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左手用R右手Python系列8——数据去重与缺失处理

is.na() #缺/非缺失 na.rm=TRUE/FALSE #移除缺失 na.omit(lc) #忽略缺失 complete.cases() #完整 mydata<...na.rm=TRUE/FALSE #移除缺失 rm.na通常作为基础统计函数的参数使用,如mean,sum等 mean(mydata$A,na.rm=TRUE) sum(mydata$A,na.rm...关于更为复杂的缺失插补技术,因为涉及到一些比较深入的方法,这里暂且不呈现,仅对缺失的描述筛选做以上简单归总。...#缺失处理: 对于列表而言,numpy中诸多统计函数都有针对缺失的操作: nansum/nanmean/nanmin/nanmax val= np.array([5,np.nan,8,9,np.nan...is.na() na.rm=TRUE/FALSE na.omit(lc) complete.cases() Python: 重复: set(针对列表通过元组过滤) drop_duplicates

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r语言求平均值_r语言计算中位数

平均值是通过取数值的总和并除以数据序列中的的数量来计算,函数mean()用于在R中计算平均值,语法如下: mean(x, trim = 0, na.rm = FALSE, ...)...trim – 用于从排序的向量的两端删除一些观测na.rm – 用于从输入向量中删除缺少。...如果缺少,则平均函数返回NA,我们如果要从计算中删除缺少,可以使用na.rm = TRUE, 这意味着删除NA。...好啦,来综合看下实例: 输出结果: 数据系列中的中间被称为中位数,在R中使用median()函数来计算中位数,语法如下: median(x, na.rm = FALSE) 参数描述如下: x...na.rm – 用于从输入向量中删除缺少。 众数是指给定的一组数据集合中出现次数最多的,不同于平均值中位数,众数可以同时具有数字字符数据。

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「R」如何汇总数据

如果数据中存在NA,需要给每个函数添加na.rm=TRUE标记去除缺失。...它可以干以下的事情: 寻找均值、标准差计数 寻找均值的标准误(强调,如果你处理的是被试内变量这可能不是你想要的) 寻找95%的置信区间(也可以指定其他) 重命令结果数据集的变量名,这样更方便后续处理...处理缺失 如果数据中存在NA,你需要添加na.rm=TRUE选项。通常你可以在summaryBy()函数中设置,但length()函数识别不了这个选项。...# 新版的length函数可以处理NA如果na.rm=T,则不对NA计数 length2 <- function (x, na.rm=FALSE) { if (na.rm) sum(!...它可以干以下的事情: 寻找均值、标准差计数 寻找均值的标准误(强调,如果你处理的是被试内变量这可能不是你想要的) 寻找95%的置信区间(也可以指定其他) 重命令结果数据集的变量名,这样更方便后续处理

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R 与 Python 双语解读统计分析基础

最大以及 0.25、0.50 0.75 三个四分位数。...R 中在默认参数的情况下,第 i 个观察对应 分位数,通过线性插获得中位数。 对于上面这类基本统计函数,如果数据中缺少,情况将变得更加复杂。为了说明,我们使用以下示例。...具有未知的向量的平均值也是未知的。但是,你可以使用 na.rm 参数(设为不可用,相当于删除)将缺失删除。...mean(data$igf1, na.rm=T) 340.167976424361 有一个例外: length 函数将无法理解 na.rm,因此我们无法使用它来计算 igf1 的非缺失的数量。...y 轴以密度单位(即每 x 单位的数据比例)单位,因此直方图的总面积为 1。如果由于某种原因,你想要其中列高每个间隔中的原始数字的那种直方图,则可以使用 freq = T 进行指定。

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R In Action |基本数据管理

非; | 或;& isTRUE(x) 判断x是否TRUE 完成以下重编码任务: 将leadership$age == 99 缺失,大于75岁Elder,小于55岁Young,中间Middle...($ == NA 错误) 不可能的NaN来标记(Not a number,不是一个数),用is.nan(),例如:sin(Inf) 4.5.2 重编码某些缺失 leadership$age...4.5.3 在分析中排除缺失 针对大部分函数,可以用na.rm=TRUE参数选项,结果忽略缺失。...sum(leadership$q5, na.rm=TRUE) 4.5.4 函数na.omit()可以移除所有含有缺失的观测(行)。...)抽取大小n的一个随机样本: 示例:从1到数据框中观测的数量(总数),抽取的数目参数:是否放回抽样(仅从总体中取样or越取样本越少) mysample <- leadership[sample(1:

