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3.9生信

matrix :矩阵,整个表只允许一种数据类型 data.frame:数据,每一只允许一种数据类型 可以根据生成的函数或者用class或者is族函数判断。...按名字 df1【,"gene"】 df1【,c('gene','change')】 d.按条件(逻辑) df1【df1$score>0,】 图片 图片 如何数据的最后一?...ncol(df1) 知道了行数就方便取最后一:df1【,ncol(df1)】 这样子方便代码复用。 如何数据除了最后一以外的其他?...","r2","r3","r4") 修改行名 d.只修改某一/的名 colnames(df1)【2】 = "CHANGE" 第二的名字改为CHANGE e.两个数据的连接merge merge...: 置:t(m) 转换:as.data.frame(m) 转换为数据 列表 列表新建和取子集 新建 q = list(m1 = matrix(1:9, nrow = 3),

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R in action读书笔记(2)-第五章:高级数据管理

结构比较紧凑的向量化版本 语法:ifelse(cond,statement1,statement2) #cond=TRUE 执行statement1;FALSE时执行statement2 3.switch结构 根据一个表达式的选择语句执行...5.6整合与重组 (aggregate & reshape) 5.6.1置 使用函数t()即可对一个矩阵或数据进行置。对于后者,名将成为变量()名。...调用格式为:aggregate(x,by,FUN) 其中x是待折叠的数据对象,by是一个变量名组成的列表,这些变量将被去掉形成新的观测, 而FUN则是用来计算描述性统计量的标量函数,它将被用来计算新观测中的...5.6.3reshape包 reshape包是一套重构和整合数据集的绝妙的万能工具。...1、 融合 数据集的融合是将它重构为这样一种格式:每个测量变量独占一中带有要唯一确定这个测量所需的标识符变量。

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生信技能树- R语言-day7

arrange(test, Sepal.Length) #默认根据这一从小到大给整个数据排序arrange(test, desc(Sepal.Length)) #从大到小distinct,数据按照某一去重复...,如果没有赋值,那么这个数据还是没有新加,没有赋值,就没有产生补充select()filter()如何简化连续的步骤1....else2, ifelse(,,ifelse)在ifelse里加一个ifelse补充 case_when练习题1.加载deg.Rdata,根据a、b两,按照以下条件生成向量x:load("deg.Rdata...先置3. 把名变成一4. “宽”变成“长”把格式变成类似于 ggplot2的形式,一作为x,一作为y5....% # 矩阵变成数据rownames_to_column() %>% #把名变成一mutate(group = rep(c("control","treat"),each = 3)) #新增一group

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生信技能树-R语言-day3

这些元素筛选出来#提示:%in%length(g %in% s) # 错误,因为%in%产生的逻辑中,T和F都存在,所以都会被计算个数,相当于length计算的是逻辑的个数g[g %in% s]#...2" "3" "4" > colnames(df1)#分别有几个子集名字 [1] "gene" "change" "score"取子集$按照坐标:数据[ , ]按照名字:数据[ “名字...,y]矩阵的置和转换 t()置(互转,要先给改名,不然置没有区别> colnames(m) m a b...7 8 9换为数据 m = as.data.frame()可以用class来判断是否转换成功list列表 新建> x <- list(m1 = matrix(1:9, nrow = 3)...8[2,] 3 5 7 9取子集:用$[ [] ]删除变量删除一个:rm()删除多个:rm( , )删除全部:rm(list = ls())清空控制台:contral+l如何判断是矩阵还是数据根据生成她的函数用

