install_version(): require(devtools) install_version(“ggplot2”, version = “2.0.0”, repos = “https://cran.r-project.org.../src/contrib/Archive/ggplot2/”) 除此之外,还可以直接从源代码安装: packageurl <- "https://cran.r-project.org/src/contrib...现在打算不定期更新记录一些笔记,公众号也会将简书的内容整理一下发布~
在R包版本依赖有误、新版R包存在bug或者新版R包函数重大更新导致自己代码报错等情况下,一个可选的解决方案是安装特定的旧版本的R包来解决。...R包的两大分发位置是CRAN和bioconductor,CRAN的R包是本文讨论的重点,bioconductor包的版本依赖比较严格,因此本文暂不分析bioconductor包的旧版本安装。...如何寻找旧版本的CRAN R包 CRAN是The Comprehensive R Archive Network,它是分发各版本R及R包的地方。...R包,也是最好安装的R包,不像R包的源码安装往往会出现编译错误; macOS binaries: 同上,mac平台的二进制R包; Old sources: 旧版本R包的源码。...如下图所示就是ROCR包的旧版本源码的位置。 便捷寻找CRAN R包 除了一步一步的按照上述步骤寻找R包主页,一个更方便的方式是: 方法1:搜索引擎直接搜索CRAN+包名即可,一般第一个就是。
2、作用:实现特定的功能,你需要什么功能,安装相应的R包就行。说人话就是使用智能手机,需要使用微信与人聊天,你就按照微信APP,需要上腾讯视频看电视剧,你就安装腾讯视频APP。...R包,使用 “BiocManager::install()来安装 (3)github网站,是R包作者写的,没有经过审核,使用”devtools::install_github...几乎不使用,使用时需要写明R包的作者,就是指明选择谁写的R包。...说人话,智能手机安装的腾讯视频,只要你不卸载,就一直在你的手机里,需要看电视剧是打开APP,看完电视了你退出APP,再次看电视时还需要再次打开APP。所有“加载”R包就相当于打开APP。...5、如何实现快速下载 如果官网速度慢,请使用镜像网站 图片 图片 官方网站CRAN网站的镜像使用方法1,Bioconductor网站的镜像使用方法2,方法2也适用CRAN 三、安装R包会遇到问题
方案 如果你正在使用支持 R 的图形界面软件,应该存在通过菜单栏方式安装 R 包的选项(例如,常用的 Rstudio 中,可以点击菜单栏 Tools 中的 Install Packages… 进行 R...其他 导入包也可以使用require()函数。下表显示了 R 包安装相关的命令及描述。...,显示所有已安装的包中具有新版本的包 new.packages 返回一个矩阵,包含所有已安装的新包 download.packages 下载一系列R包到本地目录 install.packages 从资源库下载安装一系列...R包 remove.packages 移除一系列已安装的R包 installed.packages 将已经安装的R包更新到最新版本 setRepositories 设定当前的R包的资源库列表 通过命令行安装...R 包 R CMD INSTALL aplpack_1.1.1.tgz # 安装aplpack包 从其他资源库安装 R 包 devtools 包提供了从其他流行的 Git 资源库或其他 URL 上安装
R语言是一个强大的数据分析工具,其强大之处在于有各种各样的R包帮助其实现各种各样的功能。...通常来说,R包的安装主要有四种方法,包括:1)从R语言官网上直接下载相关R包并安装;2)从Bioconductor上下载R包并安装;3)从Github上下载R包并安装;4)手动安装R包。...接下来我将和大家分享R包的具体安装: 1)首先获取下载的R包的名字,比如下载metafor这个R包,可以先在官网(https://www.r-project.org/)上找到这个包,了解一下这个包的详细内容和使用说明...3)接下来便是安装源自Github(https://github.com/)的R包了,它的步骤和安装源自Bioconductor的R包类似,需要先安装devtools包,然后用devtools包里的install_github...,github中的R包需要在其前面加上该包所在的库名,否则无法进行下载安装。
