如何根据R中的lat，lon，time来操作数据帧？_如何在R中根据数据帧的行长来子集数据帧列表_如何让R识别数据帧中的"time“列？ - 腾讯云开发者社区

前面给大家介绍过☞R中的替换函数gsub，还给大家举了一个临床样本分类的具体例子。今天我们接着来分享一下如何根据已有的映射关系来对数据框中的数据进行替换。...例如将数据框中的转录本ID转换成基因名字。我们直接结合这个具体的例子来进行分享。...接下来我们要做的就是将第四列中的注释信息，从转录本ID替换成相应的基因名字。我们给大家分享三种不同的方法。..._.*","\\1",bed$V4) #获取转录本号对应的基因名字 symbol=mapping[NM,1] 方法一、使用最原始的gsub函数 #先将bed文件中的内容存放在result1中 result1...参考资料： ☞R中的替换函数gsub ☞正则表达式 ☞使用R获取DNA的反向互补序列

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用Python绘制《天气学原理和方法》插图

用Python绘制《天气学原理和方法》插图作者：Vector 最近天气学原理需要绘制课本插图来做翻转课堂，因此整理了课本第四章几个典型图片的画法和代码，共需要的人使用。...DJF，做纬向平均 vwindM2 = vwindM.loc[dict(season="DJF")].mean("lon") # 选择合适位置的数据 DrawData = vwindM2...这里其实有一个问题，格陵兰岛根据NOAA的卫星资料在夏季是低压，可能资料有一点问题。...), coord=lon) cycle_LON, cycle_LAT = np.meshgrid(cycle_lon, lat) # 开始画图 fig = plt.figure(...add_cyclic_point(np.array(PressT), coord=lon) cycle_LON, cycle_LAT = np.meshgrid(cycle_lon, lat)

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用Python复现一篇Nature的研究: 1.数据下载及预处理

我们根据上述规律，使用wget就可以很简单的下载数据了。接下来是处理CMIP数据,为了统一语言，我使用python中的xarray来处理、merge文件。缺点是很慢，优点是易学。...下面的脚本中，merge nc文件的主要函数是concat,需要输入一系列网格相同的Dataarray，然后在time维度上进行统一。非常建议统一时间，以免后期出幺蛾子。...插值使用 TosArray.interp(lat=lat, lon=lon)，输入指定的网格和维度即可，默认为线性插值，我们这里插值成5*5的网格。...(0, 360, 5) TosInterped = TosArray.interp(lat=lat, lon=lon) ZosInterped = ZosArray.interp(lat=lat, lon..., 5) lon = np.arange(0, 360, 5) SSH = SSH.interp(lat=lat, lon=lon) SSHA = SSH.groupby("time.month")

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不到30行代码实现一个酷炫H5全景

image.png 如图所示，经度：lon，取值范围：[0,360]，纬度：lat，取值范围：[-90,90]; 2.2.2 经纬度转换三维坐标球面的点{lon,lat}，其中R为球体的半径，求球面的点的在...image.png 解： X = R * cos（lat）* sin( lon ) Y = R * sin( lat ) Z = R * cos( lat )*cos( lon ) 注：ThreeJS中默认的坐标系是右手坐标系...// X轴方向 distanceY = clientY1 - clientY2 // Y轴方向 // 其中R为球体半径，根据弧长公式： lon = distanX / R lat = distanY...，curY）相减上一次位置的值，乘以factor，计算出（lon，lat），【触摸跟随】 touchend：记录endTime,计算本次滑动过程中的平均速度，然后，每帧减去减速度d，直至速度为0或者touchstart...的值来缩放全景图片那么如何计算fov呢？

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手把手带你科研入门系列 | PyAOS基础教程十：大数据文件

_gr_20000101-20141231.nc'] 然后，用xarray读取数据，但是这里读取数据的方法，与前面的课程有非常明显的不同（前面用的是xarray.open_dataset来一次性读取nc...文件到内存中），这里用到的是xarray.open_mfdataset函数分批读取数据，我们具体来看看它是如何读取数据的。...* lat (lat) float64 -89.62 -89.12 -88.62 -88.13 ... 88.62 89.12 89.62 * lon (lon...按照chunk参数指定的500MB的大小，dask并非将7个nc文件的数据一次性读取到系统内存中，而是遵从一块一块数据读取的原则。...time: 2min 33s 从这个结果中，可以看到，虽然是4个cpu核参加数据处理，整个cell的运行时间是2min33s，但跟前面单核处理时间3min44s，并没有减少75%的运行时间。

