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TCGA数据库:SNP数据的下载整理及其可视化

一.背景知识 单核苷酸多态性主要是指在基因组水平上由单个核苷酸的变异所引起的DNA序列多态性。它是人类可遗传的变异中最常见的一种,占所有已知多态性的90%以上。...SNP是一种二态的标记,由单个碱基的转换或颠换所引起,也可由碱基的插入或缺失所致。SNP既可能在基因序列内,也可能在基因以外的非编码序列上。...SNP所表现的多态性只涉及到单个碱基的变异,这种变异可由单个碱基的转换(transition)或颠换(transversion)所引起,也可由碱基的插入或缺失所致。...但通常所说的SNP并不包括后两种情况。 理论上讲,SNP既可能是二等位多态性,也可能是3个或4个等位多态性,但实际上,后两者非常少见,几乎可以忽略。因此,通常所说的SNP都是二等位多态性的。...#使用等位基因频率或按突变状态创建基因型矩阵。

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软件构件、中间件、面向对象

EJB在应用服务器的EJB容器内运行,由容器提供所有基本的中间层服务,如事务管理、安全、远程客户连接、生命周期管理和数据库连接缓冲等。     4、COM是微软公司的。...(4)分布式对象中间件     随着对象技术与分布式计算技术的发展,两者相互结合形成了分布式对象技术,并发展成为当今软件技术的主流方向。...三个要素:对象标志(供系统内部唯一的的识别对象);属性(状态、数据、用来描述对象的静态特征);服务(操作、行为或方法,用来描述对象的动态特征)。 3、封装是对象的一个重要原则。...有2各含义:对象是全部属性和全部服务紧密结合而形成的一个不可分隔的整体;对象是一个不透明的黑盒子,表示对象状态的数据和实现操作的代码都被封装在黑盒子里面。...多态性是一种方法,这种方法使得在多个类中可以定义同一个操作或属性名,并在每个类中可以有不同的实现。多态性使得一个属性或变量在不同的时期可以表示不同类的对象。

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    java学习手册-JAVA程序员笔试题(一)

    多态性:多态性是指允许不同类的对象对同一消息作出响应。多态性包括参数化多态性和包含多态性。多态性语言具有灵活、抽象、行为共享、代码共享的优势,很好的解决了应用程序函数同名问题。...答:事务是指:通常所说的是数据库事务(Database Transaction) ,是指作为单个逻辑工作单元执行的一系列操作,要么完整地执行,要么完全地不执行,它包含原子性、一致性、隔离性、持久性四个属性...抽象类中不可以有静态的main方法 9. 不可以 10. &是位运算符,表示按位与运算;&&是逻辑运算符,表示逻辑于。 11. 12 和 -11. 12. 两个对象。...答:事务是指:通常所说的是数据库事务(Database Transaction) ,是指作为单个逻辑工作单元执行的一系列操作,要么完整地执行,要么完全地不执行,它包含原子性、一致性、隔离性、持久性四个属性...抽象类中不可以有静态的main方法 9. 不可以 10. &是位运算符,表示按位与运算;&&是逻辑运算符,表示逻辑于。 11. 12 和 -11. 12. 两个对象。

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    Java面试题分享

    面向对象特征有哪些方面? 面向对象的特征主要有一下方面 抽象:抽象是将一类对象的共同特征总结出来构造类的过程;包括数据抽象和行为抽象两方面。...多态性分为编译时地多态性和运行时的多态性 实现多态需要两件事: 方法重写:子类继承父类并重写父类的方法 对象造型:用父类型引用子类型对象,这样引用同样的方法就会根据子类对象的不同而表现出不同的行为...修饰类:表示该类不能被继承; 修饰方法:表示方法不能被重写; 修饰变量:表示变量只能一次赋值以后值不能被修改(常量) 34. 如何将字符串转换为基本数据类型?...调用基本数据类型对应的包装类中的方法parseXXX(String)或valueOf(String)即可返回相应基本类型; 一种方法是将基本数据类型与空字符串("")连接(+)即可获得其所对应的字符串...令牌和验证都具有一次消费性的特征,因此在原理上一致的,但是验证码是一种糟糕的用户体验,不是必要的情况下不要轻易使用验证码,目前很多网站的做法是如果在短时间内多次提交一个表单未获得成功后才要求提供验证码,

