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如何去掉数据中的离群样本?

今天分享一下如何删除离群样本,并探索一下是否有生物学意义。...02 PCA删除离群样本 删除距离太远的样本,上面的pca绘图的时候其实也返回来了横纵坐标信息: #筛选离群样本名称 name<-as.character(p2$data$name[p$data...2666-01B" "TCGA-44-6147-01B" "TCGA-21-5782-01A" name_index <- which(rownames(exp) %in% name) #在基因矩阵及分组中删除离群样本...只是删除了PCA中的12个样本,所以看起来影响不大,那么我们再考虑他的统计学意义,结合P值看一下对差异基因是否有影响。...gplots::balloonplot( table( deg_DESeq2[ids,'g'], deg1_DESeq2[ids,'g']) ) dev.off() 从比较的表格中可以看出删除样本之后上调的差异基因减少了将近一半

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删除列中的 NULL 值

图 2 输出的结果 先来分析图 1 是怎么变成图 2,图1 中的 tag1、tag2、tag3 三个字段都存在 NULL 值,且NULL值无处不在,而图2 里面的NULL只出现在这几个字段的末尾。...这个就类似于 Excel 里面的操作,把 NULL 所在的单元格删了,下方的单元格往上移,如果下方单元格的值仍是 NULL,则继续往下找,直到找到了非 NULL 值来补全这个单元格的内容。...有一个思路:把每一列去掉 NULL 后单独拎出来作为一张独立的表,这个表只有两个字段,一个是序号,另一个是去 NULL 后的值。...一个比较灵活的做法是对原表的数据做列转行,最后再通过行转列实现图2 的输出。具体的实现看下面的 SQL(我偷懒了,直接把原数据通过 SELECT 子句生成了)。...,按值在原表的列出现的顺序设置了序号,目的是维持同一列中的值的相对顺序不变。

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    Pandas中如何查找某列中最大的值?

    一、前言 前几天在Python白银交流群【上海新年人】问了一个Pandas数据提取的问题,问题如下:譬如我要查找某列中最大的值,如何做? 二、实现过程 这里他自己给了一个办法,而且顺便增加了难度。...print(df[df.点击 == df['点击'].max()]),方法确实是可以行得通的,也能顺利地解决自己的问题。...顺利地解决了粉丝的问题。 三、总结 大家好,我是皮皮。这篇文章主要盘点了一个Pandas数据提取的问题,文中针对该问题,给出了具体的解析和代码实现,帮助粉丝顺利解决了问题。...最后感谢粉丝【上海新年人】提出的问题,感谢【瑜亮老师】给出的思路,感谢【莫生气】、【添砖java】、【冯诚】等人参与学习交流。

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    【Python】基于某些列删除数据框中的重复值

    Python按照某些列去重,可用drop_duplicates函数轻松处理。本文致力用简洁的语言介绍该函数。...subset:用来指定特定的列,根据指定的列对数据框去重。默认值为None,即DataFrame中一行元素全部相同时才去除。...导入数据处理的库 os.chdir('F:/微信公众号/Python/26.基于多列组合删除数据框中的重复值') #把路径改为数据存放的路径 name = pd.read_csv('name.csv...原始数据中只有第二行和最后一行存在重复,默认保留第一条,故删除最后一条得到新数据框。 想要根据更多列数去重,可以在subset中添加列。...但是对于两列中元素顺序相反的数据框去重,drop_duplicates函数无能为力。 如需处理这种类型的数据去重问题,参见本公众号中的文章【Python】基于多列组合删除数据框中的重复值。 -end-

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    异常检测怎么做,试试孤立随机森林算法(附代码)

    本文内容包括: 介绍异常检测; 异常检测的用例; 孤立森林是什么; 用孤立森林进行异常检测; 用 Python 实现。 异常检测简介 离群值是在给定数据集中,与其他数据点显著不同的数据点。...这是一种无监督学习算法,通过隔离数据中的离群值识别异常。 孤立森林是基于决策树的算法。从给定的特征集合中随机选择特征,然后在特征的最大值和最小值间随机选择一个分割值,来隔离离群值。...打印异常 为了打印数据中预测得到的异常,在添加分数列和异常列后要分析数据。如前文所述,预测的异常在预测列中的值为 -1,分数为负数。根据这一信息,将预测的异常(本例中是两个数据点)打印如下。...用以下代码找出数据中存在的离群值: outliers_counter = len(df[df['salary'] > 99999]) outliers_counter 计算模型找到的离群值数量除以数据中的离群值数量...:什么是离群值以及如何用孤立森林算法检测离群值。

