数据选取与简单操作: which 返回一个向量中指定元素的索引 which.max 返回最大元素的索引 which.min 返回最小元素的索引 sample 随机在向量中抽取元素 subset 根据条件选取元素...id R M 1 1 9 7 2 2 7 2 其中,all=T代表全连接,all.x=T代表左联结;all.y=T代表右连接 2、dplyr包 dplyr包的数据合并, 一般用left_join...相比来说,其他一些方法要好一些,有dplyr,sqldf中的union 5、sqldf包 利用SQL语句来写,进行数据合并,适合数据库熟悉的人,可参考: R语言︱ 数据库SQL-R连接与SQL语句执行...四、不等长合并 1、plyr包 rbind.fill函数可以很好将数据进行合并,并且补齐没有匹配到的缺失值为NA。...#————————————————————————————不等长合并 #如何解决合并时数据不等长问题——两种方法:do.call函数以及rbind.fill函数(plyr包) #rbind.fill函数只能合并数据框格式
R语言与Python的Pandas中具有非常丰富的数据聚合功能,今天就跟大家盘点一下这些函数的用法。...transform(当然你可以选择使用自定义函数),该函数支持基于同一个数据框新建多个变量。...library(dplyr) 使用group_by函数结合summarize可以方便的完成分组聚合功能。...ddply(.data, .variables, .fun =) #一般只需提供数据框,带聚合分类字段,以及最终的聚合函数与聚合变量公式。它的用法与内置的tpply用法如出一辙。...agg函数以及povit_table等。
、parallel) 切片索引:subset——dplyr::select+filter 聚合运算:aggregate——plyr::ddply+mutate——dplyr::group_by+summarize...数据联结:merge——plyr::join——dplyr::left/right/inner/outer_join 数据塑型:plyr::melt/dcast——tidyr::gather/spread...dplyr::fliter() %>% select() %>% group_by() %>% summarize() 虽然可以借助管道函数进行代码优化,但是仍然无法与data.table的简洁想抗衡。...自定义名称: mydata[,....左手用R右手Python系列——数据合并与追加 长宽转换: 长宽转换仍然支持plyr中的melt/dcast函数以及tidyr中的gather/spread函数。
今天这篇跟大家介绍R语言与Python数据处理中的第二个小知识点——数据合并与追加。...针对数据合并与追加,R与Python中都有对应的函数可以快速完成需求,根据合并与追加的使用场景,这里我将本文内容分成三部分: 数据合并(简单合并,无需匹配) 数据合并(匹配合并) 数据追加 数据合并(简单合并...横向合并:(需匹配) 在R语言中,这种操作有很多可选方案,如基础函数merge、plyr包中的join函数以及dplyr包中的left/right/inter/full_join等函数。...merge plyr::join dplyr::left/right/inter/full_join 这里为了节省时间,只介绍第一种基础函数,欲了解详情,可以查看这篇历史文章: (R语言数据处理——数据合并与追加...本文汇总: 数据合并(简单合并) R: cbind() dplyr::bind_cols() Python: Pandas-cancat() 数据合并(匹配和并) R: merge plyr::join
不管是大学里面的数理与统计,还是研究生阶段的生物统计学,里面都会提到t检验。 小编也给大家总结过一些统计学相关的知识 ☞统计学中数据分析方法汇总!...当我们手上有很多基因的时候,该如何做t检验会更有效率呢?今天小编就给大家介绍三个批量做t检验的方法。...具体如何得到这个表达矩阵可以参考 ☞m6a甲基化相关基因boxplot并显示p值 #读取16个m6a甲基化相关基因在CHOL中的表达量 m6a_expr_type=read.table(file=...和reshape2 #如果没有安装plyr和reshape2这两个R包,先去掉下面两行的#,运行进行安装 #BiocManager::install("plyr") #BiocManager::install..."dplyr") #BiocManager::install("rstatix") #BiocManager::install("reshape2") #加载dplyr,rstatix和reshape2