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    C++面向对象程序设计_面向对象程序设计的基本机制是

    大家好,又见面了,我是你们的朋友全栈君。 文章目录 一、面向过程和面向对象的区别。 二、面向过程和面向对象的特征。 三、面向对象的基本特征:封装性,继承性,多态性(抽象性)。...1)抽象 2 )封装 3)继承 4)多态 一、面向过程和面向对象的区别。 面向过程就是分析出解决问题所需要的步骤,然后用函数把这些步骤一步一步实现,使用的时候一个一个依次调用就可以了。...面向对象是把构成问题事务分解成各个对象,建立对象的目的不是为了完成一个步骤,而是为了描叙某个事物在整个解决问题的步骤中的行为 二、面向过程和面向对象的特征。...,其实面向对象就是把显示中的一个事务当作一类东西,这类东西具有某些特性,但是它可以派生,就形成具有某个特点的对象,就是派生类 三、面向对象的基本特征:封装性,继承性,多态性(抽象性)。...【例如】银行帐户的抽象与封装 分析: 用户关心的问题:存款、取款、转帐、查询、修改密码 数据结构:帐号、余额、利息、密码等 3)继承 所表达的是对象类之间相互的关系。

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    rust智能指针

    Rust 堆上对象还有一个特殊之处,它们都拥有一个所有者,因此受所有权规则的限制:当赋值时,发生的是所有权的转移(只需浅拷贝栈上的引用或智能指针即可)。...特征对象,用于说明对象实现了一个特征,而不是某个特定的类型(在特征对象的时候,我们已经见到过了Box) 使用 Box 将数据存储在堆上 前面的文章,我们提到过,标量数据类型是被存储在栈上的。...特征对象 回归一下之前的特征对象,他帮助我们实现了某种意义上的鸭子类型。...Button 和 Select 包装成 Draw 特征的特征对象,放入一个数组中,Box 就是特征对象。...总之,当参与其中的类型定义了 Deref 特征时,Rust 会分析该类型并且连续使用 Deref 直到最终获得一个引用来匹配函数或者方法的参数类型,这种行为完全不会造成任何的性能损耗,因为完全是在编译期完成

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    JAVA实习生面试问题

    String str = new String("字符串".getBytes("GB2312"),"ISO-8859-1");        9.使用StringBuffer类与String类进行字符串连接时有何区别...17.面向对象的特征有哪些方面?         1)抽象:抽象就是忽略一个主题中与当前目标无关的那些方面,以便更充分地注意与当前目标有关的方面。...面向对象计算始于这个基本概念,即现实世界可以被描绘成一系列完全自治、封装的对象,这些对象通过一个受保护的接口访问其他对象。         4) 多态性:多态性是指允许不同类的对象对同一消息作出响应。...引用类型和原始类型具有不同的特征和用法,它们包括:大小和速度问题,这种类型以哪种类型的数据结构存储,当引用类型和原始类型用作某个类的实例数据时所指定的缺省值。...exception 表示一种设计或实现问题。也就是说,它表示如果程序运行正常,从不会发生的情况。

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    经典笔试题-Java基础篇

    1、面向对象的特征有哪些方面? 【基础】 答:面向对象的特征主要有以下几个方面: 1)抽象:抽象就是忽略一个主题中与当前目标无关的那些方面,以便更充分地注意与当前目标有关的方面。...引用类型和原始类型具有不同的特征和用法,它们包括:大小和速度问题,这种类型以哪种类型的数据结构存储,当引用类型和原始类型用作某个类的实例数据时所指定的缺省值。...对象引用实例变量的缺省值为null,而原始类型实例变量的缺省值与它们的类型有关。 9、&和&&的区别?【基础】 答:&是位运算符,表示按位与运算,&&是逻辑运算符,表示逻辑与(and)。...【基础】 答:由于Java 不支持多继承,而有可能某个类或对象要使用分别在几个类或对象里面的方法或属性,现有的单继承机制就不能满足要求。与继承相比,接口有更高的灵活性,因为接口中没有任何实现代码。...【基础】 答:1)调用数值类型相应包装类中的方法parse***(String)或valueOf(String)即可返回相应基本类型或包装类型数值; 2)将数字与空字符串相加即可获得其所对应的字符串

