geomnet是一个基于ggplot2可视化图形和网络的R包，它使用sna包计算网络布局，并且包含了使用ggplot2绘制圆的geom_circle函数。...包共用 plotly是交互式绘图展示方法 1....例一 绘制后，将鼠标放置在图中的节点或者边上，会提示节点/边的详细信息 library(geomnet) library(plotly) data(blood) #blood是geomnet自带数据...例二 绘制后，将鼠标放置在图中的节点或者边上，会提示节点/边的详细信息。右上方是工具栏。...(gg) 小编总结： 除了Cytoscape软件以外，我们也可使用geomnet包来绘制网络图，而且这种交互式展示方法可用于数据库的设计中，美观且功能性强，大家可以借鉴哦！
R包中有着函数ggplotly()，可以将ggplot2生成的图像转换为交互式的plotly图像，且还可以添加上ggplot2原生图像中无法实现的交互标签，最重要的是其使用方法非常傻瓜式，本文就将结合几个小例子来介绍...可以观察到，经过ggplotly()处理后的ggplot2图像通过R-studio中的viewer窗口打开，即当前的图像是网页文件，而随着我们鼠标的放置，可以在保留原有ggplot2外观的情况下，进行plotly...式的交互操作，注意上图中我们鼠标放置点位对应显示的悬浮标签，其中的内容是默认的格式，即在这张ggplot2图像中所涉及到的所有信息，在上图中即为横纵轴对应的数据，以及在定义形状和颜色时使用到的分类属性信息...，接着利用plotly_build()函数（换成ggplotly()效果相同）来将原生的ggplot2图像转化为交互图像，再利用style()来调整交互图像上的悬浮标签信息，效果如下图所示： ? ...可以看到悬浮标签内的信息如我们所愿，但ggplot2中的某些部件在plotly中是相冲突的，例如图例： p_changed <- ggplot(iris, aes(x=Sepal.Length, y=Sepal.Width
该包直接在R中生成基于D3的Web界面。...以MASS包中的学生调查数据集survery为例，说明hPlot绘图的基本原理。我们绘制学生身高和每分钟脉搏跳动次数的气泡图，以年龄变量作为调整气泡大小的变量。.../demo有更多的例子可供大家学习。...plotly包 接下来要给大家介绍的是另一个功能强大的plotly包。它是一个基于浏览器的交互式图表库，它建立在开源的JavaScript图表库plotly.js之上。...如果你已熟悉ggplot2的绘图系统，也可以针对ggplot2绘制的对象p，利用ggplotly函数实现交互效果。
众所周知，地图对于传达地理空间信息非常有用，我们将介绍一些简单的例子，展示一些在 R 语言中常用于制图的包，即 ggplot2 、tmap 、leaflet 和 mapview 等。...更多设置 在 ggplot() 中，离散变量的默认色标是 scale_*_hue() ，这里 * 表示颜色（为点和线等特征着色）或填充（为多边形或柱状图着色）； scale_*_grey() 用来改变灰色颜色的默认比例...下图是用 viridis 包中的 scale_*_distiller() 函数和 ggplot() 函数绘制的 1974 年北卡罗来纳州婴儿猝死的地图： 例子 ： library(viridis) map...内容扩展 gganimate 包[3] 和 plotly 包[4]可以与 ggplot2 包结合使用，分别创建动画和交互式绘图。...plotly 与 ggplot2 结合，可创建交互式地图，实现放大、缩小、移动等操作。 例子1： 我们还是使用原来那个地图作为例子，这时候使用ggplotly()将其转化为一个可交互的图形。
R语言在常规数据分析的场景下，如数据读入，预处理，整理，以及单机可视化方面表现出的优势，无论从用户体验，还是代码流畅度，令另两种语言略逊一筹。...终于，可以引出第一个可视化包ggplot2了，这个包在统计学界名气很大，功能也极为成熟，是R语言可视化中不可回避的内容。...7.1 与ggplot2的衔接 ggplotly函数可将ggplot2的图转化为plotly ggplotly(infection_ggplot, message=FALSE) 7.2 直方图与离群值...建议出图之后，大家好好把玩一下plotly的图像。 8 利用shiny生成 交互式可视化 shiny是R生态系统中一个准企业级的交互式可视化工具，在用户界面体验方面有极佳的表现。...更多内容请关注公众号或小程序海数据在线 我们有大量免费的精品在线实验课、 视频课、直播课、公开课 还有为你量身打造的学习路线 快来加入我们吧！
