次tab键 ?

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conda创建虚拟环境后文件夹只有conda-meta文件夹,无法将环境添加到IDE

1.问题描述:anaconda的envs的其中一个环境目录下,没有python.exe文件,只有conda-meta和scripts 平时创建虚拟环境都是: conda create -n test...#test为创建的虚拟环境名称 因为之前也创建过好几次了,在命令行也没有报任何错误,于是准备将刚配置的test虚拟环境添加到pycharm解释器,但是发现在test环境根本找不到除conda-meta...解决方案: anaconda虚拟环境 使用的还是base环境的python/pip 当时新建xxxx虚拟环境时 并没有指定python版本 直接conda create -n xxxxx然后激活后看到python...)) 删除有问题的虚拟环境:(base环境执行) conda remove -n xxxx --all 重新新建虚拟环境,新建时指定python版本 conda create -n test python...=3.8 #test为创建的虚拟环境名称 这样就可以啦。

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何在Ubuntu14.04创建Python虚拟环境

今天小编给大家分享一下,如何在Ubuntu14.04创建Python虚拟环境,具体的教程如下。...1、同Windows一样,在Ubuntu创建虚拟环境也是需要virtualenv的,所以在创建虚拟环境之前还是要先安装virtualenv。...3、之后在当前目录下或者切换到你想创建虚拟环境的某个文件夹下输入命令“virtualenv demo”,其中demo是虚拟环境的名字,如下图所示,虚拟环境创建成功。 ?...6、如果想要创建Python2的虚拟环境,则需要回到想要创建虚拟环境的文件夹下,并输入命令“virtualenv –p /usr/bin/python2 py2”,其中py2是虚拟环境的名字,如下图所示...接下来,小伙伴们就可以自由的在Ubuntu创建Python虚拟环境和切换Python环境了。

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何在Ubuntu14.04创建Python虚拟环境

今天小编给大家分享一下,如何在Ubuntu14.04创建Python虚拟环境,具体的教程如下。...1、同Windows一样,在Ubuntu创建虚拟环境也是需要virtualenv的,所以在创建虚拟环境之前还是要先安装virtualenv。...3、之后在当前目录下或者切换到你想创建虚拟环境的某个文件夹下输入命令“virtualenv demo”,其中demo是虚拟环境的名字,如下图所示,虚拟环境创建成功。...6、如果想要创建Python2的虚拟环境,则需要回到想要创建虚拟环境的文件夹下,并输入命令“virtualenv –p /usr/bin/python2 py2”,其中py2是虚拟环境的名字,如下图所示...接下来,小伙伴们就可以自由的在Ubuntu创建Python虚拟环境和切换Python环境了。 --- End ---

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一文掌握 conda 安装配置生物信息软件

- r 1.4 创建不同的软件运行环境 这是 conda 最有特色的地方,可以通过创建不同的环境,同时运行不同软件的多个版本。...1.4.1 创建一个环境 transcriptome 安装常用转录组分析软件 # 新建一个环境,命名为 transcriptome # 环境名字为 transcriptome # 环境安装 samtools...个通道,官方推荐使用自己的通道,但没有成功 # -n 指定安装环境 -c 指定下载通道 # conda install -n phylo -c etetoolkit ete3 ete3_external_apps...也可以按前面提供的方式导出一个已经配置好的环境的 yaml文件,在其它电脑配置时直接读取。(具体导出方式见《Bioconda 软件安装神器:版本并存、环境复制、环境导出》。...如果之前已经添加好了通道,自己在~/.condarc调整顺序。

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一文掌握Conda软件安装:虚拟环境、软件通道、加速solving、跨服务器迁移

- r 创建不同的软件运行环境 这是Conda最有特色的地方,可以通过创建不同的环境,同时运行不同软件的多个版本。...创建一个环境transcriptome安装常用转录组分析软件 # 新建一个环境,命名为transcriptome # 环境名字为 transcriptome # 环境安装 samtools multiqc...个通道,官方推荐使用自己的通道,但没有成功 # -n 指定安装环境 -c 指定下载通道 # conda install -n phylo -c etetoolkit ete3 ete3_external_apps...也可以按前面提供的方式导出一个已经配置好的环境的yaml文件,在其它电脑配置时直接读取。(具体导出方式见Bioconda软件安装神器:版本并存、环境复制、环境导出。...添加Bioconda通道时,注意顺序,给予conda-forge最高优先级,其次是bioconda。如果之前已经添加好了通道,自己在~/.condarc调整顺序。

2.8K10

Conda 为什么越来越慢?

