Entrez Gene: 用途:Entrez Gene 提供基因信息的检索和浏览。...使用方法: 在网页上访问 Table Browser:Table Browser 选择目标数据库和数据表。 定义检索条件,选择要检索的字段。.../rentrez_tutorial.html https://github.com/ropensci/rentrez/wiki https://github.com/ropensci/rentrez 首先可以查看一下它提供了哪些数据库的接口...,基本上就跟大家实时通过浏览器访问ncbi官网是同样的效果。...然后,针对每个数据库又可以使用下面的4个函数进行数据库查询交互: Searching databases: entrez_search() Finding cross-references : entrez_link
11.6.1.查询集合中的文档 早些时候,我们看到了如何使用findOne和findById方法检索单个文档MongoTemplate。这些方法返回单个域对象。...$jsonSchema只能应用于查询的顶层,而不是特定于属性的。使用properties架构的属性来匹配嵌套字段。...与查询匹配的第一个文档被返回并从数据库中的集合中删除。 11.6.3.查询不同的值 MongoDB 提供了一种操作,通过使用来自结果文档的查询来获取单个字段的不同值。...结果值不需要具有相同的数据类型,该功能也不限于简单类型。对于检索,实际结果类型对于转换和打字很重要。以下示例显示了如何查询不同的值: 示例 75....Spring Data MongoDB 2.2MongoOperations#geoNear使用$geoNear 聚合 而不是geoNear命令来运行NearQuery. dis先前在包装器类型中返回的计算距离
不合格的函数名称采用用户提供的模式搜索路径或系统范围内的默认模式名称。函数名称可以是定界标识符。SQL函数必须具有用括号括起来的参数列表。参数列表可以为空,但括号是强制性的。...定义表时,使用限定的字母大小写返回合格的表名,而不是FROM子句中指定的字母大小写。...查询元数据可以使用Dynamic SQL返回有关查询的元数据,例如查询中指定的列数,查询中指定的列的名称(或别名)以及查询中指定的列的数据类型。...表限制:无法使用快速选择来查询以下类型的表:链接表一个表,其主/数据映射具有多个节点具有映射到同一数据位置的多个字段的表(仅可使用%Storage.SQL来实现)字段限制:如果选择项列表中包含以下列,则无法使用...LogicalToStorage转换的字段地图数据输入使用检索码的字段一个其地图数据条目具有定界符的字段(不是%List存储)映射到一块嵌套存储的字段索引限制:如果选择项目列表仅由%ID字段和/或均映射到同一索引的字段组成
Endpoint关注的是如何访问服务,而API接口关注的是如何实现服务。...举例说明 API就像是一组涵盖某些功能的方法,它是一个完整的应用程序,通过一系列方法(端点)提供这些功能。例如,视频API允许获取视频列表、获取视频评论列表、删除特定视频等。...在Web开发中,API通常指的是从在线服务中检索信息的方式。API文档提供了URL列表、查询参数和其他关于如何向API发送请求的信息,并指示每个请求将返回什么样的响应。...API通过“请求”和“响应”进行操作。 URI(统一资源标识符)是一个用于标识名称或资源的字符串。相反,EndPoint是表示特定API资源或活动的单个URL。...URI可以是URL(统一资源定位符),用于指定互联网上资源的位置,也可以是URN(统一资源名称),通过名称而不是位置来标识资源。
多个主机变量被指定为逗号分隔的列表或单个主机变量数组。 在通过ODBC、JDBC或动态SQL处理的SELECT查询中指定INTO子句将导致SQLCODE -422错误。...,指定如何组织检索到的数据; 这些可能包括列名。...描述 SELECT语句执行从IRIS数据库检索数据的查询。 在其最简单的形式中,它从单个表的一个或多个列(字段)中检索数据。...如果指定此关键字,则查询将以READ UNCOMMITTED模式检索数据,而不管当前事务的隔离模式如何。 %NORUNTIME -运行时计划选择(RTPC)优化没有使用。...可以指定单个项目,也可以指定以逗号分隔的项目列表。 选择项列表可以(但不是必须)包含指定的项。
所需的实体元数据在第一次保存时确定,或者必须通过配置初始实体集提供。默认情况下,配置类会扫描基础包以寻找潜在的候选者。...您可以通过为@Document注释提供不同的集合名称来对此进行自定义。您还可以通过提供您自己的集合名称作为所选MongoTemplate方法调用的最后一个参数来覆盖集合名称。...它们在单个批量写入数据库中插入对象列表。...在更新中使用聚合允许通过使用单个操作表达多个阶段和多个条件来更新一个或多个字段。...findAndReplace提供了一种替代方法,允许通过简单的查询来识别要替换的文档。 示例 70.
