点击上方[我分享我快乐]→[...]右上角→[设为星标⭐]即可第一时间获取最新设计资源 撰文 | 王立铭 新冠病毒肺炎的毒力目前有一些粗糙的估计。...人们已经获得了新冠病毒的完整基因组序列信息，也有不少研究组已经把它和已知的许多冠状病毒序列加以比对。...但是无论如何，说在防疫急如星火的时间窗口里，想要完成这些药物和疫苗的研发、人体临床验证、大规模生产、配送和使用，真的不现实。 但我这么说，当然不是说我们面对新冠肺炎就只好束手无策了。...隔离的核心有三条： 一是找到和管理传染源。科学家们已经明确新冠病毒就是这次传染病爆发的病原体，而且它可能在人与人之间传播，那么将已经患病或者疑似患病者快速识别出来并隔离治疗，就起到了这个作用。...我们甚至可以假设一个非常极端的情形：如果从今天开始全国人民都闭门自我隔离两周时间（考虑到新冠病毒肺炎的最长潜伏期就在两周左右），如果期间出现新冠病毒肺炎症状则迅速转移至专门的医疗机构隔离和治疗，那么我们可以在两周时间内彻底清除这种病毒的威胁
然而最近，科学家却对动物和人之间的传播有了新的认识。 今年3月，香港一家宠物店里的员工确诊了新冠肺炎。在对宠物店内的宠物，以及库房供应链进行例行检测时，发现了不一样的东西。 他是被一只仓鼠传染的。...此前科学家曾表示，虽然在实验中发现仓鼠是一种易感新冠病毒的物种，但并没有任何实验以外的仓鼠感染病毒。 研究是如何进行的？ 科学家提取了宠物店内宠物和库房中宠物的病毒拭子和血液样本。...同时，还提取了相关病患的鼻拭子和唾液样本。检测发现，该新冠病毒属于德尔塔毒株。...科学家认为，有必要提高人们的意识，应用合适的检疫隔离手段和防控政策，以减少人畜/畜人传播。 尽管仓鼠和人类感染的是同一毒株，但是具体还是有所区别。...现在，研究证实宠物会传人，那么，在新冠疫情中如何管理宠物？这又给管理者增添了一项重任。 有网友认为，不能因为宠物传人，就将宠物感染者进行扑杀，而是主人应对宠物进行更好的管护。
Nature可视化图表：新冠病毒与SARS时间表对比，这次中国真速度 目前，全球已经有超24万人感染新冠肺炎，中国境外确诊已超过境内确诊病例。...由于新冠病毒COVID-19肺炎的发病机理、病毒检测、疫苗与治疗药物的研发等，在很大程度上决取于对COVID-19全基因序列的分析研究，因此，本文研究将会为生物、医疗与健康领域的相关专家们，在追溯COVID...值得注意的是，这项工作是COVID-19全基因序列及相关病毒序列的一个大规模计算与挖掘研究，我们目的并非为了获得广泛的生物学解释，除了一些最低限度的，而是拟从大序列数据的比对计算中，分析与挖掘出可能有价值的信息...以人为宿主的新冠病毒COVID-19与高致病与致命的P3/P4病毒中的SARS和MERS最像，与SARS的平均相似度达到82.6%，并且MEGA 6.0计算结果报告：COVID-19与SARS同源； 4...值得注意的是，由于存在世界范围内的旅行，本文决没有上述来自5个国家的13株病毒序列一定/可能是病毒源国之意，仅表明，这13株病毒序列为我们可能追溯查找到第一代病毒或病毒源提供了必要有价值的线索。
核酸检测是新冠检测的“金标准”。抗体检测一般用作新型冠状病毒核酸检测阴性疑似病例的补充检测指标或疑似病例诊断中与核酸检测协同使用，不能作为新型冠状病毒感染的肺炎确诊和排除的依据，更适合回顾式检查。...图：2021年新冠检测试剂盒出口月度数据 image.png 下游终端销售 按照《新冠病毒抗原检测应用方案（试行）》的要求，抗原检测的应用场景抗原分为大体分为两种，一是基层医疗卫生机构的采样检测，二是隔离观察人员以及社区居民的自测...图：新冠检测的几种方式 image.png 核酸检测：是目前新冠病毒确诊的“金标准” 核酸检测具有早期诊断、灵敏度和特异性高等特点，是确诊新冠肺炎的“金标准”。...所有生物除朊病毒外都含有核酸，核酸包括脱氧核糖核酸（DNA）和核糖核酸（RNA）。新冠病毒是一种仅含有RNA的病毒，而病毒中的特异性RNA序列是区分该病毒与其他病原体的标志物。...华大基因控股子公司华大因源的新冠病毒抗原检测试剂近期也已获得NMPA批准，华大基因旗下也集齐了核酸检测试剂、抗体检测试剂和抗原检测试剂。
