这个R教程讲解如何使用R和ggplot2包创建线图。 在一个线图中，观察值都按照x排列并连接起来。 可以使用函数geom_line()、geom_step()或geom_path()。...10.0 ## 6 OJ D2 29.5 len : 牙齿长度 dose : 药物剂量，以毫克为单位 (0.5, 1, 2) supp : 添加类型 (VC or OJ) 创建线图 在下面的图中...按组别改变线型 下面图中，组别的线型、点类型都是根据变了supp自动控制的： # 按组别 (supp) 改变线型 ggplot(df2, aes(x=dose, y=len, group=supp))...阅读更多线型： ggplot2 line types[2] 如果你想要更改点的类型，阅读文章 ggplot2 point shapes[3]。...() # 绘制子集 ggplot(data=subset(economics, date > as.Date("2006-1-1")), aes(x=date, y=pop))+geom_line
首先需要加载ggplot2包 library(ggplot2) library(gcookbook) #主要用于获取数据集,若你用自己的数据集便可以不加载 1.画点线图....geom_point() #绘制点图 ggplot(pressure, aes(x=temperature, y=pressure)) + geom_line() #绘制线图 ggplot...(pressure, aes(x=temperature, y=pressure)) + geom_line() + geom_point() #绘制点线图,相当于图层一个个叠加上去 2.画条形图 基础绘图系统...,箱线图,图中有离群点 qplot: qplot(ToothGrowth$supp, ToothGrowth$len, geom="boxplot") qplot(interaction(ToothGrowth...$supp, ToothGrowth$dose), ToothGrowth$len, geom="boxplot") #二个分类型,箱线图,图中有离群点这里是两个
单线图 假设有这么一个矩阵，第一列为转录起始位点及其上下游5 kb的区域，第二列为H3K27ac修饰在这些区域的丰度，想绘制一张线图展示。...有点难看，如果平滑下，会不会好一些，stat_smooth可以对绘制的线进行局部拟合。在不影响变化趋势的情况下，可以使用 (但慎用)。...(method="auto", se=FALSE) + theme(legend.position=c(0.1,0.8)) p dev.off() 从图中看，趋势还是一致的，线条更优美了。...stat_smooth和geom_line各绘制了一条线，只保留一条就好。...当为数值时，ggplot2会选择合适的几个刻度做标记，当为文本时，会全部标记。另外文本横轴，smooth效果不明显 (下面第2张图)。 ? ?
ggplot2是《The Grammar of Graphics》/《图形的语法》中提出了一套图形语法，将图形元素抽象成可以自由组合的要素，类似Photoshop中的图层累加，ggplot2将指定的元素...更加深入学习ggplot2，请参考《ggplot2: 数据分析与图形艺术》。 目 录 引言：ggplot2基本要素 1....函数速查表 引言：ggplot2基本要素 “+”和“%+%” 数据（data）和映射（mapping）:想要可视化的数据（data）以及一系列将数据中的变量对应到图形属性的映射（mapping）；ggplot2...几何对象（geometric）:几何对象（geom）代表你在图中实际看到的元素，如点、线、多边形等。 统计变换（statistics）:统计变换（stat）是对数据进行的某种汇总。...其中各要素通过“+”以图层(layer)的方式来粘合构图（可以简单理解为要素/图层叠加符号）；另外在ggplot2中，数据集必须为数据框(data.frame)格式，并且可以通过%+%符号调整已有数据集
R语言中的ggplot2库进行了重新实现。...使用plotnine，你可以轻松地创建各种类型的图形，包括散点图、折线图、柱状图、箱线图等。它支持对数据进行分组、筛选和变换，可以添加标签、标题、图例等元素，还可以自定义颜色、线型、点型等图形属性。...数据是要可视化的原始数据，映射是将数据映射到图形属性上，图形元素是构成图形的基本单元，如点、线、面等。...除了散点图，plotnine还支持许多其他类型的图形，如折线图、柱状图、箱线图等。你可以使用不同的函数来创建不同类型的图形元素，并通过调整参数来自定义图形的样式。...，可参考plotnine包官网[1] 总结 plotnine虽然是变相的使用Python语言对ggplot2包绘图函数的封装，但其也继承了两者的优点： 易学易用：类似ggplot2的语法，上手简单，数据可视化不再困难
