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基于 R 语言的绘图技巧汇总

A 主要知识点 学会如何导入图形,并将其并排展示; 学会设置自定义主题,简化代码,统一主题,方便绘制其他图形使用; 学会使用 ggplot2 包内置参数添加文字已经其他其他修饰图标。...D 主要知识点 实现双 Y ; 学会修改坐标为对数尺度; 添加坐标的微小刻度线。...(sides = "b") 添加 x 的 ticks; 使用 scale_y_continuous(position = "right") 改变 Y 位置。...使用 geom_point() 绘制散点图, geom_ribbon()绘制丝带形状图; 使用 stat_function() 添加函数曲线; 使用 geom_errorbar() 和 geom_errorbarh...with R: https://github.com/marco-meer/scifig_plot_examples_R 推荐: 可以保存以下照片,b站扫该二维码,或者b站搜索【庄闪闪】观看Rmarkdown

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R语言建立和可视化混合效应模型mixed effect model|附代码数据

我们已经学习了如何处理混合效应模型。本文的重点是如何建立和_可视化_ 混合效应模型的结果。 设置 本文使用数据集,用于探索草食动物种群对珊瑚覆盖的影响。...plot(mod) 点击标题查阅往期内容 R语言 线性混合效应模型实战案例 左右滑动查看更多 01 02 03 04 效应大小的格式化图: 让我们更改标签和标题。...pred.labels =c("(Intercept)", "Urchins", "Fish", "Depth"), 用数据绘制模型估计 我们可以实际数据上绘制模型估计值!...注意:数据已标准化以便在模型中使用,因此我们绘制的是标准化数据值,而不是原始数据 步骤1:将效应大小估算值保存到data.frame # 使用函数。term=固定效应,mod=你的模型。...改变颜色配合估计点。 #5 添加具有模型估计置信区间的geom_ribbon #6 根据需要编辑标签!

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R语言建立和可视化混合效应模型mixed effect model

pred.labels =c("(Intercept)", "Urchins", "Fish", "Depth"), 用数据绘制模型估计 我们可以实际数据上绘制模型估计值!...注意:数据已标准化以便在模型中使用,因此我们绘制的是标准化数据值,而不是原始数据 步骤1:将效应大小估算值保存到data.frame # 使用函数。term=固定效应,mod=你的模型。...改变颜色配合估计点。 #5 添加具有模型估计置信区间的geom_ribbon #6 根据需要编辑标签!...), color="blue") + #4 geom_line(data=x, aes(x= chinde, y=fit), color="blue") + #5 geom_ribbon...(GLMM)和线性混合模型(LMM) R语言基于copula的贝叶斯分层混合模型的诊断准确性研究 R语言如何解决线性混合模型畸形拟合(Singular fit)的问题 基于R语言的lmer混合线性回归模型

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R语言建立和可视化混合效应模型mixed effect model|附代码数据

本文的重点是如何建立和_可视化_ 混合效应模型的结果设置本文使用数据集,用于探索草食动物种群对珊瑚覆盖的影响。...pred.labels =c("(Intercept)", "Urchins", "Fish", "Depth"),用数据绘制模型估计我们可以实际数据上绘制模型估计值!...注意:数据已标准化以便在模型中使用,因此我们绘制的是标准化数据值,而不是原始数据步骤1:将效应大小估算值保存到data.frame# 使用函数。term=固定效应,mod=你的模型。...改变颜色配合估计点。 #5 添加具有模型估计置信区间的geom_ribbon #6 根据需要编辑标签!...R语言如何解决线性混合模型畸形拟合(Singular fit)的问题基于R语言的lmer混合线性回归模型R语言用WinBUGS 软件对学术能力测验建立层次(分层)贝叶斯模型R语言分层线性模型案例R语言用

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了解绘制条形图和折线图的细节

接下来我们就连载其中一个佼佼者的系统性学习五本书的笔记: 下面是YT的分享 上一个笔记是:R基础知识及快速检阅你的数据 第三章 条形图 条形图通常用来展示不同分类下(x)某个数值型变量的取值(y...本章将以ggplot2为主进行学习啦~~ ---- 3.1 绘制基本条形图 Q:当你有一个包含两列的数据框,一列为x上的位置,一列为y上的对应高度,基于此如何绘制条形图?...代码添加geom_point()可以实现 ggplot(BOD,aes(x=Time,y=demand))+ geom_line()+ ylim(0,max(BOD$demand)) #这里也世界人口为例子进行画图...A:运行geom_ribbon(),然后分别映射一个变量到ymin与ymax即可 #climate数据的Anomaly10y表示了各年温度相对于1950-1980的平均水平偏差的10年移动平均 #变量...,我把它粗略的分成基于R语言的统计可视化,以及基于Linux的NGS数据处理: 《生信分析人员如何系统入门R(2019更新版)》 《生信分析人员如何系统入门Linux(2019更新版)》 把R的知识点路线图搞定

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R语言绘图之ggplot2

那么今天我们就为大家介绍一下目前R语言中流行的绘图包ggplot2。 1. ggplot2的安装:install.packages("ggplot2")。...彩虹图(连续的x值上表示y的范围,例如Tufte著名的拿破仑远征图) geom_rug 触须 geom_segment 线段 geom_smooth 平滑的条件均值 geom_step 阶梯图 geom_text...1) coord_flip 翻转笛卡儿坐标 coord_map 地图投影 coord_polar 极坐标投影 coord_trans 变换笛卡儿坐标 分面函数 描述 facet_grid 将分面放置二维网格...200,parse=T,label ="x[1]==x[2]") labs : labs(x= "这是 X ", y = "这是 Y ", title = "这是标题") ## 修改文字 scale...使用xlim()和ylim()来设置连续型坐标的最小值和最大值 coord_cartesian(xlim=c(0,100),ylim=c(0,100)) guides:调整所有的text。

