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odd ratio值在关联分析中的含义

在GWAS分析中,利用卡方检验,费舍尔精确检等方法,通过判断p值是否显著,我们可以分析snp位点与疾病之间是否存在关联,然而这得到的仅仅是一个定性的结论,如果存在关联,其关联性究竟有多强呢?...在关联分析中的”相关系数”则对应两个常用的统计量, risk ratio和odd ratio。...如果RR = 1, 两组发病率相等,说明暴露因素和发病率没有关联。 值得一提的是,在计算过程中使用了抽样数据的频率来代表发病的概率,这个只有当抽样数目非常大才适用, 所以RR值适用于大规模的队列样本。...对于罕见疾病,患病的个体数量远小于正常组的数量,出于这样的考虑,将上述模型做一个简化处理,a + b 的值用b里表示,c + d的值有d 来表示,因为a远小于b, c远小于d, 几乎可以忽略不计,此时上述公式就变成了...从上述转换可以看出来,OR其实是RR的一个估计值,其含义和RR值相同。 通过OR值来定量描述关联性的大小, 使得我们可以直观比较不同因素和疾病之间关联性的强弱,有助于筛选强关联的因素。 ·end·

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    arcengine+c# 修改存储在文件地理数据库中的ITable类型的表格中的某一列数据,逐行修改。更新属性表、修改属性表某列的值。

    作为一只菜鸟,研究了一个上午+一个下午,才把属性表的更新修改搞了出来,记录一下: 我的需求是: 已经在文件地理数据库中存放了一个ITable类型的表(不是要素类FeatureClass),注意不是要素类...FeatureClass的属性表,而是单独的一个ITable类型的表格,现在要读取其中的某一列,并统一修改这一列的值。...表在ArcCatalog中打开目录如下图所示: ? ?...string strValue = row.get_Value(fieldindex).ToString();//获取每一行当前要修改的属性值 string newValue...= "X";//新值,可以根据需求更改,比如字符串部分拼接等。

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    矩阵特征值分解(EDV)与奇异值分解(SVD)在机器学习中的应用

    文章目录 说明 特征分解定义 奇异值分解 在机器学习中的应用 参考资料 百度百科词条:特征分解,矩阵特征值,奇异值分解,PCA技术 https://zhuanlan.zhihu.com/p/29846048...https://towardsdatascience.com/all-you-need-to-know-about-pca-technique-in-machine-learning-443b0c2be9a1...说明 在机器学习的各种算法与应用中,常能看到矩阵特征值分解(EDV)与奇异值分解(SVD)的身影,因此想反过来总结一下EDV与SVD在机器学习中的应用,主要是表格化数据建模以及nlp和cv领域。...什么是特征值,特征向量? 设A是n阶方阵,如果数λ和n维非零列向量x使关系式Ax=λx成立,那么这样的数λ称为矩阵A特征值,非零向量x称为A的对应于特征值λ的特征向量。...假设我们的矩阵A是一个m×n的矩阵,那么我们定义矩阵A的SVD为: 在机器学习中的应用 在表格化数据中的应用 (1)PCA降维 PCA(principal components analysis

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    (数据科学学习手札58)在R中处理有缺失值数据的高级方法

    一、简介   在实际工作中,遇到数据中带有缺失值是非常常见的现象,简单粗暴的做法如直接删除包含缺失值的记录、删除缺失值比例过大的变量、用0填充缺失值等,但这些做法会很大程度上影响原始数据的分布或者浪费来之不易的数据信息...,因此怎样妥当地处理缺失值是一个持续活跃的领域,贡献出众多巧妙的方法,在不浪费信息和不破坏原始数据分布上试图寻得一个平衡点,在R中用于处理缺失值的包有很多,本文将对最为广泛被使用的mice和VIM包中常用的功能进行介绍...如上图所示,通过marginplot传入二维数据框,这里选择airquality中包含缺失值的前两列变量,其中左侧对应变量Solar.R的红色箱线图代表与Ozone缺失值对应的Solar.R未缺失数据的分布情况...3、自编函数计算各个变量缺失比例   为了计算出每一列变量具体的缺失值比例,可以自编一个简单的函数来实现该功能: > #查看数据集中每一列的缺失比例 > miss.prop 唯一的矩阵就是插补的结果; method: 这个参数控制了传入数据框中每一个变量对应的插补方式,无缺失值的变量对应的为空字符串,带有缺失值的变量默认方法为"pmm",即均值插补 predictorMatrix

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    【C 语言】指针间接赋值 ( 直接修改 和 间接修改 指针变量 的值 | 在函数中 间接修改 指针变量 的值 | 在函数中 间接修改 外部变量 的原理 )

