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Day6 呦呦鹿鸣—学习R

)以dplyr包为例 官方包文档dplyr示例数据test % select(Species, Sepal.Length)3.filter()筛选行/返回具有匹配条件行可以按照某分类变量值进行数据筛选...(Sepal.Length), sd(Sepal.Length))R管道操作符2:count统计某列unique值count(test,Species)分类变量每个变量频数dplyr处理关系数据将...2个表进行连接1.內连inner_join,取交集inner_join(test1, test2, by = "x")满足两个条件:有相同变量名,相同变量列里有相同元素;2.左连left_join列表书写顺序决定了最终合成列表顺序...,每列数值类型必须相同;以"by"列为标准,补齐列表,空值为"NA"4.半连接:返回能够与y表匹配x表所有记录semi_join交集表test1部分列semi_join(x = test1,

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R语言之数值型描述分析

在分析之前,先将数据集 birthwt 分类变量 low、race、smoke、ht 和 ui 转换成因子。...除了上面提到函数 summary( ),R 还有很多用于计算特定统计量函数(见第二章)。...例如,计算数据框 cont.vars 各个变量样本标准差: sapply(cont.vars, sd) 基本包没有提供计算偏度和峰度函数,我们可以根据公式自己计算,可以调用其他包里函数计算,...psych 包里函数 describe( )可以计算变量忽略缺失值后样本量、均值、标准差、中位数、截尾均值、绝对位差、最小值、最大值、全距、偏度、峰度和均值标准误等。...实际上,在第 3 章介绍 dplyr 包里函数 group_by( )和 summarise( )就能非常灵活地计算分组统计量。

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R 数据整理(七:使用tidyr和dplyr处理数据框 2.0)

数据集如果用于统计与绘图,需要满足一定格式要求,(Wickham, 2014) 称之为 整洁数据 (tidy data),基本要求是每行一个观测,每列一个变量,每个单元格恰好有一个数据值。...,后续参数是条件,这些条件是需要同时满足,另外,条件取 缺失值观测自动放弃,这一点与直接在数据框行下标中用逻辑下标有所不同,逻辑下标中有缺失值会在结果 产生缺失值。...R 数据整理(六:根据分类新增列种种方法 1.0) 其他函数 slice dplyr函数 slice(.data, ...) 可以用来选择指定序号行子集,正序号表示保留,负序号表示排除。...比如,需要对 cancer 数据集中 v0 和 v1 两个变量同时计算平均值和标准差: 显然,如果有许多变量要计算不止一个统计量,就需要人为地将每一个变量每一个统计量单独命名。...7 2 Quebec Qn2 7 3 Quebec Qn3 7 4 Quebec Qc1 7 5 Quebec Qc3 7 6 Quebec Qc2 7 这里有个小问题,交叉分组计算频数后结果仍按照外层分类变量

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R语言数据清洗实战——高效list解析方案

list是R语言中包容性最强数据对象,几乎可以容乃所有的其他数据类型。 但是包容性最强意味着他对于内部子对象类型限制最少,甚至内部可以存在递归结构,这样给我们提取数据带来了很大困难。...2、地理信息数据源: 无论是基于s3标准sp空间数据结构,还是基于s4标准sf空间数据结构,都容纳着大量list对象。...虽然索引函数能够达到目的与list.map类似,但是两者设计初衷是不一样,list.select可以完全类比dplyrselect函数。...可以看到,当使用年份进行分组时,相当于又给mydata做了一次父级标签分类(类别即为我们选定分组变量——年份)。...如果你打算入手noSQL,那么R语言中list就是很好地对标工具(Python也许是dict吧)。 至于更为详细rlist操纵技巧,请参考起官方文档或者任坤老师主页!!!