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Matlab高阶绘图功能(文末送书,别错过)

子图和布局 % 子图布局 x1 = linspace(0, 10*pi, 1000); y1 = sin(x1); y2 = cos(x1); figure; subplot(2, 2, 1); plot...4.学术报告和出版:专业介绍如何根据不同出版要求和期刊准则,来绘制高质量图表。 内容简介 本书是一本全面指导读者掌握MATLAB数据可视化的实用指南。...专业级科研绘图与学术图表绘制指南:巧用R语言,让科研学术图表更专业、更生动!...本书专注于使用R语言进行数据分析和可视化,主要目标是帮助读者掌握R语言这一强大的数据科学工具,科技领域中更好地处理数据、分析数据以及呈现结果。...本书面向的读者群体广泛,无论是初学者还是有经验的数据科学家,都能够从中获取丰富的知识和技能,科技领域取得成功。本书中包含了实用的示例和练习,可以帮助读者掌握数据分析和可视化的关键概念和实际操作。

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Matplotlib 笔记

(编号越大,图层越靠上) ) 示例:二次函数图像添加特殊点 # 绘制特殊点 plt.scatter(x_tck, # x坐标数组 x_tck ** 2, # y坐标数组...plt.annotate( r'$\frac{\pi}{2}$', #备注显示的文本内容 xycoords='data', #备注目标点所使用的坐标系(data表示数据坐标系)...# 设置备注 plt.annotate( r'$y = x ^ 2$', #备注显示的文本内容 xycoords='data', #备注目标点所使用的坐标系(data表示数据坐标系...plt.show() 执行结果: ⭐️子图 :一个窗口中,有多个图表 ✨矩阵式布局 (最常用的) 绘制矩阵式子图布局相关API: plt.figure('Subplot Layout',...每次试验只有两种可能的结果(进或不进),而且两种结果发生与否互相对立,并且相互独立,事件发生与否的概率每一次独立试验中都保持不变,例如抛硬币。

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【Python数据分析与可视化】:使用【Matplotlib】实现销售数据的全面分析 ——【Matplotlib】数模学习

3.安装Matplotlib: 终端输入以下命令并按Enter键: pip install matplotlib 4.确认安装: import matplotlib.pyplot as plt 你可以通过再次终端运行以下命令来确认安装是否成功...多图形组合 同一个图形组合多种不同类型的图形可以让你更全面地展示数据。...创建第二个Y使用ax1.twinx()方法创建第二个Y绘制第二个数据集:使用ax2.plot(x, y2, 'b--')方法绘制第二个数据集。参数'b--'表示蓝色虚线。...我们将分析一个虚构的数据集,该数据集包含某家公司不同月份的销售数据,并展示如何绘制折线图、柱状图、散点图、直方图和组合图。...创建第二个Y使用ax1.twinx()方法创建第二个Y绘制柱状图:使用ax2.bar方法绘制柱状图,设置柱状图颜色和透明度。

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Android自定义View实战 :如何优雅实现一个时间显示控件?

前言 Android开发,时间的 UI需求非常常见,如下图: 本文将结合 自定义View & RecyclerView的知识,手把手教你实现该常见 & 实用的自定义View:时间 Carson...2.1 效果图 2.2 实现思路 2.3 实现步骤 导入 使用 RecyclerView的包 设置主布局 & RecyclerView的Item布局 设置RecyclerView的 Adapter...); //使用线性布局 LinearLayoutManager layoutManager = new LinearLayoutManager(this);...扩展使用 此次的扩展使用是为了更加丰富UI效果:将点圆圈改成图标,如下图: 代码实现 private Bitmap mIcon; // 获取图标资源 mIcon...= BitmapFactory.decodeResource(context.getResources(), R.mipmap.logo); // 步骤4绘制点圆圈处 通过Canvas

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Android实现带描边的圆角图片

MyView的内部类,继承android.view.View类,并添加构造方法和重写onDraw(Canvas canvas)方法,在里面进行作图: onDraw(Canvas canvas)方法,...首先定义一个画笔,并设置其使用抗锯齿功能,然后定义一张背景,然后定义一个要绘制的圆角矩形的区域,并将画布X上平移40像素,Y上平移20像素,再绘制一个黑色的2像素的圆角矩形,作为图片的边,最后绘制一个使用...); //获取布局文件添加的帧布局管理器 FrameLayout fl=(FrameLayout)findViewById(R.id.frameLayout1); //将自定义的MyView...(40, 20);//将画布X上平移40像素,Y上平移20像素 //为图片添加描边 paint.setStyle(Style.STROKE);//设置填充样式为描边 paint.setColor...); paint.setShader(bs);//设置渲染对象 //绘制一个使用BitmapShader渲染的圆角矩形图片 canvas.drawRoundRect(rect, 10,

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R语言之基因表达可视化实现

基因表达的差异性分析是生物信息学的必经之路。那么,基因表达差异的可视化展示也就具有了很重要的地位。首先我们介绍下目前基因表达差异性可视化的集中展示形式: 热图。...火山图基因表达差异倍数为X,差异的P或FDR(即校正P值)值为Y(实际上是P或FDR的-log10值,这样都是正的,P或FDR越小,即统计显著性越强,-log10值就越大)。...R语言中实现火山图方式很多,今天我们主要介绍ggplot2怎么实现火山图的绘制,其实火山图和散点图类似。首先,我们的数据源布局如下: ?...它的X是基因在两组样本的丰度(表达)平均值,Y是表达差异倍数。MA plot充分展示了基因丰度(表达)和表达变化之间的关系。...当然MA-plot的绘制不局限于本R包,affy包也可以进行MA-plot的绘制,在此我们就不赘述了。

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