参考文章http://www.bioinfo-scrounger.com/archives/342计算FPKM值,发现计算完每个基因下所有外显子的总长度后,记录的都是ENSEMBL gene id,而我需要的是...奇怪的是GenomicFeatures既然把GTF文件读取进去了还抽取基因id了,但它就是不提供抽gene symbol的功能。...谷歌了一波没有发现满意的答案,有个refGenome包好像可以做,但读取文件半天卡死了,特别奇怪。最后还是自己动手,完成了6万个gene feature的转换。...整个提取操作包装为函数了,输入可以是文件名或已经导入的gtf文件数据框(最好还是文件吧)。由data.table包支持,速度杠杠的!....*" gene_id = sub(pattern_id, "\\1", input[[9]]) gene_name = sub(pattern_name, "\\1", input[[9
Python 模块 概念 python中的模块是什么?简而言之,在python中,一个文件(以“.py”为后缀名的文件)就叫做一个模块,每一个模块在python里都被看做是一个独立的文件。...分类 在Python中模块分为以下几种: 系统内置模块,例如:sys、time、json模块等等; 自定义模块,自定义模块是自己写的模块,对某段逻辑或某些函数进行封装后供其他函数调用。...注意:自定义模块的命名一定不能和系统内置的模块重名了,否则将不能再导入系统的内置模块了。...在另一台服务器上想部署相同的包,只需运行: $ pip install -r requirements.txt 总结 到此这篇关于导出python安装的所有模块名称和版本号到文件中的文章就介绍到这了,更多相关...python 模块名称版本号导出内容请搜索ZaLou.Cn以前的文章或继续浏览下面的相关文章希望大家以后多多支持ZaLou.Cn!
如何在Node.js中读取和写入JSON对象到文件 本文翻译自How to read and write a JSON object to a file in Node.js 有时您想将JSON对象存储到...Node.js应用程序中的文件中,然后在以后检索它。...同步方法会阻塞Node.js事件循环,其他所有操作都必须等待文件操作完成。...从文件读取JSON 要将文件中的JSON数据检索并解析回JSON对象,可以使用fs.readFile()方法和JSON.parse()进行反序列化,如下所示: const fs = require('fs...看一下如何在Node.js中读写JSON文件的教程,以了解有关在Node.js应用程序中读写JSON文件的更多信息。 喜欢这篇文章吗? 在Twitter和LinkedIn上关注我。
代理提供了索赔流程的协助,顾客表示了宽慰和感激。" } 我们在index.py中定义了一个名为get_documents_from_file的函数,它读取json文件并创建一个文档列表。...# index.py # 加载.env文件内容到env # ELASTIC_CLOUD_ID和ELASTIC_API_KEY预期在.env文件中 load_dotenv('.env') # ElasticsearchStore...SentenceSplitter:如get_documents_from_file()的定义所示,每个文档都有一个文本字段,其中包含json文件中的对话。这个文本字段是一段很长的文本。...size=1 到目前为止,我们所做的是从JSON文件创建文档,我们将它们分块,为这些块创建嵌入,并将嵌入(和文本对话)存储在一个向量存储(ElasticsearchStore)中。...在后续的博客中,我们将看到如何在RAG流程中屏蔽PII信息后再发送到外部LLM。
标签:Python与Excel协同 本文将探讨学习如何在Python中读取和导入Excel文件,将数据写入这些电子表格,并找到最好的软件包来做这些事。...数据可能位于Excel文件中,也可能使用.csv、.txt、.JSON等文件扩展名来保存。数据可以是定性的,也可以是定量的。根据计划解决的问题类型,数据类型可能会有所不同。...就像可以使用方括号[]从工作簿工作表中的特定单元格中检索值一样,在这些方括号中,可以传递想要从中检索值的确切单元格。...图17 至此,还看到了如何在Python中使用openpyxl读取数据并检索数据。很多人可能会觉得这是一种非常困难的处理这些文件的方法,当还没有研究如何操作数据时,这肯定会更加复杂。...,即标题(cols)和行(txt); 4.接下来,有一个for循环,它将迭代数据并将所有值填充到文件中:对于从0到4的每个元素,都要逐行填充值;指定一个row元素,该元素在每次循环增量时都会转到下一行;