近日，《新型冠状病毒肺炎防控方案（第七版）》正式发布，对新冠肺炎病原学和流行病学特征、疫情监测、疫情处置等内容进行了修订。...目前，基于高通量测序技术在新冠病毒检测中可展开的技术路线有3种：宏基因组测序（Meta）、探针捕获测序（Capture）和多重PCR扩增子测序（Amplicon）。...通过解析大规模的病毒基因组信息，我们可以密切监控人群中不同毒株的传播与进化情况，制定有针对性的策略。与此同时，这些数据也能够在疫苗研发的各个阶段提供有价值的信息。...在这个意义上，基于高通量测序的新冠肺炎检测既是保护我们的坚盾，也是刺穿敌人的长矛和利刃。 结 语 如果说人类与新冠肺炎疫情斗争的历程教会了我们什么，获取和理解生命信息的重要性无疑是其中之一。...我们需要更深入地理解自己，理解病毒，理解生命是如何在变动的外部环境中维持着平衡，每一个生命体面对病毒入侵的独一无二的反应。
钟南山团队通过SEIR模型预测：我国疫情4月底逐渐下降，若隔离推迟5天、疫情规模将增加3倍。 继谷歌一名员工确诊新冠病毒后，外媒又曝出两名在意大利的亚马逊员工感染了新冠病毒。 ?...钟南山团队预测：疫情4月底逐渐下降，隔离推迟5天、规模将增加3倍 根据最新数据，目前新冠肺炎已经影响了全球76个国家和地区，确诊人数超过9万人，超3000人被夺去生命。 ?...研究人员使用了经过修改的易感性暴露-感染-去除（SEIR）流行病学模型，预测新冠肺炎的发展；另外还使用了基于2003年SARS冠状病毒爆发数据进行训练的机器学习方法，用来对模型预测进行验证。...LSTM模型，Adam优化器，500次迭代 钟南山团队将1月23日之前和之后的人口迁移数据，以及最新的COVID-19流行病学数据，整合到SEIR模型中预测疫情发展走势。...在本次研究中，团队使用了LSTM模型，用来处理和预测各种时间序列问题，以预测一段时间内新感染的数量。 ?
2 第二位演讲嘉宾是联影智能美国分公司计算机视觉方向负责人吴子彦博士，他分别介绍了联影智能两款针对新冠肺炎的防治产品：天眼CT平台和uVision。...吴子彦博士表示：“天眼智能CT平台可以通过无人操作避免医护工作者被感染，利用安装在CT扫描间顶部的摄像头获取图像，再通过人工智能算法分析患者当前体位定位出扫描区域，之后对患者进行自动移床，在最后扫描范围确认阶段...新冠肺炎AI系统1月29号就在武汉同济医院上线，提供包括预警、诊断、评估和监控4个功能，会自动检测新冠肺炎数据，第一时间提示隔离，从而降低交叉感染风险，避免造成整个医院都被隔离的情况。”...她在演讲中还透露，推想新冠肺炎AI系统已在全国上线10多家医院，其中武汉同济医院、中南医院、火神山医院等医院，目前已经诊断上万例新冠肺炎数据。...最后，应用过程中有多中心问题；例如，训练的新冠肺炎模型是薄层数据，而有的医院临床诊断是使用厚层数据，如何快速把薄层模型训练成厚层模型就非常重要。
生态与环境科学领域有2个方向入选新兴前沿，即“气候环境因素对新冠肺炎疫情的影响”和“大气二氧化氮水平与新冠肺炎死亡率升高相关”。 3....突发的新冠肺炎疫情是现代医学面临的重大挑战，相关研究迅速成为国际临床医学研究的热点，并在2021年临床医学热点前沿Top10中占据6个席位成为绝对主流，研究主题涉及新冠肺炎病例临床特征、CT诊断、药物治疗...而肿瘤免疫和联合靶向治疗是历年研究前沿的核心议题，并在新冠肺炎火热研究冲击下持续保持较高热度。 临床医学领域今年入选的29个新兴前沿均为新冠肺炎研究。...信息科学领域有1项研究入选新兴前沿，“利用医学影像检测和诊断新冠肺炎的深度神经网络研究”。 11....经济学、心理学及其他社会科学领域有7项研究入选新兴前沿，其中4项新兴前沿与新冠肺炎疫情有关，分别是新冠肺炎疫情恐惧量表的测量评估、医护人员的心理健康问题的调查以及新冠疫情对金融市场的影响等。
