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分析R中的Elasticsearch数据

您可以在任何可以安装R和Java的计算机上使用纯R脚本和标准SQL访问Elasticsearch数据。...您可以使用适用于Elasticsearch的CData JDBC驱动程序和RJDBC软件包来处理R中的远程Elasticsearch数据。...通过使用CData驱动程序，您可以利用为经过行业验证的标准编写的驱动程序来访问流行的开源数据R语言。...类路径：将其设置为驱动程序JAR的位置。默认情况下，这是安装文件夹的lib子文件夹。 DBI函数（例如 dbConnect 和dbSendQuery ）提供了用于在R中写入数据访问代码的统一接口。...注意：必须在X-Pack上启用TLS / SSL和客户端身份验证才能使用PKI。连接数据提供程序后，X-Pack将根据您配置的域执行用户身份验证和授予角色权限。

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数据科学中 R 语言教学的10个简单准则

简介前段时间看了《统计之都》最新的统计月读：统计月读（2022年9月），看到了一个比较有趣信息。统计月读（2022年9月）于是我逛了逛这个 GitHub 网站[1]。...GitHub 截图模板介绍打开是一个 html 文件，细细一品，原来作者是使用 “写轮眼[2]” 制作完成 html 格式的 slides。封面如下，整个文件截图见文末。...你可以先看看小编以前写的入门级教程：R沟通｜提升xaringan幻灯片的b格；R沟通｜设置xaringan主题；R沟通｜用xaringan包制作幻灯片。...作者给出了数据科学中 R 语言教学的 10 个简单准则，分别是：通过数据分析教学 R 语言使用参与式现场编码提供大量练习提供大量反馈使用可操作的数据例子使用真实的、丰富的、但可获得的数据集...提供知识的文化和历史背景建立安全、包容和受欢迎的社区使用核对表来集中和促进同伴的学习让学生做项目该 slides 中给出了每个准则的具体操作方案。

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「R」R检验中的“数据是恆量”问题

之前我学习和自己分析时就遇到过，尝试使用判断的方式事先检查它是不是数据存在问题（这类数据明显不服从正态分布），可以使用正态性检验，或者直接判断是不是样本组内的数据是完全一样的，如果一样就不要这个了。...所遇到的问题：分析两个样本之间是否存在差异，每个样本三个重复。现在用的是t.test，但有些样本三个重复的值一样（比如有0,0,0或者2,2,2之类的），想问下像这种数据应该用什么检验方法呢？...假设有两万个基因的表达，我手头没数据，所以写个伪代码：下面用geneExpr1与geneExpr2表示两组数据： for循环1(geneExpr1, geneExpr2): 组合某基因表达 - c...最后提供两个参考函数： 1是判断恒量： zero_range x, tol = .Machine$double.eps ^ 0.5) { if (length(x) == 1...) return(TRUE) x x) / mean(x) isTRUE(all.equal(x[1], x[2], tolerance = tol)) } 2是修正的t检验，

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R中的数据导入与导出

1、数据的导入导入文本文件使用read.table函数导入普通文本文件 read.table(file,header=FALSE,sep="",...)...read.csv("3.xxx", header=FALSE, sep=","); #指定分隔符 data3 <- read.csv("3.xxx", header=FALSE, sep="\t") 2、数据的导出...导出文本文件 write.table(x,file="",sep="",row.names=TRUE,col.names=TRUE,quote=TRUE) age <- c(22, 23); name

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R语言在数据科学中的应用

功能介绍大数据时代，我们需要一个强大的软件Runing!!!R语言出现了!!!这里是R语言最好的学习交流平台，包括R语言书籍，R语言课程，R语言程序包使用，教你获取数据，处理数据，做出决策！！...1 万亿元每款能成功面市的新药的平均研发时间是 12 年平均每款药物的研发成本约为 50 亿元实验室中筛选的化合物只有大约 1/1000 能够进入到人体试验阶段 ?...知识无极限 6、回复“啤酒”查看数据挖掘关联注明案例-啤酒喝尿布 7、回复“栋察”查看大数据栋察——大数据时代的历史机遇连载 8、回复“数据咖”查看数据咖——PPV课数据爱好者俱乐部省分会会长招募 9、...回复“每日一课”查看【每日一课】手机在线视频集锦 PPV课大数据ID: ppvke123 （长按可复制）大数据人才的摇篮！...专注大数据行业人才的培养。每日一课，大数据（EXCEL、SAS、SPSS、Hadoop、CDA）视频课程。大数据资讯，每日分享！数据咖—PPV课数据爱好者俱乐部！

