如何将sed命令合并到perl脚本中？_脚本中未终止的Sed命令_perl脚本中的awk命令出错 - 腾讯云开发者社区

1.5 Perl 命令 Perl 是一种功能强大的脚本语言，在 Linux 中也可以用来进行文件处理和统计。 $....命令顺序：sed 执行编辑命令的顺序是按照它们在命令行或者脚本中的顺序来的。确保编辑命令的顺序是符合你预期的。...06 Linux的 Perl 命令详细用法在Linux中，Perl命令提供了强大的文本处理功能，它允许你使用Perl语言的特性来进行文本处理和脚本编程。...执行Perl脚本： bashperl script.pl 在这个例子中，script.pl 是一个包含Perl脚本的文件，通过perl命令执行。...文件权限：如果要执行的Perl脚本位于受限制的目录中，或者是其他用户创建的，确保你有执行该脚本的权限。在执行Perl脚本时，需要注意文件的权限设置。

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MySQL数据全量导入PG的方法

下面会用到一个perl脚本来做数据格式的转换： https://github.com/ahammond/mysql2pgsql 1 导出mysql的数据 # 导出结构 mysqldump bx_cmdb...脚本，将上一步骤中的2个sql转为pg格式的，命令类似如下下载到 /root/目录下 chmod +x /root/mysql2pgsql.perl cd /tmp/ /root/mysql2pgsql.perl... struct.sql struct_pg.sql /root/mysql2pgsql.perl data.sql data_pg.sql sed -i.bak 's# int # bigint #g...' struct_pg.sql sed -i.bak 's# smallint # int #g' struct_pg.sql sed -i.bak 's# datetime(6) # timestamp... #g' struct_pg.sql 做上面的几个sed替换操作的原因是：这里我遇到几个问题（我下面的操作处理的不够优雅）： 1 部分int unsigned的数据，perl脚本给转成了int signed

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IC入职新同学必备技能手册 - ShellTclPerl (预告)

预计的topic list: Shell and Vim 正则表达式 Perforce (版本管理系统) Shell脚本套路 Tcl脚本套路 Perl脚本套路 Makefile套路为什么是这三个语言？...曾几何时，在找工作时候看Job Description，会发现几乎大部分数字岗位都要求“熟练csh/tcl/perl脚本”。当时，天真以为，“反正都是脚本，会一个就能过关了”。实际上有点大错特错。...而且，在centOS系统中，默认的脚本解释系统是cshell (tcsh)。所以，如果想学，就是从cshell开始吧（熟练bash的可跳过this section）。...Shell脚本的目标：批量执行linux命令或者其他self-made脚本的wrapper脚本（理解为一个总管）能吃进命令行传参，配合if/else, foreach等分支，完成简单的组合功能。...缺点：复杂文本处理任务上，没有perl那么轻松，配合sed，马马虎虎，不堪重任。 Tcl Tcl语言，是工具语言 (Tool command language)，是一个能直接操作EDA的工具语言。

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SED入门

SED历史 SED（Stream Editor）意为流编辑器，是Unix常见的命令行程序。...SED著名的语法规则包括使用 / 进行模式匹配，以及 s/// 来进行替代。与同期存在的工具ed一起，sed的语法影响了后来发展的 ECMAScript 和 Perl。...其他命令：下面这个命令将文件中的空行或者只包含空格的行删除，其中使用了正则的形式，^表示行首，$表示行尾。...sed '/^ *$/d' inputFileName 脚本 Scripting：SED支持将命令写在脚本中，通过脚本的方式调用命令，同样，也支持Unix中的管道处理。...2、Mac OS中用SED命令替换文本内容 3、Mac上的SED 4、SED Wiki

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正则表达式“派别”简述

但是，我们在使用linux下的文本处理工具如awk、sed等时，正则表达式的语法貌似还不一样，在awk中能正常工作的正则，在sed中总是不起作用，这是为什么呢？...现对常见的命令总结如下：－使用BRE语法的命令有：grep、ed、sed、vim －使用ERE语法的命令有：egrep、awk、emacs 当然，这也不是绝对的，比如 sed 通过-r选项就可以使用...如果你对sed、awk比较熟悉，你会发现我们平常在变成语言中用的\d、\w在这些命令中不能用，原因很简单，因为POSIX规范根本没有定义这些shorthand，这些是由下面将要说的PCRE中定义的。...Perl比较显诸特征之一是与sed与awk兼容，这造就了Perl成为第一个通用性脚本语言。随着Perl的不断发展，其支持的正则表达式的功能也越来越强大。...大家如果对 sed、awk命令不熟悉，可以参考耗子叔下面的两篇文章： sed 简明教程 awk 简明教程参考 GNU Regular Expression Extensions POSIX Bracket