在该工具的帮助下,广大研究人员可以轻松收集目标Instagram账户配置文件上可用的所有地理标记位置,以便将其绘制在地图上,然后将其转储到JSON中。...工具运行机制 该工具基于Selenium的webdriver实现其功能,因此Instaloctrack才能够爬取整个目标Instagram配置文件来检索帐户的所有数据以及图片链接。...接下来,工具将会异步检索每个图片链接,检查它是否包含图片描述中的位置,如果存在位置数据,则检索该位置的数据以及时间戳。...注意:由于2018年Instagram不推荐使用其位置API,并且无法再获取图片的GPS坐标,我们只能检索位置的名称。...除此之外,整个过程中所收集到的数据(位置名称、时间戳、GPS坐标、错误信息)都将被存储到JSON文件中,以供后续使用。
六、accesschk.exe 1、简介 AccessChk是微软提供的一款安全检查工具,是Sysintenals集合中的一款工具,使用它可以对Windows系统中的一些系统文件、服务、注册表等进行管理和维护排查等功能...自定义产品版本,如20H2 -f FILE, --file FILE ps1脚本运行后产生的.json文件 2.使用方式 1....将运行后产生的KB.json文件移动到cve-check.py所在的目录 3. 安装一些python3模块 python3 -m pip install requirements.txt 4....若使用脚本扫描到的系统名称和版本不准确,可以使用-n,-N进行指定 八、gtfo 1、简介 特征。该工具的唯一功能是让您能够从终端中搜索gtfobins和lolbas。...python3 vulmap.py -u http://testphp.vulnweb.com RCE漏洞使用id命令 python3 vulmap.py -u http://example.com
2.支持添加多种格式的索引,如:HTML、PDF、微软 Office 系列软件格式以及 JSON、XML、CSV 等纯文本格式。 3.Solr比较成熟、稳定。...,在内存中初始化一个词典,然后在分词过程中逐个读取字符,和字典中的字符相匹配,把文档中的所有词语拆分出来的过程 solr的索引查询为什么比数据库要快 Solr使用的是Lucene API实现的全文检索。...如何分词,新增词和禁用词如何解决 schema.xml文件中配置一个IK分词器,然后域指定分词器为IK 新增词添加到词典配置文件中ext.dic,禁用词添加到禁用词典配置文件中stopword.dic,...倒排索引是一种像数据结构一样的散列图,可将用户从单词导向文档或网页。它是搜索引擎的核心。其主要目标是快速搜索从数百万文件中查找数据。 一般情况下,像下面的一样,在书中我们已经倒过来索引。...Elasticsearch中的架构是一种映射,它描述了JSON文档中的字段及其数据类型,以及它们应该如何在Lucene索引中进行索引。
那么我们如何在繁忙的工作中尽量提高自己的工作效率呢?例如下面的小石:) ? 同时被这么多任务并行,相信如果是个小白不知道怎么处理,此时心态已经炸了吧! 而且可能同事还要这么说! ?...:☆☆☆☆ 用途:文件太多,直接使用Everything 针对文件名称+文件类型 快速检索,方便快捷,结果精准 ?...测试必备工具#bejson 在线使用地址:https://www.bejson.com/ 推荐指数:☆☆☆☆☆ 用途:(个人用的比较多的)其他功能很齐全,慢慢体验 *在线比对自己编写的代码 *接口参数json...uninstalltool卸载软件的优化版本 推荐指数:☆☆☆☆☆ 用途:例如我之前就安装python2使用系统自带删除卸载,部分注册表信息以及环境无法全部删除,后来使用该工具搜索识别扫描,直接根治删除,在安装python3...*3个应用程序分类:软件,系统和隐藏 *移除系统启动时自动运行的程序 *3种应用程序排序方式:软件名称,占用空间和安装日期 *可以删除标准'添加/删除程序'所不能删除的程序 *使用强制删除可以卸载注册表中的相关条目
本教程使用Python3代码段,但所有内容都可以在Python2上运行,只需进行少量更改。 Python中的lxml是什么? lxml是在Python中处理XML和HTML最快且功能丰富的库之一。...不同之处在于dump()只是将所有内容写入控制台而不返回任何内容,tostring()用于序列化并返回一个字符串,您可以将其存储在变量中或写入文件。dump()仅适用于调试,不应用于任何其他目的。...如何在Python中使用LXML 解析XML文件? 上一节是关于创建XML文件的Python lxml教程。在本节中,我们将研究如何使用lxml库遍历和操作现有的XML文档。...请注意,不支持直接从文件中读取。文件内容应首先以字符串形式读取。这是从同一HTML文件输出所有段落的代码。...请注意,xpath()方法返回一个列表,因此在此代码片段中仅获取第一项。 这可以很容易地扩展为从HTML读取任何属性。例如,以下修改后的代码输出结果为国旗的国家名称和图像URL。
