首页
学习
活动
专区
工具
TVP
发布
精选内容/技术社群/优惠产品,尽在小程序
立即前往

如何用好公开数据库多种组数据?

表观基因组和转录组的胰腺癌多组学分析 一.研究背景 最近,对多种癌症的多组学分析为癌症的基因组,表观基因组和转录组失调提供了新的视角。...对基因组、表观基因组、转录组和临床信息的综合分析有助于鉴定特定的分子亚组并发现胰腺癌的新生物标志物。 二.分析流程 ?...使用来自GEO数据库的外部GSE21501和GSE71729数据集来验证结果。 最后,在外部和内部数据集中选择了三个与胰腺癌预后相关的基因(GRAP2,ICAM3和A2ML1)。...表明CNV和MET畸变对转录组产生了调控作用。随后,作者通过对CNVcor和METcor基因的整合分析,确定了与生存相关的四个胰腺癌分子亚组。...由于尚无文献报道,作者将在进一步研究中研究这三个新靶标(GRAP2,ICAM3和A2ML1)在胰腺癌中的生物和临床功能。

1.8K11
您找到你想要的搜索结果了吗?
是的
没有找到

如何高效Python?

如果你一直想学Python,但是不知道如何入手,那就别犹豫了。这篇文章就是为你写的。 ? (由于微信公众号外部链接的限制,文中的部分链接可能无法正确打开。...因为写了几篇用Python做数据分析的文章,经常有读者和学生在留言区问我,想学习Python,该如何入手? 我经常需要根据他们的不同情况,提出对应的建议。这样针对性虽强,但效率不高。...下面我们分类探讨一下,不同自律能力的人,该如何Python,才能更高效。 路径I 咱们先从自律能力最差的人说起。 这样的同学,往往是三分钟热度。...那时我在Coursera上选修杜克大学的统计课程 “Statistical Inference”,配套的练习就在Datacamp上。...我们东西,由浅入深,由易到难,逐步递进。如果一味追求新知,那么之前的东西会很快遗忘。如果总是原地打转,会带来枯燥和无聊的感觉。还记得高三做的那一年卷子吧?

1.5K20

快速数据库管理

,带你了解数据库的基本框架和能够完成的任务,如果是数据库学过的话,那这篇文章可能对你而言只有前面数据库概述和设计数据库有用,数据库sql语句这部分非常的精简,几乎只是了解个框架,第一次写长文欢迎评论区大佬们的指正...一、数据库系统概述 1.数据库系统的组成 --DB -> DBMS -> DBS -> user --即由数据库(database)出发 --利用数据库管理系统(database manage system...)创建数据库中的表(database schema) -- 最后由user进行查询等等相关操作 2.数据库的特点 -- 1.有结构的 -- 数据库按照关系模型来储存数据和联系数据 -- 一般采用二维表的形式进行实现...一些运算符的详解 选择$\sigma$ 基本形式 $\sigma_{options}(表)$ 例子 $\sigma_{age=15}(student)$ --从学生表中查询年龄等于15的学生,其实等价于后面要的...2进行自增,无需用户指定 id int indentity(1,2) , aa as id *5 ) 1.1.3删除表,约束 --这部分就比较简单了 --为了比较顺利的删除约束,这里补充一下如何查看约束名称

1.9K30

大学如何开始编程?

大学如何开始编程? 作为编程初学者每个人一开始都很迷茫不知如何学习,学习也没动力,其实大家都是一样的,但这并不意味着你会成为一个糟糕的 程序猿(媛)。...就像每个人都应该学习法律,但不是都要成为律师;就像每个人都应该学习经济,但不是必须成为经济学家;就像每个人都要学习数学,也不是为了成为数学家。 思维改变归结为一条就是:不能够忍受不清晰的表述。...✍ 如何学习编程 编程语言种类繁多,用途各异,然而一旦掌握其中之一,其他的也就迎刃而解。...作为初学者,你可能要先从C语言、Python或HTML开始,一旦掌握了一门编程语言,你就发挥无穷的想象,开发各种神奇的软件和小工具啦。...多最常用的及行业内规范的算法。 写代码要做到代码规范、写注释、让代码结构清晰、整洁、易读 。 多学着用编程语言来解决问题。 你可以用编程来解决模拟真实情景中的问题。

