嵌入各种各样的组件，包括 HTML 小部件、R 图形、表格数据和文本注释等内容。 可以指定按行或列进行布局(各组件会自动调整大小以填满浏览器，并且在移动设备上也十分适配)。...可以创建故事板来呈现可视化图形和相关注释。 使用 Shiny 驱动动态可视化（可选）。...来创建一个 R Markdown 文档。...使用 File -> New File -> R Markdown 对话框在 RStudio 中创建文档，并选择 "Flex Dashboard" 模板(小编个人推荐)。界面如下所示： ?...小编有话说 本节内容主要是对谢大大的R Markdown: The Definitive Guide[5]第五章内容进行翻译和学习得到的内容。
介绍 R的bookdown扩展包是继knitr和rmarkdown扩展包之后， markdown格式的另一种扩展， 使得Rmd格式可以支持公式、定理、图表自动编号和引用、链接， 文献引用和链接等适用于编写书籍的功能...在bookdown的管理下：一本书的内容可以分解成多个Rmd文件， 其中可以有可执行的R代码， R代码生成的文字结果、表格、图形可以自动插入到生成的内容中， 表格和图形可以是浮动排版的。...设置文件名和路径，点击创建即可 ? 这时候就会出现下面的界面，右下角是自带的一些文件，其中小框内部是每章节的rmd，可以看到bookdown是将很多个rmd文件合成的一本书。...小编只能带大家入个门和拓展思维（如何创建，运用，编译）。而在你实际使用过程中可能会遇到各类实际问题，建议大家多使用bing[5]（google[6]）英文搜索，找到自己想要的答案。...这里再给大家推荐一些Bookdown相关的参考资料 《R语言教程-23章》[7] bookdown: Authoring Books and Technical Documents with R Markdown
在书稿模板的选择与测试过程中遇到了很多的坑，幸运的是逐个踩过来了，但从 TEXTEX 到Rnw(Sweave+R), 再到Rmd (Knitr + R), 最后到Bookdown, 共经历了 4 个模板...这本小册子可视为一个写中文书稿的Bokdown模板，也是中文Bookdown写作的一本说明书，其中汇总了书稿中几大核心要素的写作技巧。...bookdown: Authoring Books and Technical Documents with R Markdown[4], 2021-03-15....中国学术界也经历了一些折腾，如中科院张林波研究员等开发的CCT系统和华东师范大学肖刚与陈志杰等老师开发的天元系统，它们是 TEXTEX 系统汉化版，较好地解决了汉字生成与调用，但因没有考虑普适性或可拓展性而像方正系统一样随着...针对代码伴随，早期对这类图书有二个解决方案： Sweave/knitr + R 本质上它是在 TEXTEX 嵌入R代码块，并由R在后台运行后将结果也嵌入到 TEXTEX 中，再由 TEXTEX 的编译引擎生成
提高生产力的R包 blastula[3]是用于在R中创建漂亮的自定义电子邮件的程序包。...它可以用于根据代码、代码输出和markdown编写自定义邮件正文；并使用SMTP服务器发送电子邮件-甚至GMail -或集成生产服务，如RStudio Connect。...提升Markdown文档的软件包 ? bookdown[4]有助于使用R Markdown编写书籍和长篇文章/报告。在https://bookdown.org/上有一些书本和书本中的书籍示例。...小编做了一篇入门教程：R沟通｜用bookdown制作图书(1)，后续还会有进一步更新的想法。 citr[5] 创建一个RStudio插件，用于在R Markdown文档中插入引用。...这个包小编做了入门教程，可参见：R沟通｜设置xaringan主题；R沟通｜用xaringan包制作幻灯片 增强绘图功能的软件包 ? colorblindr[14]可以在可投入生产的R图形中模拟色盲。