本文将从ggplot2的八大基本要素逐步介绍这个强大的R可视化包。...三 几何对象（Geometric） 几何对象代表我们在图中实际看到的图形元素，如点、线、多边形等。...#设置position="dodge"，side-by-side地画直方图 ggplot(diamond)+geom_histogram(aes(x=price, fill=cut), position...ggplot2的图层设置函数对映射的数据类型是有较严格要求的，比如geom_point和geom_line函数要求x映射的数据类型为数值向量，而geom_bar函数要使用因子型数据。...以上就是ggplot2的八大要素，七颗龙珠可召唤神龙，八大要素合理使用可画出“神龙”，?！！！
、形状或大小等图形属性的一个映射，其中还可能包含对数据进行统计变换（如求均值或方差），最后将这个映射绘制在一定的坐标系中就得到了我们需要的图形。...图中可能还有分组，就是生成关于数据的不同子集的图形。...但请记住这种用法，这是叠加图层的基础； qplot(displ, hwy, data=data)+ geom_smooth()+ geom_line() 3.1.2 标度 标度控制数据到图形属性的映射...，当传入的属性值非正常输入时，譬如colour中输入的是data中某列类别型变量时，整个绘图过程不会有异常，因为ggplot2内部非常“宽容”地对类别型变量进行了标度转换，如下例： qplot(displ..., hwy, data=data, colour=drv)+ geom_smooth()+ geom_line() drv是一列字符型的数据，有f、r、4三种类型，坦白的说，若不是在这里进行绘图
这使得分析人员可以更好地掌握和比较不同地区的数据，从而更好地发现数据的规律和趋势。 geofacet的主要功能包括： 网格化绘图：Geofacet提供了一系列函数和工具，可以将地图网格化成多个小图形。...多维比较：通过将地图网格化成小图形，Geofacet可以方便地展示多个指标和变量之间的关系。例如，可以在多个小区域图中比较不同地区的人口、经济、教育等指标，以及它们之间的关系和趋势。...可扩展性：Geofacet可以与其他R语言中的数据可视化工具包无缝集成，例如ggplot2、leaflet等，从而扩展其功能和应用范围。...「geofacet绘图样例介绍」 library(ggplot2) ggplot(state_ranks, aes(variable, rank, fill = variable)) + geom_col..., aes(year, rate)) + geom_line() + facet_geo(~ state, grid = "us_state_grid2") + scale_x_continuous
几何对象是用以呈现数据的几何图形对象，如条形、线条和点。 图形属性是几何对象的视觉属性，如x坐标和y坐标、线条颜色、点的形状等。 数值的值和图形属性之间存在着某类映射。...用几何函数指定图的类型 ggplot()函数指定要绘制的数据源和变量，几何函数则指定这些变量如何在视觉上进行表示。目前，有37个几何函数可供使用。以下列出常用的函数。...Salaries by yrs.png 统计函数： ggplot2包中含有大量统计函数来计算所需的量，从而生产更多的可视化数据。通常情况下，几何函数隐式地调用统计函数，我们不需要直接处理这些问题。...修改ggplot2图形的外观 R的基础绘图中,使用par()函数或特定的画图函数的图形参数来自定义基本函数。遗憾的是，这些对ggplot2图形没有影响，该包提供了特定了函数来改变其图形的外观。...mytheme.png 多重图 基础绘图中，我们使用图形参数mfrow和基本函数layout()把两个或多个基本图放到单个图中，同样，这种方法在ggplot2中不适用。
#geom_point()完成的就是几何对象的映射，ggplot2提供了各种几何对象映射，如geom_histogram用于直方图，geom_bar用于画柱状图，geom_boxplot用于画箱式图等等...同样可以根据另外的变量给它填充颜色，比如按不同的切工： ggplot(small)+geom_histogram(aes(x=price, fill=cut)) #可以将其分开，side-by-side地画直方图...ggplot(small)+geom_bar(aes(x=clarity)) #柱状图两个要素，一个是分类变量，一个是数目，也就是柱子的高度。...ggplot2提供了很多的geom_xxx函数，可以满足我们对各种图形绘制的需求。...geom_errorbar geom_errorbarh geom_freqpoly geom_hex geom_histogram geom_hline geom_jitter geom_line