很多人提问如何安装一个免疫治疗数据队列包, IMvigor210CoreBiologies ,因为它是一个100多M的压缩包文件,在 http://research-pub.gene.com/IMvigor210CoreBiologies...都知道如何下载这样的R语言源代码压缩包文件来进行安装。..."DT", "edgeR", "ggplot2", "limma", "lsmeans", "reshape2", "spatstat", "survival", "plyr...IMvigor210CoreBiologies 依赖于它DESeq这个包,所以仍然是失败的,只能是IMvigor210CoreBiologies这个包写的有点问题, 应该是它本来就并不是为了发布它,所以也无所谓...这样你可以很顺利的安装它,但是因为你强行修改了它的依赖,所以你安装的应该是一个残缺版本,如果后续它这个包确实是依赖于 DESeq 包里面的函数或者对象,就尴尬了。
排序可能是日常数据清洗过程中比较高频的应用了,今天这一篇给大家介绍R语言和Python中最为常见的排序函数应用。...R语言: sort order rank arrange 排序根据对向量排序和数据框的排序要使用不同的函数,以上四个函数中,前三个是针对向量的,最后一个是针对数据框的。...library(dplyr) mydata%>%plyr::arrange(class,value) mydata%>%plyr::arrange(class,-value) ?...,Python提供有全局的sorted函数以及list自身的sort函数可以完成排序功能。...-------------- 本节小结: ----------- 排序函数: R语言: 向量: sort order rank 数据框: arrange Python: 列表与字典: sort sorted
,我们可以知道jsonlite是一个标准的json转化库,依赖于jsonlite我们可以自由地在JSON和DataFrame之间相互转化。 四....数据处理 dplyr/rlist/purrr 1. dplyr dplyr包是现在数据流编程的核心,同时支持主流的管道操作 %>%,主要的数据处理方法包括: (1)高级查询操作: select...ggvis最明显的区别就是在作图时直接支持%>%的管道操作,比如: ggplot2与ggvis的关系类似于plyr与dplyr的关系,都是一种演化过程。 六....data.table完美兼容data.frame,这意味着之前对data.frame的操作我们可以完全保留,并且支持更多方便的数据操作方法。...6.知乎的高分问答:如何使用 ggplot2?
1. sqldf R语言学习曲线中最陡峭的一部分就是语法,我花了一段时间才习惯使用<-代替=。我听到很多人问如何实现VLOOKUP?!?R 对于一般的数据粗加工任务非常有用,但需要一段时间才能掌握。...我发现plyr包 是一个对R基础库中诸如split,apply, combine的泛函的更好用的替代。...译者注:plyr包包含了12个命名与功能相关的函数,均以..ply命名,第一个.表示输入的数据类型(a数组 d数据框 l列表),第二个.表示输出的数据类型(_表示不输出) install.packages...你刚在首选的SQL编辑器中写了一个很棒的查询。一切都是完美的—列名都是snake case(译者注:表示单词之间用下划线连接。单词要么全部大写,要么全部小写。)...不仅可以避免生成数以百计的CSV文件,在R中运行查询还可以节省I/O和转换数据类型的时间。日期,时间等会自动设置为R中的等价表示。
plyr包是Hadley Wickham为解决split – apply – combine问题而写的一个包。...使用plyr包可以针对不同的数据类型,在一个函数内同时完成split – apply – combine三个步骤。...mean(平均值)、medium(中位数)、sum(求和)、min(最小值)、max(最大值),当然还包括自定义函数 > library(plyr) > mymat <- matrix(c(1:6),...教程,可以参考官方文档:http://plyr.had.co.nz/ 3.2.2 dplyr dplyr是一个强大的R包,用于处理,清理和汇总非结构化数据,使得R中的数据探索和数据操作变得简单快捷,也是出于...格式数据的整合,tidyr是同样也是出自 Hadley Wickham,常与dplyr包结合使用。