我们将详细研究 Hydra 如何使用 Redis 来实现所有这些功能。 请记住,这里的目标是展示如何做到这一点 —— 而不是说每种方法都是您应该如何在自己的服务中实现该特性。...并非每个 key 中都存在所有段。例如,某些 key 中不需要服务名称(Service name)和实例ID(instance ID)。 这是用户服务(user service) key 的示例。...在此示例中,主机名也恰好是Docker 容器 ID。 我们可以使用 Redis “hgetall” 命令检索有关所有可用实例的信息。...“to”,“frm” 和 “bdy” 字段是必填字段,服务可以自由地在 “body” 对象中包含自己的自定义字段。 让我们看看如何在实践中使用它。...同样,我们可以列出Redis中的所有发布/订阅通道(Pub/Sub Channnel)。消息可以通过这些通道发送,并由侦听器(listeners)检索。
段标签被命名为:前缀(Prefix)、服务名称(Service name)、实例 ID(Instance ID)和类型(type)。...并非每个 key 中都存在所有段。例如,某些 key 中不需要服务名称(Service name)和实例ID(instance ID)。 这是用户服务(user service) key 的示例。...我们看到前缀 hydra:service 后跟服务名称,在本例中为 “user-svcs”。接下来,我们看到唯一的实例ID(unique instance ID)。...第一个 key 是 “asset-svcs” 的名称 —— 由 asset service 的所有实例共享。 接下来,我们将看到三个具有惟一实例id的附加 key。三个服务实例各有一个。...所做的一切就是创建一个 hash 条目,其键由服务名称和版本组成, 并将文件内容字符串序列化后(stringified)作为其值。
这意味着,当文档(应为JSON格式)保存在Elasticsearch中时,其地址看起来像 index name:这类似于SQL world中的数据库名称。这是必不可少的信息。...3.3阅读文件 可以使用带有索引名称,类型名称和其中指定的文档ID的GET请求从elasticsearch中检索文档。...这充当该文档的准确地址(前提是所传递的所有三个信息都是准确的),Elasticsearch将为我们获取该文档。让我们看看如何检索刚刚索引的文档。...元数据包括其他信息和检索状态为“已找到”。 3.4更新文件 如果需要更新已经建立索引的文档的字段怎么办?Elasticsearch为我们提供了此操作的更新API。...该请求还包含有关要更新的文档的所有信息(索引名称,类型名称和文档ID),以便Elasticsearch可以找到该文档并对该特定字段进行更改(这不是它的确切工作方式,而是目前,我们正在深潜)。
1.2 下载基础文件 复制茴香豆所需模型文件,为了减少下载和避免 HuggingFace 登录问题,所有作业和教程涉及的模型都已经存放在 Intern Studio 开发机共享文件中。...中 其中多为技术无关的主题或闲聊 如:“nihui 是谁”, “具体在哪些位置进行修改?”...确定的回答的问题会利用基础模型提取关键词,在知识库中检索 top K 相似的 chunk,综合问题和检索到的 chunk 生成答案。...3.1 加入网络搜索 茴香豆除了可以从本地向量数据库中检索内容进行回答,也可以加入网络的搜索结果,生成回答。...现支持 书生·浦语 和 通义千问 模型类型,调用 transformers 的 AutoModels 模块,除了模型路径,输入 Huggingface 上的模型名称,如*“internlm/internlm2
特性 它支持以下特性: 设置默认值 从JSON、TOML、YAML、HCL、envfile和Java properties格式的配置文件读取配置信息 实时监控和重新读取配置文件(可选) 从环境变量中读取...对于位于用户$HOME目录中的配置文件没有任何扩展名,如.bashrc; 当你使用如下方式读取配置时,viper会从./conf目录下查找任何以config为文件名的配置文件,如果同时存在..../conf/config.json和./conf/config.yaml两个配置文件的话,viper会从哪个配置文件加载配置呢?.../conf") 写入配置文件 从配置文件中读取配置文件是有用的,但是有时你想要存储在运行时所做的所有修改。...import _ "github.com/spf13/viper/remote" Viper将读取从Key/Value存储(例如etcd或Consul)中的路径检索到的配置字符串(如JSON、TOML、