那么今天我们就为大家介绍一下目前在R语言中流行的绘图包ggplot2。 1. ggplot2的安装：install.packages("ggplot2")。...3. ggplot2的函数介绍： ggplot2里的所有函数可以分为以下几类： 用于运算（我们在此不讲，如fortify_，mean_等） 初始化、展示绘图等命令（ggplot，plot，print等）...geom_freqpoly 频率多边形（类似于直方图） geom_hex 六边形图（通常用于六边形封箱） geom_histogram 直方图 geom_hline 水平线 geom_jitter 点、自动添加了扰动 geom_line...这些承载图形属性的对象可能是点，可能是线，可能是bar stat :统计变换比如求均值，求方差等，当我们需要展示出某个变量的某种统计特征的时候，需要用到统计变换 annotate：添加注释 #由于设置的文本会覆盖原来的图中对应的位置...theme函数采用了四个简单地函数来调整所有的主题特征：element_text调整字体，element_line调整主题内的所有线，element_rect调整所有的块，element_blank清空
英国广播公司（British Broadcasting Corporation；BBC）是全球最大的新闻媒体，其中各类新闻稿件采用的统计图表能很好地传达信息。...为了方便清洗可重复数据和绘制图表，BBC数据团队用R对数据进行处理和可视化，经年累月下于去年整理绘图经验并开发了R包-bbplot，帮助我们画出和BBC新闻中一样好看的图形。...下面的代码显示了如何在标准图表制作工作流程中使用bbc_style（）。这是一个非常简单的折线图的示例，使用了gapminder程序包中的数据。...% filter(country == "Malawi") #Make plot line <- ggplot(line_df, aes(x = year, y = lifeExp)) + geom_line...) + labs(title="Living longer", subtitle = "Life expectancy in China and the US") R语言 - 线图绘制
接下来我以几个案例的形式对图表辅助线操作进行演示： library(ggplot2) library(reshape2) library(ggthemes) data图中也是经常使用的一种图表元素，它可以帮助我们对分布形态进行分割和归纳，使得数据分布形态及趋势更加明显。 接下来使用diamond数据集来展示散点图中的辅助线。...像素画处理之后，再加上均值十字线，你可以清晰地看到，数据分布形态中，左下角最为密集。 辅助线的另外一种常见的用途就是在时间序列数据中。...ggplot(economics,aes(date,unemploy))+geom_line() ?...start是一个代表日期的字段，也就是说我们可以赋值给geom_vline函数一个字段，从而在折线图中绘制出多个时间点的辅助线。
01") %>% rename(date = Date, gdp = Value) %>% mutate(lgdp = log(gdp)) # Take logs library(ggplot2...此外，似乎或多或少有规律地围绕这一趋势波动。与趋势之间存在相对较长的持久偏差，可以将其视为周期性波动。 与线性趋势的偏差 从系列中提取趋势的第一种方法是在常数和趋势项上回归目标变量并获得拟合值。...在下图中绘制。...下图绘制了由HP过滤器获得的实际GDP周期性成分的值，并将其与线性趋势下的序列的值进行比较。 尽管HP过滤器在经济学中得到了广泛的应用，但它们的某些功能也受到了广泛的批评。...该方法的优点是该函数不仅允许提取序列的趋势，周期和噪声，而且还可以更明确地了解周期发生的时间段。 R中的方法实现也很简洁，但是在使用之前需要进行一些其他的数据转换。
ggplot2 R的作图工具包，可以使用非常简单的语句实现非常复杂漂亮的效果。...qplot 加载qplot library(ggplot2) # 测试数据集，ggplot2内置的钻石数据 qplot(carat, price, data = diamonds) dsmall 图中比较不同分类的差异。...geom_area() geom_bar() geom_line() geom_point() geom_polygon() geom_text() geom_tile() > library("ggplot2...几何对象(Geometric)：几何对象代表我们图中看到的图形元素，如点、线、多边形等。 ? 统计变换(Statistics)：对原始数据进行某种计算，例如二元散点上加上一条回归线。 ?