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使用Python处理NetCDF格式文件

可移植性：或称跨平台性，即在一种操作系统上创建的 netCDF 文件通常可被其他操作系统上的软件读取。可扩展性：即可有效地读取一个大 netCDF 文件的一个小子集，而无需读取整个文件。...本文不对NetCDF数据格式进行过多的介绍，主要讲一下如何处理NetCDF格式文件，并且如何对最终的数据进行可视化分析。...) # 默认为读文件，此处 'r' 可省略 # 读取相关变量 lat = data.variables['lat'][:].data lon = data.variables['lon'][:].data...# 添加数据循环和不添加数据循环的效果见后文两张图 cycle_air, cycle_lon = add_cyclic_point(air, coord=lon) cycle_LON, cycle_LAT...Notebook中也给出了使用 scipy 读取 netcdf 文件的示例。 ? 图1 无数据循环 ?

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给Python算法插上性能的翅膀——pybind11落地实践

Pybind11 通过 C++ 编译时的自省来推断类型信息，来最大程度地减少传统拓展 Python 模块时繁杂的样板代码，且实现了常见数据类型，如 STL 数据结构、智能指针、类、函数重载、实例方法等到..., lat1, lon2, lat2, test_cnt): res = geo_distance(lon1, lat1, lon2, lat2, test_cnt) print(res...虽然实际场景中也可以用Python多进程的方式来利用多核，但是在模型越来越大动辄数十G的趋势下，内存占用过大不说，进程间频繁切换的context switching overhead，以及语言本身的性能差异...++ GPU高性能版抽帧so为例，除了提供抽帧接口给到Python端调用，还需要回调给Python从而通知抽帧进度以及帧数据。...因此，pybind11也支持了数据地址传递的方式，避免了大数据块在内存中的拷贝操作，性能上提升很大。

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用Python复现一篇Nature的研究: 1.数据下载及预处理

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智能网联汽车开发篇：行驶轨迹跟踪

3.云端服务器将GPS信息存储在数据库中。 4.通过访问云端服务器的HTML网页，使用百度地图，将目标小车的轨迹描画出来。...="insert into map_route(session,time,lat,lon) values('$session','$time','$lat','$lon')"; echo...location文件夹内的文件，见baidu网盘，如下: 链接: https://pan.baidu.com/s/1zamZax-S36paXvl04_tc9g 提取码: 3biu 主要功能：读取数据库中的...Y8bhFnBJ7sePopR1','lat' : lat,'lon' : lon} try: r = requests.post("http:/...http://VPS的IP地址/location/index.html 手机端的效果图，如下所示： PC端的效果图，如下所示： 0×06 结束功能有许多可以优化的地方，比如可以追加轨迹播放、根据时间检索轨迹等功能

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MATLAB读取nc文件_如何转换mp3文件格式

因为课题处理30年的降雨和蒸发的遥感资料（.NC格式），而想要在Arcgis中处理要求的是raster格式的，所以需要批量转化为tif文件，所以在此分享自己改编之后的代码，可以简洁明了的实现这个过程：...=ncread(ncFilePath,'lat'); %读取维度信息 time=ncread(ncFilePath,'time'); %读取时间序列 pre...，所以他人可以不管 %% 展示数据内部结构等信息 % pcolor(lat,lon,sum_pre); % shading flat;...%移除网格线，否则图上一片黑什么都没有 % [x,y]=meshgrid(lon,lat); %根据经纬度信息产生格网，3600列（经度），1800列（纬度） %...二者代码的区别及要点如下： 1.在读入文件时可以预先用NASA提供的Panoply读一下NC文件看看各个变量的名字、大小写以及维度，比如第二个代码中变成了二维的’LON’、‘LAT’和’monthly_ET

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xarray | 数据结构(3)

