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Python在生物信息学中的应用:序列化Python对象

我们需要将Python对象序列化为字节流,这样就可以将其保存到文件中、存储到数据库中或者通过网络连接进行传输。 解决方案 序列化最普遍的做法是使用 pickle 模块。...pickle 是一种Python特有的自描述的数据编码。通过自描述,被序列化后的数据包含每个对象开始和结束以及它的类型信息。因此,你无需担心对象记录的定义,它总是能工作。...你可以看到线程又奇迹般的重生了,从你第一次序列化它的地方又恢复过来。 pickle 对于大型的数据结构比如使用 array 或 numpy 模块创建的二进制数组效率并不是一个高效的编码方式。...如果你需要移动大量的数组数据,你最好是先在一个文件中将其保存为数组数据块或使用更高级的标准编码方式HDF5 (需要第三方库的支持)。...对于最常见的使用场景,你不需要去担心这个,但是如果你要在一个重要的程序中使用pickle去做序列化的话, 最好去查阅一下 官方文档 (https://docs.python.org/3/library/

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RPC的序列化方案详解

byte数组化为student对象 ByteArrayInputStream bis = new ByteArrayInputStream(data); Hessian2Input input = new...Integer 2.4 Protobuf Protobuf 是 Google 公司内部的混合语言数据标准,是一种轻便、高效的结构化数据存储格式,可以用于结构化数据序列化,支持Java、Python、C+...byte数组化为student对象 StudentProtobuf.StudentMsg deStudent = StudentProtobuf.StudentMsg.parseFrom(data);...4.2 对象太庞大 RPC请求经常超时,排查后发现他们的入参对象非常得大,比如为一个大List或者大Map,序列化之后字节长度达到了上兆字节。...4.3 使用序列化框架不支持的类作为入参类 Hessian天然不支持LinkHashMap、LinkedHashSet等,而且大多数情况下最好不要使用第三方集合类,Guava中的集合类,很多开源的序列化框架都是优先支持编程语言原生的对象

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Redis 与序列化

序列化概念 序列化:把对象转化为可传输的字节序列过程称为序列化。 反序列化:把字节序列还原为对象的过程称为反序列化。 ?...为什么需要序列化 序列化最终的目的是为了对象可以跨平台存储,和进行网络传输。而我们进行跨平台存储和网络传输的方式就是IO,而我们的IO支持的数据格式就是字节数组。...因为我们单方面的只把对象转成字节数组还不行,因为没有规则的字节数组我们是没办法把对象的本来面目还原回来的,所以我们必须在把对象转成字节数组的时候就制定一种规则(序列化),那么我们从IO流里面读出数据的时候再以这种规则把对象还原回来...Jackson2JsonRedisSerializer:使用Jackson库将对象序列化为JSON字符串。优点是速度快,序列化后的字符串短小精悍,不需要实现Serializable接口。...但这个 toString 不一定能解析的回来。如果使用 java 原生序列化方式,可能会有远程代码执行问题,因此建议使用其他序列化方式代替。

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序列化与反序列化:核心概念解析

序列化和反序列化是计算机科学中的基本概念,广泛用于数据存储、传输和处理。让我们深入了解这两个概念,以及它们如何在实际开发中运用。...远程通信:在网络传输中,将对象序列化为字节流,方便在网络间传输。 缓存:将对象序列化后存储在缓存中,以提高读取效率。...(Deserialization) 2.1 定义 反序列化序列化的逆过程,即将某种特定格式(字节流、JSON、XML 等)转换回原始的数据结构或对象状态。...2.2 应用场景 数据读取:从文件或数据库中读取序列化后的数据,并反序列化为原始对象。 网络通信:接收网络传输的字节流,并反序列化为本地可用的对象。...序列化负责将数据结构化为可存储和传输的格式,而反序列化则是这个过程的逆操作。通过了解和掌握这两个概念,我们可以更加灵活地在各种应用场景中处理数据,为我们的开发工作带来极大便利。

