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R语言标记组间信息

大家对ggplot应该很熟悉,那么围绕ggplot也开发了很多辅助包,今天给大家介绍下如何在我们绘制图像上简单标注差异信息,比如P值、倍数差等。那么需要用到包ggsignif。...首先看下安装: install.packages("ggsignif") 那么既然是差异分析,那么我们需要看下这个包所提供分析方法包括:t.test(), wilcox.test(), aov()...接下来通过实例来看下具体参数设置: ##载入包 library(ggplot2) library(ggsignif) ##基础绘制 ggplot(mpg,aes(class, hwy)) +...Y_position是指横线位置;xminxmax组合对应两组位置(3,5)(1,4) ggplot(mpg,aes(class, hwy)) + geom_boxplot() +...##去除连接竖线,或者增加长度 ggplot(iris,aes(x = Species, y = Sepal.Length)) + geom_boxplot() + # using `ggsignif

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60-R可视化-8-用ggsignif做统计分析绘图

brackets to your ggplots[2][ggplot2添加p值显著性 - 简书 (jianshu.com)](https://www.jianshu.com/p/77f12664540b..."ggplot2添加p值显著性 - 简书 (jianshu.com "ggplot2添加p值显著性 - 简书 (jianshu.com)")") 前言 之前提到过两个快速出图R包:58-R可视化...-7-用ggpubr与ggstatsplot快速出高颜值图 (qq.com) 通过看包说明不难发现,他们其实都调用了ggsignif: 通过这个包,我们就可以给自己创建ggplot 绘图对象添加统计数据了...简单学习一下ggsignif这个包: 这个包用起来非常简单,我们无须对数据框做任何处理,只需要在ggplot 绘图代码基础上增加一些代码即可。...,如果我color 与x 均映射多个组别希望进行比较,应该如何设定呢?

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组间差异分析就要这样可视化!

,今天要介绍是另外一个R包ggsignif,其帮助手册链接如下 https://cran.r-project.org/web/packages/ggsignif/vignettes/intro.html...首先我们用示例数据跑一跑 > library(ggplot2) > library(ggsignif) > head(iris) Sepal.Length Sepal.Width Petal.Length...,就会自动在上面添加p值连线,默认都在顶部添加,当我么同时指定了多组数据比较时,就会重叠,示例如下 > ggplot(iris, aes(x = Species, y = Sepal.Length)...virginica"), + c("setosa", "virginica"), + c("setosa", "versicolor") + ) + ) 效果图如下 为了避免这个问题...,ggsignif还支持直接指定文字注释内容横线宽高度,代码如下 > ggplot(iris, aes(x = Species, y = Sepal.Length)) + + geom_boxplot

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如何巧妙解决问题

问题 ?...解决问题思路 这种问题解决方法有很多,比如:可以使用递归,我们写一个函数,功能如下:使用表2中上手编号在表2中档案号中进行查找;判断该档案号是否有上手编号;如果有继续调用我们写函数自身,如果没有...虽然上述方法大概能够解决这个问题,但是我们可以使用FME来优雅、巧妙解决这个问题解决方式如下: 将问题进行一点转换(用词不一定准确啊) 如果我们需要是一个这样编号串:编号,上手编号,上上手编号...编号与上手,上手与上上手,这两条线段共有节点就是上手这个节点,我们可以根据这样关系,将短线段连接起来,形成长线段,长线串起一串节点对应编号,就是我们需要值(我问了兜兜,不存在什么重复,也就是说...所以,这就将问题转换成了我FME能够处理、并且不那么复杂问题(可能有点绕啊,不过没关系,多看两边就懂了) 具体解决方式 魔板截图 ? 解释: 通过观察,编号都是是一个字母加上两位数组成