2 月 3 日，此时继推想发布针对新冠肺炎的 CT+AI 产品已过去数天，前期的研发，测试，装机工作接近尾声，经历无数个不眠之夜后，「如何将机器送到山东淄博的医院？」是摆在推想人眼前的一道难题。...由于该套 CT+AI 系统专门针对新冠肺炎感染症状定制，培训人员除了系统安装工作，还需深入诊室和病房，与医生进行近距离接触和交流，教会他们如何使用和注意事项。...「很快，我们不仅把档案库里遗存的肺炎病例全都筛了一遍，快速标记出疑似患者」，周宏斌语气中透出藏不住的自豪感，「而且，上线当天我们就帮医院确诊了一名新冠肺炎病例。」...「在前期研发过程中，我们已经与武汉同济医院进行深度合作，医院通过提供疫区的典型病例数据帮助我们训练模型，推想肺炎 AI 是真正源于武汉疫情一线的真实病例，再应用于疫情一线的 AI 产品」。...与普通肺炎相不同的是，新冠肺炎在影像上会有对应的变化，比如新冠肺炎的急性症状更明显，影像上的感染区更多，如何针对这些新症状，新特征，构建训练模型成为产品研发组一道槛。
均来自Nature——且都是武汉肺炎疫情爆发以来首次通过同行评审后发表的正式论文。 ? 而且一篇还来自石正丽——在非典病毒病源研究方面功勋卓著的科学家，也是此次新冠肺炎应急科研攻关研究项目组组长。...研究结果：7个被鉴定和测序出的非结构性蛋白也存在于SARS冠状病毒中。 意味着新冠病毒与SARS紧密相关，这也是新冠病毒被命名为2019-nCoV的主要原因。 ?...更直接的证据是： 石正丽团队在5名病人身上，获取了全长度基因组序列，发现彼此之间相似度超过99.9%，与SARS冠状病毒有79.5%的序列一致。...另外，这项研究同样指出，由于新型冠状病毒和SARS-CoV RBD结构域之间的氨基酸序列和预测的蛋白质结构具有高度相似性，新冠病毒可以有效利用ACE2（血管紧张素转化酶2）作为细胞侵入受体，从而可能促进人与人之间的传播...2月3日，在美国首例新冠肺炎确诊患者治疗中起到明显效果的Remdesivir（瑞德西韦），已由中日友好医院曹彬教授牵头，启动中国临床试验。
本病例强调了在地方、州和联邦各级临床医生和公共卫生当局之间密切协调的重要性，以及迅速传播与治疗这种新感染患者有关的临床信息的必要性。...鼻咽和口咽拭子样本用合成纤维拭子采集，每个拭子插入含有2-3毫升病毒传输介质的单独无菌管中。在血清分离管中收集血清，然后按照CDC指南离心。尿液和粪便标本均收集在无菌标本容器中。...(3)基因测序GENETIC SEQUENCING 2020年1月7日，中国研究人员通过国家卫生研究院GenBank数据库和全球共享流感数据倡议（GISAID）数据库共享了2019-nCoV的完整基因序列...只有3个核苷酸和1个氨基酸有差异。 （3）讨论DISCUSSION 对美国2019年第一例确诊新冠肺炎病例的报告说明了目前对这一新爆发疾病，包括传播动力学和临床疾病的全谱尚不完全了解。...我问医生，妈妈是否得了新型冠状肺炎，医生说没有试剂来确定她是否感染，无法确诊。 1月28日晚上9点，我妈成功转入了隔离病房。但实际上这种做法也是不可取的，进入隔离病房我无法照顾她了。
