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ggplot2--R语言宏基因组学统计分析(第四章)笔记

4.3.3.3 使用坐标系统来调节和限制XY 坐标系用途是在计算机屏幕上调整从坐标到二维平面的映射。在ggplot2中可用不同坐标系中,笛卡尔坐标系和极坐标系是最常用坐标系。...我们可以使用这些函数及其相应参数来调整要在绘图中显示属性。这里我们说明如何使用coord_cartesian()参数xlim和ylim分别调整XY极限。...在下面的代码中,我们创建一个新plot对象p5,并使用coord_cartesian()更改XY限制放大到感兴趣区域。...公式可以是x~y,这表示将绘图分割成变量x每个值一行和变量y每个值一列。实现facet_grid(x~y)函数将生成一个矩阵,其中行和列由xy可能组合组成。公式可以是x~....刻面变量可以参数形式列出,形式为Facet_wrap(x~y+z)。~符号左边变量形成行,而右边变量形成列。Facet_wrap(x~.)语法。

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关于Python可视化Dash工具

连续折线之间区域被填充; 14、bar:条形图 在条形图中,每行data_frame表示为矩形标记; 15、timeline:时间图 在时间图中,每一行数据框都表示为日期类型x矩形标记...表示为类别中抖动标记; 20、histogram:直方图 在直方图中,每一行data_frame被组合在一起成为矩形标记,可视化该值聚合函数histfunc(例如,计数或总和)1D分布...y(或者x,如果orientation是'h'时); 21、pie:饼图 在饼图中,数据帧每一行表示为饼图扇区。...26、scatter_matrix:矩阵散点图散点图矩阵(或SPLOM)中,每行data_frame由多个符号标记表示,在2D散点图网格每个单元格中有一个,其将每对dimensions...; 28、parallel_categories:并行类别图 在并行类别(或平行集)图中,每行data_frame与其他共享相同值组合,dimensions然后通过一组平行绘制为折线标记,每个平行对应一个

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我用PythonSeaborn库,绘制了15个超好看图表!

花瓣长度与物种间关系条形图(基于鸢尾数据集)。 02. 散点图 散点图是由几个数据点组成图。 使用x表示花瓣长度,y表示数据集萼片长度,制作散点图。...这里使用x表示物种,y表示花瓣长度。...在上图中,每个数据点表示为一个点,并且这些点排列使得它们在分类上不会相互重叠。 在这里,所有萼片宽度数据点不同方式代表每个物种一个点。 12....特征图 特征图可视化了数据集中变量之间两两关系。 创建了一个坐标网格,将所有数值数据点将在彼此之间创建一个图,在x具有单列,y具有单行。...联合分布图 联合分布图将两个不同类型图表组合在一个表中,展示两个变量之间关系(二元关系)。

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数据视化三大绘图系统概述:base、lattice和ggplot2

: 分类箱图、条形图 1 Lattice绘图系统 特点:一次成图;适用于关系变量间交互:在变量z不同水平,变量y如何随变量x变化。...xyplot() y ~ x | A 散点图矩阵 splom() dataframe 带状图 stripplot() A ~ xx ~ A 高级绘图中表达式通常格式:y ~ x | A *...主要变量即为图形两个坐标,其中y在纵轴上,x在横轴上。变形:单变量绘图,用 ~ x 即可;三维绘图,用z ~ x*y;多变量绘图,使用数据框代替y ~ x即可。...1.条件变量用法~ x | A表示因子A各个水平下数值型变量x分布情况;y ~ x | A * B表示因子A和B各个水平组合下数值型变量xy之间关系。...,可以添加第三个元素,指定页数 Main/sub 字符型向量,设定主标题和副标题 Panel 函数,设定每个面板要生成图形 Scales 列表,添加坐标标注信息 Strip 函数,设定面板条带区域