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    【6】进大厂必须掌握的面试题-Hibernate

    Hibernate框架提供了使用JPA批注以及基于XML的配置将纯旧的Java对象映射到传统数据库表的选项。 同样,Hibernate配置也很灵活,可以从XML配置文件以及以编程方式完成。...但是,HQL完全面向对象,并且了解诸如继承,多态性和关联之类的概念。 Hibernate是Red Hat Community的一个开源项目,已在全球范围内使用。...Hibernate支持使用代理对象进行延迟初始化,并且仅在需要时才执行实际的数据库查询。 Hibernate缓存有助于我们获得更好的性能。...Hibernate内置的事务管理功能消除了try-catch块的使用。 Hibernate查询语言(HQL)更加面向对象,并且与Java编程语言非常接近。对于JDBC,我们需要编写本机SQL查询。...JDBC代码与应用程序紧密结合。

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    【愚公系列】软考高级-架构设计师 084-面向对象开发

    对象是现实世界中实体的抽象表示,类是一组对象的抽象描述。 抽象化是为了突出与应用相关的特性,舍弃不相关的特性。...要点总结: 封装是信息隐蔽技术,将相关的概念组合成一个单元模块。 通过封装,可以隐藏对象的内部细节,只暴露必要的接口供外部使用。...1.6 继承继承是面向对象编程中表示类之间层次关系(父类与子类)的概念,使得一个类可以继承另一个类的特性。...强制多态:强制多态指的是通过强制类型转换将一个对象当作另一个类型的对象来处理,以实现特定的操作。 多态性由继承机制支持,通常将通用的消息放在抽象层,而具体不同的功能实现放在具体类的低层。...绑定:是一个把过程调用和响应调用所需要执行的代码结合的过程。在一般的程序设计语言中,绑定可以是静态绑定(在编译时进行)或动态绑定(在运行时进行)。

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    GWAS综述(生信文献阅读俱乐部精选)

    Genome- wide association studies (关联分析):扫描遗传标记,通常是单核苷酸多态性(SNPs),使用统计学相关的手段以发现与性状相关的变异体 Complex traits...Genotype imputation 基因型估算 : 用于估计研究对象的未观察基因型的方法,对于在基因型单核苷酸处具有缺失或不可靠基因型的个体 多态性(SNP)和所有个体在没有基因型SNP Recombination...最后应用方面,使用基因组特征注释从精细定位选择的SNP,以优先进行后续功能研究。 例如eQTL,表达数量性状基因座。...使用LD精细定位一个复杂的特征是基于,前提是祖先减数分裂重组减少了LD,意味着与性状关联最强的SNP是因果变异或接近因果变异。...通过开发针对某些疾病或特征的定制的SNP array,成本效益型使得额外的基因分型变得更容易获得。

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    2022 最新 Java 基础 面试题(一)

    2022 最新 Java 基础 面试题(一) 1、面向对象的特征有哪些方面?...答: 面向对象的特征主要有以下几个方面: · 抽象:抽象是将一类对象的共同特征总结出来构造类的过程,包括数据抽 象和行为抽象两方面。抽象只关注对象有哪些属性和行为,并不关注这些行为的 细节是什么。...· 多态性:多态性是指允许不同子类型的对象对同一消息作出不同的响应。 简单的说就是用同样的对象引用调用同样的方法但是做了不同的事情。多态性分 为编译时的多态性和运行时的多态性。...答: · 调用基本数据类型对应的包装类中的方法 parseXXX(String)或 valueOf(String)即可返回相应基本类型; · 一种方法是将基本数据类型与空字符串(”“)连接(+)即可获得其所...结构型 [描述如 何将类或对象结合在一起形成更大的结构 ]、行 为型[对在不同的对象之间划分责任 和算法的抽象化])共 23 种设计模式,包括 :Abstract Factory( 抽象工厂模式 ),