它的构建是为了用最少的代码快速绘制专业又美观的图表。 ggplot与python中的pandas有着共生关系。如果打算使用ggplot，最好将数据保存在DataFrames中。...这两个绘图包的底层依旧是matplotlib，因此，在引用时别忘了使用%matplotlib inline语句。值得一说的是plotnine也移植了ggplot2中良好的配置语法和逻辑。...Basemap工具在地理信息读写、坐标映射、空间坐标转化与投影等方面做的要比geopandas更加成熟，它可以使用常规的地图素材数据源（shp）作为底图进行叠加绘图，效果与精度控制比较方便，图表质量堪比...由此产生的数据可以在用户界面中呈现，这种优雅的简单性产生了漂亮且有效的可视化效果，且只需很少的代码。 数据源是一个DataFrame，它由不同数据类型的列组成。...只需一次导入，您就可以在一个函数调用中创建丰富的交互式绘图，包括分面绘图（faceting）、地图、动画和趋势线。它带有数据集、颜色面板和主题，就像 Plotly.py 一样。
原始数据中重要的“元素”都有了 ，我们自己的数据也是只需要这四列就可以了。...当然了既然是ggplot2绘制的Manhattan图（点图），那么关于点，线，坐标，主题的设置当然都可以设置了，看这里 ggplot2|详解八大基本绘图要素 ggplot2|theme主题设置，详解绘图优化...%>% # 添加高亮和注释信息：snpsOfInterest中的rs编号和P值大于6的点 mutate( is_highlight=ifelse(SNP %in% snpsOfInterest,...3）区域放大展示 重点展示某一区域的P值情况 library(ggforce)data %# 添加高亮和注释信息：snpsOfInterest中的rs编号和P值大于6的点 mutate...以上就是ggplot2绘制一些常见的Manhattan图，好处当然就是兼容ggplot2的参数，也就可以根据需要自行设置。
Bokeh是一个专门针对Web浏览器的呈现功能的交互式可视化Python库。这是Bokeh与其它可视化库最核心的区别。正如下图所示，它说明了Bokeh如何将数据展示到一个Web浏览器上的流程。 ?...程序 Bokeh可以转换写在其它库（如matplotlib， seaborn和ggplot）中的可视化 Bokeh能灵活地将交互式应用、布局和不同样式选择用于可视化 Bokeh面临的挑战： 与任何即将到来的开源库一样...在上面的图表中，你可以看到顶部的工具选项（缩放、调整大小、重置、旋转缩放），这些工具可以帮助你与图表进行互动。...在Bokeh服务器上进行可视化绘图有多个优点： 图表有更多的受众 可对大数据集进行交互式可视化 可根据数据流自动更新图表 创建控制面板和应用程序 开始在Bokeh服务器上绘图之前，我先运行了“bokeh-server...执行后续的绘图操作，这将影响已经生成的图形。 5. 图表可视化 为了更好地理解这些步骤，让我举例演示： 绘图范例-1：在Notebook文档中创建二维散点图（正方形标记） ? ?
4.3.2 使用gglot()创建绘图时的简单概念 Ggplot2的算法很简单：您提供数据，告诉ggplot2如何将变量映射到几何，使用什么图形，它负责细节。...4.3.3 使用ggplot()绘图 4.3.3.1 创建一个层叠的图 ggplot2语法的第一个明显特性是分层，这意味着一个图至少由一个层创建，并通过使用gglot()函数向现有图添加更多玩家来增强。...因此，在ggplot2中，绘图实际上是由geom(例如geom_point())创建的，并由更多geom(例如geom_mooth()等)增强。一个几何图形表示一层地块。...空图 应该在aes()函数中指定数据帧中需要绘图的任何信息。在本例中，我们通过aes()函数实现美学映射：分别指定x和y变量。但是，只绘制了一个空白的GGPlot。...对象p是类ggPlot的R S3对象，由数据和其他包含关于该图的信息的组件组成。我们可以使用Summary()函数访问信息的详细信息，以跟踪确切使用了哪些数据以及变量是如何映射的。
擅长不同编程语言的程序员会选择各自技术范畴内成熟、好用的工具包，比如 R 语言的开发者最常使用的是 ggplot2，但它不支持 Python；以前 Python 语言的开发者使用最多的是 matplotlib...ggplot2 是 R 的作图工具包，可以使用非常简单的语句实现非常复杂漂亮的效果。然而不幸的是，ggplot2 并不支持 Python。...这点小小的改变就足以使得 Altair 明白，它不该使用连续色标，而是使用独立色标。 图表的扩展 Altair 的另一个美妙之处就是，我们可以从现有的图表中创建新的图表。...如果想添加数据提示的功能（tooltip，鼠标悬停在数据上时，会显示该数据的详细信息），只需要增加一行代码： categorical_chart = alt.Chart(data).mark_circle...（注：D3.js 是一个 JavaScript 库，用于在 Web 浏览器中生成动态的交互式数据可视化。 它利用了广泛实施的 SVG，HTML5 和 CSS 标准，具有高度的可定制性） 统计支持较差。