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【R语言】高维数据可视化| ggplot2中会“分身术”facet_wrap()与facet_grid()姐妹花

facet_grid()形成由行和列面化变量定义面板矩阵。当有两个离散变量,并且这些变量所有组合存在于数据中时,它是最有用。如果只有一个具有多个级别的变量,请尝试facet_wrap()。...这通常比facet_grid()更好地利用了屏幕空间,而且显示基本上是矩形。 分面图是根据数据类别按照行或者列,或者矩阵分面的方式将散点图,柱形图等基础图标展示四到五维数据结构。...facet_grid()按照x调节取值范围 06 facet_grid()调节y取值范围 ?...facet_grid()按照y调节取值范围 07 facet_grid()调节XY取值范围 m+facet_grid(vars(drv), vars(cyl),scales="free ") ?...facet_grid()按照xy调节取值范围 08 facet_wrap()矩阵排列 m+facet_wrap(~cyl) ?

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数据可视化Seaborn入门介绍

它将变量任意两两组合分布绘制成一个子图,对角线用直方图、而其余子图用相应变量分别作为xy绘制散点图。显然,绘制结果中上三角和下三角部分子图是镜像。...),但实际上接口调用方式和传参模式都是一致,其核心参数主要包括以下4个: data,pandas.dataframe对象,后面的xy和hue均为源于data中某一列值 x,绘图x变量...中折线图,会将同一x多个y统计量(默认为均值)作为折线图中位置,并辅以阴影表达其置信区间。...这里seaborn中小费数据集进行绘制,得到如下回归图表: 5. 矩阵矩阵图主要用于表达一组数值型数据大小关系,在探索数据相关性时也较为实用。...绘图接口有stripplot和swarmplot两种,常用参数是一致,主要包括: x散点图x数据,一般为分类型数据 y散点图y数据,一般为数值型数据 hue,区分维度,相当于增加了第三个参数

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可视化技能之Matplotlib(上)|可视化系列01

Axes包含了一套坐标(axis),确定了x/y坐标之后,数值再确定对应坐标,也就唯一确定了所在位置(这是二维情况下,更高维度就会对应着更多axis),散点图是去确定点在域下位置,柱状图是确定每个柱柱所在位置...通过ax.scatter(x,y)绘制x为横坐标,y为纵坐标的散点图,scatter重要参数如下: •x,y:对应着xy数据,散点画在坐标[xi,yi]处。...plot()常用参数如下: •x,y: xy数据,当plot()只有一个输入列表或数组时,参数被当做y,也就是value,x索引自动生成,也就是ax.plot(y)相当于ax.plot(...(ipath); ax.axis('off'); ax.imshow(img); 给散点图加标签并加分隔线来绘制矩阵图,实践一下以上方法: import matplotlib.lines...总结下本文从Matplotlib可视化基础框架一步步画散点、折线、柱状、箱线等图,通过理解参数拓展画了瀑布图、矩阵图、棒棒糖图等,并且微调坐标文本、标题等图形元素,让可视化更完备,通过双y绘制帕累托图等组合

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python数据科学系列:seaborn入门详细教程

它将变量任意两两组合分布绘制成一个子图,对角线用直方图、而其余子图用相应变量分别作为xy绘制散点图。显然,绘制结果中上三角和下三角部分子图是镜像。 ?...),但实际上接口调用方式和传参模式都是一致,其核心参数主要包括以下4个: data,pandas.dataframe对象,后面的xy和hue均为源于data中某一列值 x,绘图x变量 y,绘图...lineplot lineplot不同于matplotlib中折线图,会将同一x多个y统计量(默认为均值)作为折线图中位置,并辅以阴影表达其置信区间。...这里seaborn中小费数据集进行绘制,得到如下回归图表: ? 5. 矩阵矩阵图主要用于表达一组数值型数据大小关系,在探索数据相关性时也较为实用。...绘图接口有stripplot和swarmplot两种,常用参数是一致,主要包括: x散点图x数据,一般为分类型数据 y散点图y数据,一般为数值型数据 hue,区分维度,相当于增加了第三个参数