安装R语言的包的方法: 1....自动安装(在线安装) 在R的控制台,输入 install.packages("gridExtra") # 安装 gridExtra install.packages("stepNorm", contriburl...手动安装(离线安装) Windows: 下载package.zip文件 打开R的菜单栏->Packages->“Install package from local zip file…” 选择package.zip...文件 Linux上安装R包(离线安装): 下载package.tar.gz文件 在Shell终端(注意不是R)输入: sudo R CMD INSTALL package.tar.gz 注意:需要sudo...查看全部安装的R包: .packages(all.available=T) 查看某个安装的R包: library("XML") help(package="XML")
r语言的包中,集成了众多函数,大大扩展了r的功能且降低了使用难度。本篇文章就来介绍r语言中包的两种安装方式:install.packages和从github安装包。...install.packages() install.packages()是从镜像安装包,在括号中输入包的名称字符串就可以完成包的安装。...语句中的 AnomalyDetection为包名,twitter为仓库名。很明显,安装包时还需要知道仓库名,为我们带来了不便。...本方法的缺点在于,因为要进行搜索,所以运行耗时较长。 除上述方法,通过本地安装包也是常用的方法之一。...但实际操作中,经常会遇到要安装一个包要先安装很多包的情形,因此本地安装方法有时可操作性较差,因此不在这里详细介绍。
关于R和RStudio安装在这里就不再介绍了,网上有很多相关内容,如果安装过程有困难可以后台私信我。 PS.本次内容为R包安装及初识向量。 ? PART2 R包安装 问:什么是R包?...答:包是R函数、数据、预编译代码以一种定义完善的格式组成的集合。它们提供了种类繁多的默认函数和数据集。...(对于刚接触R的同学来说可能看起来比较抽象,但是没关系,我们会在后续的学习中慢慢了解R包的概念) 1.R包安装:第一次安装一个包,使用命令install.packages()即可。...#示例:安装ggplot2包 install.packages('ggplot2') install.packages("ggplot2") 值得注意的一点是,包的名称需要放在单引号''或者双引号""...中 2.R包载入:安装完成后,想要调用这个包中的命令、数据等信息,就需要先载入这个包,需要用到的命令为library()。
说实话,自从之前好好学习了一下入门的R以后,一直没有用过R,很多东西都忘了,还是需要靠做笔记方便日后查阅。 本期讲一下R包的几种来源以及安装指定版本R包的几种方法。 R包来源及安装方法 1....CRAN网站 可以理解为R包的官网,凡是需要通过CRAN下载的R包,都可以通过install.packages("pkg_name")来安装。 2....Bioconductor 里面多是跟生信相关的R包,通过BiocManager::install("pkg_name")来安装。 3....安装指定版本R包 复现文章或R包的更新与当前的R版本或R代码不兼容时,就需要考虑安装某个特定版本的R包了,这里列一些常见的安装指定版本R包的方法供大家参考。...源码安装 在这里也许能找到你需要的R包历史版本。
自杀式R包 只能安装成功一次,再次重复安装就会报错。 R包的依赖处理非常奇怪,随着安装R包的数量变多,有较大概率会遇到R包依赖崩溃的情况。...如果是在Windows平台下,那么应该首先检查R包安装路径是否有问题(使用.libPaths()函数查看),尽量不要安装到".RLibrary"之类的无版本依赖的文件夹中。...而如果是linux平台下或者包安装路径并没有“.RLibrary”之类的文件夹, 那么注意R包的安装或者载入过程中是否出现如下warnning或error: Error in completeSublasses...如果大家搜索过这个错误会发现遇到这个问题的人还挺多的,而且看起来他们的解决方案相对是没有切合问题本质或者是比较偶发的解决方案:如重新安装一个R包,修改R包的载入顺序等等。...Suggests依赖项的包可以缺失,而Depends和Imports中的依赖项是需要先于当前包安装的。当前包载入后,所有Depends中的R包也会被载入。
简介 平常在各种R语言群里,总会遇到关于安装R包的问题,例如:搭载在github上的R包,由于网速(外网)原因而无法下载该怎么办?...这里小编分享下平常逼不得已才使用的“下三滥”方法——直接下载包,通过本地安装。 网上好多解决方案都是基于R gui的,但现实中使用Rstudio这个IDE会更多些。...接下来以gmm包在Rstudio下安装为例: 教程 使用bing搜索该包,找到相应网站[1]。 关键词:R包名称+R,或者可以再加上CRAN。 ?...搜索技巧:R包名称+R 找到Downloads板块,下载对应的压缩包 这里以mac为例 ?...这个方法对一些有很多依赖包的包可能会很头疼,就怕安装完成,他还说你有其他包没安装,那你只能“将错就错”了!