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Seurat:用于分析10X单细胞转录组数据的R包

Seurat是一个分析单细胞转录组数据的R包，提供了t-SNE降维分析，聚类分析，mark基因识别等多种功能，网址如下 https://satijalab.org/seurat/ 基本用法如下 1....预处理预处理就是根据基因的表达量等特征，对细胞进行过滤，通常的做法就是指定一个阈值，比如要求一个细胞中检测到的基因数必须大于100，才可以进入到下游分析，如果小于这个数字，就过滤掉该细胞。...为了指定一个合适的阈值，我们首先需要查看细胞中不同特征的分布，常见的有以下几个指标 1.nGene 2.nUMI 3.mito.percent nGene代表的是在该细胞中共检测到的表达量大于0的基因个数...::colSums(pbmc@raw.data[mito.genes, ]) / Matrix::colSums(pbmc@raw.data)# 将统计的百分比数据添加对象中 pbmc 的细胞是非常少的，可以看做是离群值，所以在筛选时，如果一个细胞中检测到的基因个数大于4000，就可以进行过滤。

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Elasticsearch 5.x 版本中的冷热数据架构

因为它们不包含数据，也不参与搜索和索引操作，所以它们对 JVM 的要求与在大量索引或长时间、昂贵的搜索中可能出现的要求不同。因此，不太可能受到长时间垃圾收集暂停的影响。...因此，可以为它们提供比数据节点所需配置低得多的 CPU、RAM 和磁盘配置。热节点这个专门的数据节点执行集群中的所有索引。它们还持有最新的索引，因为这些索引通常最常被查询的。...另一种策略是为集群中的任何索引添加一个通用模板，"template": "*"，它在热节点中创建新的索引。...最后，通过在elasticsearch.yml中设置index.codec: best_compression，我们还可以在所有冷数据节点上实现更好的压缩。...---- 英文原文链接：“Hot-Warm” Architecture in Elasticsearch 5.x.

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R语言建模入门：如何理解formula中y~.和y~x:z的含义？

背景：2019年的某月末日，三路人开局，兴趣所致组建了“花儿少年”：一个有组织、有纪律的R语言入门交流学习组织。自此，开启了一段小白&大师的成长史。...01 — 如何理解formula中y~.和y~x:z的含义？ y~. 和 y~x:z 是一个简单的formula。~和 : 是formula中的运算符，但它们与通常理解的数学运算符存在一定的差距。...以下是formula中其他一些运算符的含义： ~ ：~连接公式两侧，~的左侧是因变量，右侧是自变量。 + ：模型中不同的项用+分隔。注意R语言中默认表达式带常数项，因此估计只需要写y~x。...- ：-表示从模型中移除某一项，y~x-1表示从模型中移除常数项，估计的是一个不带截距项的过原点的回归方程。此外，y~x+0或y~0+x也可以表示不带截距项的回归方程。...y~x+w+z的含义： y~x+I(w+z)的含义：可以发现，第二个公式将w+z作为一个整体估计这一变量的参数。

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R数据框一个有趣的小问题

') 然后如果想把第一行去掉，只保留第二行数据，我们一般的操作可以有两种直接中括号减去第一行：test[-1,] dplyr的slice函数：slice(test,-1) 此时就发现了，第一种方法会只得到了一个向量...，而不是像第二种依然得到一个数据框那么问题出在哪里呢？...首先是因为我们的数据框就只有2行1列，一共就2个单元格，去掉第一行，其实也就是只剩下一个单元格的元素了；其次[] 这个符号，它其实也是一个函数，存在于base包中，它有一个默认参数drop = TRUE...如果剩下的内容是字符串，那么就直接返回字符串；如果剩下的还是一个数据框，那么就返回数据框）这个函数其实也可以看帮助文档，只要在这种特殊符号的函数两边加上引号即可：?"...[" 【至于我是怎么知道的，因为我有个花花，她说她看了好几本R语言的书里面有提到】最后的那个dplyr::slice ，当然就是将参数默认调整成了：drop = TRUE ，所以会返回数据框，而没有对数据进行降级

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R中的数据结构(Array,Factor,List,DataFrame)

1、R中的数据结构-Array #一维数组 x1 <- 1:5; x2 <- c(1,3,5,7,9) x3 <- array(c(2, 4, 6, 8, 10)) #多维数组 xs R中的数据结构-Factor Factor因子因子用来存储类别变量和有序变量，这类变量不能用来计算，只能用来分类或者计数。...一个List就像是一个JSON，一个包含很多键值对的数据结构。...，删除之后，它后面的位置索引都自动减一 j$sex <- NULL; j #四、检索 j=='Joe' #五、查看长度 length(j) 4、R中的数据结构-DataFrame 数据框用于存储多行和多列的数据集合...可以把数据框理解为excel中的列。 ?