(如TXT等)导入到kibana中。...image.png 据上图,我们可以看到,格式化的json数据主要分两部分,一部分负责描述索引,如 : {"index":{"_index":"shakespeare","_id":0...二,实际操作 1,文本处理 这里我们采用python3进行文本处理,处理的原则是,以换行符为界,每一行,做为一个独立的文档(doc)。最终输出json文件。...三、应用 这里简单讲一下,如何使用Kibana进行数据检索。例如,我们需要查询《刑法》中,有关“走私”和“拐卖”的相关条款。...中,并可以通过kibana进行关键字检索了。
斐波那契数列中的每一个元素,都等于前一个数和前前一个数的和,即: f(n)=f(n-1)+f(n-2) ,而最常见的斐波那契数列的前两位数都是1。...(data) 执行这个python文件,我们可以获得如下所示的输出: [dechin@dechin-manjaro store_class]$ python3 json_dic.py {'1': 1...同时在python3的库中一般也自带了sqlite3,不需要自己安装,下面我们用ipython演示一下如何在python中使用sqlite3数据库: [dechin@dechin-manjaro store_class...其中每一个元组代表一个满足检索条件的键值对,每一个元组中的元素代表每一列的值。...这里三种方案实际上各有优劣,推荐的使用场景为:在轻量级、日常使用中可以重点使用json格式进行对象的存储,我们也可以很方便的在系统上直接查看json格式的文件内容;在多用户或多进程使用的案例中,推荐使用
近年来,它还被用来发布前端包和库,如 Angular、React、Vue.js 甚至 Bootstrap。...build (b): 将 Angular 应用程序编译到给定输出路径上名为 dist/ 的输出目录中。必须从工作空间目录中执行。 config: 检索或设置 Angular 配置值。...之后,您将使用目录结构和一堆配置和代码文件创建项目。它将主要采用 TypeScript 和 JSON 格式。...我们看看各个文件的作用: /e2e/:包含网站的端到端(模拟用户行为)测试 /node_modules/:使用 npm install 将所有 3rd 方库安装到此文件夹 /src/:包含应用程序的源代码...的配置文件 angular.json:包含 CLI 的配置 package.json:包含项目的基本信息(名称、描述和依赖项) README.md:包含项目描述的 markdown 文件 tsconfig.json
)USB设备,这些设备出现在历史记录中但不会出现在auth.json中; 当使用-s标志安装时创建加密存储(7zip存档)以在crontab调度程序的帮助下自动备份和积累USB事件; 根据特定USB设备的...快速开始 usbrip可在PyPI下载和安装: $ pip3 install usbrip 截图 Git Clone 为简单起见,让我们同意所有出现~/usbrip$前缀的命令都在~/usbrip目录中执行...存储密码保存在/var/opt/usbrip/usbrip.ini中。 ./installers/uninstall.sh脚本会从系统中删除所有安装项。...Help 获取模块名称列表: $ usbrip -h 获取特定模块的子模块名称列表: $ usbrip -h 获取特定子模块的所有开关列表: $ usbrip <submodule...序列号”列(-c COLUMN [COLUMN],--column COLUMN [COLUMN])按日期过滤从外部文件中获取的日志(-f FILE [FILE ...]
弹性 : Elasticsearch 运行在一个分布式的环境中,从设计之初就考虑到了这一点。 灵活性 : 具备多个案例场景。数字、文本、地理位置、结构化、非结构化。所有的数据类型都欢迎。...这意味着从索引文档到可以搜索的时间只有轻微的延迟(通常是1秒)。 Cluster 集群是一个或多个节点(服务器)的集合,它们共同保存你的整个数据,并提供跨所有节点的联合索引和搜索功能。...新建一个文件accounts.json,然后将数据复制粘贴到该文件中,保存退出 在这个accounts.json文件所在目录下执行如下命令: curl -H "Content-Type: application...我们在”bank”索引中检索,q=*参数表示匹配所有文档;sort=account_number:asc表示每个文档的account_number字段升序排序;pretty参数表示返回漂亮打印的JSON...默认情况下,会返回完整的JSON文档(PS:也就是返回所有字段)。这被成为source(hits._source) 如果我们不希望返回整个源文档,我们可以从源文档中只请求几个字段来返回。
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