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生化小课 | 氨基酸具有共同的结构特征

生 化 小 课 医学生:生理生化 必有一挂 生科/生技:生化书是我见过最厚的教材 没有之一 每周一堂 生化小课 —— 期末/考研 逢考必过—— 氨基酸具有共同的结构特征 所有20...由于α-碳原子周围成键轨道的四面体排列,四个不同的基团可以占据两个独特的空间排列,因此氨基酸具有两种可能的立体异构体。...由于它们是彼此的不可叠合的镜像(图3-3),这两种形式代表一类立体异构体,称为对映异构体(见图1-21)。所有具有手性中心的分子都是光学活性的——也就是说,它们会旋转平面偏振光的平面。...对于所有手性化合物,具有与L-甘油醛构型相关的立体异构体被称为L,与D -甘油醛构型相关的立体异构体被称为D。...另一种指定手性中心周围构型的系统是RS系统,它用于有机化学的系统命名法,更精确地描述了具有多个手性中心的分子的构型(第17页)。

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    如何构建创造性设计模式:单例模式

    单例设计模式是一种软件设计模式,它将类的实例化限制为一个对象。与其他创造性设计模式(如抽象工厂)相比,单例构建器模式将创建一个对象,并且还将负责只存在该对象的一个实例。...当创建一个单例类时,有一些问题需要记住: 如何确保一个类只有一个实例? 如何方便地访问类的惟一实例? 类如何控制实例化? 如何限制类的实例数量?...至少,messenger的创建将是同步的,不会创建重复的副本。这种方法的问题是,只有在创建对象时才需要同步。使用上述代码将导致不必要的开销。 另一种方法是使用双重检查锁定方法。...现在,双重检查锁定需要特别小心,因为很容易在错误的实现中选择正确的实现。最好的方法是使用volatile关键字实现延迟加载。...,防止volatile的读取对任何后续的读写进行重新排序。

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    具有可解释特征和模块化结构的深度视觉模型

    例如:90%的信息是可解释的,其中83%表示目标部件,7%表示纹理,10%不能被解释。 如何使用语义图形模型来表示CNN? 如何学习中间层的解耦、可解释的特性?...如何在不损害区分能力的情况下提高可解释性? 如何学习具有功能可解释结构的网络? 今天我们先说说第一条:如何使用语义图形模型来表示CNN? 学习CNN的解释性图 假设CNN是预训练的用于目标分类。...CNN的卷积过滤器记忆了多少类型的视觉模式呢? 特征图中激活的分布 哪些模式被共同激活来描述一个部分? 中间是不同卷积层的特征图,这些过滤器在某些区域被共同激活,以表示马的头部。...该图形具有多层 → CNN的多个conv层 每个节点 → 一个目标的模式 过滤器可以编码多个模式(节点) → 从滤波器的特征映射中分离出一个混合模式 每个边缘 → 共激活关系和两个模式之间的空间关系 输入...学习节点连接,学习节点间的空间关系。 挖掘多个聚类:一个具有多个父节点的节点V,它在不同的图像之间保持一定的空间关系。

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    项目总结 | 对 时间 构建的特征工程

    我说的大多数都是一些数据清洗、数据去除异常点、针对数据特性做出的特别的特征工程的操作,然后面试官给我的建议是下一次面试多说一下常规的特征工程处理,因为这样面试官才会跟你有共鸣,能更好的理解你说的特征工程是什么...本文主要讲述一些比较有意思的特征工程。但是这个有意思就是不那么普通,但是也不那么特殊,让人看了耳目一新的那种感觉。 有趣的特征工程 【节假日消耗的能源更多?】...最大值与最小值的差值 最大值与最小值的倍数 使用时间序列的shift偏移 周期性的特征工程 部分时间特征是具有周期性的。...简单的说,就是通过平移特征工程,然后绘制自相关系数随着平移距离的函数图像。 有了这个周期性之后,就可以构建更多的特征。比方说同比(去年同月)或者环比(相邻月份)。...环比和同比一般都是比率,我们可以再构建这个环比的梯度,类似二阶差分。 卡尔曼滤波器 在百度搜索“时间序列 滤波”等关键词的时候,会发现有下面的内容: ? ? ?

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    R语言随机森林模型中具有相关特征的变量重要性

    p=13546 ---- 变量重要性图是查看模型中哪些变量有趣的好工具。由于我们通常在随机森林中使用它,因此它看起来非常适合非常大的数据集。...大型数据集的问题在于许多特征是“相关的”,在这种情况下,很难比较可变重要性图的值的解释。 为了获得更可靠的结果,我生成了100个大小为1,000的数据集。...顶部的紫色线是的可变重要性值 ,该值相当稳定(作为一阶近似值,几乎恒定)。红线是的变量重要性函数, 蓝线是的变量重要性函数 。例如,具有两个高度相关变量的重要性函数为 ?...实际上,我想到的是当我们考虑逐步过程时以及从集合中删除每个变量时得到的结果, apply(IMP,1,mean)} 在这里,如果我们使用与以前相同的代码, 我们得到以下图 plot(C,VI[2,]...然而,当我们拥有很多相关特征时,讨论特征的重要性并不是那么直观。