    文章目录 一、直接修改 和 间接修改 指针变量 的值 二、在函数中 间接修改 指针变量 的值 三、在函数中 间接修改 外部变量 的原理 一、直接修改 和 间接修改 指针变量 的值 ---- 直接修改 指针变量...// 打印一级指针地址 printf("%d\n", p); // 命令行不要退出 system("pause"); return 0; } 执行结果 : 二、在函数中...间接修改 指针变量 的值 ---- 在 函数 中 间接修改 指针变量 的值 , 将 指向一级指针 的 二级指针 变量 , 传递到 函数形参 中 , 在 函数中 , 使用 * 符号 , 修改 二级指针...p2 = &p; // 间接修改指针的值 *p2 = 12345678; // 打印一级指针地址 printf("%d\n", p); // 在函数中 ,...三、在函数中 间接修改 外部变量 的原理 ---- 如果要 修改 一级指针 的值 , 必须 传入 指向 一级指针 的 二级指针 变量 才可以 , 传入一级指针变量 , 不能修改一级指针变量值 ; 这是因为

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    SQL聚合函数 %DLIST

    通常是所选表中列的名称。 %FOREACH(col-list) - 可选-列名或以逗号分隔的列名列表。 %AFTERHAVING - 可选-应用在HAVING子句中的条件。...NULL不作为元素包含在%List结构中。 %DLIST(DISTINCT BY(col2) col1)返回一个元素的%List,其中只包含那些col1字段值在col2值不同(唯一)的记录中。...请注意,在ODBC模式下,%DLIST用逗号分隔列值列表,而$LISTTOSTRING(默认情况下)返回%List列值中用逗号分隔的元素。...XMLAGG返回一个串接的值字符串。 示例 下面的嵌入式SQL示例返回一个主机变量,该变量包含示例的Home_State列中列出的所有值的IRIS列表。...下面的嵌入式SQL示例返回一个主机变量,该变量包含示例的Home_State列中列出的所有不同(唯一)值的IRIS列表。

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    基础篇:数据库 SQL 入门教程

    SQL 高级言语学习 LIKE – 查找类似值 LIKE 操作符用于在 WHERE 子句中搜索列中的指定模式。...JOIN – 多表关联 JOIN 用于根据两个或多个表中的列之间的关系,从这些表中查询数据。 有时为了得到完整的结果,我们需要从两个或更多的表中获取结果。我们就需要执行 join。...数据库中的表可通过键将彼此联系起来。主键(Primary Key)是一个列,在这个列中的每一行的值都是唯一的。在表中,每个主键的值都是唯一的。...语法: select 列名 from 表A INNER|LEFT|RIGHT|FULL JOIN 表B ON 表A主键列 = 表B外键列; 不同的 SQL JOIN: 下面列出了您可以使用的 JOIN...实例: select max(orderno) from orders; MIN – 最小值 MIN 函数返回一列中的最小值。NULL 值不包括在计算中。

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    ❤️ 爆肝3天!两万字图文 SQL 零基础入门,不怕你学不会,就怕你不收藏!❤️

    SQL 高级言语学习 ???? LIKE – 查找类似值 LIKE 操作符用于在 WHERE 子句中搜索列中的指定模式。...有时为了得到完整的结果,我们需要从两个或更多的表中获取结果。我们就需要执行 join。 数据库中的表可通过键将彼此联系起来。主键(Primary Key)是一个列,在这个列中的每一行的值都是唯一的。...在表中,每个主键的值都是唯一的。这样做的目的是在不重复每个表中的所有数据的情况下,把表间的数据交叉捆绑在一起。 如图,“Id_P” 列是 Persons 表中的的主键。...MAX – 最大值 MAX 函数返回一列中的最大值。NULL 值不包括在计算中。...MIN – 最小值 MIN 函数返回一列中的最小值。NULL 值不包括在计算中。

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    测试新手百科:黑盒测试用例的设计(图文并茂,非常详细!)

    非(NOT):若a为1,则b为0;否则b为1。 或(OR):若a或b或c为1,则d为1;否则d为0。 与(AND):若a和b和c都为1,则d为1;否则d为0。...2)因果图的约束条件 1、对于输入条件的约束有E、I、O、R四种: 异(E):E必须总为真,而a、b最多只有一个为1。 或(I):I为真时,a、b和c中至少有一个必须为1。...唯一(O):a、b中,有且仅有一个必须为1。 要求 (R):如果a为1,b也必须为1。 2、对于输出结果的约束只有M一种: 屏蔽(M):如果结果a为0,则b强制为0。...一、假设有一规格说明: “第一列中的字符必须是‘A’或‘B’,第二列中的字符必须是一个数字。在这种情况下,对文件进行更新。如果第一个字符不正确,产生提示信息X12。...3.在判定表中为每个“因”的组合生成一列。例:(列3)和(列4)。 4.对于每种“因”的组合,判断所有其他“果”的状态,并放置在对应的每一列中。例:已得在001,000两种组合下结点71的结果为1。