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不如用最经典工具画最酷炫

第一反应可能是柱状图和折线图组合,柱子表示数量,次坐标折线表示占比,例如下图。 ? 然后我们可以通过操纵坐标尺度,添加数据标签、折线节点,隐藏标签和网格线,使得图形更加干练直观。 ?...我们可以利用散点图,将散点横坐标与数量一致,纵坐标与类别标签一致,因此添加一个辅助列作为散点图 y 值。 ? 在图形上右键-选择数据,添加系列“占比”,系列值选择辅助列。 ?...点击确定后继续在图形上右键-更改图表类型,将“占比”换为散点图,并绘制在次坐标。 ?...确定后再次右键-选择数据,这次我们选择编辑系列“占比”,发现变成了 XY 轴系列值两项,X 选择原始数量列。 ?...让我们看看这个例子,变形和排版能让你 EXCEL 图表变得与众不同。首先选择一行数据插入柱状图。 ? 去除多余部件,仅保留纵坐标标签,并添加数据标签。 ?

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《数据可视化基础》第11章:两个或多个连续性变量相关可视化(一)

例如,我们可能有不同动物量化测量数据集,如动物身高、体重、长度和每日能量需求。为了绘制仅仅两个这样变量关系,例如身高和体重,我们通常会使用散点图。...在下面的图中,头长度在y上表示,身体质量在x上表示,每只鸟都用一个点表示。这就是所谓散点图”,通过上图我们可以发现一种趋势,即身体质量越高,头部越长。 ?...因此我们想要在上面数据可视化基础上,再观察头骨大小是否和头部长度有关系。在?可视化当中,我们用X代表身体质量;用Y代表了头部长度;利用颜色来映射性别。...因此作为气泡图一个替代方法,我们可以对所有变量绘制散点图矩阵。在这个矩阵上。 在下图下图散点图矩阵上,我们可以看到三个变量(身体长度,头骨大小以及身体质量)互相为XY变量下绘制出散点图。...通过这个矩阵我们可以看出不同变量散点图是什么样子。 ?

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8个plotly绘图技巧

公众号:尤而小屋作者:Peter编辑:Peter大家好,我是Peter~本文介绍可视化神器plotly绘图8个常见技巧点:如何添加标题及控制标题颜色和大小如何自定义xy名称饼图中如何同时百分比和数值如何控制柱状图宽度如何添加注释如何绘制多子图如何添加图例以及控制其大小...多种图表类型: Plotly 支持多种常见图表类型,适用于不同类型数据。你可以轻松创建折线图、散点图、柱状图、热力图、桑基图、3D 图等。...美观性: Plotly 图表具有出色视觉效果和美观性,支持自定义样式和主题,满足不同可视化需求。...'color': 'blue' # 标题颜色 } })# 显示图表fig.show()图片plotly绘图如何自定义xy名称In 3:import...# 添加散点图fig.add_trace(go.Scatter(x=x_data, y=y_data, mode="markers"))# 自定义 x y 名称fig.update_xaxes

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关于Python可视化Dash工具—plotly中级图表

# 如果设置,则在主图上方绘制一个水平子图,可视化x分布。 # marginal_y–地毯、盒子、小提琴或柱状图中一种。 # 如果设置,则在主图右侧绘制一个垂直子图,显示y分布。...# 鸢尾花类型=1sepal_width,sepal_length散点图x为密度图,y为直方图 fig = px.scatter(df, x="sepal_width", y="sepal_length...散点图x为箱线图,y为小提琴图 fig = px.scatter(df, x="sepal_width", y="sepal_length", marginal_x...="box", marginal_y="violin") fig.show() df = px.data.iris() # 所有花卉,x为箱线图,y为小提琴图,颜色鸢尾花类型分类 fig =..."box", marginal_y="violin") fig.show() # 密度热力图,鸢尾花类型=1sepal_width,sepal_length散点图x为密度图,y为直方图 fig

