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Rmarkdown使用及转换为R文件

R Markdown是一种用于创建动态文档工具,它结合了R代码、文本和结果展示。...代码块可以包含任何有效R代码,并且可以在文档不同位置重复使用。 多种输出格式:R Markdown支持多种输出格式,包括HTML、PDF、Word、Markdown等。...你可以根据需要选择适合输出格式,使用相应R包和设置来生成最终文档。 可嵌入文本和标记:除了R代码,你还可以在R Markdown文档嵌入文本、标题、段落、列表、链接、图片等。...你可以使用Markdown或HTML标记语言来格式化文本和添加样式。 动态生成结果:R Markdown可以自动执行R代码块,并将结果嵌入到文档。...你可以将R Markdown文档转换为不同输出格式,并将其共享给他人,以便他们查看、交互和复制你分析。

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1.5w字Rmarkdown入门教程汇总

R配套软件包tinytex可以帮助你在将LaTeX或R Markdown文档编译为PDF时自动安装缺少LaTeX软件包,确保将LaTeX文档编译正确次数以解决所有交叉引用。...默认情况下代码和结果会在输出文件呈现。如果通过参数来控制代码块运行结果输出情况可以在{r }设置。一般包括代码及运行结果输出、图片表格格式定义等。...全局设置markdown代码块存在一样参数设置,则可以提前设计好全局代码块参数。...5.设置表格行与 这里使用函数是column_spec(),其中以下代码含义:制定前两数据,字体加粗、颜色白色,表格填充"#D7261E"。...如果输出文档具有固定页面宽度(例如,PDF文档),则文本输出可能会超过页面的页边距。 R全局选项宽度可用于控制R函数输出文本宽度,如果默认太大,则可以尝试使用较小

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1.5w字Rmarkdown入门教程汇总

R配套软件包tinytex可以帮助你在将LaTeX或R Markdown文档编译为PDF时自动安装缺少LaTeX软件包,确保将LaTeX文档编译正确次数以解决所有交叉引用。...默认情况下代码和结果会在输出文件呈现。如果通过参数来控制代码块运行结果输出情况可以在{r }设置。一般包括代码及运行结果输出、图片表格格式定义等。...全局设置markdown代码块存在一样参数设置,则可以提前设计好全局代码块参数。...5.设置表格行与 这里使用函数是column_spec(),其中以下代码含义:制定前两数据,字体加粗、颜色白色,表格填充"#D7261E"。...如果输出文档具有固定页面宽度(例如,PDF文档),则文本输出可能会超过页面的页边距。 R全局选项宽度可用于控制R函数输出文本宽度,如果默认太大,则可以尝试使用较小

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rmarkdown+flexdashboard制作dashboard原型

这里所说解决方案不仅是指R语言里面有诸多图形语法系统(比如base系统、grid系统、lattic系统等),更重要是它拥有(目前比较成熟)系统级输出方案,你可以理解如何在项目中从一而终组织你分析内容...其中yaml头文件vertical_layout参数用于控制整个图标布局行列布局规则,vertical_layout: fill效果自动按布局。...参数fill时,所有图表高度会根据当前页面浏览器高度自适应调整)。...Html Widgets html widgets部件是R语言中很有特色一类交互式动态可视化组间,这些组间通常是封装第三方js可视化库,而且调用非常简单,也不需要调整太多美化参数(因为都是底层定制好...Tabular Data —— 表格 表格输出一般有两种情况,仅输出原生表格或者使用shinyrenderTable函数封装动态更新表格。

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R沟通|Rmarkdown(5)一些常用技巧

修改某些字体颜色 Markdown语法没有用于更改文本颜色内置方法。...我们可以使用HTML和LaTeX语法来更改单词格式 对于HTML,我们可以将文本包装在标记使用CSS设置颜色,例如 text </ span...这时输出结果,目录一个界面,正文另起一页。 ? 5. 控制文本输出宽度 有时从R代码输出文本可能太宽。如果输出文档具有固定页面宽度(例如,PDF文档),则文本输出可能会超过页面的页边距。...R全局选项宽度可用于控制R函数输出文本宽度,如果默认太大,则可以尝试使用较小。此选项通常表示每行字符粗略数目。...如果使用R代码导入图片的话,使用knitr::include_graphics()结合R chunkfig.align = 'center'参数进行居中。