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    异常检测怎么做,试试孤立随机森林算法(附代码)

    在该任务中,孤立森林算法是简单而有效的选择。 本文内容包括: 介绍异常检测; 异常检测的用例; 孤立森林是什么; 用孤立森林进行异常检测; 用 Python 实现。...异常检测简介 离群值是在给定数据集中,与其他数据点显著不同的数据点。 异常检测是找出数据中离群值(和大多数数据点显著不同的数据点)的过程。...这是一种无监督学习算法,通过隔离数据中的离群值识别异常。 孤立森林是基于决策树的算法。从给定的特征集合中随机选择特征,然后在特征的最大值和最小值间随机选择一个分割值,来隔离离群值。...用以下代码找出数据中存在的离群值: outliers_counter = len(df[df['salary'] > 99999]) outliers_counter 计算模型找到的离群值数量除以数据中的离群值数量...:什么是离群值以及如何用孤立森林算法检测离群值。

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    【Python】基于多列组合删除数据框中的重复值

    最近公司在做关联图谱的项目,想挖掘团伙犯罪。在准备关系数据时需要根据两列组合删除数据框中的重复值,两列中元素的顺序可能是相反的。...本文介绍一句语句解决多列组合删除数据框中重复值的问题。 一、举一个小例子 在Python中有一个包含3列的数据框,希望根据列name1和name2组合(在两行中顺序不一样)消除重复项。...import numpy as np #导入数据处理的库 os.chdir('F:/微信公众号/Python/26.基于多列组合删除数据框中的重复值') #把路径改为数据存放的路径 df =...经过这个函数就可以解决两行中值的顺序不一致问题。因为集合是无序的,只要值相同不用考虑顺序。 duplicated():判断变成冻结集合的列是否存在重复值,若存在标记为True。...numpy as np #导入数据处理的库 os.chdir('F:/微信公众号/Python/26.基于多列组合删除数据框中的重复值') #把路径改为数据存放的路径 name = pd.read_csv

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    Mysql与Oracle中修改列的默认值

    于是想到通过default来修改列的默认值: alter table A modify column biz default 'old' comment '业务标识 old-老业务, new-新业务'...找后台运维查生产数据库,发现历史数据的biz字段还是null 原因: 自己在本地mysql数据库试了下,好像的确是default没法修改历史数据为null 的值。这就尴尬了。...看起来mysql和oracle在default的语义上处理不一样,对于oracle,会将历史为null的值刷成default指定的值。...总结 1. mysql和oracle在default的语义上存在区别,如果想修改历史数据的值,建议给一个新的update语句(不管是oracle还是mysql,减少ddl执行的时间) 2....即使指定了default的值,如果insert的时候强制指定字段的值为null,入库还是会为null

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    如何使用Excel将某几列有值的标题显示到新列中

    如果我们有好几列有内容,而我们希望在新列中将有内容的列的标题显示出来,那么我们怎么做呢? Excel - TEXTJOIN function 1....- - - - 4 - - - 在开始,我们曾经使用INDEX + MATCH的方式,但是没有成功,一直是N/A https://superuser.com/questions/1300246/if-cell-contains-value-then-column-header...所以我们后来改为TEXTJOIN函数,他可以显示值,也可以显示值的标题,还可以多个列有值的时候同时显示。...- - 4 - - - 15 Year 5 - - - - 5 - - - =TEXTJOIN(", ",TRUE,IF(ISNUMBER(B2:I2),$B$1:$I$1,"")) 如果是想要显示值,...则: =TEXTJOIN(", ",TRUE,IF(ISNUMBER(B2:I2),B2:I2,"")) 其中,ISNUMBER(B2:I2)是判断值是不是数字,可以根据情况改成是不是空白ISBLANK

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    Python - 字典中的值求和

    地图是Python中的一个关键数据组件,它使人们能够存储密钥和数据对。这些可与各种编程框架中的关联数组相媲美。这些旨在快速保存和访问数据。在参考书中,元素应该是不同的。相反,元素可以属于任何数据类别。...'key':我们希望计算值总和的特定键。 “Sum”:一个 Python 函数,用于计算可迭代对象中所有元素的总和。 算法 第 1 步:设置一个变量来存储值的添加。...步骤2:可以访问与提供的键关联的字典值列表。 第 3 步:要计算值的总和,请使用 sum() 函数。 步骤 4:将总和分配给在步骤 1 中创建的变量。 步骤5:应打印或返回值的总和。...,利用预先存在的 Python 函数来计算“工资”字典中包含的元素总数并安排结果。...然后,使用“sum()”函数来计算“工资”地图中所有元素的总数。'sum()' 方法是 Python 中的一种固有方法,它接受序列作为参数并返回集合中整个集合的相加。