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Nginx编译配置脚本篇（10）- Makefile相关脚本

3.3、设置ngx_objs_dir和ngx_use_pch 3.4、输出编译参数相关信息到objs/Makefile文件中 3.5、根据NGX_PERL_CFLAGS输出信息到objs/Makefile...输出信息到objs/Makefile文件中这段不是重要内容，忽略代码如下： if test -n "$NGX_PERL_CFLAGS"; then echo NGX_PERL_CFLAGS...= NO ]; then . auto/lib/perl/make fi 可以看到该脚本并不直接起作用，而是调用子目录的脚本去实现对应的功能的，子目录的那些脚本就是将对应第三方库的链接信息写入objs...5、auto/install脚本文件详解 5.1、写入安装perl模块的相关指令到obj/Makefile文件代码如下： if [ $USE_PERL !...Nginx之后，需要使用make install命令安装Nginx到指定的目录，这里就是生成这部分内容的代码了。

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我被跨系统的换行符折磨疯了~~~

在Unix/Linux系统中，行尾只使用换行符 \n，系统会自动加上\r实现回车+换行的操作；在 Mac 系统中，行尾只使用回车符 \r，系统会自动加上 \n实现回车+换行的操作；这对我们通常也没什么影响...^M，运行时弹出如下错误提示： metaphlan_to_stamp.pl: /usr/bin/perl^M 解释器错误：没有那个文件和目录找不到名字为perl^M的解释器，实际应该是用perl做解释器...，因为这个是perl脚本。...其它语言脚本也会有类似问题，如bash^M, python^M等。怎么修改呢? 找到这个程序，把\r去掉即可。用下面的命令。...ctrl+m，稍微麻烦一些 sed -i 's/^M//' metaphlan_to_stamp.pl 有时不如果知道程序在什么地方，可以用which返回脚本的路径，直接替换 sed -i 's/\r/

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LeetCode刷题实战193：有效电话号码

(x means a digit) 题意给定一个包含电话号码列表（一行一个电话号码）的文本文件 file.txt，写一个 bash 脚本输出所有有效的电话号码。...(123) 456-7890 解题思路一：grep命令 grep命令用于查找文件里符合条件的字符串，其中-P选项可以让grep使用perl的正则表达式语法。...Bash脚本： grep -P '^(\d{3}-|$\d{3}$ )\d{3}-\d{4}$' file.txt 思路二：sed命令 sed命令是利用script来处理文本文件，其中-n选项仅显示...script处理后的结果，取消将模式空间中的内容自动打印出来，-r选项表示在脚本中使用扩展正则表达式。...Bash脚本： sed -n -r '/^([0-9]{3}-|$[0-9]{3}$ )[0-9]{3}-[0-9]{4}$/p' file.txt 好了，今天的文章就到这里，如果觉得有所收获，请顺手点个在看或者转发吧

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【黄啊码】如何将制表符分隔的文件转换为CSV

我已经看到了sed和gawkbuild议，但是我想知道是否有“首选”的select。只是为了澄清，在这个文件中没有embedded式标签。...这里的空格是一个文字标签： $ echo "hello world" | tr "\t" "," hello,world 当然，如果你在文件中embedded了string文字中的标签，这也会错误地翻译这些标签...以下是一个Python脚本，它从stdin中取出TSV行，并将CSV行写入stdout： import sys import csv tabin = csv.reader(sys.stdin, dialect...-lpe 's/"/""/g; s/^|$/"/g; s/\t/","/g' output.csv Perl比sed，awk和Python更快。...有了这个，你也不需要调用任何其他的外部命令。只有一个awk命令可以完成这项工作。另一种方式，如果你有空白列，你在乎。

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梳理正则表达式发展史

并且根据这篇论文的算法，将正则引入到编辑器 qed ，以及之后的编辑器 ed 中，然后又移植到了我们熟悉的文本搜索工具 grep 中。...Unix 系统或类 Unix 系统上的大部分工具，如 grep 、sed 、awk 等都属于 POSIX 派系。...POSIX 派系 POSIX 派系是遵循 POSIX 规则的正则表达式，其中代表软件有：grep ，sed 和 awk 等。...PCRE 与 Perl Perl1 提供了正则表达式操作符——是通用脚本语言的首创； Perl2 补充 /i 量词，能够进行不区分大小写匹配等； Perl3 支持 /e 量词，能够增强替换运算符的能力；...macOS 基于 BSD，预置 BSD 工具链，众多命令行工具与 Linux 下 GNU 工具的行为不一致，例如常见的 gzip ， find 和 sed ，以及本文重点提及的 grep。