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R初学者必知图形添加显著性标记小细节

❝本节来介绍如何对图形做显著性标记,介绍两种方法第一种通过代码来自动进行标记,另一种通过手动方式来添加标记;两种方法各有其独特用处,各位观众老爷细细品味。...加载R包 library(tidyverse) library(readxl) library(ggsignif) library(rstatix) library(ggpubr) library(ggsci..._2022_1184_MOESM6_ESM.xlsx",sheet = 3) %>% mutate(value=as.numeric(DTT)) %>% drop_na() %>% ggplot...,如果数据分组较为复杂并且存在分面操作情况;那么需要对上述代码位置信息做过多调整,因此第一种方法对初学者不太友好;接下来介绍如何使用「ggsignif」包来手动添加显著性标记 ❞ 构建数据 dataf...❞ 案例二 ggplot(dataf, aes(Group,Score))+ geom_bar(aes(fill = Subject), stat = "identity",

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如何解决秒杀性能问题超卖讨论

2、超卖   任何商品都会有数量上限,如何避免成功下订单买到商品的人数不超过商品数量上限,这是每个抢购活动都要面临难题。 二、如何解决? ---- 首先,产品解决方案我们就不予讨论了。...2、后端 那么后端数据库在高并发超卖下会遇到什么问题呢?...针对上述问题如何解决呢? 我们先看眼淘宝高大上解决方案:   I: 关闭死锁检测,提高并发处理性能。   II:修改源代码,将排队提到进入引擎层前,降低引擎层面的并发度。   ...前移到Redis中,所有的写操作放到内存中,由于Redis中不存在锁故不会出现互相等待,并且由于Redis写性能读性能都远高于MySQL,这就解决了高并发下性能问题。...然后通过队列等异步手段,将变化数据异步写入到DB中。 优点:解决性能问题 缺点:没有解决超卖问题,同时由于异步写入DB,存在某一时刻DBRedis中数据不一致风险。

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AI如何帮助解决解决犯罪问题

11 次查看 到目前为止,人工智能在警务方面的使用主要集中在面部识别帮助以最有效方式部署资源等领域,但 诺桑比亚大学队最近  一项研究强调地点了它如何能够帮助解决解决犯罪,特别是通过提供洞察犯罪所用武器...“通器仔细微调,这些可用于预测特定射击事件相应枪伤残留物(GSR),例如用过病例,伤口,潜在,也是射手手“。...他们解释说:“在血腥星期天之后,问题在于确定枪击是否被平民或军人射杀。” “调查人员在受害者身上发现了大量GSR,并得出结论认为这些是枪击活动造成。...“它们甚至可能扩展到分析科学领域其他领域,这些领域经常遇到可变化学痕迹,例如简易爆炸装置,纵火促进剂环境污染物分析。...” 从实验室到市场路径很少是一个简单路径,但这项研究结果肯定有趣,足以表明在解决谋杀案时,警察很快会得到额外帮助。

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跟着Nature microbiology学画图~堆积柱形图+箱线图以及组合图

image.png 重复图片是Figure1中堆积柱形图箱线图,然后将其组合 ? 需要工具及准备 本次可视化基于windows 10系统。...说明没问题,是得到了dataframe;这样:数据准备好了,作图工具也准备好了,那么我们就开始作图: ggplot(df,aes(x=Status,y=Relative.abundance.......发现目标图里横坐标标签存在一定角度,那么横坐标纵坐标标签用以下代码实现: ggplot(df,aes(x=Status,y=Relative.abundance.......image.png 箱图2: 带p value箱图绘制 先要安装另外两个包:ggsignif这个显著性检验包 install.packages('ggsignif') ggthemr包:...各类检验适用 情况如下: ? ggsignif主要一个函数是geom_signif(),使用方法ggplot2中其他geom_***()一样,作为图层添加到图形中就可以,他主要参数为: ?