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R语言︱数据集分组、筛选(plit – apply – combine模式、dplyr、data.table)

R语言︱数据集分组 大型数据集通常是高度结构化,结构使得我们可以按不同方式分组,有时候我们需要关注单个组数据片断,有时需要聚合不同组内信息,并相互比较。...介绍一种按照日期范围——例如按照周、月、季度或者年——对其进行分组超简便处理方式:R语言cut()函数。...## #dplyr基本函数 select——子集选取(筛选变量,列) select(Hdma_dat,pclass,survived) ##选择pclass变量 ?...(iris$setosa)] #按照照setosa大小,重排Sepal.Length数据列 四、dplyr与data.table data.table可是比dplyr以及python...data.table比较简洁一步搞定,dplyr花了两步,不过dplyr可以通过%>%来实现一步搞定。%>%功能是用于实现将一个函数输出传递给下一个函数第一个参数。

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手把手教你R语言方差分析ANOVA

R语言中,实现方差分析主要涉及到以下步骤:数据导入数据清洗ANOVA计算结果解析ANOVA评估首先,你需要一个数据集,其中包含至少一个分类变量(通常是因子类型)和一个或多个数值型变量。...这些数值型变量是你要分析目标,而分类变量则用于将数据分成不同组。...在R,你可以使用aov()函数来执行方差分析。这个函数需要一个公式,该公式描述了你要分析数值型变量分类变量之间关系。...(变量水平数减1)和残差自由度(观察总数减1和自变量水平数减1); Sum Sq列显示平方和(即组均值与总体均值之间总变化)。...residuals(object = one.way))结果显示:残差不显著即是表明残差服从正态分布,可以采用ANOVA分析方法判断RR在D分组分布水平。

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RFM模型及R语言实现

R实现比较简单,用cut 或 quantile 函数都可以实现。...这时候我们要考虑是直接用R(Recency)、F(Frequency)、M (Monetary)三个变量还是要进行变换,因为R、F、M三个字段测量尺度不同最好对三个变量进行标准化,例如:Z得分(实际情况可以选择线性插值法...另外一个考虑:就是R、F、M三个指标的权重该如何考虑,在现实营销这三个指标重要性显然不同!...输出结果后将R、F、M三个字段分类与该字段均值进行比较,利用Excel软件条件格式给出与均值比较趋势!...另外一个考虑是针对R、F、M三个指标的标准化得分按聚类结果进行加权计算,然后进行综合得分排名,识别各个类别的客户价值水平; 至此如果我们通过对RFM模型分析和进行客户细分满意的话,可能分析就此结束。

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生信代码:数据处理( tidyverse包)

大家在学习R语言时候,大多参考《R语言实战》这本书,但这本书年代过于久远(中文第二版是2016年),主要着力点也是在R base上,R语言可视化ggplot2包只是简要介绍,而对于tidyverse...包,《R语言实战》并未涉及,这也导致R语言学习难度增加,今天我们给大家引入tidyverse包学习。...,如果后续要使用到,需要保存下来 5 arrange() R base包涉及到排序包括 sort(),rank(),order(),而在dplyr与排序相关是arrange()包,默认是从高到低进行排序...,如果变换排序顺序则可以使用-(变量)或者desc(变量)。...,例如对于我们本文中数据框,我们如果对个人或者科目感兴趣的话,可以使用group_by(name或者type),然后利用summarize函数就可以求出分类之后各个统计值。

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结构方程模型 SEM 多元回归和模型诊断分析学生测试成绩数据与可视化

p=24694 本文首先展示了如何将数据导入 R。然后,生成相关矩阵,然后进行两个预测变量回归分析。最后,展示了如何将矩阵输出为外部文件并将其用于回归。 数据输入和清理 首先,我们将加载所需包。...NA 是默认值 # 使用 dplyr 对特定测试进行子集化 select(sub, c(T1, T2, T4)) # 使用 psych 包获取描述 请注意,R 将原始数据空白单元格视为缺失,...cov(gdest) #保存原始数据协方差矩阵 模型结果及其含义: 多重 R 平方 告诉您在给定模型变量线性组合情况下预测或解释变量方差比例。...调整后 R 平方 告诉您总体水平 R 平方值估计值。 残差标准误差 告诉您残差平均标准偏差(原始度量)。如果平方是均方误差 (MSE),则包含在残差旁边方差分析表。...首先,我们将创建 T4(标准残差,控制 T1 以外预测变量。 residuals(mot4) #将残差保存在原始数据框 接下来,我们为 T1(预测变量)创建残差,控制 T1 以外预测变量