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think-cell chart系列11——散点图

散点图也属于日常应用高频图表,那么在think-cell chart中该如何制作呢…… 下面开始给大家演示,首先看一下下面这一散点图案例: ? 看起来很复杂样子,其实一步一步做出来,也很简单。...下面我们还是按照老步骤,先在ppt中think-cell chart菜单中插入散点图,确定散点图数据组织结构: ?...如上图所示,第一列是数据点标签,第二列第三列分别为XY数据,第四列(size)数据是散点面积大小(没错是为做气泡图准备,下节会讲到),最后一列是分列标签。...有人会好奇我案例中那个底部带颜色背景是怎么做出来。 ? ? 没错是用ppt形状插入功能插入法,插入三个大小一样矩形,填充不同颜色衬底放就可以了(就是这么简单)。...如果你发现该散点图有明显区间规律,可以通过手动添加线条,将其区隔开,形成易于识别的矩阵图。这样可以更好识别出图表所展示数据规律。 ?

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14个Seaborn数据可视化图

这里x表示年龄,y表示频率。例如,对于Bins= 10分布图,大约有50个人年龄在0到10岁之间 b.联合图 它是两个变量组合。 这是一个二元分析例子。...a.条形图 这是一个二元分析例子。 在x上有一个分类变量,在y上有一个连续变量。...图15:泰坦尼克号数据关联矩阵聚类图 x-label和y-label是一样,但是它们协调方式不同。这是因为它们是根据它们相似性分组。 顶部和左侧类似流程图结构描述了它们相似程度。...聚类图使用层次聚类来形成不同集群。 网格 网格图为我们提供了对可视化更多控制,并通过一行代码绘制各种各样图形。...之后,我们可以使用不同图和常见变量来进行特殊变化。 回归图 这是一个更高级统计图,它提供了散点图以及对数据线性拟合。

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70个精美图快速上手seaborn!

以下是Seaborn库一些主要特点: 美观默认样式:Seaborn通过提供现成样式和颜色主题,使得创建各种类型图形变得更加简单。它默认样式经过精心设计,使得图表具有更高可读性和美观度。...内置统计图形:Seaborn提供了一系列内置统计图形,例如柱状图、箱线图、散点图、折线图等。这些图形不仅易于使用,还具有各种选项和参数,可以帮助你更好地展示和理解数据。...多变量数据可视化:Seaborn提供了一些强大工具来可视化多变量数据。你可以使用Seaborn绘制矩阵图、热力图、聚类图等,揭示不同变量之间关系和模式。...=tips, x="day",y="tip",hue="sex") plt.show() 图片 dodge参数表示在执行hue分组时候,不同组别下数据是否放在一个主体中: In 52: sns.boxplot...如何理解seaborn.FacetGrid函数?

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手把手教线性回归分析(附R语言实例)

在这个公式中,斜率(slope)a表示每增加一个单位x,直接会上升高度;变量b表示X=0时y值,它称为截距,因为它指定了直线穿过y位置。 回归方程使用类似于斜截式形式对数据建立模型。...这时候你就是在用你模型去预测一个值,换句话说,你正在陈述这样事实:我在实验之中并没有用这个X值,并且我数据里也没有它,但是我想要知道这个X值是怎样投射到Y。...图4 散点图矩阵 与相关系数矩阵一样,每个行与列交叉点所在散点图表示其所在行与列两个变量相关关系。由于对角线上方和下方xy是交换,所以对角线上方图和下方图是互为转置。...每个散点图中呈椭圆形对象称为相关椭圆(correlation ellipse),它提供了一种变量之间是如何密切相关可视化信息。位于椭圆中心点表示x变量均值和y变量均值所确定点。...散点图中绘制曲线称为局部回归平滑(loess smooth),它表示xy变量之间一般关系。最好通过例子来理解。

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领券