Solr 支持更多格式的数据,而 Elasticsearch 仅支持json文件格式; 4.Solr 官方提供的功能更多,而 Elasticsearch 本身更注重于核心功能,高级功能多有第三方插件提供...,在查询时设置 Solr原理 Solr是基于Lucene开发的全文检索服务器,而Lucene就是一套实现了全文检索的api,其本质就是一个全文检索的过程。...而数据库中并不是所有的字段都建立的索引,更何况如果使用like查询时很大的可能是不使用索引,所以使用solr查询时要比查数据库快 solr索引库个别数据索引丢失怎么办 首先Solr是不会丢失个别数据的。...分布式:Solr Cloud的配置比较复杂 倒排索引是实现“单词-文档矩阵”的一种具体存储形式,通过倒排索引,可以根据单词快速获取包含这个单词的文档列表。...此名称很重要,因为如果节点设置为按名称加入群集,则该节点只能是群集的一部分。 节点是属于集群一部分的单个服务器。它存储数据并参与群集索引和搜索功能。 索引就像关系数据库中的“数据库”。
为了能够监控SNMP代理在这些设备上提供的数据,Zabbix服务器初始化配置时必须支持SNMP数据源。 SNMP 检查只支持 UDP 协议。...见批量处理技术部分内部如何运作的详细信息。对于无法使用“批量请求”的接口可以通过设置可以关闭。...,否则您将从 SNMP 设备获取累积值,而不是差异值)。 所有必填字段都标有红色星号。 现在保存监控项,进入 监测中 → 最新数据 来获取你的SNMP数据!...为了找到最佳数量的对象来查询给定的设备,Zabbix使用以下策略。它在请求中查询“值1”时谨慎开始。如果成功,它会在请求中查询“值2”。...但是,Zabbix不会将计数减少到30以下, 因为它会假设进一步的失败是由于UDP数据包丢失,而不是设备的限制。
(对于单一值,结果对象中没有行,因此%Next()返回0,而不是错误。) 然后,可以使用%Print()方法显示整个当前行的结果,或者检索当前行的指定列的值。...%GetRow()和rset.getrows()以编码列表结构的元素形式从查询结果集中返回一行的数据值。 rset.name按查询结果集中的属性名称、字段名称、别名属性名称或别名字段名称返回数据值。...%Get("fieldname")通过字段名或别名从查询结果集中或存储的查询返回一个数据值。 rset.%GetData(n)按列号从查询结果集中或存储的查询中返回一个数据值。...%ROWCOUNT RETURN } }}可以使用ZWRITE rows命令返回检索到的数组中的所有下标,而不是按下标检索单个行。...例如,对于SELECT Name AS Last_Name,只能使用rset.LastName或rset。“ Last_Name”来检索数据,而不能使用rset.Name。
使用管理门户SQL接口(一)本章介绍如何在InterSystems IRIS®数据平台管理门户上执行SQL操作。 管理门户界面使用动态SQL,这意味着在运行时准备和执行查询。...打开表格——以显示模式在表格中显示当前数据。 这通常不是表中的完整数据:记录的数量和列中的数据长度都受到限制,以提供可管理的显示。...因此,必须首先指定要通过单击SQL接口页面顶部的 “开关switch” 选项要使用的命名空间。这将显示可用名称空间列表,可以从中进行选择。可以设置管理门户默认命名空间。...使用表拖放在文本框中构造SQL代码。可以使用Query Builder(而不是Execute Query文本框)来指定和执行SELECT查询。...(注意,时间戳是调用Print查询窗口的时间,而不是执行查询的时间。) “打印查询”按钮用于打印查询窗口的屏幕截图。
:生物通路数据库Human Phenotype Ontology: 与人类疾病相关的基因数据库CORUM: 人、小鼠、大鼠的蛋白质复合物数据库…这不是一个详尽的列表,还有许多其他可用的数据库未在此处列出...注释工具在 R 中,有许多流行的包用于基因/转录本级别的注释。这些软件包提供的工具可以获取您提供的基因列表,并使用上面列出的一个或多个数据库检索每个基因的信息。...AnnotationDbiAnnotationDbi 是一个 R 包,它提供了一个接口,用于连接和查询使用 SQLite 数据存储的各种注释数据库。...虽然 AnnotationDbi 是一个流行的工具,但我们不会通过代码来使用这个包。但是,如果您对更多细节感兴趣,我们在此处提供了材料链接以及使用我们当前数据集的示例。...使用输出,您可以了解可以在 AnnotationHub 对象中查询的信息:图片请注意有关使用对象 [AH2] 检索记录的注释 - 这将是我们如何从 AnnotationHub 对象中提取单个记录的方法。