从病毒的基因，蛋白，宿主以及核苷酸序列等相关信息出发，基于NCBI数据库中新冠病毒（COVID-19）相关数据，构建新冠基本信息图谱 V1.0。...其中，医用防护装备包含了医用手套、口罩、隔离服等；日常防护用品包含洗手液、消毒用品等；医用诊疗设备包含常规检查设备和氧疗设备；治疗用药包含了《新型冠状病毒感染的肺炎诊疗方案》多个版本中的中、西药品。...5.1 简介以及潜在应用 新冠肺炎流行病学知识图谱包含了流行病学知识图谱Schema和基于此Schema定义的新冠肺炎资源实例(待更新)。...新冠肺炎资源实例包含了发生在2019年~2020年2月期间，COVID-19疫情中确诊患者的流行病学调查数据，这些数据来自中各省市卫健委公布的个案流调信息。...8.2 简介以及潜在应用 新冠英雄图谱包括了医疗专家组、因公殉职英雄、武汉当地和全国各地的意见领袖等，涉及生平事迹和基本属性，并与新冠百科、新冠科研、新冠临床、新冠防控等图谱中的一些概念或实体关联。
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根据新华网的报道，钟南山院士团队专家、呼吸疾病国家重点实验室副主任赵金存教授介绍称，广州医科大学呼吸疾病国家重点实验室、广州海关技术中心生物安全三级实验室及中山大学附属第五医院合作，从一例新冠肺炎患者的粪便拭子标本中分离到一株新型冠状病毒...在这位 35 岁男性的检查结果中，鼻咽拭子和口咽拭子 2019 新型冠状病毒（2019-nCov）检测结果为阳性，入院后，除了干咳等症状外，还陆续出现了恶心、呕吐、排稀便和腹部不适等症状。...在国家卫健委最新制定的《关于印发新型冠状病毒感染的肺炎诊疗方案（试行第五版 修正版）》中，新冠病毒的传播途径为「经呼吸道飞沫和接触传播是主要的传播途径。气溶胶和消化道等传播途径尚待明确。」...1 月中旬，王广发随专家组前往武汉工作，他回忆自己看诊新冠病毒肺炎患者期间，戴着 N95 口罩、帽子和手套，但唯独没有戴护目镜。...这份研究来自武汉大学中南医院妇产科、武汉大学医学院和北大医院，研究人员回顾性分析了 9 例经实验室检测确诊为新冠肺炎孕妇的临床病例，对其临床特征进行了数据采集和详细分析。
其中，武汉中南医院的研究统计了院内新冠病毒的感染情况和诊疗方式（1 月 1 日至 28 日）。在 138 位住院病人中，被感染医务人员占比达到 29%。...由于研究数据来自武汉一线，其内容引起了人们的广泛关注。在这篇文章中，他们描述了该医院从 1 月 1 日到 1 月 28 日收治的 138 例 2019-nCov 肺炎住院病人的临床特征。 ?...世卫组织专家：皮质类固醇不应用于新冠肺炎治疗 除了对于疫病传播的分析，一些研究也对目前对患者采取的治疗方案进行了研究。...但世界卫生组织 1 月 28 日发布的临床指南中建议，除非另有说明，建议不要对新冠病毒感染者使用类固醇。 新冠肺炎患者会出现急性肺损伤和急性呼吸窘迫综合征，这是宿主免疫反应引起的。...该研究比较了新冠病毒与其他类似疾病采用皮质类固醇治疗的临床数据。发现没有临床数据表明，皮质醇对 SARS、MERS 等病毒引起的呼吸道感染治疗有益。
知识疫图专题 2020年5月08日 19:30-20:30 报告题目： 知识疫图——AI+大数据在新冠肺炎知识智能服务中的应用 摘要：针对新冠肺炎疫情，清华大学AMiner团队联合多个研究团队和机构在其科技大数据挖掘服务平台基础上研发上线...，以期从繁杂的信息中客观地梳理出疫情发展脉络，用AI让大众更全面深入的知道新冠疫情深度知识。...-20:30 报告题目： 基于搜索日志的新冠肺炎预测 摘要：随着现代信息技术特别是互联网的快速发展，搜索引擎成为人们获取医疗相关讯息的重要工具，这些大数据涉及人们对疾病的关注、对自身症状的描述等。...第四讲：技术实践 2020年5月29日 19:30-20:30 报告题目： 新冠疫情中新闻学术数据的获取及分析应用 摘要：通过对疫情相关事件和学术论文等信息的收集、整理及分析，来展示疫情的发展变化...首先我们分别从论文、新闻、人工整理的学术事件三个方向入手整理数据源，获取疫情相关数据，依托AMiner平台我们很快收集了论文和学术信息，新闻我们是采集新华网等高质量的新闻媒体平台获得。