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R tips:RMarkdown代码块控制选项

RMardkown代码在渲染时可以得到更加精细控制,诸如代码是否运行、是否显示、如何显示、文本是否输出如何输出、图片是否显示、如何显示等等。...II 文本 result 比较重要一个参数,用于控制文本输出是否显示以及如何显示,有四个可选项:markup、asis、hold、hide。...由于它和warning很常见,其实可以作为默认参数设置,通过knitr::opts_chunk$set设置好,如上面的include参数代码一样。...fig.height,fig.width:设置图片大小地方。 注意RMarkdown图片输出是不需要使用pdf或者ggsave等方法进行保存,只需要将图片plot或者print即可。...或out.height控制它在输出文件显示大小,其一个百分比字符,如:“80%”。

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AI应用开发基础教程_借助LangChain来调用ChatGPT_API

次要背景颜色 textColor 控制应用中大部分文本颜色。 文本颜色 font 选择应用中使用字体。如果未设置设置了无效,则默认为“无衬线”。...转换为嵌入保存 两个步骤代码 load_qdrant函数:准备一个操作向量数据库客户端 build_vector_store函数:将PDF文本转换为嵌入保存在向量数据库 from qdrant_client...检索方法调整 可以通过retriever选项进行调整 调整生成响应方法 使用chain_type参数。例如,将其设置map_reduce或类似方法时,可以考虑甚至非常长上下文。...各种参数设置 参数名称 描述 详细说明 k 指定搜索时要命中文档数量 默认:4(在本书中设置10) score_threshold 当在search_type中选择similarity_score_threshold...时使用 设置相似性分数阈值 filter 在Qdrant,如果在创建向量DB时每条记录设置了元数据,你可以使用它来调整要检索上下文 请另行检查在其他向量DBs兼容性 在RetrievalQA

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使用markdown,knitr和pandoc在R语言中编写可重现报告

在本指南中,我们想向您展示如何使用现在提供一些奇妙,免费工具和软件包编写美观,可重复报告。这些工具将帮助您交流科学知识,希望您再也不会复制和粘贴R输出。...实际上,它是应用于纯文本文档一组简单格式设置命令,可以轻松地将其转换为格式精美的html,pdf或word docs。...以R markdown编写文件具有扩展名 .Rmd。 将R markdown视为可以编译 上述markdown变体之一东西 。...显示和隐藏代码及输出 通过为每个代码块设置选项,您可以选择要包含在虚拟报告内容。 echo= TRUE:如果要在报告显示代码,FALSE 或者要隐藏代码,请选择此项 。...它还可以在安装LaTeX系统上产生PDF输出。”” 首先,您需要下载 安装pandoc。安装后,您便可以使用pnadoc knitr软件包随附 功能将生成md文件转换为所需任何格式。

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绘制图表(1):初次实现

使用字符串格式设置功能可打印出漂亮输出,如分列打印数字。然而,在有些情况下,仅使用纯文本还不够。(俗话说,一图胜千言。)...我们将使用更高级图形框架(reportlab.graphics包及其子模块),它能让我们创建各种形状,将其添加到Drawing对象,再将Drawing对象输出PDF文件。...构造函数String主要参数包括x坐标和y坐标以及文本。另外,你还可指定各种属性,如字号、颜色等。在这里,我设置参数textAnchor,它指定要将字符串哪部分放在坐标指定位置。...要绘制折线图,必须数据集中数据绘制一条折线。这些折线上每个点都由时间(年和月)和(从相关获取太阳黑子数)组成。要获取一,可使用列表推导。...你可是用类似的方式来获取其他(对于每行时间,必须根据年和月来计算,如year+month/12。)

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Day7:R语言课程 (R语言进行数据可视化)

使用R base包提供函数'mean()': mean(rpkm_ordered[,"sample1"]) 只想要其中一个样本(数据框1平均值,可以这样实现,但要从所有12个样本获取此信息该如何实现...图直线达到点是除异常值外最小和最大。 使用四分位(IQR)确定异常值,IQR定义:Q3-Q1。低于Q1或高于Q3超过1.5 x IQR任何都被视为异常值,表示竖线上方或下方点。...R提供选择png或pdf等格式,选择要存放图片目录。还提供了决定输出图像大小和分辨率选项。 第二种方法是使用R函数并将写入文件编码到脚本。...这种方法允许用户从头到尾运行脚本自动执行该过程(不需要人工点击操作来保存)。在R术语输出被定向到特定输出设备,指示输出文件格式。...这将打开要写入设备: pdf("figures/scatterplot.pdf") 如果要修改图像大小和分辨率,则需要在初始化时将相应参数作为参数添加到函数