/github.com/rstudio/bookdown) 是继knitr和rmarkdown扩展包之后， 另一个增强markdown格式的扩展， 使得Rmd格式可以支持公式、定理、图表、文献自动编号和引用等适用于编写书籍的功能...在bookdown的管理下一本书的内容可以按章节分解成多个Rmd文件， 其中可以包含可执行的R代码， R代码生成的统计汇总结果、表格、图形可以自动插入到生成的内容中， 表格和图形可以是浮动排版的。...R程序都在一个单独的R会话中独立地运行，避免了不同Rmd文件之间同名变量和同名标签的互相干扰。...每一章可以有若干节与子节，分别用markdown的二级标题(二个#开始)和三级标题(三个#开始)编写。...R Bookdown编译界面. 经build编译生成的图书默认保存在_book子目录中。
默认情况下代码和结果会在输出文件中呈现。如果通过参数来控制代码块运行结果的输出情况可以在{r }中设置。一般包括代码及运行结果的输出、图片表格格式定义等。...out.width和out.height选项指定在输出中实际显示的宽和高，如果使用如"90%"这样的百分数单位则可以自动适应输出的大小。...2.插入外部图形文件 如果一个图不是由一个R代码块生成的，你可以用两种方式包含它: 方法一 使用Markdown语法!...方式二 在source editor情况下，直接外部拉入图形即可，会自动保存在相对文件夹的images文简介中，或者点击图形按钮导入。 ?...图片尺寸更改与插入R代码生成的图形的情况相同。
前两期内容见：R沟通｜Bookdown中文书稿写作手册（中）；R沟通｜Bookdown中文书稿写作手册（上） 第 3 章 Bookdown 中的章节标题 我们在第3章讲述章节标题的设置、标签与引用. 3.1...章节标题 章节标题用遵从markdown的规则，用#设置， 一级标题用一个 #, 在 bookdown 中表示章, 相当于 TEX 中的\chapter{} 二级标题用二个 #, 在 bookdown...第 5 章 Bookdown中的图形 5.1 由R生成单个图形示例 这是第5章的内容， 讲述浮动对象图形的标签与引用....图 5.1: iris数据集Petal.Length} ~ Species的箱线图. 5.2 由R生成两个图形并置示例 在R的代码块选项中设置out.width='50%', fig.show='hold...直线为数据集拟合线性模型的结果. 5.3 由R生成两个图形堆叠示例 在R的代码块选项中设置out.width='90%', fig.show='hold'就可获得二个图形的并置. 5.4 静态图形示例
默认情况下代码和结果会在输出文件中呈现。如果通过参数来控制代码块运行结果的输出情况可以在{r }中设置。一般包括代码及运行结果的输出、图片表格格式定义等。...fig.subcap：设置图片的副标题 out.width和out.height选项指定在输出中实际显示的宽和高，如果使用如"90%"这样的百分数单位则可以自动适应输出的大小。...2.插入外部图形文件 如果一个图不是由一个R代码块生成的，你可以用两种方式包含它: 方法一 使用Markdown语法!...方式二 在source editor情况下，直接外部拉入图形即可，会自动保存在相对文件夹的images文简介中，或者点击图形按钮导入。 ?...图片尺寸更改与插入R代码生成的图形的情况相同。
bookdown是著名R包作者谢益辉开发的，支持采用Rmarkdown (R代码可以运行)或普通markdown编写文档，然后编译成HTML, WORD, PDF, Epub等格式。...(点击阅读原文，跳转博客，所有外链可点) 在Bookdown的官网，有很多免费的用bookdown写的R书籍，如Hadley Wickham等撰写的《R for Data Science》，Roger...还有很多基于Bookdown的教程，一时也想不起来，欢迎大家补充。我们前面转录组和R培训的教案也是用bookdown写作的，后续再调整下格式，出一批电子书和纸质书，有意向和需求的欢迎联系。...下面分2步讲述，自己如何构建一个Bookdown书籍，第一部分是通过bookdown示例了解其基本功能和使用，第二部分是个人在使用过程中碰到的问题和解决方式。...Customize our bookdown 准备Rmd文件 基本规则 一个典型的bookdown文档包含多个章节，每个章节在一个R Markdown文件里面 (文件的语法可以是pandoc支持的markdown