Conda 包含的软件越来越多,而且软件的不同版本都保留了下来,软件的索引文件越来越大,安装一个新软件时搜索满足环境中所有软件依赖的软件的搜索空间也会越来越大,导致solving environment...创建一个新环境conda env create -n env_name)再安装软件,这样就不用考虑与已有的软件的兼容问题了,也可以大大降低搜索空间和提高解析软件依赖的速度。...如果安装的软件提供了 environment.yaml 那么用起来,文件对应的软件版本都很明确,解析依赖关系时更快(具体导出方式见《Bioconda 软件安装神器:版本并存、环境复制、环境导出》)。...如果之前已经添加好了通道,自己在~/.condarc调整顺序。...# 去激活 source deactivate 目前在同样的操作系统(CentOS)测试可以通过,不同操作系统 centos-ubuntu 尚未测试,各位可以测试下提供下反馈。

2.9K10

python:conda简介及安装教程

/anaconda/cloud/conda-forge/ # 设置搜索时显示通道地址 conda config --set show_channel_urls yes # 删除默认源 conda config...--remove channels defaults # 查看通道地址 conda config --show channels 建议参考上图执行 6.查看所有虚拟环境 conda env list...7.创建虚拟环境 jupyter notebook是好用的交互式编辑器,cudnn是用于深度神经网络的GPU加速库,这里直接都安装到noti虚拟环境 conda create -n noti jupyter...conda list:查看环境的所有包 conda install XXX:安装 XXX 包 conda remove XXX:删除 XXX 包 conda env list:列出所有环境 conda...create -n XXX:创建名为 XXX 的环境 conda create -n env_name jupyter notebook :创建虚拟环境 activate noti(或 source

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Anaconda安装与初步使用

Anaconda是一个用于科学计算的Python发行版,支持 Linux, Mac, Windows系统,提供了包管理与环境管理的功能,可以很方便地解决版本python并存、切换以及各种第三方包安装问题...download 安装过程需要将路径加入环境变量,这样可以直接在cmd命令行调用,如果你已经安装Python环境,这里勾选时会变红,提示系统已有Python环境,如果写入PATH,那么可能会替代原环境.../ # 设置搜索时显示通道地址 conda config --set show_channel_urls yes 使用 conda list可以查看安装了哪些包 ?...conda list 环境管理。...创建一个名为python27的环境 conda create -n py27 python=2.7 # 安装好后,使用activate激活某个环境 activate python27 source

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Anaconda安装使用

Anaconda是一个用于科学计算的Python发行版,支持 Linux, Mac, Windows系统,提供了包管理与环境管理的功能,可以很方便地解决版本python并存、切换以及各种第三方包安装问题...虚拟环境管理: 在conda可以建立多个虚拟环境,用于隔离不同项目所需的不同版本的工具包,以防止版本上的冲突。...升级为3.4.x系列的当前最新版本 补充:如果创建新的python环境,比如3.4,运行conda create -n python34 python=3.4之后,conda仅安装python 3.4相关的必须项...,python, pip等,如果希望该环境像默认环境那样,安装anaconda集合包,只需要: # 在当前环境下安装anaconda包集合 conda install anaconda # 结合创建环境的命令...//mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free/ # TUNA的help镜像地址加有引号,需要去掉 # 设置搜索时显示通道地址 conda config

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conda:基于python的软件管理系统

何在一台服务器上同时安装不同版本的python,不同版本的package, 而且不互相干扰,是一个令人头痛的问题。...为了解决这个问题,首先是virtualenv这个包的发明,实现了python环境的隔离,接下来就是conda的出现,conda不仅仅解决了python的环境隔离问题,还进一步扩展,支持任意软件的隔离。...从安装文件的大小也可以看出,Anaconda是Miniconda的8倍。...在安装程序, 也是不推荐你直接添加环境变量的。这就意味着,你需要切换到对应的安装目录下,才可以访问其可执行程序。...在后续的文章,会对这些内容进行详细的描述。 ·end· —如果喜欢,快分享给你的朋友们吧— 原创不易,欢迎收藏,点赞,转发!生信知识浩瀚海,在生信学习的道路上,让我们一起并肩作战!

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Linux学习 - 又双叒叕一个软件安装方法

r - defaults - conda-forge 创建不同的软件运行环境 这是Conda最有特色的地方,可以通过创建不同的环境,同时运行不同软件的多个版本。...# ete3存在于2个通道,官方推荐使用自己的通道,但没有成功 # -n 指定安装环境 -c 指定下载通道 # conda install -n phylo -c etetoolkit ete3...bokeh ggplot # 最后退出新环境 source deactivate r 创建比对工具环境 (bioconda的例子,https://bioconda.github.io/index.html...#set-up-channels) # 环境名字为 aligners # 环境安装 bwa bowtie hisat star conda create -n aligners bwa bowtie...,也就是上面conda create建立的环境 # -b:一般不需要指定,如果conda没在环境变量需要给出conda的安装路径 conda_env_run.sh -c 'ete3 -h mod'