一般来说就是Windows电脑的中文用户名需要修改电脑系统的环境变量,R包下载等等。...但是今天有一个学员起初是下载R包无法联网,所以失败,根据我们的经验当然是options(download.file.method = 'libcurl')就轻轻松松解决啦,不过这次居然是仅仅是解决了R自带...R包下载问题,使用BiocManager仍然是无法安装R包,如下所示: ?...='libcurl') 果然,现在在Windows电脑里面R语言的安装R包和下载文件就OK啦。...接下来就继续安装R包吧 使用管理员打开R哦,然后就 options()$repos options()$BioC_mirror options(BioC_mirror="https://mirrors.ustc.edu.cn
tidyverse安装失败,install.packages('tidyverse') 错误原因大概是其中有个依赖包xml2安装不上,解决办法是yum install libxml2-devel,这样就可以安装...xml2了,也可以安装tidyverse了
说实话,自从之前好好学习了一下入门的R以后,一直没有用过R,很多东西都忘了,还是需要靠做笔记方便日后查阅。 本期讲一下R包的几种来源以及安装指定版本R包的几种方法。 R包的来源 1....CRAN网站 可以理解为R包的官网,凡是需要通过CRAN下载的R包,都可以通过install.packages("包名")来安装 2....Bioconductor 里面多是跟生信相关的R包,通过BiocManager::install("包名")来安装,今天的例子edgeR和limma都可以通过这种方法安装。 3....安装指定版本R包 复现文章或R包的更新与当前的R版本或R代码不兼容时,就需要考虑安装某个特定版本的R包了,这里列一些常见的安装指定版本R包的方法供大家参考。...源码安装 在这里也许能找到你需要的R包历史版本 https://cran.r-project.org/src/contrib/Archive/ packageurl <- "https://cran.r-project.org
事实证明,包还是非常难安装的,一边安装,一边想着,一些收费的软件是有原因的…… 目录: 1. ggplot2包安装报错 2,安装rlange1.0.0 3. 安装Rtools3.6 4....测试成功安装ggplot2 现在最新的R版本是4.2.1,因为有些包只能运行在3.6版本中,因此我需要安装3.6,这里安装常用的ggplot2时报错了,总结一下问题解决的方法。...2,安装rlange1.0.0 如果现在网上搜索R包的地址,包括其不同的版本,可以键入: https://cran.r-project.org/src/contrib/Archive/ 如果知道包的名称...,比如ggplot2,键入: https://cran.r-project.org/src/contrib/Archive/ggplot2 可以看到,旧版本的ggplot2,下载到本地,然后安装就可以了...这种方法可以推广到R3.5,R4.0,R4.1,windows系统安装Rtools就是为了防止本地编译时出错,里面有C,C++,Fortran等各种编译器,一篮子满满的。有了它,就不怕R包安装了。
ChAMP 包提供了完整的分析illumina甲基化芯片的pipeline, 和普通的Bioconductor 包的安装一样,代码只有简单的两行 source("http://bioconductor.org.../biocLite.R") biocLite("ChAMP") 我用的电脑是windows 操作系统,64位的R-3.4.3,安装过程中除了网速较慢,花费一点时间安装之外,并没有出现任何的问题。...dll 文件就是windows操作系统下的动态链接库,在加载R包的过程中,如果这个R包有对应的动态链接库,那么就会加载进来。...解决方案就是设置环境变量R_MAX_NUM_DLLS, 不管是什么操作系统,R语言对应的环境变量都可以在.Renviron文件中进行设置。...ChAMP的功能确实是更加的强大和完整,同时也意味它的依赖包会特别的多,从而出现dll文件达到上限的错误。本文记录的解决方案,适合于任何操作系统,希望可以帮助到大家。
R包安装的方式 之前在学习数据挖掘课程的时候,就按照小洁老师教的方法整理过相应的笔记啦,R包安装与使用 那我们先回顾一下,基本的R包安装方法——配置好镜像,然后按照对应的来源安装需要的R包。...) #安装R包 括号里面写入需要安装的包的名字 2...."EnhancedVolcano") #安装需要的R包 3....Github上R包 如果是github上的包,可以采用输入作者名以及R包名字之后使用命令进行安装 安装Github上的包 #使用devtools安装 install.packages('devtools...() #查看已安装的R包 search() #查看已载入的R包 查看已经安装的R包 查看已经载入的R包 R包安装成功的唯一标准:library()没有error——小洁老师
miui网站提供了所有小米手机的卡刷包下载链接,但是默认只有最新的3个版本。如果我要下载旧点的版本(比如现在是miui8,但是我想下miui7),一般会在论坛里搜索,但如果论坛里也搜索不到怎么办呢?...这个时候我们会借助于历史页面网站,因为虽然页面更新了,但是旧版本的下载链接还是有效的。...1、 打开网站: http://web.archive.org/ 2、 在搜索框中输入要查看的页面url,比如红米Note的miui下载页面:http://www.miui.com/download-218...然后,页面会显示所有收录的历史记录。 ? 3、 选择某一天的版本进去,发现有7.0的rom了 ?...4、点击下载,由于此时的链接地址是被web.archive.org处理过的: http://web.archive.org/web/20161118214831/http://bigota.d.miui.com
,不用查说明文档了…… R语言包,就是别人编写好的程序、函数放到一起,你直接用就可以,不用重新编写,大部分的R包在CRAN中,用install.packages进行安装,还有一些在bioconductor...下面介绍一下如何查看已经安装的R包,应用场景很多,主要就是你想在另外电脑上配置同样的环境时,直接按图索骥就行了。当然,更简单的是把包直接copy进去,安装相同的版本,直接用就行了。...下面介绍几种R包的管理,包括如何查看已经安装的R包,如何查看已经加载的R包,如何安装R包,如何删除R包,如何查看R版本,如何查看R包的版本,所谓的一答解千文,就是说的本篇呀! 1....查看已安装的包 installed.packages() 它会给出来,所有已安装的R包的详细信息,包括包名,路径,版本,优先级,建议等,提取已安装的包名: as.data.frame(installed.packages...安装和卸载R包 安装R包,如果是在CRAN中,直接用install.packages(), install.packages("ggplot2") 加载一下,看看是否成功: > library(ggplot2
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