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【Android Protobuf 序列化】Protobuf 使用 ( Protobuf 序列化 | Protobuf 反序列化 )

使用 ( Protobuf 源码分析 | 创建 Protobuf 对象 ) 中 , 创建了 Protobuf 对象 , 本博客中将序列化 , 保存到本地文件中 ; 序列化操作 : 调用 Protobuf...对象的 toByteArray 方法 , 可以将对象序列化为字节数组 ; // 将 addressBook 对象转为字节数组 var bytes: ByteArray...Log.i(TAG, "序列化耗时 ${System.currentTimeMillis() - serializeStart} ms , 序列化大小 ${bytes.size} 字节") 日志打印结果...: 2021-04-27 10:11:17.053 10000-10000/kim.hsl.protobuf I/MainActivity: 序列化耗时 4 ms , 序列化大小 34 字节 二、Protobuf...反序列化 ---- 反序列化操作 : 调用 Protobuf 对象的 parseFrom 方法 , 传入字节数组作为参数 , 可以字节数组序列化为 Protobuf 对象 ; var deserializeAddressBook

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protobuf 序列化和反序列化

前言 Protocol Buffers(protobuf)是一种轻量级的数据交换格式,可以用于结构化数据的序列化和反序列化。它使用二进制格式来编码数据,以提高传输效率和数据压缩比。...序列化是将结构化数据转换为一系列字节的过程,反序列化则是将字节流解析为结构化数据的过程。 序列化的过程通常涉及以下步骤: 定义消息类型:使用.proto文件定义消息类型和字段。...序列化数据:使用protobuf库,将消息对象序列化为字节数组。 传输数据:将字节数组发送给接收方。...反序列化数据:接收方使用protobuf库,将字节数组序列化为消息对象,并访问其中的字段。 在序列化过程中,protobuf使用压缩技术来减小数据的大小,从而提高传输效率。...支持多种数据类型:protobuf支持各种基本数据类型(整数、字符串、布尔值等),以及复杂的数据类型(嵌套消息、枚举等),可以灵活地描述和处理各种数据结构

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【Java编程进阶之路 07】深入探索:Java序列化的深层秘密 & 字节

对于不同类型的字段(基本类型、对象、数组等),有不同的序列化方式。 瞬态(transient)字段和静态字段不会被序列化。 写入字节流: writeObject方法负责将对象写入字节流。...对于不同类型的字段,有不同的序列化策略。例如,基本类型字段会被转换为相应的字节表示,对象引用会被递归地序列化为其组成部分的字节表示,数组会被逐个元素地序列化。...例如,基本类型字段会从字节表示中恢复,对象引用会被递归地反序列化为相应的对象,数组会被逐个元素地反序列化为数组对象。 返回重构后的对象:反序列化完成后,会返回重构后的对象。...避免序列化不必要的信息,临时变量、缓存数据等。 对于复杂的数据结构,考虑使用嵌套序列化或自定义序列化方式,以减少冗余数据。...例如,对于数组或列表等连续数据结构,可以使用更高效的编码和解码算法。 考虑使用并行化技术来加速序列化和反序列化的过程,特别是在多核处理器上。

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Protobuf用过没?

可以在协议中以\0结尾表示结束,也可以在字符串 以固定长度来表示,比如255 在字符串的表述前面加一个长度,这样也可以用来表示任意长度的,任意字符的字节数组: 比如上述的Student就读过多所School...作为客户端,将序列化的内容发送到服务端。 反序列化: 一般来说接受到数据的服务器再将数据反序列化为内存里对象的结构状态,便于我们去操作。...其实除了分布式的网络访问方式,有时候也可以在同一个进程里跨语言调用,比如C#/Python/Golang调用C++的代码,使用了Protobuf也就不用过于关心不同语言之间数据类型兼容的问题,调用的时候只需要传入一个序列化的数据地址和数据大小...,包括设置/获取接口,序列化与反序列化等。...ParseFromString反序列化 在有些系统构成中,可能还需要用到json,也可以直接使用MessageToJsonString将对象序列化为一个json #include