Seaborn库旨在以数据可视化为中心来挖掘与理解数据，它提供的面向数据集制图函数主要是对行列索引和数组的操作，包含对整个数据集进行内部的语义映射与统计整合，以此生成信息丰富的图表。...Plotly生成的所有图表实际上都是由JavaScript产生的，无论是在浏览器还是在Jupyter中，所有的可视化、交互都是基于plotly.js的，它是一个高级的声明性图表库，提供了20多种图表类型...plotnine是Python中图形语法的一种实现，它基于ggplot2包，语法绘图功能强大，可以轻松将数据映射到构成图的可视对象，然后创建自定义的图形。...声明使Altair变得简单、友好和一致，用户使用Altair可以轻松设计出有效且美观的可视化代码。 11 ggplot ? ggplot是基于R语言的ggplot2包和Python的绘图系统。...ggplot的运行方式与Matplotlib不同，它允许用户对组件进行分层以创建完整的绘图。例如，用户可以从轴开始画，然后添加点，接着添加线、趋势线等。
导语 GUIDE ╲ 前面我们介绍了一个对有害同义突变预测的方法PrDSM，可以发现，在对模型的分析中，大量的使用ROC对模型进行评估，今天我们就来介绍一下ROC的相关内容和两种ROC绘图方法：pROC...一般情况下，如果真阳性率和假阳性率分布已知，可以通过对y轴上的真阳性率和x轴上的假阳性率绘制的累积分布函数(概率分布下的面积，从-∞到判别阈值)来生成ROC曲线，因此ROC图有时被称为敏感性vs(1−特异性...#add是否将其他ROC曲线将被添加到现有的plot中 2....plotROC试图通过提供绘图和交互式工具来解决这些缺点。提供可以生成用于web使用的交互式ROC曲线图，以及打印版本的功能。plotROC是基于ggplot2绘图的。...install.packages("plotROC") library(plotROC) 1.生成展示绘图的ROC数据 以下一段语句是用于生成展示绘图的ROC数据（在我们自己绘图的时候可用自己的数据）
这个包的主要功能是:可以创建交互式的各种图表，如散点图、气泡图、时间序列、热图、树形图、条形图等；支持各种R对象；支持Highstocks图表、Choropleths；支持管道方法和各种各样的主题与外观...hc_add_series():根据数据的类型将数据添加到现有对象的通用函数，和ggplot2中geom_类似。 hcaes():和ggplot2中ase()用法相似。...这些名称在图例和工具提示中使用。还可以修改颜色和其他属性。...= "Speed and Stopping Distances of Cars", showInLegend = TRUE ) hc 使用hc_add_serieschart()向图表中添加更多的...series(就像ggplot中的图层一样)。
程序 Bokeh可以转换写在其它库（如matplotlib, seaborn和ggplot）中的可视化 Bokeh能灵活地将交互式应用、布局和不同样式选择用于可视化 Bokeh面临的挑战： 与任何即将到来的开源库一样...在Bokeh服务器上进行可视化绘图有多个优点： 图表有更多的受众 可对大数据集进行交互式可视化 可根据数据流自动更新图表 创建控制面板和应用程序 开始在Bokeh服务器上绘图之前，我先运行了“bokeh-server...执行后续的绘图操作，这将影响已经生成的图形。 5....绘图范例-2：将两种视觉元素合并在一张图中 绘图范例-3：为上图添加一个悬停工具和坐标轴标签 绘图范例-4：使用纬度和经度数据来绘制印度地图 注：我已经有一个CSV格式的印度边界的纬度和经度的多边形数据...我们还谈到了如何使用绘图接口创建个性化的可视化图表，通过该功能，你可以将多种视觉元素结合到一起来展示数据信息。
3. ggplot ggplot基于ggplot2，一个 R 语言绘图系统，以及The Grammar of Graphics的概念。...ggplot的运行方式与matplotlib不同：它允许你对组件进行分层以创建完整的绘图。例如，你可以从轴开始画，然后添加点，然后是线、趋势线等。...Bokeh 与ggplot一样，Bokeh同样基于The Grammar of Graphics，但与ggplot不同的是，它是原生Python的，而不是从R语言移植过来的。...与Bokeh一样，Plotly的强项正在制作交互式图，但它提供了一些在大多数库中没有的图表，如等高线图，树状图和3D图表。...它适用于所有数据类型并生成图表作为SVG，可以缩放它们而不会丢失图像质量。由于这个库相对较新，一些文档仍在进行中。你可以制作非常基本的图表 - 但这是就是您想要的。 11.
