两者的区别和联系:
近交系数是个体的值
亲缘系数是两个个体之间的值
两者的计算方法:
可以使用通径分析的方法进行计算
也可以采用由系谱构建亲缘关系A矩阵的形式进行计算, 这种方法在数据比较大时更为方便...2, 系谱数据
这里我们模拟了四个个体的系谱关系, 想要计算一下每个个体的近交系数, 以及个体间的亲缘系数, 使用R语言实现....个体5和6的近交系数为0.125.
5, 计算亲缘系数
根据计算的亲缘关系A矩阵,这个矩阵时个体间的方差协方差矩阵, 对角线为每个个体的方差, 非对角线为个体间的协方差....因为共有6个个体, 1和2的亲缘系数 = 2和1的亲缘系数, 因此他们之间的亲缘系数一共有6*5/2 = 15个. 这里我们都计算, 共有36行....:
#1 计算出矩阵的行, 确定循环数
#2 计算出个体的ID名在矩阵中的顺序, 因为有些ID可能是字符或者没有顺序, 主要用于后面的个体编号的确定
#3 为了计算更快, 我们生成一个6*6的矩阵
#4