HTML 视频播放器通过支持多种格式和编解码器,确保了视频的高质量播放和流畅体验。同时,其良好的兼容性和可访问性使得视频内容能够在各种设备和平台上无缝展示。...Stars: 24.2k License: MIT Plyr 是一个简单、轻量级、易于访问和可定制的 HTML5、YouTube 和 Vimeo 媒体播放器,支持现代浏览器。...它依赖于 HTML5 视频和 MediaSource 扩展来进行播放。它通过将 MPEG-2 传输流和 AAC/MP3 流转换为 ISO BMFF (MP4) 片段来工作。...插件化架构 支持 HTML5 视频播放 可以自定义新的媒体支持接口 相关链接 [1] videojs/video.js: https://github.com/videojs/video.js [2]...sampotts/plyr: https://github.com/sampotts/plyr [3] video-dev/hls.js: https://github.com/video-dev
—————————— unlist与list的区别 unlist(x)生成一个包含x所有元素的向量。...> l.ex <- list(list(1:5, LETTERS[1:5]), list("Z","A"), NA) > #list数据[]与[[]]是一样的 > l.ex[2] [[1]] [[1]...list是大规模数据操作非常优秀的方式,能够存放非结构化的文本数据。但是如果,文本分好词之后的数据(如下图),如何将存放在list中的数据进行导出呢?...——不等长合并 两种方法:c(),可以将list[1] 和list[2]进行直接合并,可以兼容不等长,当然合并之后,还有list文件; rbind.fill函数,不等长合并函数,在plyr包中。...#如何解决合并时数据不等长问题——两种方法:do.call函数以及rbind.fill函数(plyr包) #rbind.fill函数只能合并数据框格式 #do.call函数在数据框中执行函数(函数,数据列
因为大部分json数据包返回之后都会被转换为R语言中的非结构化数据类型——list。 也就是说,对于list数据结构的处理熟练程度,将会决定着你在数据清洗中所花费的时间与精力。...导入json数据包: library("dplyr") library("jsonlite") library("magrittr") library("plyr") library("rlist")...,plyr、dplyr、tidyr什么的统统都束手无策了。...找到课程的第一条——董明伟老师的Python课程,然后顺便通过浏览器定位到老师的知乎live主页,将live主页上到的信息与抓取到的信息进行对比匹配,我们可以找到那些对我们非常重要的课程信息。 ?...具体情况如何,我们用一个循环自己查看下!
说句题外话,SAS的字符串函数种类真是多到了变态的地步,这一部分是前后版本兼容的需要,另外也是SAS内部分团队开发模块的结果。相关小故事大猫以后可以给大家介绍。...因为我们不可能一开始就知道模型应该如何设定,就连大牛们写文章也是各种“Play With Your Data”、“Try-And-Error”过来的,因此我们需要不断尝试与修改我们的代码,往往在所有Coding...那么R是如何解决的呢?...大猫在这引用R社区开发大神Hadley Wickha的话,这个戴耳钉的Assistant Professor在谈到为什么会开发Plyr、Dplyr等包的时候说到: “程序员都说数据挖掘中70%的时间都花在数据清洗上面了...我的Plyr/Dplyr/Tidyr包就是为此而生的。我希望你们能用宝贵的时间去做更多更重要的事。”
利用 Photoshop 编辑工具,您可以将每张照片制作成完美的图片二、使用数以千计的画笔将图像变成艺术使用数千款自定义画笔绘画和绘图,或者创建自己的画笔,Photoshop 提供了极为丰富的画笔系列,...此版本为兼容 DirectX/Metal 的 GPU 添加了新的支持,不再依赖于计算机上的 OpenCL 子系统。只需导航到滤镜 > 风格化 > 油画,然后在打开的油画对话框中设置滤镜属性。...凭借新颖的特色和测试版滤镜,您可以在 Photoshop 中实现令人惊叹的编辑效果。1....借助此版本,您可以测试新式渐变工具和渐变插值方法,它们可以更好地控制如何创建美观且更平滑的渐变!可以创建线性渐变和径向渐变,还可以添加、移动、编辑和删除色标,并更改渐变 Widget 的位置。...七、改进了与 Illustrator 的互操作性改进了 Illustrator 与 Photoshop 之间的互操作性,允许交互操作的同时,轻松地将那些带有图层/矢量形状、路径和矢量蒙版的 Ai 文件引入