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JavaScript大小比较 赋值运算符详解

如果一个操作数 NaN,或者被转换为 NaN,则始终返回 false。...console.log("a" >"3"); //返回true,字符a编码61,字符3编码33 console.log("a" > 3); //返回false,字符a被强制转换为NaN 5)如果一个操作数是对象...= NaN); //返回true NaN与任何都不相等,包括它自己。null undefined 相等,但是它们是不同类型的数据。...在相等比较中,null undefined 不允许被转换为其他类型的。 示例2 下面两个变量的是相等的。...在全等运算中,应注意以下几个问题: 如果两个操作数都是简单的,则只要相等,类型相同,就全等。 如果一个操作数是简单的,另一个操作数是复合型对象,则不全等。

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OSCA单细胞数据分析笔记13—Multi-sample comparison

这里我们将每一个样本某一细胞类型的所有细胞,按照基因累加counts表达,当作该样本的该细胞类型的Bulk RNA-seq表达矩阵(pseudo-bulk)。...y <- calcNormFactors(y) y (4)差异分析(校正批次效应) 首先需要交代design matrix # tomato 分组情况 # pool 批次情况 y$samples...NaN NaN NaN ## Gm1992 NaN NaN NaN NaN ## Gm37381 NaN NaN NaN NaN ## Rp1...在上述方法中,得到ambient后,如果知道其中某些基因在样本细胞中一定是不表达的,作为阴性对照参考,可提高预估的精度。...基本流程类似上面的DE pipeline,只是表达矩阵(列为样本细胞类型,行名为基因,基因表达水平)变成了细胞丰度矩阵(列为样本,行为细胞类型,细胞组成数目),同样采用 edgeR pipeline

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如何在ggplot2图形上添加显著性差异注释?

stat_signif(mapping = NULL, data = NULL, position = "identity", na.rm = FALSE, show.legend = NA, inherit.aes...geom_signif(mapping = NULL, data = NULL, stat = "signif", position = "identity", na.rm = FALSE, show.legend...如果指定且inherit.aes=TRUE(默认),它将与绘图顶层的默认映射结合。如果没有绘图映射,则必须提供映射。...data # 绘图数据所在的数据框 position # 位置调整;可以是字符串,也可以是位置调整函数的结果 na.rm # 逻辑词,默认为FALSE,移除缺失时显示警告信息,TRUE,则不显示警告信息...,则标签将解析表达式 参考资料 stat_signif()geom_signif()函数帮助文件 https://mp.weixin.qq.com/s/cjeoILJhZhQngXlm2ZZ4Eg

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JavaWeb02-CSS,JS(Java真正的全栈开发)

如果缺少左外边距的,则使用右外边距的。 如果缺少下外边距的,则使用上外边距的。 如果缺少右外边距的,则使用上外边距的。 内边距 元素的内边距在边框内容区之间。...运算符的行为如下: 如果运算数是对象,返回 false 如果运算数是数字 0,返回 true 如果运算数是 0 以外的任何数字,返回 false 如果运算数是 null,返回 true 如果运算数是 NaN...Infinity 被 Infinity 除,结果 NaN。 如果除数是无穷大的数,结果被除数。 如果被除数 0,结果 0。...如果某个运算数是 NaN,等号将返回 false,非等号将返回 true。 如果两个运算数都是对象,那么比较的是它们的引用。...即使两个数都是 NaN,等号仍然返回 false,因为根据规则,NaN 不等于 NaN如果一个运算数是 Boolean ,在检查相等性之前,把它转换成数字

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大老粗别走,教你如何识别「离群处理「缺失」!