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生信课程note-3

dim(df1)nrow(df1)ncol(df1)#名,列名rownames(df1)colnames(df1)#4.数据取子集df1$score 向量取子集用的是[] 取score这一...用于取子集的逻辑向量:与x对应,不必须由x生成。(例子中即通过score为gene取子集)记住,==是等于的意思,>-是赋值的意思## 代码思维#如何数据的最后一?...df1[,3]df1[,ncol(df1)]#如何数据除了最后一以外的其他?df1[,-ncol(df1)] 注:!-给数值用,!给逻辑用。...mm[2,]m[,1]m[2,3]m[2:3,1:2]mt(m):m<-as.data.frame(m) 转换为数据 必须要赋值矩阵画热图: pheatmap::pheatmap(m)...iris最后一有哪几个取值,每个取值重复了多少次iris[,ncol(iris)]table(iris$Species)# 2.提取内置数据iris的前5,前4,并转换为矩阵,赋值给a。

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手把手教你做一个“渣”数据师,用Python代替老情人Excel

3、导入表格 默认情况下,文件中的第一个工作表按原样导入到数据中。 使用sheet_name参数,可以明确要导入的工作表。文件中的第一个表默认为0。...使用index_col参数可以操作数据中的索引,如果0设置为none,它将使用第一作为index。 ?...2、查看多 ? 3、查看特定 这里使用的方法是loc函数,其中我们可以指定冒号分隔的起始行和结束。注意,索引从0开始而不是1。 ? 4、同时分割 ? 5、在某一中筛选 ?...8、筛选不在列表或Excel中的 ? 9、用多个条件筛选多数据 输入应为一个表,此方法相当于excel中的高级过滤器功能: ? 10、根据数字条件过滤 ?...以上,我们使用的方法包括: Sum_Total:计算的总和 T_Sum:系列输出转换为DataFrame并进行置 Re-index:添加缺少的 Row_Total:T_Sum附加到现有的DataFrame

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阿榜的生信笔记3

()读取行数、ncol()读取数、rownames()读取名、colnames()读取列名 3、数据取子集 ①、$:取数据中的某一项 #4.数据取子集 df1$gene mean(df1$...score) ②、按坐标可以取到对应的 ## 按坐标 df1[2,2] df1[2,] df1[,2] df1[c(1,3),1:2] ③、 按名字和按条件(逻辑) ## 按名字 df1[,"gene..."] df1[,c('gene','change')] ## 按条件(逻辑) df1[df1$score>0,] 大家看看这道思考题: 4、建立自己的代码思维 下图教会了我们如何优雅地去数据的最后一...的名 colnames(df1)[2] <- "CHANGE" 6、数据的连接 我们如何这两个数据连接起来呢?...如上图所示,colnames()<-c()列名重新赋值,t()置,互相转换,as.data.frame()矩阵转换为数据 m t(m) as.data.frame(m) 提个小问题:下图m

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学界 | 把酱油瓶放进菜篮子:UC Berkeley提出高度逼真的物体组合网络Compositional GAN

本文提出 GAN 为框架、目标组合建模为自洽的组合-分解网络。该模型以其边缘分布的目标图像为条件,通过明确学习可能的交互,在联合分布中产生逼真的图像。...大多数 GAN 实例的目标是学习一种可以源分布中的给定样例转换为输出分布中生成的样本的映射。...我们的工作重点是两个目标组合的问题重构为先组合好给定的目标图像生成可以对目标交互关系建模的联合图像,再将联合图像分解,获得单个目标。这样的重构可以通过组合-分解网络加强自洽约束 [37]。...本文提出 GAN 为框架、目标组合建模为自洽的组合-分解网络。该模型以其边缘分布的目标图像为条件,通过明确学习可能的交互,在联合分布中产生逼真的图像。...前两表示输入的太阳镜图像和面部图像,第三和第四分别表示用配对和未配对数据训练的组合 GAN 的输出。最后一表示 ST-GAN 模型生成的图像。 ?