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Python输出还可以这么花里胡哨,这个第三方库值得你了解一下

我们可以看到,上面例子输出Hello WorldHello被设置红色斜体,World默认。...这个例子,我们采用了Panel(面板),面板轮廓红色,内容文案加粗黄色。 以上只是简单介绍两个小例子,接下来我们来看看Rich是如何rich各种精美的输出吧! 2....可以看到,输出Hello是酒红色,颜色通过style参数设置,这里颜色是英文单词,同时也可以是16进制颜色码、RGB或者颜色color(n)表示等等。...3.8. markdown格式输出 Rich 可以呈现markdown,并可相当不错将其格式转移到终端。...为了渲染 markdown,导入Markdown类,使用包含 markdown 代码字符串来构造它,然后将其打印到控制台。

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71-R分享01-Rmd新手入门指南

我们可以将Rmd 理解,可以在md 文档运行R 代码,并能将R 代码运行结果最终输入到输出报告文件。 输出格式可以是HTML、docx、pdf、beamer等。...Rmd 基本结构 一个Rmd 文件包含三个部分: 分别是: yaml 格式开头部分 一般md 格式正文部分 R 代码部分 我第一个Rmd 选择Rmd 创建: 选择默认即可,这里选择输出...详说三大结构 3.1 开头部分 我们可以将Rmd 开头部分理解其元数据。可以用来规定文章标题、作者、日期、输出格式、输出设置等属性。...例如: s <- 0 for(x in 1:5) {s <- s + x^x; print(s)} 运行结果: collapse 选项 通常代码块代码,会根据其运行输出,拆分成多个文本块,如果我们不希望输出...4.2 其他格式文件转换 从HTML格式可以转换成PDF格式 打开浏览器进入选定网页后,可以选择菜单“打印”, 选打印机“另存为PDF”, 然后选“更多设置”, 将其“缩放”改为自定义, 比例改为

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GPT学术优化 (GPT Academic):支持一键润色、一键中英互译、一键代码解释、chat分析报告生成、PDF论文全文翻译功能、互联网信息聚合+GPT等等

PDF 文件,并提取摘要和翻译 crazy_functions\代码重写全英文_多线程.py 将Python源代码文件中文内容转化为英文 crazy_functions\图片生成.py 根据激励文本使用...程序会先根据传入txt参数搜索需要处理文件,逐个解析其中内容,将内容拆分为指定长度文章片段,然后使用另一个程序文件request_gpt_model_in_new_thread_with_ui_alive...库来提取PDF文档文本内容,对每个PDF文件分别进行处理生成中英文摘要。...函数生成注释结果使用Markdown表格输出写入历史记录文件。...文件名 功能简述 代码重写全英文_多线程.py 将Python源代码文件中文内容转化为英文 图片生成.py 根据激励文本使用GPT模型生成相应图像 对话历史存档.py 将每次对话记录写入Markdown

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R沟通|Rmarkdown教程(2)

R配套软件包tinytex可以帮助你在将LaTeX或R Markdown文档编译为PDF时自动安装缺少LaTeX软件包,确保将LaTeX文档编译正确次数以解决所有交叉引用。...新建流程 在弹出选项框里,可以申明rmarkdownTitle、Author以及默认输出文件格式,一般可以选择HTML、PDF、Word格式,具体见下图。 ?...选项框 在新建markdown文件里,主要包含三块内容:1.YAML、2.markdown文本、3.代码块。 ?...2)markdown文本 markdown文本是rmarkdown里主要内容(上图3位置),由编辑人员按照markdown语法自行编写文本内容, 3)代码块 rmarkdown一个主要功能是可以执行文件内代码块...演示Rstudio版本4.0.3 参考资料 [1] R: https://www.r-project.org [2] RStudio IDE: https://www.rstudio.com [

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十大至简规则,用Jupyter Notebook写代码应该这样来