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python simplejson模块浅

PYTHON中,basestring派生了unicode类型和str类型     unicode字符串是一个编码点序列,该序列在内存中会被表示成一组字节(0-255),str是指8字节流。     ...把对象转换为字节序列的过程称为对象的序列化,比如把一个字典对象以某种格式(JSON)写到文件中;把字节序列恢复为对象的过程称为对象的反序列化,比如读取某种格式化(JSON)的文件,构造一个字典对象。     ...在python的library文档中将JSON归为网络数据控制类,很好的说明了他们的用途,主要用于网络数据控制,编解码等。...结构)读取为python对象 simplejson.loads(s, **kwargs):从字符串中(包含JSON结构)读取为python对象 class simplejson.JSONDecoder.../text.json', 'w+') json.dump([1,2], fp)         ##将python数组进行序列化,保存到文件中 fp.seek(0) print "----dump---

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Carson带你学序列化:Google出品的序列化神器Protocol Buffer使用攻略

作用 通过将 结构化的数据 进行 串行化(序列化),从而实现 数据存储 / RPC 数据交换的功能 序列化: 将 数据结构或对象 转换成 二进制串 的过程 反序列化:将在序列化过程中所生成的二进制串 转换成...(); // 序列化消息 并 返回一个包含它的原始字节字节数组 protocolBuffer.parseFrom(byte[] data); // 从一个字节数组序列化(解析) 消息 <-- 方式...(); // 把 person消息类对象 序列化为 byte[]字节数组 System.out.println(Arrays.toString(byteArray1));...= Demo.Person.parseFrom(byteArray1); // 当接收到字节数组byte[] 反序列化为 person消息类对象 System.out.println...其他编码方式, Json、XML等等 即将 Protocol Buff 对象 转化为其他编码方式的数据存储对象 下面展示的是 将 Protocol Buff 对象 转化为 Json对象 //

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Java编解码

编解码 Java序列化的目的主要有两个: 1.对象序列化 2.网络传输 当进行远程跨进程服务调用时,需要把被传输的对象转化为字节数组或者ByteBuffer对象。...当远程服务读取到字节数组或者ByteBuffer对象时,需要将其解码为Java对象。这就是所谓的Java对象编解码技术。...Java序列化 Serializable JDK1.1已经提供序列化功能,不需要额外的类库。一般远程调用(RPC)很少使用Java自带的序列化进行消息的编解码和传输。...Java序列化缺点: 无法跨语言 序列化后的码流太大 序列化性能低 主流编码框架 Google的Protobuf 特点: 结构化数据存储格式 编码性能高 语言无关,平台无关,扩展性好 支持...Java,C++和Python FaceBook的Thrift Thrift支持三种典型的编解码方式 通用二进制编解码 压缩二进制编解码

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使用Python验证并利用Redis未授权漏洞

文章来源|MS08067 Web高级攻防第3期作业 本文作者:huang(Web高级攻防3期学员) Python序列化与反序列化 原理 Python序列化是将Python对象及其所拥有的层次结构化为一个字节流的过程...,反序列化是将字节流转化回一个对象层次结构。...Python对象序列化模块间的关系 在python中通常使用json、pickle/cPickle以及marshal、shelve等方式进行序列化和反序列化操作。...Pickle模块序列化与反序列化 pickle序列化与反序列化函数 函数 说明 dumps 对象反序列化为bytes对象 dump 对象反序列化到文件对象,存入文件 loads 从bytes对象反序列化...load 对象反序列化,从文件中读取数据 与 PHP 序列化相似,Python 序列化也是将对象转换成具有特定格式的字符串(python2)或字节流(python3),以便于传输与存储 python2

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Java对象为啥要实现Serializable接口?