其他SELECT子句中列别名的使用由查询语义处理顺序控制。 可以通过ORDER by子句中的列别名引用列。...SqlFieldName的大小写对应于表定义中指定的字段名,而不是选择项列表中指定的字段名。 因此,SELECT name FROM Sample.Person返回字段列标签为Name。...Subquery_n:指定单个选择项的子查询的结果。 选择项可以是字段、聚合函数、表达式或文字。 在子查询之后而不是在子查询中指定列别名。...可以将这些table-ref类型的任意组合指定为逗号分隔列表或使用JOIN语法。 如果指定单个table-ref,则从该表或视图检索指定的数据。...如果指定多个表引用,SQL将对这些表执行连接操作,将它们的数据合并到一个结果表中,从这个结果表中检索指定的数据。 如果指定了多个table-ref,可以用逗号或显式连接语法关键字分隔这些表名。
这将显示可用名称空间的列表,可以从中进行选择。 应用筛选器或从模式下拉列表中选择模式。 可以使用Filter字段通过输入搜索模式来筛选列表。...通过单击模式名称标题,可以按字母升序或降序列出模式。 每个列出的模式都提供指向其关联表、视图、过程和查询(缓存的查询)列表的链接。...如果模式没有该类型的项,则在该模式列表列中显示一个连字符(而不是命名链接)。 这使能够快速获得关于模式内容的信息。 单击“表”、“视图”、“过程”或“查询”链接将显示有关这些项的基本信息的表。...通过单击表标题,可以按该列的值升序或降序对列表进行排序。 过程表总是包括区段过程,而不管管理门户SQL界面左侧的过程设置如何。...1.0000%的百分比值更大,指示当前数据中该列的重复值的相对数量。通过使用这些选择性值,可以确定要定义的索引以及如何使用这些索引来优化性能。
要显示RowID(记录ID),可以使用%ID伪字段变量别名,该别名显示RowID,而不管它被分配的名称是什么。...SELECT Home_City,Home_State FROM Sample.Person 可以使用SELECT直接查询引用字段(例如Home),而不是使用下划线语法。...因为返回的数据是列表格式的,所以可能需要使用$LISTTOSTRING或$LISTGET函数来显示数据。...但是,在生产应用程序中,首选的编程实践是显式列出所选字段,而不是使用星号语法形式。 显式列出字段可以使应用程序更清晰、更容易理解、更容易维护,并更容易按名称搜索字段。...聚合函数的参数可以是下列任何一种: 单个列名计算查询所选行的所有非空值的聚合: SELECT AVG(Age) FROM Sample.Person 也允许使用标量表达式来计算聚合: SELECT
REST 的核心思想是,通过向资源的 URL 发送请求并获得响应(通常是 JSON,但这取决于 API)来检索资源。...我们传递查询并得到响应。除此之外,它还允许我们将不同的实体组合到单个查询中。 GraphQL 的优势 检索精确的数据,无任何多余数据。...GraphQL 的劣势 对于简单的应用程序来说,设置类型、查询等可能有点 复杂,因为使用 REST 可以很容易地完成。 它使用的是 单个端点,而不是遵循 HTTP 规范进行缓存。...如果使用 REST,我们至少要发出 2 到 3 个请求,类似于: /user/以获得用户(作者)的详细信息,比如名称。 /user//posts 获取该用户发布的帖子列表。...}} 通过使用这样的查询,我们将能获得具有以下属性的 JSON 响应。