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做数据分析必须学R的4个理由

R 已证明自己是不断成长的大数据领域的一个有用工具，并且已集成到多个商用包中，比如 IBM SPSS® 和 InfoSphere®，以及 Mathematica。...备注：本文不是一部 R 教程。下面的示例仅试图让您了解 R 会话看起来是什么样的。 R 二进制文件可用于 Windows、Mac OS X 和多个 Linux® 发行版。源代码也可供人们自行编译。...R 工作区在提示符下键入一个命令，R 就会响应。此时，在真实的环境中，您可能会从一个外部数据文件将数据读入 R 对象中。...的多个重要功能：保存结果—boxplot() 函数返回一些有用的统计数据和一个图表，您可以通过类似 michelson.bp = … 的负值语句将这些结果保存到一个 R 对象中，并在需要时提取它们。...在 R 中输入数据的最简单方式是，将数据输入到其他地方，然后将它导入到 R 中。人们已经努力地为 R 添加了一个电子表格前端，但它们还没流行起来。

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做数据分析必须学R的4个理由

R 已证明自己是不断成长的大数据领域的一个有用工具，并且已集成到多个商用包中，比如 IBM SPSS® 和 InfoSphere®，以及 Mathematica。...备注：本文不是一部 R 教程。下面的示例仅试图让您了解 R 会话看起来是什么样的。 R 二进制文件可用于 Windows、Mac OS X 和多个 Linux® 发行版。源代码也可供人们自行编译。...R 工作区在提示符下键入一个命令，R 就会响应。此时，在真实的环境中，您可能会从一个外部数据文件将数据读入 R 对象中。...的多个重要功能：保存结果—boxplot() 函数返回一些有用的统计数据和一个图表，您可以通过类似 michelson.bp = … 的负值语句将这些结果保存到一个 R 对象中，并在需要时提取它们。...在 R 中输入数据的最简单方式是，将数据输入到其他地方，然后将它导入到 R 中。人们已经努力地为 R 添加了一个电子表格前端，但它们还没流行起来。

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【大数据问答】R语言如何导入其他统计软件中的数据？

R语言如何导入其他统计软件中的数据？ R导入SAS数据集可以使用 foreign 包中的 read.ssd() 和 Hmisc 包中的 sas.get() 。...在SAS中使用 PROC EXPORT 将SAS数据集保存为一个逗号分隔的文本文件，使用从.csv格式的文件中导入数据，使用read.csv()函数或者read.table()函数。...或者一款名为Stat/Transfer的商业软件将SAS数据集为R数据框。...R导入SPSS数据集可以通过 foreign 包中的 read.spss()函数或者Hmisc 包中的 spss.get() 函数。...导入Stata数据集可以通过foreign包中的read.dta()函数。【温馨提示】foreign包和Hmisc包都是的R的扩展包，因此在使用之前，若是没有安装，需要先安装。

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【Cocos2d-x游戏开发】Cocos2d-x中的数据存储技术

其中大部分的存储功能被封装到了UserDefault类中。二、数据存储 1.UserDefault类 UserDefault 是一个小型的数据管理类。...你可以通过这个类保存并获得基本类型值的数据。例如：setBoolForKey("played", true) 将在数据库中添加一个值为 true 的布尔型数据。它的 key 是 "player"。...Cocos2d-x中文件读写的方式和C++对文件的操作是一样的，先创建一个文件指针指向一个文件，然后打开这个文件，接着写入数据，最后关闭文件。...fopen:打开一个文件，可以根据参数的不同来决定文件的打开方式（比如 r,w,a等等）。　　fseek:移动文件指针，可以将指针指向文件中特定位置的字符。　　...其实在Cocos2d-x中还有利用比如csv,json等保存数据的方法，但由于篇幅限制，本篇博客中我们就不再探讨了，以后的博客中会详细的介绍json和csv的操作。

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Day5——R中的数据类型及结构

逗号的生信旅程D5_R中的数据今天继续学习了R*******今天主要学习了R中的数据类型和数据结构，其中向量和数据框是两种最常用的数据结构，也是今天的重点学习对象。...**************请在作业中回答一个问题：save(a,file="test.RData")这句代码如果报错object a not found，是为什么，应该怎么解决？...那我把a删掉试试rm(a)再次重新运行save(a,file="test.RData")好了目标对象a不存在了~所以报错的原因是：代码中不存在a这个对象那怎么解决呢？...看一下自己的代码中是否存在a这个变量名，会发现果然没有，那仍需要保存这个变量的话，就需要把这行代码中的a改成你要保存的变量某某某，如果不需要保存的话就说明这是一句废话，删掉这一句就好啦********还有还有...，看群消息发现c不适合作为变量名，因为他是个创建向量的函数呀，所以R语言博大精深，要边学边悟呀！