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如何用Power BI获取数据

image.png 打开PowerBI Desktop 页面,从功能栏上点击“获取数据”,选择“更多”。 image.png 页面就会显示不同渠道的数据源,根据需要选择一个数据源。...点击“连接”后,页面会弹出“导航器”对话。“导航器”左边显示表格的名称,右边显示表格的内容,选择表格后,点击“加载“就可以导入数据。...选中要编辑的列名,鼠标右键,可以出现:从表中删除新名称复制或替换。通过此菜单,还可以更改数据类型。 image.png 每个步骤都会显示在“查询设置”窗格上的“已应用步骤”列表中。...如何行列置? Power BI 的可视化效果和建模工具最适用于列式数据,也就是我们通常看到的Excel按每一名排列的数据。 但是,有时候给到你的是按来排列的,如何实现行列置呢?...点击Power Query编辑器中的“置”,可以换为。 image.png 操作步骤动图演示: image.png 推荐:人人都需要的数据分析思维 image.png

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如何用Power BI获取数据

image.png 打开PowerBI Desktop 页面,从功能栏上点击“获取数据”,选择“更多”。 image.png 页面就会显示不同渠道的数据源,根据需要选择一个数据源。...点击“连接”后,页面会弹出“导航器”对话。“导航器”左边显示表格的名称,右边显示表格的内容,选择表格后,点击“加载“就可以导入数据。...选中要编辑的列名,鼠标右键,可以出现:从表中删除新名称复制或替换。通过此菜单,还可以更改数据类型。 image.png 每个步骤都会显示在“查询设置”窗格上的“已应用步骤”列表中。...如何行列置? Power BI 的可视化效果和建模工具最适用于列式数据,也就是我们通常看到的Excel按每一名排列的数据。 但是,有时候给到你的是按来排列的,如何实现行列置呢?...点击Power Query编辑器中的“置”,可以换为。 image.png 操作步骤动图演示: image.png 推荐:人人都需要的数据分析思维

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R语言数据结构(三)数据

check.rows: 若为TRUE,则会检查的长度和名称是否一致。 check.names: 逻辑。若为TRUE,则会检查数据中变量的名称,确保它们是符合语法规范的变量名称且不重复。...stringsAsFactors: 逻辑,指定是否字符向量转换为因子向量。在R 4.0.0之前,默认设置是TRUE,但现在已更改为FALSE。...# 2 Bob FALSE 21 London 删除数据 下面示例代码展示了如何使用负数索引和subset()函数在R语言中删除数据中的,并在每个操作后注释了相应的输出结果。...= 25) cat("根据条件删除age为25岁的后的数据:\n") print(df_deleted_age) # 根据条件删除age为25岁的后的数据: # name age gender...<- subset(df, select = -c(age)) cat("根据条件删除age后的数据:\n") print(df_deleted_age_column) # 根据条件删除age后的数据

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Power Query 真经 - 第 7 章 - 常用数据转换

“Sales Category” 放在【】上,“Date” 放在【】上,“Units” 放在【】上。 接下来,可以在同一数据集中建立另一个数据透视表。...(译者注:逆透视的本质是表示结构的多个属性转换为一个属性的多个;透视的本质是某个属性内容转换为结构。...此时,判断透视表有一个精准的判别条件,就是:若某表置后,含义完全不变,则为透视表;而若置后,无法正确解读其语义,则该表不是透视表。...【警告】 这个搜索应用了一个筛选器,显示包含用户输入的字符模式的任何。不接受通配符和数学运算符。 在处理中的过程中有超过 1,000 数据集时,遇到一个挑战。...图 7-22 手动创建一个包含 “ia” 的筛选器 当用户不能在筛选器列表中看到数据时,或者需要为筛选器配置一些更复杂的条件,如【且】和【或】条件时,【筛选】对话的这个视图非常有用。

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【生信技能树培训笔记】R语言基础(20230112更新)