，如热图、小提琴图、带误差线的折线图等等。...它支持多种编程语言，如 Python、R、JavaScript 等等。...它可以绘制出高质量的折线图、散点图、柱状图、条形图等等。...Wave') p.line(x, y, legend_label='Sine') show(p) Altair Altair 是一个基于 Vega-Lite 的 Python 可视化库，可以快速轻松地绘制出高质量的折线图...as pd df = pd.read_csv('data.csv') ggplot(df, aes(x='date', y='value', color='variable')) + \ geom_line
而各位大佬在写好包后会心有灵犀的上传到R包的仓库，即CRAN，bioconductor等，以便于大家下载使用~~书中会多次使用tidyverse这个用于共享如何构建以及使用数据的R包合集，让大家更轻松地使用数据...本章主要帮助我们从基础绘图过度到ggplot2之中。 2.1绘制散点图 Q: 如何绘制散点图？...绘制散点图 library(ggplot2) ggplot(mtcars, aes(x= wt, y= mpg))+geom_point() #这里的第一部分ggplot2创建绘图对象，将数据框传递给该函数...绘制折线图 ggplot(pressure,aes(x=temperature,y=pressure))+geom_line()+geom_point() #使用geom_line()得到类似的结果...A: 1.hist()函数绘制直方图 hist(mtcars$mpg,breaking=10)#通过breaks参数指定组距 2.使用ggplot2绘制直方图 ggplot(mtcars,aes(x=
5.8.2 ggplot2的原理 如果要使用ggplot2绘制数据，则数据必须是数据框。 使用aes映射函数来指定数据框中的变量如何映射到图上的要素 使用geoms来指定数据在图表中的表示方式，例如。...5.8.3 使用aes映射功能 该aes函数指定数据框中的变量如何映射到绘图上的要素。...例如，我们可以从该图中看出，基因18在细胞10中高度表达，但在细胞1中低表达。 该图还为我们提供了有关聚类算法结果的信息。通常，聚类算法旨在将数据点（例如，细胞）分成其成员彼此更相似的组。...通过转换，使得第一主成分尽可能地考虑数据的可变性，并且每个后续主成分考虑了在必须与先前成分正交的约束下可能的最大方差量。...我们将研究如何在未来的实验室中更深入地使用单细胞RNA-seq分析中的PCA图，这里的目的是让您大概了解PCA图是什么以及它们是如何生成的。 让我们为我们的test数据制作一个PCA图。
library(ggplot2) # Grammar of graphics library(cowplot) # Arranging multiple plots into a grid library...使用 geom_errorbar() 添加误差项；使用 stat_function() 将对数正态的密度函数加入图中（当然也可以使用 geom_line()）。...，接下来绘制第二个子图。...绘制子图二（曲线图） 方式一：定义曲线函数，然后通过 geom_line() 进行绘制。...方式二：加载图形（公式），通过 annotation_custom() 结合 rasterGrob()，将该图导入到子图中。
这个图在科研绘图中较为常用，例如：将算法的收敛情况和计算所耗时间同时绘制。...library(ggplot2) # Grammar of graphics 设置主题 接下来，为了方便起见，作者在绘图前设置好了主题，并将该函数命名为 my_theme。...绘制单轴 首先，处理下第一个线性图所需要的数据，一共是两列。...学会融会贯通，用到自己的科研绘图中。 先简单绘制出线性图，可以看到：在 x 轴附近， y 轴下降的很快。...之后使用 annotation_custom(ggplotGrob(panel_D1)) 将前面那幅图添加到该图中。
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