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提升R语言的数据可视化效果的五个范例

R语言可用来做任何事，从简化数百万的GPS数据，到制作泡泡图或简单绘制大量直线。...在R语言中，我利用绝妙的ggplot2包中的geom_segment()命令，绘制起讫点重心间纤细透明的白色线条。...在这个例子中，R语言输出图片后，无需做太多工作，只是增加了泰晤士河、一些标签，然后优化了印刷颜色。这张地图中描绘出了几十万条线段，这也是R语言绘制海量数据能力的极佳例证。...我们坚持使用输出时地图的颜色，然后手动编辑水流图的颜色。水流图是利用ggplot2包中的geom_ribbon()功能制作的。目前为止展示的所有图片都是从数据开始的，最少也有数千行数据。...最后这张图片，我们展示一个小型数据的例子—获得蓝色牌匾的100位伦敦人。手动编辑每个人的数据，每个人的名字包含3个属性：他们活着的年龄、他们创作最重要作品的年龄、他们一生中生活在伦敦的时期。

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做数据分析必须学R语言的4个理由

R 已证明自己是不断成长的大数据领域的一个有用工具，并且已集成到多个商用包中，比如 IBM SPSS® 和 InfoSphere®，以及 Mathematica。...备注：本文不是一部 R 教程。下面的示例仅试图让您了解 R 会话看起来是什么样的。 R 二进制文件可用于 Windows、Mac OS X 和多个 Linux® 发行版。源代码也可供人们自行编译。...R 工作区在提示符下键入一个命令，R 就会响应。此时，在真实的环境中，您可能会从一个外部数据文件将数据读入 R 对象中。...R 的不足之处公平地讲，R 也有一些事做不好或完全不会做。不是每个用户都适合使用 R： R 不是一个数据仓库。在 R 中输入数据的最简单方式是，将数据输入到其他地方，然后将它导入到 R 中。...人们已经努力地为 R 添加了一个电子表格前端，但它们还没流行起来。电子表格功能的缺乏不仅会影响数据输入，还会让以直观的方式检查 R 中的数据变得很困难，就像在 SPSS 或 Excel 中一样。

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2021-09-11：给你一个32位的有符号整数x，返回将x中的数

2021-09-11：给你一个32位的有符号整数x，返回将x中的数字部分反转后的结果。反转后整数超过 32 位的有符号整数的范围就返回0，假设环境不允许存储 64 位整数（有符号或无符号）。...func main() { i := math.MinInt64 ret := reverse(i) fmt.Println(i) fmt.Println(ret) } func reverse(x...int) int { neg := ((uint(x) >> 63) & 1) == 1 x = twoSelectOne(neg, x, -x) m := math.MinInt64 / 10...o := math.MinInt64 % 10 res := 0 for x !...= 0 { if res x%10 < o) { return 0 } res = res*10 + x%10 x /= 10 } return

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独家 | 一文读懂R中的探索性数据分析（附R代码）

本文将通过介绍一个代码模板的四个基本步骤，来帮助您完成数据分析的初期探索。探索性数据分析（EDA）是数据项目的第一步。我们将创建一个代码模板来实现这一功能。...在这篇文章中，我们将回顾一些我们在案例分析中使用的功能：第1步：取得并了解数据；第2步：分析分类变量；第3步：分析数值变量；第4步：同时分析数值和分类变量。...基本EDA中的一些关键点：数据类型异常值缺失值数值和分类变量的分布（数字和图形的形式）分析结果的类型结果有两种类型：信息型或操作型。...，因此很容易筛选出符合某些条件的变量，例如：有至少80％的非空值（p_na < 20）有少于50个唯一值（unique <= 50）建议：所有变量都是正确的数据类型吗？...将图表以jpeg格式保存到当前目录中： freq(data, path_out = ".") 分类变量的所有类别都有意义吗？有很多缺失值吗？经常检查绝对值和相对值。

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【R语言】根据映射关系来替换数据框中的内容

前面给大家介绍过☞R中的替换函数gsub，还给大家举了一个临床样本分类的具体例子。今天我们接着来分享一下如何根据已有的映射关系来对数据框中的数据进行替换。...例如将数据框中的转录本ID转换成基因名字。我们直接结合这个具体的例子来进行分享。...假设我们手上有这个一个转录本ID和基因名字之间的对应关系，第一列是转录本ID，第二列是基因名字然后我们手上还有一个这样的bed文件，里面是对应的5个基因的CDs区域在基因组上的坐标信息。...首先我们做准备工作，读入这两个文件，会用到前面讲过的☞正则表达式 #读入转录本和基因名之间的映射关系 mapping=read.table("id_mapping.txt",sep="\t",row.names...参考资料： ☞R中的替换函数gsub ☞正则表达式 ☞使用R获取DNA的反向互补序列

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