本篇可以用于情感挖掘中的监督式算法的模型评估,可以与博客对着看:R语言︱监督算法式的情感分析笔记 机器学习算法评估的主要方案为: 机器学习算法的建立——K层交叉检验(数据分折、交叉检验...,而且均方差由于进行了平方,所得值的单位和原预测值不统一了,比如观测值的单位为米,均方差的单位就变成了平方米,更加难以比较; 标准化平均方差对均方差进行了标准化改进,通过计算拟评估模型与以均值为基础的模型之间准确性的比率...2、三大指标计算 23种树数量方式(j),每一折的汇总mse指标,有5折,共215个案例。 代码中运用了dplyr包,这个包是数据预处理、清洗非常好用的包,升级版plyr包。...group_by()与summarise函数有着非常好的配合,先分组生成group_by格式的文件(dplyr包中必须先生成这个格式的文件),然后进行分组计数。 一共125个案例,如下图。 ?...iForest是怎么构造的,给定一个包含n条记录的数据集D,如何构造一个iForest。
这是所有初学者都会问的问题,网上也有很多回答,而且这些学习建议往往很“热情”地列了一个长长的书单。然而,小伙伴们面对这个书单往往心生畏惧或不知如何选择。...我想学习的是实战中的数据处理方法,例如如何做事件研究法!如何计算移动平均!如何批量计算回归!...也许你已经闭着眼睛都能背出许多(排除几本经典)当下中文R教材的套路:先用1/5的篇幅告诉你R的历史与安装方法,然后用近1/2的篇幅教你最基本的操作,例如提取变量、新建变量,然后用剩下大约1/2的篇幅教你一些最基本的命令...抛去那些冗长的函数介绍,每一期开课大猫都将根据自己科研的经历与小伙伴们提出的需求,精心选择一个数据处理实践中遇到的问题进行讲解,更赞的是,所有代码都已经经过高度优化,并且注释详细,你拿去就能直接用哦!...症状三: 如何选择包? R当中有那么多包,做数据处理的就有data.table,dplyr,plyr2等包,绘图的就有ggplot2,ggvis等包,究竟哪些包在经济/金融研究中才是最常用的?
上一篇中,主要介绍了使用foreach包来在R语言环境中实现任务的并行处理,其实在R语言中还有另外一个多进程包同样可以完成多进程任务,那就是parallel包,其语法与R语言内置的apply组函数以及plyr...包内的_pply组函数一致。...,两者之间的性能如何。...使用ldply向量化函数: system.time( mydata3 <- plyr::ldply(1:16,GETPDF) ) 用户 系统 流逝 0.49 0.02 3.19 由测试可知,foreach...、parallel、ldply的时间消耗分别为1.85、1.65、4.54,但是由于使用的api数据获取方式来测试的,可能每一次时间都会有差异,但总体上加速明显,使用foreach、parallel的耗时与普通的
澄清了函子的含义,那么如何在程序中表达它? 在Haskell中,函子是在其上可以map over的东西。稍微有一点函数式编程经验,一定会想到数组(Array)或者列表(List),确实如此。...我们已经知道自函数就是把类型映射到自身类型,那么自函子就是把范畴映射到自身范畴。 自函子是如何映射范畴的,见下图: ?...我们看看幺半群的定义中规定的结合律。对于函数而言,结合律就是将函数以各种结合方式嵌套起来调用。我们将常用的compose函数看作此处的二元运算。...运算的结果是元组,而左侧的f却是接收一个Number类型的函数,它们是彼此不兼容的。...有什么好办法能消除这种不兼容性?
具体代码如下: remove(list = ls()) #一键清空 #加载包 library(ggplot2) library(reshape2) library(plyr) suppressMessages...(library(ggpubr)) suppressMessages(library(dplyr)) 读入Deseq2标准化后的表达数据 # 1.1 表达数据 data <- read.csv("....出图 # 这个是我自己写的一个ggplot2的主题,可以自定义修改其中的参数 if(T){ mytheme <- theme(plot.title = element_text(size = 12..._1.0.0 ggpubr_0.4.0 ## [6] estimate_1.0.13 plyr_1.8.6 reshape2_1.4.4 ggplot2_3.3.2 ##...数据可视化——R语言ggplot2包绘制精美的小提琴图》 数据和代码下载: https://gitee.com/ct5869/shengxin-baodian/tree/master/TCGA 作者:赵法明 编辑
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