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如何为地图数据使用tSNE聚类

编译:yxy 出品:ATYUN订阅号 在本文中,我会展示如何在经纬度坐标对上使用tSNE来创建地图数据的一维表示。这种表示有助于开发新的地图搜索算法。这对于诸如“这个经纬度坐标是新泽西或者纽约的吗?”...许多聚类算法的核心是以这样的方式识别高维数据集中的相似性,从而可以降低维度。...tSNE算法用于保持较高空间中的线性空间关系,而一些聚类算法例如,径向基函数网络中使用的算法是试图增强空间关系,使得新空间可线性分离(例如XOR逻辑问题的解决方案。...我们可以对来自基本数据结构的这些数据使用所有1维排序和搜索算法。此外,将经纬度维数降低到1维会减少进行距离计算所需计算量的一半。我们可以只取新的1维表示的差,而不取经度和维度值之间的差。...如果对更快的地图搜索算法感兴趣,可以访问下方链接: https://towardsdatascience.com/kmeans-hash-search-map-search-in-o-n%C2%B2lgn

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python如何对类进行测试

下面介绍针对类的测试,很多程序中都会用到类,因此能够证明你的类能够正确地工作会大有裨益。如果针对类的测试通过了,你就能确信对类所做的改进没有意外地破坏其原有的行为。...1.各种断言的方法python在unittest.TestCase类中提供了很多断言方法。断言方法检查你认为应该满足的条件是否确实满足。如果该条件满足,你对程序行为的假设就得到了确认。...------你所做的大部分工作都是测试类中方法的行为,但存在一些不同之处,下面来编写一个类进行测试。...进行上述修改存在风险,可能会影响AnonymousSurvey类的当前行为。例如,允许每位用户输入多个答案时,可能不小心出力单个答案的方式。...3.测试AnonymousSurvey类下面来编写一个测试,对AnonymousSurvey类的行为的一个方面进行验证:如果用户面对调查问题时只提供了一个答案,这个答案也能被存储后,使用方法assertIn

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    RDKit | 基于Ward方法对化合物进行分层聚类

    从大量化合物构建结构多样的化合物库: 聚类方法 基于距离的方法 基于分类的方法 使用优化方法的方法 通过使用Ward方法进行聚类从化合物库中选择各种化合物,Ward方法是分层聚类方法之一。...Morgan指纹生成和距离矩阵计算 创建指纹作为聚类的输入数据,并使用它创建距离矩阵。...通过树状图可视化聚类结果 之所以将诸如Ward方法之类的聚集聚类称为分层聚类,是因为可以通过绘制逐个收集数据并形成一个组的过程来绘制类似于树状图的图。这样的图称为“ 树状图 ”。...树状图中,x轴表示每个数据,y轴表示聚类之间的距离,与x轴上的水平线相交的聚类数是聚类数。 PCA:主成分分析 可视化聚类结果的另一种方法是数据降维。...换句话说,如果主要使用剩余的60%信息进行聚类,则无法在2D平面上将其分离。进行主成分分析时,请确保在做出任何决定之前检查累积贡献。 ----

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    如何利用机器学习和分布式计算来对用户事件进行聚类

    在这篇文章中,我会确定对每个人来说特定的地理活动区域,讨论如何从大量的定位事件中(比如在餐厅或咖啡馆的签到)获取用户的活动区域来构建基于位置的服务。...这些独特的属性使DBSCAN算法适合对地理定位事件进行聚类。 图1:两由DBSCAN算法(ε= 0.5和minPoints = 5)聚类得出的两个类簇。一个是L型,另一个是圆形。...图中是佛罗里达地图,特别是开普科勒尔地区,签到的地方会有一个带颜色的点。 事件根据其发生的地理位置被聚类。...地图重叠:OpenStreet地图。 进一步增强地理定位数据分析 这一分析是围绕地理坐标进行的,但可以很容易地扩展到其他事件属性上,如签到时间、场地类型(餐厅、体育馆、博物馆)或用户的状态。...通过这种方式,数据处理通道可以在Spark上完整地实现SQL和机器学习的统一框架。这种扩展的数据管道对特定类别的事件将提供更准确的聚类结果。 Spark产生的聚类分析结果可以保存在一个数据存储表中。

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    腾讯 | 流聚类和记忆网络对用户兴趣进行增强

    三个部分的思路比较接近: 记忆网络存储了聚类中心的emb 基于用户,item和序列的emb和聚类中心计算内积作为相似度得分,然后检索topK相似的聚类中心进行增强 兼顾了一些效率问题,因此在使用的过程中做了采样...其次,基于用户画像与记忆在记忆网络中的质心的相似性进行端到端流聚类。 在训练之前,随机初始化N个聚类的中心,这些中心是存储在记忆网络1中的d维向量。...然后可以得到与当前用户向量最相似的聚类,使用蒸馏方法来更新相应的聚类中心,公式如下,是超参数,(这里应该是对和当前用户向量最接近的中心的误差对中心进行更新,笔者猜测这里可能是采用指数移动加权平均等方式)...为了平衡不同用户对聚类的影响,降低计算成本,本文根据用户的活跃类型进行采样参与聚类,这里采样应该是对需要增强的低活用户进行聚类,他们的行为比较稀疏,而对行为丰富的就不需要这里的操作了。...对个性化增强向量进行增量更新。为记忆网络2中的每个用户预定义个性化增强向量,并用零向量初始化。并基于下式更新个性化增强向量。