对于统计学家来说,离群缺失通常是一个棘手的问题,如果处理不当可能会导致错误。离群可能会导致我们的结果偏离真实结果,而缺失造成的信息损失可能会导致建模失败。...当然,我们也可以对分类变量的某个进行异常判断。例如,性别1=男性,2=女性。如果赋值3,则为异常值。这里我们介绍一个自定义函数。...R提供一些函数来处理缺失。要确定向量是否包含缺少,可以使用is.na()函数。“is.na()”函数是用于确定元素是否na类型的最常用方法。...它返回与传入参数长度相同的对象,并且所有数据都是逻辑FALSE或TRUE)。假设我们有6个病人,但是只记录了4个,而缺少了2个。...例如,如果第一行中没有缺失,则显示“0”。最后一行计算每个变量缺失的数量。例如,“Wind”变量没有缺失,显示“0”,而Ozone变量有37个缺失

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大话 JavaScript(Speaking JavaScript):第六章到第十章

未初始化的变量,缺少的参数缺少的属性都具有该非如果没有明确返回任何内容,函数会隐式返回它。 null表示“没有对象”。它用作一个非,期望一个对象(作为参数,在对象链中的成员等)。...x) { ... } 警告 false,0,NaN''也被视为false。 未定义 null 的历史 单个非可以扮演undefinednull的角色。...陷阱:NaN 特殊的数字NaN(参见NaN)不等于自身: > NaN === NaN false 因此,您需要使用其他方法来检查它,这些方法在陷阱:检查是否 NaN中有描述。 严格不等 (!...«if_true» : «if_false» 如果条件true,则结果if_true; 否则,结果if_false。 例如: var x = (obj ?...短路 如果第一个操作数已经确定了结果,则不会评估第二个操作数。

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Python—关于Pandas的缺失问题(国内唯一)

使用该方法,我们可以确认缺失“ NA”都被识别为缺失。两个布尔响应均为。isnull() True 这是一个简单的示例,但强调了一个重点。Pandas会将空单元格“NA”类型都识别为缺失。...意外的缺失 到目前为止,我们已经看到了标准缺失非标准缺失如果我们出现意外类型怎么办? 例如,如果我们的功能应该是字符串,但是有数字类型,那么从技术上讲,这也是一个缺失。...从前面的示例中,我们知道Pandas将检测到第7行中的空单元格缺失。让我们用一些代码进行确认。...7 False 8 False 在第四行中,数字12。...int(row) 如果可以将值更改为整数,则可以使用Numpy's将条目更改为缺少。np.nan 另一方面,如果不能将其更改为整数,我们pass将继续。

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能不能让R按行处理数据?

现在我想做的是对于每一行,找出非NA的,填充到“mean.scale”这个新的变量;如果有多个非NA,那么就计算其平均值。也就是说,我希望最终得到如下数据集: ?...对,这个步骤castmelt函数的作用类似,只不过这里直接用了data.table自己的语句。...事实上,data.table也整合了reshape中的castmelt函数,并且将cast函数升级dcast,感兴趣的小伙伴可以去研究一番。 在拉直数据后,接下来要做的工作就很简单了。...首先,别忘了mean中的na.rm = T参数,它能够让函数忽略缺失。...其次,最后计算出的结果中会有NaN(not a number),产生这种情况是因为在计算均值中出现了0作为除数的情况,对此我们需要用!is.finite()将其排除。

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JavaScript 中的 NaN

NaN number JavaScript 中的数字类型是所有数字的集合,包括 “Not A Number”,正无穷负无穷。...JavaScript 通过内置函数来检测 NaN:isNaN() Number.isNaN(): isNaN(NaN); // => true isNaN(1); // => false Number.isNaN...另一方面,Number.isNaN('Joker12') 会检查参数是否 NaN 而不进行转换。该函数返回 false ,因为'Joker12' 不等于 NaN。...fontSize * 2 被评估 undefined * 2,结果 NaN。 当把缺少的属性或返回 undefined 的函数用作算术运算中的时,将生成 “Not A Number”。...正确处理 undefined(缺少的属性提供默认)是防止这种情况的好方法。 数学函数的不确定形式或无效参数也会导致 “Not A Number”。但是这些情况很少发生。

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