2.1K60

如何利用conda管理python环境

使用conda create 命令可以创建环境conda create --name ncl -c conda-forge ncl=6.4.0 # --name 参数用来指定环境名,即新创建环境名为...ncl # -c 参数用来指定源通道 conda-forge 为源通道别名 # ncl=6.4.0 为从源通道下载指定版本的包 上述命令是通过conda安装ncl,目前不支持windows系统安装...-n, --name 环境名 -c CHANNEL 指定通道 --channel-priority 源通道优先于软件包版本 --no-channel-priority 软件包版本优先于源通道...构建相同的conda环境 使用显示说明文件可以在相同的机器或不同机器上的相同操作系统下创建相同的环境。...通过说明文件创建环境时,conda不会检查依赖,创建之前要确保文件没问题。 加入环境变量 conda环境可以包括已经保存在 Linux,OS X,Windows系统的环境变量。

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Bioconda软件安装神器:版本并存、环境复制、环境导出

/ - conda-forge 创建不同的软件运行环境 这是Conda最有特色的地方,可以通过创建不同的环境,同时运行不同软件的多个版本。...个通道,官方推荐使用自己的通道,但没有成功 # -n 指定安装环境 -c 指定下载通道 # conda install -n phylo -c etetoolkit ete3 ete3_external_apps...ggplot conda install -c https://conda.binstar.org/bokeh ggplot # 最后退出新环境 source deactivate r 创建比对工具环境...conda install -c r -n r r-essentials=1.6.0 R会安装于conda_path/envs/r/bin,软链到位于环境变量的目录即可正常使用。...,也就是上面conda create建立的环境 # -b:一般不需要指定,如果conda没在环境变量需要给出conda的安装路径 conda_env_run.sh -c 'ete3 -h mod'

1.9K10

Anaconda使用

假设我们需要安装Python 3.4,此时,我们需要做的操作如下: # 创建一个名为python34的环境,指定Python版本是3.4(不用管是3.4.x,conda会为我们自动寻找3.4.x的最新版本...创建一个名为python34的环境,指定Python版本是3.4(不用管是3.4.x,conda会为我们自动寻找3.4.x的最新版本) conda create --name python34 python...3.4相关的必须项,python, pip等,如果希望该环境像默认环境那样,安装anaconda集合包,只需要: # 在当前环境下安装anaconda包集合 conda install anaconda...//mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free/ # TUNA的help镜像地址加有引号,需要去掉 # 设置搜索时显示通道地址 conda config.../anaconda/pkgs/free/ # TUNA的help镜像地址加有引号,需要去掉   # 设置搜索时显示通道地址 conda config --set show_channel_urls yes

2.2K41

Conda:误解与迷思

个结果:这些是我的Conda / Python环境的包,这些包基本上是由Python-only工具(pip和virtualenv)无法管理的。...如果你想避免这些困难,一个更好的想法是pip安装conda,然后创建一个新的conda环境安装conda包。...从历史上看,默认conda通道的软件包构建过程没有尽可能开放,并且获取构建更新的过程主要依赖于在Continuum上知道某人。谣言是,这主要是因为原始的conda创建过程没有像今天一样明确和精简。...一旦pull请求合并,在Windows,OSX和Linux上的二进制版本将自动创建并加载到conda-forge通道。...也许PyPI可以利用conda-forge的现有构建系统,并创建一个选项来自动构建平台轮和源分发,并在一个透明的命令自动推送到PyPI。这绝对是一种可能性。

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远程工作利器:高效指南教你如何在Linux服务器上部署Jupyter Notebook并实现安全远程访问

远程工作利器:高效指南教你如何在Linux服务器上部署Jupyter Notebook并实现安全远程访问 1.安装 Anaconda和python 你可以在终端运行以下命令来检查是否已安装: python...、Paddle、tensorflow、pytorch,GPU[cuda12.4、cudnn]、CPU安装教学,版本cuda11.2 自由切换 #1.创建指定python版本的环境 conda create...激活环境 conda activate your-env #3.退出环境 conda deactivate 2.安装 Jupyter 使用 pip 安装 Jupyter。...conda install nb_conda 安装完成后,需要在服务器重新启动一下 Jupyter notebook,会发现多了一个菜单栏 Conda 在服务器创建一个虚拟环境 python312...多个 Python 版本 kernel 配置 虽然上面已经创建了虚拟环境,并显示出来了,但是在创建新的 notebook 时并显示 python312,因为 python312 存在不同的虚拟环境里面,

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万字长文:深度全面了解Conda的各种骚操作,强烈建议收藏

创建/删除 查看既存环境conda env list 创建虚拟环境conda create -n [环境名称] [安装库包列表] 查看环境列表:conda env list 引申知识 启动新创建环境...:oldgeek-study 新创建环境安装所需包:oldgeek-study 退出新环境:输入exit 删除环境conda remove -n [环境名称] --all 创建个低版本的环境:Python3.8...环境创建/删除 conda最有特色的点,可以便利创建不同的开发环境,对开发环境进行管理 查看既存环境conda env list (base) coder@192 ~ % conda env list...oldgeek-study (oldgeek-study) coder@192 ~ % 新创建环境安装所需包:oldgeek-study 安装网络HTTP包:rquests,悲剧安装失败 (oldgeek-study...创建环境也可以使用pip安装,执行命令:pip install requests pip 是一个Python包管理工具,主要是用于安装 PyPI 上的软件包。

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