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    Spark应用HanLP对中文语料进行文本挖掘--聚类

    ,如下: image.png 现在需要做的就是,把这些文档进行聚类,看其和原始给定的类别的重合度有多少,这样也可以反过来验证我们聚类算法的正确度。...这样子的话,就可以通过.txt\t 来对每行文本进行分割,得到其文件名以及文件内容,这里每行其实就是一个文件了。...2.4 使用每个文档的词向量进行聚类建模 在进行聚类建模的时候,需要提供一个初始的聚类个数,这里面设置为10,因为我们的数据是有10个分组的。...2.5 对聚类后的结果进行评估 这里面采用的思路是: 1. 得到聚类模型后,对原始数据进行分类,得到原始文件名和预测的分类id的二元组(fileName,predictId); 2....,发现其数据确实是按照预期进行处理的;接着可以针对每个partition进行数据整合: // firstCharInFileName , firstCharInFileName - predictType

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    对用电负荷时间序列数据进行K-medoids聚类建模和GAM回归

    p=4146 通过对用电负荷的消费者进行聚类,我们可以提取典型的负荷曲线,提高后续用电量预测的准确性,检测异常或监控整个智能电网(Laurinec等人(2016),Laurinec和Lucká( 2016...在此还有一个非常重要的注意事项,对时间序列进行归一化是对时间序列进行每次聚类或分类之前的必要步骤。我们想要提取典型的消耗曲线,而不是根据消耗量进行聚类。 维数上已大大降低。...让我们对数据进行聚类并可视化其结果。 让我们绘制 评估的结果。 聚类的最佳数目为7。让我们绘制结果。 提取的消费数据比平均季节性数据更平滑。现在,K 中心提取了4个典型的轮廓,并确定了3个簇。...但是也可以检查具有不同数量聚类的其他结果。 结论 在本教程中,我展示了如何使用时间序列表示方法来创建用电量的更多特征。然后,用时间序列进行K-medoids聚类,并从创建的聚类中提取典型的负荷曲线。...---- 本文摘选《对用电负荷时间序列数据进行K-medoids聚类建模和GAM回归》

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    (修改)腾讯 | 流聚类和记忆网络对用户兴趣进行增强

    三个部分的思路比较接近: 记忆网络存储了聚类中心的emb 基于用户,item和序列的emb和聚类中心计算内积作为相似度得分,然后检索topK相似的聚类中心进行增强 兼顾了一些效率问题,因此在使用的过程中做了采样...其次,基于用户画像与记忆在记忆网络中的质心的相似性进行端到端流聚类。 在训练之前,随机初始化N个聚类的中心,这些中心是存储在记忆网络1中的d维向量。...然后可以得到与当前用户向量最相似的聚类,使用蒸馏方法来更新相应的聚类中心,公式如下,是超参数,(这里应该是对和当前用户向量最接近的中心的误差对中心进行更新,笔者猜测这里可能是采用指数移动加权平均等方式)...为了平衡不同用户对聚类的影响,降低计算成本,本文根据用户的活跃类型进行采样参与聚类,这里对所有用户都会进行采样,对长期行为相对少的用户(低活用户),主要根据类似的簇对其进行增强,推断该用户未体现出来的其它兴趣...当然对高活用户进行增强同样有效。 基于相似性得分,从记忆网络1中检索与用户向量最相似的K1个相似聚类中心。

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    讨论k值以及初始聚类中心对聚类结果的影响_K均值聚类需要标准化数据吗

    在数据挖掘的几个主要研究领域中,聚类是其中一个重要研究领域,对它进行深入研究不仅有着重要的理论意义,而且有着重要的应用价值。...论文在对现有聚类算法进行详细的分析和总结基础上,针对K均值聚类算法随机选取初始聚类中也的不足之处,探讨了一种改进的选取初始聚类中心算法。对初始聚类中心进行选取,然后根据初始聚类中也不断迭代聚类。...(2)随机选取5个数据作为初始聚类中心点,然后用编写的K均值MATLAB程序对数据组进行聚类记录结果。...很多时候,事先并不知道给定的数据集应该分成多少个类别才最合适; (3) 在 K-means 算法中,首先需要根据初始聚类中心来确定一个初始划分,然后对初始划分进行优化。...这个初始聚类中心的选择对聚类结果有较大的影响,一旦初始值选择的不好,可能无法得到有效的聚类结果; (4) 该算法需要不断地进行样本分类调整,不断地计算调整后的新的聚类中心,因此当数据量非常大时,算法的时间开销是非常大的