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    MySQL(七)联结表

    一、联结表基础知识 1、关系表 把信息分解成多个表,一类数据一个表,各表通过某些常用值(即关系设计中的关系(relational))互相关联; 2、外键(foreign key):外键为某个表中的一列,..., B_name; 该SQL语句中,select语句指定要检索的列(因为是创建关联,所以指定了3个列,区别在于A_name在A表中,B_name和B_mobile在另一个表);from语句列出了2个表分别是...子句,在这里on等同于where) 3、联结多个表 SQL对一条select语句中可以联结的表的数目没有限制,创建规则也基本相同(首先列出所有表,然后定义表之间的关系) PS:MySQL在运行时关联指定的每个表以处理联结...语句中明确使用p1前缀给出所需列名,否则MySQL将返回错误,因为其无法正确区分想要的具体为哪一列; 3、自然联结 无论何时对表进行联结,应至少有一个列出现在不止一个表中(被联结的列);标准的联结返回所有数据...一般使用select *通配符,对其他表的列使用明确的自己来完成,通配符只对第一个表使用,所有其他列明确列出。 4、外部联结 用来检索包含了在相关表中没有关联行的行,这种类型的联结称为外部联结。

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    学习SQLite之路(三)

    DEFAULT 约束:当某列没有指定值时,为该列提供默认值。 UNIQUE 约束:确保某列中的所有值是不同的。 PRIMARY Key 约束:唯一标识数据库表中的各行/记录。...CHECK 约束:CHECK 约束确保某列中的所有值满足一定条件 (2)primary key约束:  PRIMARY KEY 约束唯一标识数据库表中的每个记录。   ...在一个表中可以有多个 UNIQUE 列,但只能有一个主键。   在设计数据库表时,主键是很重要的。主键是唯一的 ID。   ...在 SQLite 中,主键可以是 NULL,这是与其他数据库不同的地方。   主键是表中的一个字段,唯一标识数据库表中的各行/记录。主键必须包含唯一值。主键列不能有 NULL 值。   ...唯一索引不允许任何重复的值插入到表中。

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    如何使用Fluent Nhibernate中的Automapping进行OR Mapping映射

    更多的修改意味着更多的风险,为了减少这方面的风险,同时为了减少配置的工作量,所以在最新的项目中采用了Fluent NHibernate中的Automapping。...(比如CostCenter中有public virtual long Id{get;set;},对应表中的列COST_CENTER_ID) 对于一对多的关系,使用父方的类名作为属性名,表中使用父表的主键列名作为对应的外键列的列名...virtual Class Class{get;set;}) 对于SubClass,采用将多个子对象都存在同一个表中的方式实现,使用“TYPE”列作为DiscriminatorColumn,使用之类的类名作为子类的唯一标识...TYPE的列 } } 然后就是关于DiscriminateColumn中的值如何映射成对应的Subclass,需要实现ISubclassConvention接口,代码如下: public class...{ var r = System.String.CompareOrdinal(a, b); if (r > 0)

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    SQL聚合函数 XMLAGG

    以下两个示例都返回相同的单个值,即Sample.Person表的Home_State列中列出的所有值的串联字符串。...XMLAGG(DISTINCT BY(Col2)col1)返回一个串联字符串,该字符串仅包含col2值不同(唯一)的记录中的col1字段值。...XMLAGG和ORDER BY XMLAGG函数将来自多行的表列的值连接到单个字符串中。因为在计算所有聚合字段之后,将逐个从句应用于查询结果集,所以逐个不能直接影响该字符串中的值序列。...在某些情况下,XMLAGG结果可能会按顺序显示,但不应依赖此排序。给定聚合结果值中列出的值无法显式排序。 相关聚合函数 XMLAGG返回一个串连的值字符串。 LIST返回值的逗号分隔列表。...请注意,虽然有些行的FavoriteColors为空值,但该值不包括在连接的字符串中。数据值以内部格式返回。

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    数据科学家需要掌握的几大命令行骚操作

    学习shell中的来龙去脉无可否认地会让你更高效。除此之外,命令行还在计算方面有一次伟大的历史记录。例如,awk - 一种数据驱动的脚本语言。...Awk首次出现于1977年,它是在传奇的K&R一书中的K,Brian Kernighan的帮助下出现的。在今天,大约50年之后,awk仍然与每年出现的新书保持相关联!...有用的选项: sort -f 忽略大小写 sort -r 逆序 sort -R 乱序 uniq -c 计算出现次数 uniq -d 只打印重复行 CUT命令 cut用于删除列。...”的第1列和第3列的前10行 head filename.csv | grep "some_string_value" | cut -d, -f 1,3 找出第二列中唯一值的数量。...# 同样的功能,但是按照文件名列出当前目录下所有包含该关键词的文件 grep -c 'some_value' * Grep使用or运算符- |来检索多个值. grep "first_value|second_value