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《Linux与unix Shell编程指南》总结

2）使用at命令提交命令或脚本使用at命令提交作业有几种不同的形式，可以通过命令行方式，也可以使用at命令提示符。...如果希望向at命令提交一个shell脚本，使用其命令行方式即可。在提交脚本时使用- f选项。...，将当前行并到上一行末尾 # 并以单个空格代替原来行头的“=” sed -e :a -e '$!...# 文件必须以特定顺序传给sed。下面第一种版本的脚本可以直接在命令行下输入； # 第二种版本则可以放入一个带执行权限的shell脚本中。（由Rahul Dhesi的一 # 个脚本修改而来。）...# 文件必须以特定顺序传给sed。下面第一种版本的脚本可以直接在命令行下输入； # 第二种版本则可以放入一个带执行权限的shell脚本中。（由Rahul Dhesi的一 # 个脚本修改而来。）

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SHELL(bash)脚本编程八：技巧

1、笔试题先来看某公司的两个笔试题： 1、写脚本实现，可以用shell、perl等。在目录/tmp下找到100个以abc开头的文件，然后把这些文件的第一行保存到文件new中。...分析：寻找名字符合某个模式的文件可以用find，但find不能控制寻找到的文件数量，也许可以用for循环控制一下，查看文件的第一行有许多方法，可以用head、sed等。根据以上思路写出脚本： #!...2、写脚本实现，可以用shell、perl等。把文件b中有的，但是文件a中没有的所有行，保存为文件c，并统计c的行数。问题没什么可分析的，直接的解决方案： #!...但本例中，需要重点理解的是：IFS在数组扩展中的特性，命令grep和sort的运用，以及进程替换的使用。...-name '*.html' -exec sed -i 's/xxxx/oooo/g' {} \; 或类似的命令，显然，这样一个文件接着一个文件串行处理将花费巨大的时间成本。

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Sed 高级功能：我这小脑瓜都快绕晕了

D;$d' file 在《Linux生产环境上，最常用的一套“Sed“技巧》一文中，我们介绍了常用的sed命令和操作，而且使用了两张图来作为辅助。...本篇属于sed的中级用法，常见在一些sed脚本中，在日常中应用并不多，但往往能够获得意想不到的效果。原理工作模式这要从sed的工作模式来说起。 ?...为了使使用者在书写sed脚本的时候真正的”自由”，sed还允许在脚本中用”:”设置记号。标签，有种类似编程语言的特性了。...t label if分支，从最后一行开始，条件一旦满足或者T，t命令，将导致分支到带有标号的命令处，或者到脚本的末尾。测试命令。...End 为了提高你在公司的竞争力，你是可以弄一堆sed脚本唬人（埋雷）的。和某些perl脚本一样，即使是有相关经验的开发着，理解起来也要下点功夫，就不要说其他人了。

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使用 sed 命令进行复制、剪切和粘贴

该命令使用两个唯一的脚本（-e）纯粹是为了帮助提高可读性和组织性。...将步骤划分为单独的脚本可能会很有用，但是从技术上讲，以下命令与一个脚本语句一样有效： $ sed -n -e '/three/h ; g ; p' example.txtLine threeLine three...用 sed 剪切和粘贴现在你知道了如何将字符串从模式空间转到保留空间并再次返回，你可以设计一个 sed 脚本来复制、删除，然后在文档中粘贴一行。...第二个脚本删除包含字符串 three 的任何行。这样就完成了与文字处理器或文本编辑器中的剪切动作等效的功能。...three 它甚至可以写在一个专门的脚本文件中： #!

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在 Shell 中转换 Python 正则表达式

在Shell中，我们通常可以使用sed命令来转换Python正则表达式。sed是一个流编辑器，可以用来对文本进行替换、删除等操作。...我们想要将这个正则表达式转换为适用于sed命令的格式。.../usr/bin/env python# 脚本用于获取 iTunes 中的所有流派import re,sys,sets## 从互联网上找到的代码，用于处理流派名称中的 HTML 实体def unescape...由于 AppleScript 允许他运行 shell 脚本并捕获结果，他想象他可以使用某种类型的 shell 命令来完成同样的操作，比如 grep、perl，或其他命令。...他的 *nix 命令行技能非常生疏，他正在寻找一些指导。总之，他希望找到一种将以上 Python 代码转换成可以直接从 shell 中调用并获得类似结果的方法。

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linux修改文件名称 rename_shell重命名文件指令

Linux命令中的rename命令主要用于给文件重命名，与mv命令有些类似，但rename可以对批量文件进行重命名，而mv命令则只能对单个文件重命名，下面就给大家详细介绍下Linux rename命令的使用方法吧...一直到 log100.txt 现在想要把这批文件的log全部替换为 history rename log history log* 这句命令的意思很明白了，把以 log开头的所有文件中的 log字符替换为...rename ‘s/\.bak$//’ *.bak 这个命令很简单，因为我还没有系统学习过perl，我不知道perl里替换字符串是不是这么干的，但sed是这么干的，所以如果你有sed或者tr基础，很容易明白...，这个替换和sed里的正则语法是一模一样的。...rename ‘y/A-Z/a-z/’ * 依然和sed的替换语法一样，不用多解释，如果看不懂的话，可以系统学习一下sed先。