坐标坐标是存储在 DataArray 和 Dataset 的 coords 属性中的辅助变量。...用于基于标签的索引和对齐操作，就像 pandas 中的 DataFrame 和 Series 的索引。事实上，这些维度坐标内部使用的是 pandas.Index 存储其值。...注： xarray 中的术语和 CF 中的术语不同。CF中的维度坐标称作坐标变量，而非维度坐标称作辅助坐标变量 [注1]。CF是指 Climate and Forecast [注2]。...当对 lon 或 lat 进行 index 操作时会报错。...因为在 Dataset 和 DataArray 对象中每个多索引层都可以通过 ‘virtual’ 坐标获取，它的名称不能与相同对象的其它层，坐标和数据变量的名称冲突。

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Python结合Matlab气候数据工具箱CDT

s_tid=srchtitle 1.3 https://github.com/chadagreene/CDT 二、实例研究： 2.1 Python脚本下载ERA5数据集 ERA Interim官网数据下载链接...基于CDT工具箱&m_map工具箱 clc;clear;close all % 在命令行窗口中以文本形式显示 NetCDF 数据源 source 中的所有组、维度、变量定义，以及所有属性。...(data,'latitude'); lon = ncread(data,'longitude'); T = ncread(data,'t2m'); t = ncdateread(data,'time'...(lon,lat,Tm); axis xy figure(4); [Lon,Lat] = meshgrid(lon,lat); pcolor(double(Lon),double(Lat),Tm) shading...m_pcolor(Lon,Lat,T-273.15) % temperature in deg C hold on; m_contour(Lon,Lat,sp,'r') % pressure contours

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网格气象场插值-NCL版

通常所说的regridding/remaping/interpolation都是将不同网格的数据映射到新的网格。...rectilinear网格数据是最常见的，比如WRF模式中的lat-lon投影对应的则是此网格类型； ?...ESMF，主要包括如下步骤：生成原网格数据生成目标网格数据创建包含上述两种网格数据的nc文件创建包含映射权重的nc文件应用权重到原网格数据，映射生成目标网格数据复制原文件元属性到映射后到数据.../atan(1.) ;-- radians to degrees f = addfile("triangular_grid_ICON.nc","r") var = f->S(time|0,depth|0...new netCDF file end 当然还可以进行其他网格类型间的映射操作，只需要根据上述转换脚本进行适当的修改即可，具体操作参考操作步骤。

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飓风“桑迪”路径图的制作

我们今天利用之前介绍过的Python的matplotlib和basemap包，来制作桑迪的路径图，重构桑迪的整个发育过程。 ? 、 ? ?...下载：数据文件数据文件中的wind(最大风速)单位为knot，pressure(气压)单位为mb，时间为世界时。...# Adjust time zone according to NYC lt = dt - timedelta(hours=5) lon = rec['lon'][idx]...x,y = m(lon, lat) # Plot track for i in range(idx): a0,b0 = m(rec['lon'][i],...rec['lat'][i]) a1,b1 = m(rec['lon'][i+1], rec['lat'][i+1]) m.plot((a0,a1),(b0,b1), linewidth

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科研实战 | 基于CMIP6温度空间趋势图绘制并叠加显著性检验之方法一

因为从各个不同机构下载的数据，从文件名中，一般我们就能看出其nc文件内容，这是为了良好的可读性，在科研中，当文件非常多的时候，你会发现这么命名文件好处是相当明显的）：remapbiled表示该文件经过了...这里稍微解释一下time、lon、lat三个参数（为什么要解释呢？...因为本人踩过坑，这三个参数的含义不用解释了，我想大家应该都能明白）：首先是time，这个参数呢，不同的文件，其格式可能不一样，但是有一点一定要搞清楚，这是字符串格式，还是整数格式的时间；lon和lat的位置也一定要弄清楚...，经过cdo处理以后，这里打印出来的顺序跟nc文件中存储的顺序可能不一致，实际的nc可能是lat和lon的顺序，另外还要注意lat和lon的排序，有些可能是从小到大，有些则可能从大到小排列。...7、如何去除中间的白线文章最后，介绍一下如何去除中间的白线。第一行和第二行是解决趋势图上的白条，第三行和第四行是去掉打点图中的白条。