,而读操作则又涉及将字节流转化为编程语言类型的特定数据类型。...下面我们可以通过例子来实现将序列化的对象存储到文件,然后再将其从文件中反序列化为对象,代码示例如下: 先定义一个序列化对象User: public class User implements Serializable...序列化是指把对象转换为字节序列的过程,我们称之为对象的序列化,就是把内存中的这些对象变成一连串的字节(bytes)描述的过程。 而反序列化则相反,就是把持久化的字节文件数据恢复为对象的过程。...,那么反序列化的过程中将会导致InvalidClassException异常。...有个特殊的地方需要注意的是,数组类是不能显示地声明serialVersionUID的,因为它们始终具有默认计算的值,不过数组类反序列化过程中也是放弃了匹配serialVersionUID值的要求。

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Hadoop重点难点:Hadoop IO压缩序列化

序列化 序列化是指将结构化对象转化为字节流以便在网络上传输或写到磁盘进行永久存储的过程。反序列化是指将字节流转回结构化对象的逆过程。...RPC协议将消息序列化成二进制流后发送到远程节点,远程节点接着将二进制流反序列化为原始消息。...BytesWritable BytesWritable 是对二进制数据数组的封装。它的序列化格式为一个指定所含数据字节数的整数域(4字节),后跟数据内容的本身。...例如,长度为2的字节数组包含数值3和5,序列化形式为一个4字节的整数(00000002)和该数组中的两个字节(03和05) NullWritable NullWritable 是 writable 的特殊类型...只要能够被 Sertialization 序列化和反序列化,任何类型都可以。

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Hadoop重点难点:Hadoop IO压缩序列化

序列化 序列化是指将结构化对象转化为字节流以便在网络上传输或写到磁盘进行永久存储的过程。反序列化是指将字节流转回结构化对象的逆过程。...RPC协议将消息序列化成二进制流后发送到远程节点,远程节点接着将二进制流反序列化为原始消息。...BytesWritable BytesWritable 是对二进制数据数组的封装。它的序列化格式为一个指定所含数据字节数的整数域(4字节),后跟数据内容的本身。...例如,长度为2的字节数组包含数值3和5,序列化形式为一个4字节的整数(00000002)和该数组中的两个字节(03和05) NullWritable NullWritable 是 writable 的特殊类型...只要能够被 Sertialization 序列化和反序列化,任何类型都可以。

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Python是怎样处理json模块的

; 对象与对象之间用逗号隔开; “{}”用来保存对象; “[]”用来保存数组; json跟python中的字典看起来很像,两者之间的区别?...1)json的key只能是字符串,dict的key可以是任何可hash的对象,例如:字符串、数字、元组等; 2)字典是一种数据结构,json是一种数据格式;字典有很多内置函数,有多种调用方法,而json...是数据打包的一种格式,并不像字典具备操作性; 3)json的字符串强制用双引号,dict的字符串可以用单引号、双引号; 一般而言,我们会把json转化为python中的字典或者列表,再对其进行操作。...Python处理json的模块:json Pythone3的标准库JSON模块,可以很方便的帮我们进行json数据的转换和处理,这里主要指序列化(json.dumps()、json.dump())和反序列化...序列化和反序列化: 将对象转换为可通过网络传输或可以存储到本地磁盘的数据格式(:XML、JSON或特定格式的字节串)的过程称为序列化;反之,则称为反序列化

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python|浅谈Python中的pickle模块

Pickle模块的作用 Pickle模块用于将python对象序列化为字节流,可存储在文件或数据库中,也可同通过网络进行传输。...使用反序列化(Unpickle)可以将生成的字节流转换回python对象。...“Pickling”是将Python对象层次结构转换为字节流的过程,“unpickling”是反向操作,从而将字节流(来自二进制文件或类似字节的对象)转换回对象层次结构。...酸洗(或去除)也可称为“序列化”,“编组”,不要将其与marshal模块混淆或“扁平化”; 但是,为了避免混淆,这里使用的术语是“酸洗”和“破坏”。 什么叫序列化?...把对象在内存中的结构转换成便于存储或传输的二进制或文本格式,而且以后可以在同一个系统或不同的系统中重建对象的副本。pickle模块能把任何Python对象序列化成二进制格式。 ?

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