44910

如何学习统计

可能学习和工作还有兴趣都跟统计沾些边,一些朋友和网友也问我些如何学习统计之类的问题,他们当然一样是非统计出身。...这两条平行的观点,就构成了我对以下问题的建议:一个非统计出身的人,如何学习统计?...经济直觉完毕。关于统计直觉,我是类似这样理解的。对非统计科班出身的我们来说,这种训练可能更为重要,而且更为迫切。...如何实际运用中心极限定理 关于中心极限定理,对被抽取样本的那个总体没有要求任何限制。不管被抽取样本的那个总体,其分布的形状如何,样本和的分布都是正态的。...讲个极端的例子,在Oracle数据库里,有一个用于测试和练习的公共账户scott,里面有一些数据库表的实例,其中主要两个表,雇员表EMP和部门表DEPT。

52330

推荐Java——初识数据库

这就是我们要学习的数据库相关知识,到这你应该明白了,原来头像是放在数据库的,无论你是手机还是电脑登录微信,都会从数据库取你的头像,所以你看到的都是同一个头像。...那么,常见的数据库有哪些呢?...1,创建数据库 create database 数据库名字; 2,创建数据库,并指定编码方式 create database 数据库名字 character set utf8; 3,查看所有数据库 show...databases; 4,查看某个数据库的创建情况 show create database 数据库名字; 5,修改数据库 alter database 数据库名字 character set 字符集...; 6,删除数据库 drop database 数据库名字; 7,选中某个数据库 use 数据库名字; 8,查看当前正在使用的数据库 select database(); 总结 这节内容已经进入Java

2.1K40

LinkedOmics | TCGA多组关联分析数据库

至于CVCDAP分析的则是单一组方面的各种分析。...以上这些数据库虽然各有各的用处,但是如果我们想要做多组之间的相关分析的话,比如我们想要做TP53和miRNA之间的相关性的话,那以上的这些数据库就不能用了。...所以今天就来给大家介绍一个多组关联分析的数据库: LinkedOmics (http://www.linkedomics.org/login.php) 01内置数据集介绍 在使用一个工具之前,首先还是要了解这个数据库里面包括哪些东西的...由于是要做多组的关联分析的,一定要对于TCGA数据包括哪些数据要有一定的认识。这样才能方便我们来进行交叉分析的。 关于TCGA的数据库的话,这个数据库有一个简单的介绍。...具体这个数据库怎么操作可以查看我们第二个帖子。 数据库使用场景 以上就是这个数据库主要的使用场景。对于这个数据库,如果我们想要进行多组交叉分析的时候还是挺有用的。

3.2K40

SQL基础编程_如何编程

把分开的两列合成在一个结果中 三.SQL的多表操作 1.嵌套子循环 (1).where子查询 (2).from子查询 (3).from与where子查询互换 (4).select子查询 2.JOIN——连接多个数据库...(或多表) 3.null与内连接与外连接 一.SQL的环境搭载 单机离线环境 安装:下载Beekeeper-studio 运行:可导入一个简单数据库进行实验 在线环境 (这是在python基础下创造的...h:from 数据库名称 as h 2.选中数据库中hero一行(可以同时选中多行中间用,隔开):select h.hero 3.在select中将自己编辑的新的数据命名 eg:h.life + h.speed...h之后,h后面的内容必须是数据库每一列名称的内容 2.sql四则运算 sql可以单独经行运算 含义 运算符 加法运算 + 减法运算 _ 乘法运算 * 除法运算 / 求余运算 % 就好像select...= LIKE 判断字符串相似 name LIKE 'ab%' %表示任意字符,例如’ab%‘将匹配’ab’,‘abc’,‘abcd’注意有些数据库大小写敏感,有些不敏感 is NULL 判断是否是NULL

1.5K30

大数据到底应该如何

大数据到底应该如何? 本文关键字:大数据专业、大数据方向、大数据开发、大数据分析、学习路线 文章目录 大数据到底应该如何? 一、食用须知 二、大数据的基本概念 1. 什么是大数据 2....数据是如何采集的 3. 大数据真的能预测吗 三、什么是大数据开发 四、什么是大数据分析 五、应如何学习大数据 一、食用须知 再更一篇技术杂谈类的文章。。。...数据是如何采集的 大数据分析的第一步就是对数据的收集和管理,我们需要先来了解一下数据是如何产生的?又是被如何捕获的?那些看似杂乱的数据真的能被分析吗?...因为关系型数据库属于写时模式,也就是说不符合预先设定的数据类型和规范的数据不会通过校验,存不到数据库中。...除数据库中的数据以外,那些能直接导入到数据库中的数据文件我们也可以把它们视为结构化的数据,如:CSV格式。这些数据通常需要具备统一的列分隔符、行分隔符,统一的日期格式等等。

31910
领券