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《高效R语言编程》6--高效数据木匠

通常数据清理是将非标准文本字符串转换成lubridate简介所描述数据格式。vignette("lubridate") ? 整洁是个广泛概念,包括重构数据,以便有利于数据分析和建模。...用法是:gather(data,key,value,-religion),分别是数据框,要转换成分类列名,单元值列名和清除收集变量 使用seperate()分割联合变量 分割是指将一个实际由两个变量组成变量分割成两个独立列...使用broom::tidy()广泛应用于模型数据,并以标准数据框格式返回模型输出。使用变量名非标准化求值更高效,见R语言 dplyr传递参数_自由 平等~忠诚 奉献-CSDN博客[2]。...与基本R类似函数不同,变量无需使用 $ 操作符就可直接使用,设计与magrittr包%>%管道操作符一起使用,以允许每个数据阶段写成新一行。其是一个大型包,本身可以看成一门语言。...非标准计算 代码没有引号包裹原始名字,这种方式叫做非标准计算(NSE),高效交互使用函数,减少键盘输入,允许Rstudio自动完成。还是函数名多个_。

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Rdplyr 列式计算

下面是联合 across() 和它最喜欢动词函数 summarise()一些例子。但你可以联合 across() 和任意其他dplyr」 动词函数,我们后面会提及。...208. 83.1 31.5 #> # … with 6 more rows 因为 across() 通过和 summarise() 以及 mutate() 结合使用,所以它不会选择分组变量以避免意外地修改它们...所以 across() 会计算它标准差,3(常量) 标准差是 NA,你可以最后计算 n() 来解决这个问题: df %>% summarise(across(where(is.numeric)...这使 「dplyr」 更容易使用(因为需要记住函数更少),使我们更容易实现新动词(因为我们只需要实现一个函数,而不是四个)。..._at() 函数是 「dplyr唯一你需要手动引用变量地方,这让它们比较奇怪且难以记忆。 为什么过了这么久才发现 across()?

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DAY6-学习R

install.packages(“包”)或BiocManager::install(“包”)install.packages("dplyr") 加载 library和require 使用一个R包需先安装再加载...library(dplyrdplyr五个基础函数mutate(),新增列——mutate(test, new = Sepal.Length*Sepal.Width)要修改数据框名称将创建变量名称将分配给新变量值...select()按列筛选select(test,1)#筛选test第一列select(test,c(1,5))#筛选test第一列和第五列select(test,Sepal.Length)#筛选...test名为Sepal.Length一列按列名筛选select(test, Petal.Length, Petal.Width)选择字符向量列,select不能直接使用字符向量筛选,需要使用one_of...))#按照Species分组,计算每组Sepal.Length平均值和标准差并汇总dplyr两个实用技能管道操作 %>% —— 相当于将左边作为右边函数第一个参数,快捷键: ctrl+shift+

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干货 | 男朋友老是说自己R语言很6,快来用这40道题目检测他

4 Excel文件格式是最常用储存数据文件格式之一。了解如何将Excel文件转化为R语言格式非常重要。下面是一个Excel文件,其中数据储存在第三个工作表。...在这种情况下,数据集中分类变量将先被转化为虚拟变量,其可以展示数据集中某个分类是否存在。比如,当对“Parameter”项数据创建虚拟变量后,数据集显示如下。...实际计算相关性函数写法是:cor。在选项B,分母应该是标准差而不是方差。相似地,选项C公式是错误。因此,选项D是正确选择。...21 “dplyr”是R中最流行工具包之一,它包括5个核心数据处理函数。下面选项哪一个不是dplyr核心函数?...A) select() B) filter() C) arrange() D) summary() 答案: (D) summary 是R语言基础工具包函数而不是dplyr函数。

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生信学习-Day6-学习R

先按照Species分组,计算每组Sepal.Length平均值和标准差 group_by(test, Species) summarise(group_by(test, Species),mean...summarise(mean(Sepal.Length), sd(Sepal.Length)):在每个分组内,这一步计算了Sepal.Length列平均值(mean)和标准差(sd)。...数据框是R语言中类似于表格二维数组结构,每一列包含了一个变量值,每一行包含了每个变量一个值集。...test1 <-: 这是R语言中赋值操作符,用于将data.frame()函数创建数据框赋值给变量test1。...结果将是一个新数据框,其中包含了test1那些在test2找到匹配项行,而不包含在test2找不到匹配项行。这种操作通常用于数据集筛选,以保留与另一个数据集相关数据。

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