R Markdown文件(.Rmd)文件支持多种输出， 如网页(html_document)、MS Word(word_document)、PDF(pdf_document, 需要LaTeX编译器支持)...)， 和Microsoft Office的PowerPoint幻灯片(powerpoint_presentation)格式。...document | R Markdown: The Definitive Guide (bookdown.org)[21] md 格式默认下是严格的最简单的md 语法，此外还有如下变种：Valid...不过，对于内容的输出图片来说，其结果会保存在一个文件夹中： 这时候有两个选择： 将图片上传到图床，并不在Rmd 中输出图片，这也是我一直使用的方法； 利用Mweb 的发布服务，将本地图床一键全部上传到云端.../github_document_format.html [21]3.7 Markdown document | R Markdown: The Definitive Guide (bookdown.org
（Greenplum）和HAWQ数据库中的数据 dplyr：提供了一个访问常见数据库的接口 data.table：data.table包的fread()函数可以快速读取大数据集 git2r：用于访问git...rmarkdown ：用于创建可重复性报告和动态文档 knitr：用于在PDF和HTML文档中嵌入R代码块 flexdashboard：基于rmarkdown，可以轻松的创建仪表盘 bookdown：以...R Markdown为基础，用于创作书籍和长篇文档 rticles：提供了一套R Markdown模板 tufte：用于实现Tufte讲义风格的R Markdown模板 DT：用于创建交互式的数据表 pixiedust...shinyjs：用于在Shiny应用程序中执行常见的JavaScript操作 miniUI：提供了一个UI小部件，用于在R命令行中集成交互式应用程序 shinyapps.io：为创建的Shiny应用程序提供托管服务...drat：一个用于创建和使用备选R包库的工具 testthat：单元测试，让R包稳定、健壮，减少升级的痛苦。 roxygen2：通过注释的方式，生成文档，远离Latex的烦恼。
Overleaf默认的编译器为pdfLaTeX，因此要使其支持中文需要改为XeLaTeX。 注释 Overleaf等工具中可以使用快捷键Ctrl+/来批量注释或批量取消注释。...[htbp]是个可选参数项，允许用户指定图片、表格等元素被放置的位置。这一可选参数项可以是下列字母的任意组合。 h(here): 当前位置；将图形放置在 正文文本中给出该图形环境的地方。...p(page): 浮动页；将图形放置在一只允许有浮动对象的页面上。 注意：在使用这些参数时： 如果在图形环境中没有给出上述任一参数，则缺省为 [tbp]。 给出参数的顺序不会影响到最后的结果。...[htbp]是个可选参数项，允许用户指定图片、表格等元素被放置的位置。这一可选参数项可以是下列字母的任意组合。 h(here): 当前位置；将图形放置在 正文文本中给出该图形环境的地方。...p(page): 浮动页；将图形放置在一只允许有浮动对象的页面上。 注意：在使用这些参数时： 如果在图形环境中没有给出上述任一参数，则缺省为 [tbp]。 给出参数的顺序不会影响到最后的结果。
Pivitol（Greenplum）和HAWQ数据库中的数据 dplyr：提供了一个访问常见数据库的接口 data.table：data.table包的fread()函数可以快速读取大数据集 git2r...rmarkdown ：用于创建可重复性报告和动态文档 knitr：用于在PDF和HTML文档中嵌入R代码块 flexdashboard：基于rmarkdown，可以轻松的创建仪表盘 bookdown...：以R Markdown为基础，用于创作书籍和长篇文档 rticles：提供了一套R Markdown模板 tufte：用于实现Tufte讲义风格的R Markdown模板 DT：用于创建交互式的数据表...shinyjs：用于在Shiny应用程序中执行常见的JavaScript操作 miniUI：提供了一个UI小部件，用于在R命令行中集成交互式应用程序 shinyapps.io：为创建的Shiny应用程序提供托管服务...drat：一个用于创建和使用备选R包库的工具 testthat：单元测试，让R包稳定、健壮，减少升级的痛苦。 roxygen2：通过注释的方式，生成文档，远离Latex的烦恼。