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    【Rust日报】2019-09-14 - Rust Bay Area Meetup视频发布

    即使对于任意长的顺序呈现的输入数据流,也可以仅使用有限量的先验中间存储来产生或减少数据,因此可以用于数据通信。...该压缩格式使用Zstandard压缩方法并使用xxHash-64校验方法(可选)来检测数据损坏。 以Zstandard定义的数据格式不会允许随机访问压缩数据。...对封装trait对象或trait对象引用的集合进行操作 这里有一个trait: trait Get { fn get(&self) -> u32; } 以及一些实现该trait的类型: struct...references let mut v2 = Vec::>::new(); // collection of boxed trait objects 想要一个可以对这个特征对象的泛型集合进行操作的函数...Sized, { ... } 如何编写一个可以使用I类型的Iterator的单个函数?有更好的方法吗? 下列代码解决了上述问题,且未添加任何trait的实现。

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    Java面试之基础及语法

    【基础】 答:面向对象的特征主要有以下几个方面: 1)抽象:抽象就是忽略一个主题中与当前目标无关的那些方面,以便更充分地注意与当前目标有关的方面。...引用类型和原始类型具有不同的特征和用法,它们包括:大小和速度问题,这种类型以哪种类型的数据结构存储,当引用类型和原始类型用作某个类的实例数据时所指定的缺省值。...对象引用实例变量的缺省值为null,而原始类型实例变量的缺省值与它们的类型有关。 9、&和&&的区别?【基础】 答:&是位运算符,表示按位与运算,&&是逻辑运算符,表示逻辑与(and)。...【基础】 答:由于Java 不支持多继承,而有可能某个类或对象要使用分别在几个类或对象里面的方法或属性,现有的单继承机制就不能满足要求。与继承相比,接口有更高的灵活性,因为接口中没有任何实现代码。...【基础】 答:1)调用数值类型相应包装类中的方法parse***(String)或valueOf(String)即可返回相应基本类型或包装类型数值; 2)将数字与空字符串相加即可获得其所对应的字符串

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    编程_三大编程思想:POP、OOP、AOP

    数据抽象:以数据为中心,将数据对象、数据对象之间的关系和数据对象的基本操作封装在一起(对象)来进行描述,形成抽象数据类型ADT(Abstract Data Type)。...2、封装性: ​ 一种信息隐蔽技术,用户只能看见对象封装界面上的信息,对象的内部实现对用户是隐蔽的。封装的目的是使对象的使用者和生成者分离,使对象的定义和实现分开。...4、多态性: ​ 一个类实例的相同方法在不同的情形有不同的表现形式。多态机制使具有不同内部结构的对象可以共享相同的外部接口。实现了,通过一个公共类可以以相同的方式调用不同对象的不同实现。 ​...实现简单:可有效地减少程序的维护工作量 缺点: 面向对象在面向过程的基础上高度抽象,从而和代码底层的直接交互非常少,从而不适合底层开发和游戏开发,甚至是多媒体开发 复杂性,对于事务开发而言,事务本身是面向过程的...缺点: 增加额外重复代码,且紧耦合 每个业务逻辑需要一个装饰器实现或代理 使用麻烦,须增加容器 总结 ​ POP:是以功能为中心来思考和组织程序,注重功能的实现,达到效果就可以了; ​ OOP:则注重封装