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风云卫星AWX格式读取与可视化

版本：Python3.7 数据：风云卫星AWX格式数据来自：github 前言近期需要读取awx格式数据，气象家园有人提到axw有对应的库，故测试一下awx的示例脚本并作些简单美化读取文件、访问数据...' ds = Awx(pathfile) # 打印文件头信息 print(ds) # 获取xarray.DataArray格式的观测数据 print(ds.values) # 裁剪到指定的经纬度范围...print(ds.sel(lat=slice(20, 40), lon=slice(100, 130))) # 保存数据为netCDF格式文件 ds.values.to_netcdf('ANI_VIS_R01...=6206, lr_lat=659, ul_lon=7732, lr_lon=14870, clat=3500, clon=10000, std_lat1_or_lon=3000, std_lat2=6000...(dar.lon, dar.lat, dar, cmap='Greys_r') plt.show() AwxHead(filename_Sat96='ESLF170A.AWX', int_order=0

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Python实践 | 亿级经纬度距离计算代码实现

ceil 4import math 5import time 经纬度计算自定义函数 1def geodistance(lng1,lat1,lng2,lat2): 2 lng1, lat1, lng2...pandas分别导入源表和目标表，两个表关联得到原点与目标点的所有配对 1file_name = r'D:\python\geo\stable.csv' 2df1=pd.read_csv(file_name...（经纬度差值大于某个值，距离大于某个值，参见参数表 1n=m[abs(m.lon-m.lon2)<diff_lon][abs(m.lat-m.lat2)<diff_lat] 得到下图表格： ?...=1) 根据经纬度差值判断距离是一个大致的范围，我们选取纬度值54.0获取了最大的经度差值，随着纬度减小，此时计算的距离会大于该阈值，所以要对初次计算结果进行过滤，得出满足阈值的条目： 1distance...不是的话需要先写入标题行 7 if filecount > 1: 8 f.write(csv_file[0]) 9 # 批量写入i至i+分片大小的多行数据

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Python可视化 | xarray绘图样式配置

这个文件包含如何创建图形元素默认风格的信息。所修改的参数值仅在当前 Python 会话中有效。若重启 Python 且不运行参数修改代码，则仍为参数仍为默认值。...ggplot 本样式集来自于 R 语言的同名绘图系统 ggplot2. 该样式集它在呈现数据方面吸取了很多最新的解决方案，并注重数据可视化的简单性。...Windows 系统一般情况下无需以下操作。...\\uwnd.2020.nc", drop_variables = ["time_bnds"]).sel(level = 850, lon = slice(0, 160), lat=slice(85,...\\vwnd.2020.nc", drop_variables = ["time_bnds"]).sel(level = 850, lon = slice(0, 160), lat=slice(85,

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如何快速熟悉一个陌生的nc格式数据

前言首先，要快速熟悉一个陌生的nc格式数据，你可以使用Python中的xarray库。xarray是一个用于处理多维数组的强大工具，特别适用于处理带有标签的多维数据。...它提供了一种直观的方式来组织、分析和可视化数据，尤其适用于气候科学和地球科学领域的数据处理。 xarray库的核心数据结构是DataArray和Dataset。...DataArray类似于NumPy数组，但它包含坐标和维度标签，使得数据更易于理解和操作。...接下来，我将为你提供一个简单的xarray库介绍，以帮助你更好地理解如何使用它来处理陌生的nc格式数据。...You are running version 2.14.1 可以看到有pre和stn两个变量，数据单位说是mm/month，那么pre就是月降水再看维度，(time, lat, lon) 下面对数据进行切片

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xarray | 数据结构(2)

OrderedDict 数据或坐标中变量的区别是语义上的，你可以忽略这些差异。...下面是如何为天气预测构造数据集的例子： ? 上例中， temperature 和 precipitation 为数据变量(data variables)。...也可以标准的字典方法（比如： values, items, __delitem__, get, update）来改变Dataset中的变量。...使用 copy 方法可以复制 Dataset，但是执行的是浅复制操作。就是说数组仍然存储在相同的 numpy.ndarray 对象中。...这和 linux 中的管道操作非常类似。

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【R语言】根据映射关系来替换数据框中的内容

用Python绘制《天气学原理和方法》插图

用Python复现一篇Nature的研究: 1.数据下载及预处理

不到30行代码实现一个酷炫H5全景

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给Python算法插上性能的翅膀——pybind11落地实践

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xarray | 数据结构(3)

Python结合Matlab气候数据工具箱CDT

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飓风“桑迪”路径图的制作

科研实战 | 基于CMIP6温度空间趋势图绘制并叠加显著性检验之方法一

风云卫星AWX格式读取与可视化

Python实践 | 亿级经纬度距离计算代码实现

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如何快速熟悉一个陌生的nc格式数据

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