unsetunsetBookdown 的优势unsetunset Bookdown 是著名 R 包作者谢益辉开发的，主要服务于数据科学家和统计学家，但它的灵活性和易用性也使得其他领域的作者能够利用它来撰写...或者直接下载压缩包 4、打开工程中章节对应的.Rmd 文件进行编辑 按章节命名好 Rmd 即可 Rmd 也即 R Markdown 和 Markdown 本质上都是标记语言 语言:Markdown...而 RMarkdown 是建立在 Markdown 基础之上的一种语言，旨在方便将文本和代码混合在同一个文件中。 用途:Markdown 主要用于编写格式化文本，如网页、文章、文档等。...而 RMarkdown 可以执行嵌入的代码块，将结果动态渲染到文档中。这对于分析报告和可重复研究非常有用。 输出格式:Markdown 通常会被渲染为 HTML、PDF 等格式。...工具支持:Markdown 有许多编辑器支持。而 RMarkdown 主要由 R 生态圈中的工具支持，如 RStudio IDE。
参考： 第 31 章 ggplot2之延迟映射 | 数据科学中的 R 语言 (bookdown.org)[1] A ggplot2 Tutorial for Beautiful Plotting in...因此你可以凭借你的心情，通过geom 或stat 创建你的图形对象。 通常来说，数据框的变量直接映射到图形元素，然后生成图片。...延迟映射的三阶段 直接参考第 31 章 ggplot2之延迟映射 | 数据科学中的 R 语言 (bookdown.org) 中记录的内容： 第一个阶段，拿到数据之后。...和内圈小的color 正好渐变色相反了。...R 语言 (bookdown.org): https://bookdown.org/wangminjie/R4DS/tidyverse-ggplot2-aes-eval.html [2] A ggplot2
| Mastering Software Development in R (bookdown.org)[1] R实战：grid包 - 悦光阴 - 博客园 (cnblogs.com)[2] (11条消息...) R语言grid包使用笔记——viewport_数据之美-CSDN博客_r语言grid包[3] 1-基本介绍 grid包是一个底层的绘图系统，能够灵活地控制图形输出的外观和布局，但是grid包不提供创建完整图形的高级绘图系统...，例如，ggplot2和lattice，而是提供绘制开发这些高级绘图的基础接口， 比如我目前的业务需求恰好就是常常ggplot 的个性定制无法满足，因此这里作出一些尝试。...此外，除了grid 可以创建grob 对象外，还有其他包包括gridExtra 也可以创建grob 对象如tableGrob。...gp = gpar(col = "gray", lty = 3)) grid.draw(my_circle) 不同于ggplot 中，我们直接在图形对象中给如
-6.zip 还有官方模板：https://github.com/rstudio/bookdown-demo 1-什么是bookdown 是继knitr和rmarkdown扩展包之后， 另一个增强markdown...和一般的自动化流程一下[[02-可重复工作执行简明指南（上）]]，bookdown 的创作，我们也要养成一个好习惯，创建一个目录，用Rproj 来管理这个目录下的bookdown 内容。...这是用R的bookdown功能制作中文图书的模板，输出格式为bookdown::gitbook和bookdown::pdf_book." site: bookdown::bookdown_site output...这是我的第一个测试，时间：`r date()` 上面的setup 代码块为了便于md 文件显示，我将反问号打了注释。 你可以将这个index 理解为对所有Rmd 的整体配置，一劳永逸。...不同章节中的R 环境，会继承到后续章节（按照代码顺序），包括使用的包、变量等等； 不同章节中的代码块不可以有相同的名称； 你可以自由管理Rmd 文件的位置，比如放在工作目录的其中某个子目录下。
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