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    使用高斯混合模型对不同的股票市场状况进行聚类

    我们可以根据一些特征将交易日的状态进行聚类,这样会比每个对每个概念单独命名要好的多。...上图代表了一些具有 4 个集群的多模态数据。高斯混合模型是一种用于标记数据的聚类模型。 使用 GMM 进行无监督聚类的一个主要好处是包含每个聚类的空间可以呈现椭圆形状。...高斯混合模型不仅考虑均值,还考虑协方差来形成集群 GMM 方法的一个优点是它完全是数据驱动的。提供给模型的数据就可以进行聚类。...使用符合 GMM 的宏观经济数据对美国经济进行分类 为了直观演示 GMM,我将使用二维数据(两个变量)。每个对应的簇都是三个维度的多正态分布。...我们可以继续并合并任意数量的维度,但是在进入 n 维度之前,了解提供给模型的数据的相关结构很重要。 总结 这是我们如何将 GMM 应用于金融市场和经济的简单介绍。

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    Spark应用HanLP对中文语料进行文本挖掘--聚类详解教程

    ,如下: 图2.png 现在需要做的就是,把这些文档进行聚类,看其和原始给定的类别的重合度有多少,这样也可以反过来验证我们聚类算法的正确度。...这样子的话,就可以通过.txt\t 来对每行文本进行分割,得到其文件名以及文件内容,这里每行其实就是一个文件了。...2.4 使用每个文档的词向量进行聚类建模 在进行聚类建模的时候,需要提供一个初始的聚类个数,这里面设置为10,因为我们的数据是有10个分组的。...2.5 对聚类后的结果进行评估 这里面采用的思路是: 1. 得到聚类模型后,对原始数据进行分类,得到原始文件名和预测的分类id的二元组(fileName,predictId); 2....,发现其数据确实是按照预期进行处理的;接着可以针对每个partition进行数据整合: 1.// firstCharInFileName , firstCharInFileName - predictType

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    如何对类中的private方法进行测试?

    问题:如何对类中的private方法进行测试? 大多数时候,private都是给public方法调用的,其实只要测试public即可。...但是有时由于逻辑复杂等原因,一个public方法可能包含了多个private方法,再加上各种if/else,直接测public又要覆盖其中每个private方法的N多情况还是比较麻烦的,这时候应该考虑单对其中的...那么如何进行呢? 思路: 通过反射机制,在testcase中将私有方法设为“可访问”,从而实现对私有方法的测试。...假设我们要对下面这个类的sub方法进行测试 class Demo{ private function sub($a, $b){ return...这也是为什么对protected方法更建议用继承的思路去测。 附: 测试类改写为下面这种方式,个人感觉更清晰。

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    利用pyecharts对职位数据进行地图可视化

    pyecharts 是基于百度开源的Echarts、方便与Python 进行对接、直接可以用于python的一个库。 今天我们利用pyecharts实现职位数据的地图可视化。...所以要自行安装对应的地图文件包,如果下载失败或者觉得下载太慢,可以用镜像进行下载。...我们先对数据源的工作地址,进行字符串的切割,取出上海、广州等城市名称: df["工作地址"] = df["工作地址/经验要求/学历要求/招聘人数"].str.split(',', expand=True...因为maptype=‘china’时,地图只显示全国省级行政区,数据只能是省级行政区,不能显示城市名称,所以我们需要导入经纬度,绘制散点图。...取出上海的行政区,利用Map进行地图可视化: df["工作地址"] = df["工作地址/经验要求/学历要求/招聘人数"].str.split(',', expand=True)[0] df8 = df

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    Chem Sci | 用机器学习策略对逆合成途径进行评估和聚类

    2021年10月23日,浙江大学化学工程与生物工程学院的莫一鸣等人在Chemical Science杂志发表文章,介绍了对逆合成途径进行评估和聚类的机器学习策略。 以下是全文主要内容。...由于缺乏现成的模型来编码整个路线的信息,本文建立了一个动态树结构的LSTM模型,用于对具有相同目标分子的不同路线进行排序,以及用于对在战略上相似的路线进行聚类。...聚类之后,图3a中蓝色突出显示的节点和边缘为路线聚类,图3b放大该聚类,显示该聚类中共有三个主要中间体化合物。...为了方便了解化学家如何在实践中设计合成路线,作者从单步专利反应数据库中策划了一个逆合成路线数据库。...经过训练的Tree-LSTM模型还可以作为一种工具,对策略相似的路线进行聚类,这样用户就可以专注于逆合成程序提出的在策略上不同的路线。

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    对层级聚类树进行模块分割,定位基因在哪个模块中

    Cut tree(rows): 把行聚类结果切成几个类 2. Cut tree(columns): 把列聚类结果切成几个类 3....Row clustering cutree results as row annotations: 把行聚类的结果作为行注释标记在图上,这是为了后面更好的对应每个类 4....Column clustering cutree results as column annotations: 把列聚类的结果作为列注释标记在图上,这是为了后面更好的对应每个类 输出的结果除了图,还有几个表格...`Row labels only display row cluster boundary items`: 只标记每个行聚类的第一个基因。 2....结果如下,每个类的边界基因就定了,再去`row-cluster`的表格中去寻找基因就可以了。 如果不想聚类,或想标记更多基因,也可以使用下面这个功能,每隔多少位标记 1 个基因。 1.

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