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使用 sed 命令进行复制、剪切和粘贴

该命令使用两个唯一的脚本（-e）纯粹是为了帮助提高可读性和组织性。...将步骤划分为单独的脚本可能会很有用，但是从技术上讲，以下命令与一个脚本语句一样有效： $ sed -n -e '/three/h ; g ; p' example.txt Line three Line...用 sed 剪切和粘贴现在你知道了如何将字符串从模式空间转到保留空间并再次返回，你可以设计一个 sed 脚本来复制、删除，然后在文档中粘贴一行。...第二个脚本删除包含字符串 three 的任何行。这样就完成了与文字处理器或文本编辑器中的剪切动作等效的功能。...three 它甚至可以写在一个专门的脚本文件中： #!

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表达定量

常用命令图片##----构建索引## 后续索引可直接使用服务器上已经构建好的进行练习cd $HOME/database/GRCh38.105nohup salmon index -t Homo_sapiens.GRCh38...salmon_index >salmon-index.log &cd $HOME/project/Human-16-Asthma-Trans/Expression/Salmon##----运行# 编写脚本...fq.gz -2 ${input}/${id}_2_val_2.fq.gz -p 5 -o ${outdir}/${id}.quantdone如图4##----合并表达矩阵# 原始count值矩阵 (替换脚本中的...$0"}"}' |sed 's/.quant//g'## 完整版：ls -d *quant |tr '\n' ',' |sed 's/,$//' |awk '{print "{"$0"}"}' | perl...quant,SRR1039512.quant} --names {SRR1039510,SRR1039511,SRR1039512} --column tpm --output tpm.txt# 后台运行脚本

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Linux系统管理员修炼三层次

，能通过细微的蛛丝马迹判断一些用户（含入侵者）的恶意行为并能做出迅速反应（损失评估、健康检查、修补）； 10、精通几种常见的脚本语言（bash、sh、perl、php等），熟练一些主要的文本处理工具（grep...、sed、awk等），掌握几种编辑器（vi/vim、emacs等）；第三层次：黑客级管理员 1、首先是一个高级管理员； 2、熟悉内核原代码树结构，阅读过一些主要的内核功能模块代码，掌握全部的内核模块算法...grep, xargs, vi/vim, sed, awk, man, echo, du, mount, fdisk, fsck, cat, sort, tail, head, yast, ifconfig...； 4、运行级别； 5、文件系统搭接； 6、各种自启动和自关闭脚本；模块5、用户： 1、用户创建，用户删除，密码安全，磁盘配额； 2、登入过程，初始化脚本，退出脚本， 3、用户行为信息收集和分析，用户权限...NIS, XNTP(时间同步), HTTP, SAMBA, PROXY server, SSH, kerberos, FTP, 3、打印服务，模块8、脚本编程： 1、bash编程语言，perl和php

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【生信菜鸟经】如何系统入门Perl

Perl是典型的脚本语言，短小精悍，非常容易上手，尤其适合处理文本，数据，以及系统管理。...需要实现非常多的功能，然后就可以自己总结脚本技巧，也能完全掌握perl的各种语法。在生物信息学领域，需要实现的功能有！...perl 单行命令我个人特别喜欢这个知识点，我也专门下载过一本书来学习，把这个教程看完就基本上能全明白：http://www.catonmat.net/blog/perl-one-liners-explained-part-one...学习单行命令的前提是掌握非常多的奇奇怪怪的perl自定义变量和perl的基础语法，用熟练了之后就非常方便，很多生物信息学数据处理过程我现在基本不写脚本，都是直接写一行命令，完全代替了shell脚本里面的...awk、sed/grep系列命令。

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【天枢系列 01】Linux行数统计：命令对决，谁才是王者？

MySQL数据全量导入PG的方法

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SED入门

正则表达式“派别”简述

Nginx编译配置脚本篇（10）- Makefile相关脚本

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梳理正则表达式发展史

《Linux与unix Shell编程指南》总结

SHELL(bash)脚本编程八：技巧

Sed 高级功能：我这小脑瓜都快绕晕了

使用 sed 命令进行复制、剪切和粘贴

在 Shell 中转换 Python 正则表达式

linux修改文件名称 rename_shell重命名文件指令

使用 sed 命令进行复制、剪切和粘贴

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Linux系统管理员修炼三层次

【生信菜鸟经】如何系统入门Perl

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