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    R语言随机森林模型中具有相关特征的变量重要性

    大型数据集的问题在于许多特征是“相关的”,在这种情况下,很难比较可变重要性图的值的解释。...例如,考虑一个非常简单的线性模型 在这里,我们使用一个随机森林的特征之间的关系模型,但实际上,我们考虑另一个特点-不用于产生数据-  ,即相关   。我们考虑这三个特征的随机森林   。...例如,具有两个高度相关变量的重要性函数为 看起来  比其他两个  要  重要得多,但事实并非如此。只是模型无法在  和  之间选择   :有时会    被选择,有时会被选择 。...我想我发现图形混乱,因为我可能会想到的  重要性 的    恒定。考虑到其他变量的存在,我们已经掌握了每个变量的重要性。...关联度接近1时,与具有相同   ,并且与蓝线相同。 然而,当我们拥有很多相关特征时,讨论特征的重要性并不是那么直观。

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    数据科学竞赛:递增特征构建的简单实现

    “贡献力”,很显然基于这些字段我们可以生成很多的特征。...有一种特征就是关于这些变量的递增变量,什么意思呢?...另外上述方法中有一个小技巧,就是使用了gc.collect(),可以帮助我们在大量数据的情况下节省点内存。 为了解决这个函数跑不动的问题,我就又写了一个方法。这个方法最终是我构建特征的方案。...总结 本次文章我们以构建特征工程中遇到的一个问题出发,讲解了如何计算一个increasing趋势特征,并引出一个值得思考的问题:大矩阵的转置(存储)。如果有空我们下期推文将研究一下大矩阵的相关问题。...另外我们还可以构建其他的特征,如:每一行大于这行平均值的个数特征等等。 以上就是本次文章的全部内容,亲爱的朋友下次再见。

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    构建具有用户身份认证的 React + Flux 应用程序

    序言:这是一篇内容详实的 React + Flux 教程,文章主要介绍了如何使用 API 获取远程数据以及如何使用 JSON Web Tokens 进行用户身份认证。...但是,在构建一个真实的 React 应用程序时,我们还需要考虑其它一些不经常讨论的事情:如何调用远程 API 以及如何验证用户身份。...使用 Auth0,我们只需要放置一个 script 标签就可以立即得到一个 登录框 ,它具有 社交登录 ,多重身份认证 等等。...我们会使用 webpack 编译,而使用 React + Webpack 构建一个新项目最简单的方式就是使用 Yeoman 的生成器。...毫无疑问: 创建一个 React + Flux 应用程序需要写大量代码,而构建小项目很难看到它的优势。但是,随着应用程序体量的增长,单向数据流以及 Flux 遵循的应用结构变得非常重要。

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    构建具有用户身份认证的 React + Flux 应用程序

    但是,在构建一个真实的 React 应用程序时,我们还需要考虑其它一些不经常讨论的事情:如何调用远程 API 以及如何验证用户身份。...使用 Auth0,我们只需要放置一个 script 标签就可以立即得到一个 登录框 ,它具有 社交登录 ,多重身份认证 等等。...我们会使用 webpack 编译,而使用 React + Webpack 构建一个新项目最简单的方式就是使用 Yeoman 的生成器。...也许这并不是你的应用程序的真实场景, 但是在这个例子中,限制用户信息很好的演示了需要认证的应用程序是如何工作的。 我们已经有了处理单个联系人的 action 和 store,所以让我们开始编写组件。...毫无疑问: 创建一个 React + Flux 应用程序需要写大量代码,而构建小项目很难看到它的优势。但是,随着应用程序体量的增长,单向数据流以及 Flux 遵循的应用结构变得非常重要。

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    策略模式:处理不同策略具有不同参数的情况

    策略模式确实在处理不同策略需要不同参数的情况下会显得有些复杂。然而,这并不意味着策略模式不能在这种情况下使用。有几种可能的解决方案: 1....使用上下文来传递参数:你可以在上下文中存储需要的参数,并在需要的时候传递给策略对象。这通常需要在策略接口中添加一个接受上下文的方法。 2....将参数嵌入到策略中:如果某些参数是在策略创建时就已知的,你可以在创建策略对象时将这些参数嵌入到策略中。这通常需要在策略的构造函数中添加相应的参数。 5....使用函数参数:在某些语言中,你可以使用函数参数来实现策略模式。这样,你可以为每个策略提供不同的参数。 以上都是处理这个问题的可能方法,选择哪种方法取决于你的具体需求和应用场景。...注意,无论选择哪种方法,都需要确保你的设计保持了足够的灵活性和可扩展性,以便在未来可以方便地添加新的策略或修改现有的策略。