而借助AI技术可以高效的辅助当前新冠肺炎病例的大规模筛查和诊疗，有助于及时发现潜在患者，加强防控。 此前，阿里、百度等科技巨头就率先投入到了AI技术防疫的战斗中。...商汤科技 覆盖新冠肺炎筛查、诊疗和研究的三大AI方案 公众场所的防疫工作中，测温环节是前期判断人员是否可能感染新冠肺炎的重点。...此外，为方便民众获取权威疫情防控知识，帮助及时鉴别疑似病例，依图还上线了“新冠状肺炎小依医生”，可对新冠肺炎科普知识的智能查询、疑似患者的智能问诊及导诊等服务。...结语 总体来看，AI在防疫中的影像初筛环节能发挥重要作用。而受限于时间问题，各大公司都忙于产品迭代，目前关于“AI医生”系统的具体准确性指标上还未有详细数据公布。...我们也希望，AI公司在此次防疫中投入的技术方案在日后也能沉淀经验。在更大维度上，不止应对新冠肺炎，希望AI未来能在医疗的其他应用场景中发挥更大的效力，推动人类社会发展。
本篇案例的主要内容是新冠肺炎疫情数据的探索性分析，包括中国各省和世界各国的实时数据，及中国和世界各国的历史数据。...2.2 全国各省实时数据探索性分析 下面让我们一起来分析国内的新冠肺炎疫情情况。...数据清洗之后，我们将绘制折线图查看新冠肺炎数据的变化趋势： # 时间序列数据绘制折线图 import matplotlib.pyplot as plt import matplotlib.dates as...随着疫情防控深入，临床数据的不断累积，有个新情况逐渐凸显出来——由于核酸检测的时间较慢，一些患者无法确诊收治，但是病症的临床表现又高度疑似新冠肺炎。...此外，我们还使用了Pandas进行数据可视化，通过图表的绘制探索数据的内涵。同时，我们介绍了时间序列数据的处理方法、如何使用Groupby技术进行数据分组，以及层次化索引的操作方法。
作者使用了七个不同的带注释基因组进行测试，结果表明即使输入序列与参考数据库的序列相似性较低， MetaEuk 也是高度敏感的。...为了证明 MetaEuk 在大规模宏基因组学数据中发现新的真核蛋白的能力，作者从 Tara Oceans project 的 912 个样本中组装了contigs 。...---- 供稿人：Forest Lee 一句话评价 瑞德西韦用于治疗新冠肺炎的临床试验正式公布 文章信息 题目：Compassionate Use of Remdesivir for Patients...方法：该研究对住院的新冠肺炎确诊患者（患者在正常呼吸或接触氧气支持时氧饱和度均不高于94%）在一般治疗的基础上加用了remdesivir瑞德西韦，患者接受了为期10天的瑞德西韦疗程，第一天静脉注射200mg...结论：瑞德西韦在重型新冠肺炎患者的治疗中发挥了一定作用，其有效性应建立在更多的随机临床试验中。
为了支持此次抗疫无国界合作和对话，会议主办方包括乔治布什美中关系基金、中科健康、腾讯医疗健康和中投中财携手邀请中美6位研究和医学专家，进行一次我称之为“虚拟路边聊天”的交流，共同探讨和反思抗疫经验，以及迈入新冠后全球共同关心的话题...今天，我想先邀请国家卫健委高级别专家组组长钟南山院士与我们分享疫情防控措施和策略，更重要的是如何能够防止新冠病毒的二次爆发。...那时候还是一个半月前，我们才刚刚接诊第一个新冠患者，在那次电话会议中，我们聆听了中方同道宝贵的抗击新冠经验交流，他们介绍了公共卫生和临床上的做法，我们很感动中国朋友们能这样伸出援手帮助我们，我们也怀着感恩之心把同样的做法带给了非洲同道...在医院有了第一位新冠患者之后，我们快速地腾出一整层楼用于收治新冠患者。我们也开始规划接下来12个小时的举措，即如何重新部署整个医院，将所有新冠阴性的患者移动到其他区域。...正是因为这种信息公开和数据共享，我们才获取了更多知识，才能在当前开展药物和疫苗研发。
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