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一行代码添加P值可视化技巧分享~~

(内容来源于网络,本来小编想自己写来着,可是,小编机会忘完啦,详细内容,小伙伴们可自行搜索哈~~) 可视化绘制中P值绘制 作为本期推文重点介绍,如何在我们可视化图表中添加P值,使其更好表现图表含义是在绘制图表是需要考虑...本次,小编就使用R-ggpubrR-ggsignif包进行P值添加及定制化操作。...R-ggsignif添加P值 R-ggsignif 包可是专门为绘制P值第三方包,其实用也较为简单,接下来通过三个小例子解释一下: 「样例一」: ggplot(mpg, aes(class, hwy)...("**", "NS") comparisons = list(c("S1", "S2")),size=.7, y_position = 9.3, vjust = 0.2 设置P值显示样式样式...是不是觉得使用R-ggsignif包绘制P值更加方便些呢,更多属性设置其他用法,小伙伴们可去ggsigni包官网进行查阅。 总结 今天这篇推文小编汇总了常见P值可视化绘制方法,希望对大家有所帮助。

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跟着JoVE学作图:R语言ggplot2做簇状柱形图并添加显著性标记完整示例

添加显著性标记用到ggsignif包中geom_signif()函数 在昨天推文基础上,如果是利用带重复原始数据作图,然后利用geom_signif()函数作图时候我遇到了报错,暂时还不知道如何解决...提供了代码和数据,今天推文来学习一下他代码是如何 首先是准备数据 他这里是直接通过代码输入数据,没有将数据存储到文件里 Genotype = c("Wildtype", "APOE4",...相当于是用原始数据先算了平均值标准差 这里赋值符号他直接用等于号=,而没有用<- 给因子变量指定水平 df$Genotype<- factor(df$Genotype, levels=(c(...包 library(ggplot2) library(ggsignif) 簇状柱形图代码 ggplot(df, aes(x=Material, y = Mean, fill=Genotype))...还需要仔细学习下geom_signif()函数用法,学习如何在簇状柱形图基础上自动添加显著性检验结果

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录制剪辑视频,如何解决占用空间过大问题

prompts: a big movie tape in the crowded lighting room 问题 最近做视频比较多。我一般采用手机录制,然后加上 B-roll 素材进行剪辑。...有没有办法在尽量保持画质基础上,减小剪辑后视频体积呢? 我在之前知识星球文章里面给你提过,一种懒人解决办法[1]。 尽管尝试之后,读者们表示很满意。...但是我在后续实际运用中,还是发现了一些问题 —— 这个方法,可以有效利用免费云存储云计算资源,但你还是得忍耐上传一个大体积视频文件,等待处理完成,以及下载瘦身后版本所耗费时间。...前面的第一阶段,用是 Final Cut Pro 。主要解决 Recut 联动快速预览粗剪、加入 B Roll 简单文字说明,并且调整速度之类问题。...参考资料 [1] 一种懒人解决办法: https://t.zsxq.com/04eaYBMrr [2] 看了「Mac 云课堂」休康做视频: https://youtu.be/0LSHhatwTxM

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如何解决读取BsonUndefined问题

我们可以通过以下几步解决这个问题: 1)我们首先需要分析是什么情况导致数据中存在undefined值。...2)如果这个问题仅存在于开发/测试环境,而不是遗留数据导致。 那么修正代码出错地方并清理数据库中脏数据就可以了。 3)如果这种脏数据是遗留数据并且在生产环境也是存在。...问题似乎已经被彻底解决了,其实没有。 因为生产环境脏数据还没有被清理,我们现在只是容忍了脏数据存在。...如果我们清理了这个collection所有脏数据之后这种undefined脏数据还是会产生出来,那么我们就应该好好review一下之前代码是哪里有问题并进行修改了。...写了个Demo来复现并解决这个问题,代码可参考[这里](https://github.com/dhyuan/demo_projects/tree/master/mongo_testcontainer)。

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如何解决性能问题

在市场压力下,选择一个简单而快速解决问题方法是比选择其它方法更为明智而有效率选择。然而,性能是可用性一部分,而且通常它也需要被更仔细地考虑。...提高一个非常复杂系统性能关键是,充分分析它,来发现其“瓶颈”,或者其资源耗费地方。优化一个只占用1%执行时间函数是没有多大意义。...02 我曾犯过一些错误 通常,性能瓶颈一个例子是,数牛数目:通过数脚数量然后除以4,还是数头数量。...其他例子还包括在循环里做不必要 I/O 操作,留下不再需要调试语句,不再需要内存分配,还有,尤其是,不专业地使用库其他没有为性能充分编写过子系统。...(不只是在新设计里,在信任你 boss 这方面,作为一个好程序员,这是一个非常好使用你技能机会)然而,在你考虑重构子系统之前,你应该问你自己,你建议是否会让它好五倍到十倍。