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    生化小课 | 常见的二级结构具有特征性的二面角

    生 化 小 课 医学生:生理生化 必有一挂 生科/生技:生化书是我见过最厚的教材 没有之一 每周一堂 生化小课 —— 期末/考研 逢考必过—— 常见的二级结构具有特征性的二面角 α螺旋和β构象是多种蛋白质中主要的重复二级结构...Ramachandran引入的,是将特定蛋白质结构中观察到的所有φ和ψ角可视化的有用工具,通常用于测试三维蛋白质结构的质量。...在Ramachandran图中,定义α螺旋和β构象的二面角落在空间允许结构的相对有限的范围内(图4-8a)。...已知蛋白质结构的φ和ψ的大部分值落在预期的区域,如预测的那样,α螺旋和β构象值附近浓度较高(图4-8b)。唯一经常在这些区域之外的构象中发现的氨基酸残基是甘氨酸。...由于Gly残基的侧链很小,它可以参与许多其他氨基酸在空间上禁止的构象。在这些区域之外的构象中经常发现的唯一氨基酸残基是甘氨酸。

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    如何写出更具有Python风格的代码

    任何普通的程序员都可以编写计算机可以理解的代码。只有好的程序员可以编写人类可以理解的代码。 ?...推导式风格的代码是优雅的,人类易读的。 四、你还在显式的关闭文件吗?...迭代器是一个更笼统的概念:任何一个对象只要它所属的类具有__next__方法(Python 2是next)和具有返回 self 的__iter__方法都是迭代器。...生成器是通过调用具有一个或多个 yield 表达式的函数而构建的,并且该函数是满足上一段对iterator 的定义的对象。...他们真正的区别是:当你需要一个具有某些复杂的状态维护行为的类,或者想要公开除__next__(和__iter__和__init__)之外的其他方法时,你就需要自定义迭代器,而不是生成器。

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    如何发布具有超高性能的地图服务

    ,为了在地图上快速加载大量的矢量要素,且方便快捷的在前端处理矢量的样式,且矢量数据可以携带对应的若干属性字段,目前主流的做法是使用矢量切片(vector tiles)的方式将矢量数据发布为服务进行调用:...(Blazing fast),而在我实际的使用体验中也确实如此,在今天的文章中我就将为大家分享有关martin发布矢量切片地图服务的常用知识。...的部署使用方法: 2.1 martin的安装 martin提供了多种多样的安装方式,其中我体验下来比较简单稳定的安装方式是基于cargo,这是Rust的包管理器(因为martin基于Rust开发,这也是其超高性能的原因之一...的基础使用超级简单,只需要在启动martin服务时设置好目标PostGIS数据库的连接参数字符串,它就可以自动发现数据库中具有合法坐标系(默认为EPSG:4326)的所有矢量表,并自动发布为相应的地图服务...: 对mapbox、maplibre等地图框架了解的朋友,就知道上述信息可以直接用于向地图实例中添加相应的source和layer,下面是一个简单的基于maplibre的地图示例,要素加载速度非常之快

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    微服务模式下如何实现多模块并行构建发布

    在微服务项目中具有很多个服务模块,为了便于管理需要将项目规范化,使用GitLabGroup管理整个项目,每个project对应一个微服务,每个微服务对应一个Jenkins job。...开始发布的时候需要我们在手动选择各个服务然后发布。模块很多的时候就不太方便了。...用户选择要发布的微服务,然后根据服务名称并行触发每个要发布服务的流水线进行构建和发布。 我们先来看看如何使用pipeline中的parallel语法,这里列举了两个例子:并行任务、并行阶段。...parallel parallelMap //判断状态 for ( i in buildStatus.keySet()){ currentBuild.description = "构建信息...有时候我们需要设置一个集中控制项目来根据设置的参数有序触发各个模块服务对应的流水线进行发布。在各个模块之间没有发布顺序的时候,我们可以使用Pipeline的Parallel语法进行项目的并行构建。

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    为什么IoT公司保持构建具有巨大安全漏洞的设备?

    这受到广泛赞誉的国家标准与技术研究所(NIST)网络安全框架的体现,该架构是与行业合作开发的,并提供可适应任何规模或简档的组织的基于风险的指导和最佳实践。...一个框架也可以作为联邦机构目前正在进行的一些分散的物联网工作的急需的协调点。 然而,对于物联网行业等待政府来说,这是一个错误,这个问题是迫切的,随着新的“物联网”攻击事件的发展,将会变得更加如此。...因为大多数消费者不会更改这些设置,所以产品应该设计为具有唯一凭据,或者要求用户首次使用时设置新的凭据。这样做会阻碍物联网设备的最简单和最广泛的方法。...与手机和计算机不同,IoT设备通常在没有人力监督或可视性的情况下运行。许多这些对象缺少显示消息的屏幕。与其他类型的产品召回一样,当设备出现安全问题时,业主需要收到通知,并告知如何应用安全更新。...当物联网设备被转售时,应该有一种简单的方法来进行出厂重置以擦除数据和凭据。例如,IBM Security最近展示了二手车的销售商如何能够保留对车辆的远程功能(如地理定位)的访问,而无需买家的意识。

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