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    『数据库』怎样设计一个数据库

    使用范围:取决于分解后R上的所有事务的总效率是否得到了提高 三、设计用户子模式 注重的问题 (1) 使用更符合用户习惯的别名 (2) 针对不同级别的用户定义不同的View,以满足系统对安全性的要求...一、数据库物理设计的内容和方法 设计物理数据库结构的准备工作 对要运行的事务进行详细分析,获得选择物理数据库设计所需参数 充分了解所用RDBMS的内部特征,特别是系统提 的存取方法和存储结构 选择物理数据库设计所需参数...数据库查询事务 查询的关系 查询条件所涉及的属性 连接条件所涉及的属性 查询的投影属性 数据更新事务 被更新的关系 每个关系上的更新操作条件所涉及的属性 修改操作要改变的属性值 每个事务在各关系上运行的频率和性能要求...当通过聚簇码进行访问或连接是该关系的主要应用, 与聚簇码无关的其他访问很少或者是次要的时候,可 以使用聚簇。...设计候选聚簇 对经常在一起进行连接操作的关系可以建立聚簇 如果一个关系的一组属性经常出现在相等比较条件中,则 该单个关系可建立聚簇 如果一个关系的一个(或一组)属性上的值重复率很高,则 此单个关系可建立聚簇

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    java工程师笔试面试题

    该接口包含与事务属性有关的方法, TransactionDefinition接口中定义了五个表示隔离级别的常量、代表传播行为的常量,TransactionDefinition 中以...解答:进程是资源分配的基本单位。所有与该进程有关的资源,都被记录在进程控制块 PCB 中。以表 示该进程拥有这些资源或正在使用它们。...而且,进程的调度与切换都是由操作系统内核完成, 而线程则既可由操作系统内 核完成,也可由用户程序进行。 229. 同步和异步有何异同,在什么情况下分别使用他们?...面向对象的特征有哪些方面? 解答:面向对象的特征主要有以下几个方面: 1)抽象:抽象就是忽略一个主题中与当前目标无关的那些方面,以便更充分地注意与当前目标有关 的方面。...序列化是将对象状态转换为可保持或传输的格式的过程。与序列化相对的是反序列化,它将流转换为对象,这两个过程结合起来可以轻松的储存和传输数据。

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    六、类和对象

    面向对象:是把构成问题事务分解成各个对象,建立对象的目的不是为了完成一个步骤,而是为了描述某个事物在整个解决问题的步骤中的行为。...多态性允许你将父对象设置成为和一个或更多的他的子对象相等的技术,赋值之后,父对象就可以根据当前赋值给它的子对象的特性以不同的方式运作。简单的说就是用同样的对象引用调用同样的方法但是做了不同的事情。...多态性分为编译时的多态性和运行时的多态性。 这四大特性共同构成了面向对象编程的基础,使得代码更加模块化、可重用和可扩展。在软件开发过程中,合理地使用这些特性可以提高开发效率和代码质量。...str2[0] = 'h'; // 修改第一个字符为小写'h' str2.assign("new string"); // 分配新的字符串内容 字符串连接 你可以使用 + 操作符或 append() 函数来连接字符串...; // 连接两个字符串 str2.append(" and universe!"); // 同样连接字符串 字符串长度 你可以使用 size() 或 length() 函数来获取字符串的长度。

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    2023华为面试真题

    简单的说就是用同样的对象引用调用同样的方法但是做了不同的事情。多态性分为编译时的多态性和运行时的多态性。...完全以缓存为准,使用延迟异步加载的策略(异步线程负责维护缓存的数据,定期或根据条件触发更新),这样就不会触发更新。...所有 I/O 都被视为单个的字节的移动,通过一个称为 Stream 的对象一次移动一个字节。 流 I/O 用于与外部世界接触。它也在内部使用,用于将对象转换为字节,然后再转换回对象。...*中) 与 NIO 最重要的区别是数据打包和传输的方式。 原来的I/O 以流的方式处理数据,而 NIO 以块的方式处理数据。...身份认证是指客户端与服务端连接进行身份认证,包括客户端与 Broker 之间、Broker 与Broker 之间、Broker 与 ZooKeeper 之间的连接认证,目前支持 SSL、SASL 等认证机制

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    领券