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    (4) MySQL中EXPLAIN执行计划分析

    所以id全为1,因此,我们就要按照由上至下读取执行计划 按照我们的SQL语句,我们会认为执行顺序是a,b,c,但是通过上图可以发现,Mysql并不是完成按照SQL中所写的顺序来进行表的关联操作的 执行对表的执行顺序为...a,c,b,这是由于MySQL优化器会根据表中的索引的统计信息来调整表关联的实际顺序 2....eq_ref 唯一索引或主键索引查询,对应每个索引键,表中只有一条记录与之匹配 ref 非唯一索引查找,返回匹配某个单独值的所有行 ref_or_null 类似于ref类型的查询,但是附加了对NULL...KEY_LEN列 显示MySQL索引所使用的字节数,在联合索引中如果有3列,假如3列字段总长度为100个字节,Key_len显示的可能会小于100字节,比如30字节,这就说明在查询过程中没有使用到联合索引的所有列...Ref列 表示当前表在利用Key列记录中的索引进行查询时所用到的列或常量 11. rows列 表示MySQL通过索引的统计信息,估算出来的所需读取的行数(关联查询时,显示的是每次嵌套查询时所需要的行数)

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    问与答127:如何列出并统计列表中的唯一值?

    Q:在一列中包含有很多数据,我想使用公式来列出并统计其唯一值,我不想使用数据透视表,下图1所示为示例数据。 ? 图1 使用公式,在列C中列出其唯一值,列D中列出这些值相应出现的数量。...),0) 其中,使用: COUNTIF(C1:C1,A2:A25) 计算第二个区域A2:A25中,每个单元格中的值在第一个区域中出现的次数,要么是1(表明出现了),要么是0(表明没有出现,即没有这个值)...,而这正是我们查找的唯一值。...然后,使用MATCH执行精确匹配查找,所得到的位置也就是该值在区域A2:A25中的位置。再将结果传递给INDEX函数,从而获取值。...在单元格D2中输入公式: =COUNTIF(A2:A25,C2) 统计获取的唯一值在原列表中出现的次数,如下图3所示。 ? 图3 最后,向下复制公式得到最终结果,如下图4所示。 ?

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    C#二十七 Dataset和DataAdapter

    DataSet是ADO.NET中最核心的成员之一,是各种基于.NET平台程序语言(如VB.NET、C#.NET、C++.NET)的数据库应用程序开发最常接触的类,这是因为DataSet在ADO.NET实现从数据库中抽取数据的作用...,true表示设置该列只读,默认为非只读 Table 该列所属的DataTable Unique 设置列的每一行中的值是否必须是唯一的,如果为true表示该列值不能重复,也就是唯一,默认是非唯一 ​4.3...DataView用来在观察数据时提供排序和过滤的功能。DataColumn用来对表中的数据值进行一定的规限。比如哪一列数据的默认值是什么、哪一列数据值的范围是什么、哪个是主键、数据值是否是只读等。...[0]; r["psnSex"]= "女"; //按列名修改该行的值 r[0]=""; //按列索引修改行,这里是修改该行的第一列数据 查: 获得某个表的某一行使用表的索引器,获得行的某一列值使用行的索引器...{ foreach(DataColumn c in dtPerson.Columns) Console.WriteLine("{0}",r[c.ColumnName]); } ​

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    linux 的一些脑洞操作

    test.csv 实现DNA序列反向互补 cat seq.txt | sed 'y/ATGC/TACG/' |rev 某一行插入另外一个文件的内容 sed '2 r a.txt' test.csv 对一个文件按照第一列进行筛选...test.csv #将第一个文件第一列的值存入关联数组,并给值为1,如果第二个文件建立的关联数组对应值为1,说明在第一个文件第一列出现过,则输出整行 对文件第二列和第三列进行展开 展开前四列 ?...旧结束位置)取出关联数组的值(ampl1,ampl2...)...,将关联数组的值作为关联数组下标新创建关联数组Ampl,将第二个文件的值(1,2,3,4,5列,其中4、5列是我们要的信息)用sprintf生成字符串存入Ampl,第三文件按照第四列(ampl1,ampl2...,用split切割sprintf生成的字符串,取出第二个文件存入的值(这里只取出了需要的4,5列,123列的值输出第三个文件的123列(新染色体,新起始位置,新结束位置)的值)。

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