一共22个Python绘图包： Python 绘图包 altair - 基于Vega Lite的声明性统计可视化 bokeh - 用于Python的交互式Web绘图 Chartify - Bokeh包装...，使数据科学家更容易创建图表 diagram - 使用UTF-8字符的文本模式图 ggplot - 基于R的绘图系统ggplot2 glumpy - OpenGL科学可视化库 holoviews - 来自注释数据的复杂和声明性可视化...- 提供灵活的数据可视化工具集，允许基于matplotlib快速直观地总结数据集的完整性 plotly - 基于plotly.js的交互式网络可视化 PyQtGraph - 交互式实时2D/3D/图像打印和科学...PyVista – 通过可视化工具包（VTK）的流线型界面进行3D绘图和网格分析 seaborn - 用于制作有吸引力且信息丰富的统计图形的库 toyplot - 儿童大小的Python绘图工具包，具有成人大小的目标...pandas-profiling - 生成具有可视化功能的统计分析报告，以进行快速数据分析 pyechars - 基于Echarts库的Python绘图库 最后再分享一个对应上面22个绘图包的思维导图
点击上方蓝色字体，关注程序员zhenguo 你好，我是 zhenguo今天这篇文章不是项目，我的第十个项目还在整理中。今天我参考github，总结出一个极简但却包括了几乎所有Python的绘图包。...，使数据科学家更容易创建图表 diagram - 使用UTF-8字符的文本模式图 ggplot - 基于R的绘图系统ggplot2 glumpy - OpenGL科学可视化库 holoviews - 来自注释数据的复杂和声明性可视化...- 提供灵活的数据可视化工具集，允许基于matplotlib快速直观地总结数据集的完整性 plotly - 基于plotly.js的交互式网络可视化 PyQtGraph - 交互式实时2D/3D/图像打印和科学...PyVista – 通过可视化工具包（VTK）的流线型界面进行3D绘图和网格分析 seaborn - 用于制作有吸引力且信息丰富的统计图形的库 toyplot - 儿童大小的Python绘图工具包，具有成人大小的目标...pandas-profiling - 生成具有可视化功能的统计分析报告，以进行快速数据分析 pyechars - 基于Echarts库的Python绘图库 最后再分享一个对应上面22个绘图包的思维导图
Seaborn库旨在以数据可视化为中心来挖掘与理解数据，它提供的面向数据集制图函数主要是对行列索引和数组的操作，包含对整个数据集进行内部的语义映射与统计整合，以此生成信息丰富的图表。...Plotly生成的所有图表实际上都是由JavaScript产生的，无论是在浏览器还是在Jupyter中，所有的可视化、交互都是基于plotly.js的，它是一个高级的声明性图表库，提供了20多种图表类型...5 plotnine plotnine是Python中图形语法的一种实现，它基于ggplot2包，语法绘图功能强大，可以轻松将数据映射到构成图的可视对象，然后创建自定义的图形。...声明使Altair变得简单、友好和一致，用户使用Altair可以轻松设计出有效且美观的可视化代码。 7 ggplot ggplot是基于R语言的ggplot2包和Python的绘图系统。...ggplot的运行方式与Matplotlib不同，它允许用户对组件进行分层以创建完整的绘图。例如，用户可以从轴开始画，然后添加点，接着添加线、趋势线等。
其可以使用非常简单的代码为两个平台创建图表 Python工具 bokeh – 用于 Python 的交互式网页绘图工具 ggplot – 与ggplot2 面向R语言的 API相同 glumpy – OpenGL...科学可视化库 matplotlib – 2D 绘图库 pygal – 一个动态 SVG 图表库 PyQtGraph – 交互式和实时的 2D/3D/图像 绘制以及科学/工程工具 seaborn – 一个能够制作极具吸引力的和展现翔实统计信息数据的图表库...mpld3 – Matplotlib Graphics的 D3 渲染工具 R工具 ggplot2 – 一个基于图形语法的绘图系统 lattice – R语言格子图形 plotly – 交互式图表（向...ggplot2 的输出中添加了交互性）, 统计图和简单网络图 rbokeh – 针对 Bokeh 的R语言接口 rgl – 使用了 OpenGL 的3D 可视化 shiny – 用于创建交互式应用和可视化的框架...visNetwork – 交互式网络可视化 Ruby工具 Chartkick – 使用 Ruby 的单线创建图表的工具 其他工具 不与特定平台或语言绑定的工具 Charted – 一个能够从任何数据文件中创建自动化
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