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    Python 数据处理 合并二维数组和 DataFrame 中特定列的值

    pandas.core.frame.DataFrame; 生成一个随机数数组; 将这个随机数数组与 DataFrame 中的数据列合并成一个新的 NumPy 数组。...numpy 是 Python 中用于科学计算的基础库,提供了大量的数学函数工具,特别是对于数组的操作。pandas 是基于 numpy 构建的一个提供高性能、易用数据结构和数据分析工具的库。...在这个 DataFrame 中,“label” 作为列名,列表中的元素作为数据填充到这一列中。...结果是一个新的 NumPy 数组 arr,它将原始 DataFrame 中 “label” 列的值作为最后一列附加到了随机数数组之后。...运行结果如下: 总结来说,这段代码通过合并随机数数组和 DataFrame 中特定列的值,展示了如何在 Python 中使用 numpy 和 pandas 进行基本的数据处理和数组操作。

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    【说站】python如何过滤列表中的唯一值

    python如何过滤列表中的唯一值 1、使用collections.Counter函数对列表进行计数,并通过列表推导式过滤出非唯一值,过滤出计数大于1的值。...2、Counter是dict的子类,用来计数可哈希对象。是一个集合,元素像字典键一样存储,计数存储为值。 计数可以是任何整数值,包括0和负数。它可以接收一个可迭代的对象,并计数它的元素。...in Counter(lst).items() if count > 1]   # EXAMPLES filter_unique([1, 2, 2, 3, 4, 4, 5]) # [2, 4] 以上就是python...过滤列表中唯一值的方法,希望对大家有所帮助。...更多Python学习指路:python基础教程 本文教程操作环境:windows7系统、Python 3.9.1,DELL G3电脑。

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    如何在 Python 中计算列表中的唯一值?

    在本文中,我们将探讨四种不同的方法来计算 Python 列表中的唯一值。 在本文中,我们将介绍如何使用集合模块中的集合、字典、列表推导和计数器。...接下来,我们将探索列表理解,提供一种简洁有效的方法来实现预期的结果。最后,我们将研究如何使用集合模块中的计数器,它提供了更高级的功能来计算集合中元素的出现次数。...方法 1:使用集合 计算列表中唯一值的最简单和最直接的方法之一是首先将列表转换为集合。Python 中的集合是唯一元素的无序集合,这意味着当列表转换为集合时,会自动删除重复值。...生成的集合unique_set仅包含唯一值,我们使用 len() 函数来获取唯一值的计数。 方法 2:使用字典 计算列表中唯一值的另一种方法是使用 Python 中的字典。...通过使用元素作为键,并将它们的计数作为字典中的值,我们可以有效地跟踪唯一值。这种方法允许灵活地将不同的数据类型作为键处理,并且由于 Python 中字典的哈希表实现,可以实现高效的查找和更新。

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    大佬们,如何把某一列中包含某个值的所在行给删除

    一、前言 前几天在Python白银交流群【上海新年人】问了一个Pandas数据处理的问题,一起来看看吧。 大佬们,如何把某一列中包含某个值的所在行给删除?比方说把包含电力这两个字的行给删除。...这个方法肯定是可行的,但是这里粉丝想要通过Python的方法进行解决,一起来看看该怎么处理吧。...二、实现过程 这里【莫生气】给了一个思路和代码: # 删除Column1中包含'cherry'的行 df = df[~df['Column1'].str.contains('电力')] 经过点拨,顺利地解决了粉丝的问题...顺利地解决了粉丝的问题。 但是粉丝还有其他更加复杂的需求,其实本质上方法就是上面提及的,如果你想要更多的话,可以考虑下从逻辑 方面进行优化,如果没有的话,正向解决,那就是代码的堆积。...【Python自动化高效办公超入门】大家好,我是Python进阶者,很多粉丝有自动化办公的需求,在此我和【吴老板】、【月神】大佬合力共著一本Python自动化高效办公书籍,目前已经正式上市了,欢迎大家订阅

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