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如何优雅解决群友Python问题

01 问题描述 这个问题来源于自己Python交流群中一个问题,如下图所示,需要计算每列中各值出现次数,然后组成一个新表。 ?...02 解决思路 计算每列各值出现次数,我们可以使用groupby方法,当然最简单还是使用value_counts方法。...首先读取数据 接着使用一个循环语句,依次计算每列值计算 (由于每列值计数返回是series数据,而且我们也需要在结果表中一列加上列名),构建每列值计数dataframe。...03 解决代码 import pandas as pd data = pd.read_excel('例子.xlsx',sheetname='Sheet1',index_col='index') frames...这样,就可以通过不到10行代码就可以优雅解决群友问题啦,不得不说Python以及pandas强大了。

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统计绘图 | 一行代码添加P值可视化技巧分享

(内容来源于网络,本来小编想自己写来着,可是,小编机会忘完啦,详细内容,小伙伴们可自行搜索哈~~) 可视化绘制中P值绘制 作为本期推文重点介绍,如何在我们可视化图表中添加P值,使其更好表现图表含义是在绘制图表是需要考虑...本次,小编就使用R-ggpubrR-ggsignif包进行P值添加及定制化操作。...R-ggsignif添加P值 R-ggsignif 包可是专门为绘制P值第三方包,其实用也较为简单,接下来通过三个小例子解释一下: 「样例一」: ggplot(mpg, aes(class, hwy)...("**", "NS") comparisons = list(c("S1", "S2")),size=.7, y_position = 9.3, vjust = 0.2 设置P值显示样式样式...是不是觉得使用R-ggsignif包绘制P值更加方便些呢,更多属性设置其他用法,小伙伴们可去ggsigni包官网进行查阅。 总结 今天这篇推文小编汇总了常见P值可视化绘制方法,希望对大家有所帮助。

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如何解决SELinux问题

说起SELinux,多数Linux发行版缺省都激活了它,可见它对系统安全重要性,可惜由于它本身有一定复杂性,如果不熟悉的话往往会产生一些看似莫名其妙问题,导致人们常常放弃使用它,为了不因噎废食,学学如何解决...SELinux问题是很有必要。... 当然,我们现在知道这个问题是由于SELinux引起,但还不知其所以然,实际上问题原因此时已经被audit进程记录到了相应日志里,可以这样查看: shell>...很简单,借助ls命令-Z参数即可: shell> ls -Z /path 回到问题开始,拷贝之所以没出现问题,是因为cp自动修改上下文属性,而移动之所以出现问题是因为mv保留原文件上下文属性。...注:关于SELinuxApache详细介绍,可以参考『man httpd_selinux』。 知道了如何解决SELinux问题,以后如果遇到类似的情况不要急着武断关闭SELinux。

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统计绘图 | 一行代码添加P值可视化技巧分享

,详细内容,小伙伴们可自行搜索哈~~) 可视化绘制中P值绘制 作为本期推文重点介绍,如何在我们可视化图表中添加P值,使其更好表现图表含义是在绘制图表是需要考虑。...本次,小编就使用R-ggpubrR-ggsignif包进行P值添加及定制化操作。...R-ggsignif添加P值 R-ggsignif 包可是专门为绘制P值第三方包,其实用也较为简单,接下来通过三个小例子解释一下: 「样例一」: ggplot(mpg, aes(class, hwy)...("**", "NS") comparisons = list(c("S1", "S2")),size=.7, y_position = 9.3, vjust = 0.2 设置P值显示样式样式...是不是觉得使用R-ggsignif包绘制P值更加方便些呢,更多属性设置其他用法,小伙伴们可去ggsigni包官网进行查阅。 总结 今天这篇推文小编汇总了常见P值可视化绘制方法,希望对大家有所帮助。

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