位片索引不是使用布尔标志来索引数值数据值(如在位图索引中那样),而是以二进制值表示每个值,并为二进制值中的每个数字创建一个位图,以记录哪些行的该二进制数字具有1。...请注意,插入或更新需要在所有n个位片中设置一个位,而不是设置单个位串。这些附加的全局设置操作可能会影响涉及填充位片索引的插入和更新操作的性能。...,它是SqlTableName,而不是持久类名称。...例如,默认模式是SQLUser,而不是User。该值区分大小写。 第二个参数是SQL索引映射名称。这通常是索引的名称,指的是磁盘上存储索引的名称。对于新索引,这是在创建索引时将使用的名称。...如果%BuildIndices()因检索数据时出现问题而失败,系统将生成一个SQLCODE错误和一条消息(%msg),其中包含遇到错误的%ROWID。 构建完索引后,启用映射以供查询优化器选择。
nodelet对于摄像头和3D传感器这类数据传输量非常大的设备特别有用。 节点在系统中必须有唯一的名称。节点使用特定名称与其他节点进行通信而不产生歧义。...在接下来的课程中,将通过一些示例学习如何使用这些命令。 ROS1节点的一个强大功能是可以在启动该节点时更改参数。此功能能够改变节点名称、主题名称和参数名称。...在后面的课程中学习如何使用这些命令。 服务 当需要直接与节点通信并获得应答时(RPC),将无法通过主题实现,而需要使用服务。 服务需要由用户开发,节点并不提供标准服务。...可以通过rossrv看到有关服务数据结构的信息,并且与rosmsg具有完全一致的用法。 通过rosservice可以列出服务列表和查询某个服务。...节点使用此服务器来存储和检索运行时的参数。 参数服务器使用XMLRPC实现并在ROS节点管理器下运行,这意味着它的API可以通过通用的XMLRPC库进行访问。
sets **Reactome:**生物通路数据库 Human Phenotype Ontology: 与人类疾病相关的基因数据库 CORUM: 人、小鼠、大鼠的蛋白质复合物数据库 … 这不是一个详尽的列表...注释工具 在 R 中,有许多流行的包用于基因/转录本级别的注释。这些软件包提供的工具可以获取您提供的基因列表,并使用上面列出的一个或多个数据库检索每个基因的信息。...AnnotationDbi AnnotationDbi 是一个 R 包,它提供了一个接口,用于连接和查询使用 SQLite 数据存储的各种注释数据库。...虽然 AnnotationDbi 是一个流行的工具,但我们不会通过代码来使用这个包。但是,如果您对更多细节感兴趣,我们在此处提供了材料链接[1]以及使用我们当前数据集的示例。...ah 使用输出,您可以了解可以在 AnnotationHub 对象中查询的信息: 请注意有关使用对象 [[AH2]] 检索记录的注释 - 这将是我们如何从 AnnotationHub 对象中提取单个记录的方法
使用嵌入式SQL(四)SQL游标游标是指向数据的指针,该数据允许嵌入式SQL程序对所指向的记录执行操作。通过使用游标,Embedded SQL可以遍历结果集。...在DECLARE语句中,提供了SELECT语句,该语句标识游标将指向的记录。然后,将此游标名称提供给OPEN游标语句。然后,反复发出FETCH游标语句以遍历SELECT结果集。...基于游标的查询使用DECLARE游标名称CURSOR FOR SELECT来选择记录,并(可选)将select列值返回到输出主机变量中。 FETCH语句遍历结果集,使用这些变量返回选定的列值。...通过在DECLARE语句而不是FETCH语句中指定INTO子句,可能会导致性能的小幅提高。因为DECLARE是声明,而不是执行的语句,所以它不会设置或终止SQLCODE变量。...通常,INTO子句是在DECLARE语句中指定的,而不是在FETCH语句中指定的。
使用保存操作的简单情况是保存一个 POJO。在这种情况下,表名由类的名称(非完全限定)确定。您还可以使用特定的集合名称调用保存操作。您可以使用映射元数据来覆盖存储对象的集合。...以下示例显示了如何插入一行并检索其内容: 示例 55....您可以通过提供目标类型直接将投影应用于结果select(Class)。 您可以通过以下终止方法在检索单个实体和检索多个实体之间切换: first(): 只消费第一行,返回一个Mono....如果没有配置基础包,基础设施会扫描带注释的配置类的包。以下示例显示了如何对存储库使用 Java 配置: 示例 59....在测试方法中,我们使用存储库来查询数据库。我们StepVerifier用作测试辅助工具来验证我们对结果的期望。
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