论文链接:https://arxiv.org/pdf/1810.08055.pdf 下面,我们就以展示可复现性研究成果目标,看看 Jupyter 要怎样写才比较合理。...规则 2:记录过程,而不仅仅是结果 计算型 notebook 交互特性使得尝试和对比不同方法或参数更加快速和容易,以至于我们在执行这些交互式调研时往往无法将其记录下来。...那么,尝试让 notebook 每个单元格执行一个有意义分析步骤,并且该步骤可以根据单元格代码或周围 markdown 描述很容易地理解。...如果你要在其他项目或 notebook 重用代码,请考虑将其转换为模块、包或库,遵循良好软件开发实践(如单元测试)。 模块化不仅节省空间,支持维护,调试方便,还使增加交互性变得更加简单。...除了允许重用之外,你还要考虑如何利用 notebook 独特结构来支持阅读和探索。至少,将所有 notebook 静态 HTML/PDF 版本存储在出版物附带代码库最终版本

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十大至简规则,用Jupyter Notebook写代码应该这样来

论文链接:https://arxiv.org/pdf/1810.08055.pdf 下面,我们就以展示可复现性研究成果目标,看看 Jupyter 要怎样写才比较合理。...规则 2:记录过程,而不仅仅是结果 计算型 notebook 交互特性使得尝试和对比不同方法或参数更加快速和容易,以至于我们在执行这些交互式调研时往往无法将其记录下来。...那么,尝试让 notebook 每个单元格执行一个有意义分析步骤,并且该步骤可以根据单元格代码或周围 markdown 描述很容易地理解。...如果你要在其他项目或 notebook 重用代码,请考虑将其转换为模块、包或库,遵循良好软件开发实践(如单元测试)。 模块化不仅节省空间,支持维护,调试方便,还使增加交互性变得更加简单。...除了允许重用之外,你还要考虑如何利用 notebook 独特结构来支持阅读和探索。至少,将所有 notebook 静态 HTML/PDF 版本存储在出版物附带代码库最终版本

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ChatPaper全流程加速科研:论文阅读+润色+优缺点分析与改进建议+审稿回复

主函数 main() 演示了如何使用 Paper 类处理 PDF 文件,根据 PDF 文件路径初始化 Paper 对象,调用 parse_pdf() 函数解析 PDF 文件获取相应信息。...,根据查询信息和关键词得到论文列表,再根据列表论文信息获取论文 pdf 文件保存。...生成对应回复文本,并将回复输出到指定格式文件。...使用了正则表达式对文本进行匹配处理,提取关键信息后进行逻辑处理和字符串拼接,形成回复文本。 实现输出格式txt、markdown等格式回复文件。...其中,程序分为若干个子功能,包括:将PDF第一张图另存为图片,获取PDF文件每个页面的文本信息并将其按章节组织成字典返回,获取PDF文件标题,获取PDF文件章节。

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Linux命令行艺术

例如,假设 var=foo.pdf,那么 echo ${var%.pdf}.txt 将输出 foo.txt。 使用括号扩展({…})可以减少不必要重复输入相似文本以及文本组合。...大多数 Linux 安装过程会将 LANG 或其他有关变量设置符合本地设置。意识到当你改变语言环境时,排序结果可能会改变。明白国际化可能会时 sort 或其他命令运行效率下降许多倍。...若要了解内存状态,运行理解 free 和 vmstat 输出。尤其注意“cached”,它指的是 Linux 内核用来作为文件缓存内存大小,因此它与空闲内存无关。...-type f -ls 假设你有一个类似于 web 服务器日志文件文本文件,并且一个确定只会出现在某些行上,假设一个 acct_id参数在URI。...pr:将文本格式化成页/形式 fold:包裹文本几行 column:将文本格式化成多或表格 expand 和 unexpand:制表符与空格之间转换 nl:添加行号 seq:打印数字 bc:计算器

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Python 开发者需要知道完美终端工具

Python脚本程序,你只需导入 rich print 方法,该方法和其他 Python 自带功能参数类似。...4.自定义 Console 控制台输出 想要对 Rich 终端内容进行更多自定义设置,你需要导入构造一个控制台对象: from rich.console import Console console...,请注意,与内置“打印”功能不同,Rich 会将文字自动换行以适合终端宽度。 有几种方法可以为输出添加自定义颜色和样式。你可以通过添加 style 关键字参数整个输出设置样式。...实际上,由 Rich 渲染任何内容都可以添加到标题/行(甚至其他表格)。 Table 类很聪明,可以调整大小以适合终端可用宽度,并能根据需要做文本环绕处理。...你可以将 Rich 设置默认回溯处理程序,这样所有异常都将由 Rich 你呈现。 下面是在 OSX(与 Linux 类似)上外观:

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