一、前言用R分析数据得出结果,需要解决两个问题:用什么包/函数来处理数据如何整理数据,使得数据可以套进函数里进行处理?...#t函数可以矩阵或者数据进行互换 [,1] [,2] [,3]a 1 2 3b 4 5 6c 7 8 9#转换> as.data.frame...(m) #矩阵转换成数据数据结构 a b c1 1 4 72 2 5 83 3 6 9重点:数据或举证置之后,其数据结构都是矩阵。...重点与Tips:数据按照逻辑取子集,TRUE对应的/留下,FALSE对应的/丢掉。用于取子集的逻辑向量,与原集对应即可,不必一定由原集生成。...默认all=FALSE,表示只取共同中相同的内容进行合并,当指定all=TRUE时,取两个数据中指定行列的并集进行合并,任一表中的缺失,则用NA填充。

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生信技能树数据挖掘笔记

,可以是具体的(即下标),可以是函数,可以是向量图片图片图片图片如何修改向量中的某个或者某些元素图片图片简单的向量作图图片图片数据、矩阵和列表向量是一维的矩阵是二维的图片lis列表t可装万物图片数据的来源图片新建数据框图片从文件中读取...(放在工作目录下)图片数据的属性图片dim()多少、多少列,nrow()多少,ncol()多少列,rownames()数据取子集图片图片图片图片图片图片图片数据数据的修改图片图片图片图片图片图片图片矩阵新建和取子集...(不支持$)图片矩阵的的置、转换图片图片图片矩阵画热图图片图片列表的的新建和取子集图片l[[2]]:取第二个子集,再取矩阵的子集列表支持$图片图片数据结构的总结图片函数和R包图片图片图片图片图片图片图片图片图片图片...适用于大文件);R语言读取图片常见分隔符:逗号;空格;制表符(\t)图片图片图片图片图片图片图片图片图片图片图片图片图片图片图片图片图片图片图片图片图片R语言作图图片图片图片图片图片图片图片图片映射,根据数据某一的属性来定义图的某个属性图片图片图片图片图片图片图片图片图片图片...),它可以转换为data.frame图片图片图片图片玩转数据框图片图片keep_all=T时,考察完输入列的独立性后,其他保留输出图片图片图片图片条件语句和循环语句图片图片图片图片图片图片图片图片图片图片图片图片图片表达矩阵画箱线图图片图片图片图片图片图片

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从零开始的异世界生信学习 R语言部分 06 R应用专题

library(dplyr) arrange(test, Sepal.Length) #按照一的顺序所有数据从小到大排序,列名不带引号, arrange(test, desc(Sepal.Length...#如何结果存下来?...() %>% #表达矩阵转换为数据 rownames_to_column() %>% #名变成一 mutate(group = rep(c("control","treat"),each...为1表示,为2表示,FUN是函数 test<- iris[1:6,1:4] apply(test, 2, mean) ##对test数据的每一求平均值 apply(test, 1, sum...(第一个写的数据),右表中多余的数据舍去,没有的数据显示缺失 right_join(test1,test2,by="name") ##右连接,以右侧的表的行为准构成新的数据(第二个写的数据),左表中多余的数据舍去

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7道题,测测你的职场技能

自定义格式代码的完整结构为:正数;负数;零;文本。 3个分号划分4个区段,每个区段的代码对不同类型的内容产生作用。...【题目2】使用定位条件功能进行批量填充 如何使得左边的表变成右边的表呢?也就是说,如何使得多个不连续的空白单元格同时输入数据? 有人说,我输入其中一个单元格,然后复制到其他空白单元格不就可以了吗。...【题目3】使用辅助将以下左表变为右表形式 如图,要将左表变为右表的形式,其实就是表里的姓名列,每隔一插入空白如何实现呢?我们可以通过添加辅助的方法来实现。...【题目4】下表中籍贯含有“北”字的单元格内容置换为“练习” 需求是,只要籍贯里的内容含有“北”字的,就统一替换为“练习”。如“北京朝阳区”,含有“北”字,所以,转换为“练习”。...选中籍贯,Ctrl+F 快捷键打开【查找和替换】对话,在“查找内容”里输入“*北*”,在“替换为”对话里输入“练习”,再点击【全部替换】。

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