Trimmomatic 软件可以对NGS测序数据进行质量过滤，其去除adapter的功能只是针对illumina的序列，从reads的3’端识别adapter序列并去除，相比cutadapt，少了几分灵活性...但是在过滤低质量序列时，采用了滑动窗口的算法，给定窗口长度和步长，如果该窗口内所有碱基的平均质量值低于阈值，则将该窗口及其以后的碱基全部去除。...对于数据量很多的reads, 滑动窗口算法比cutadapt的算法运行速度更快。官网如下 http://www.usadellab.org/cms/?...序列，在查找时，首先执行一个seed match, 就是只在序列中查找adapter的前几个碱基，如果前几个碱基都找不到，就没必要在查找后面的碱基了，通过seed match可以加快运行速度，2表示在进行...seed match时，允许的最大错配数；当满足了seed match后，trimmomatic会将adapter 序列的全长与输入序列进行比对，从而识别adapter序列。
根据序列长度进行过滤 默认情况下，该软件会根据长度对序列进行过滤，--length_required指定最小长度，小于该长度的reads会被过滤掉;--length_limit指定最大长度，大于该长度的...默认情况下，是不会根据序列复杂度进行过滤的，如果想要进行过滤，需要添加-Y参数，同时使用-y参数指定复杂度的阈值，取值范围0-100， 默认值为30，复杂度低于30%的序列会被过滤掉。 8....根据index 对序列进行过滤 fastp支持根据index对序列进行过滤， --filter_by_index1参数指定一个index文件，该文件中每行是一个index，如果序列的index在该文件中...对双端数据进行校正 通常情况下，reads的3’端质量较差，双端测序的数据，可以根据overlap部分的序列，对低质量的测序结果进行校正。...fastp支持对UMI标记的序列进行预处理，添加-U参数之后，fastp就可以对UMI数据进行预处理。
cutadapt软件可以对NGS数据进行质量过滤，FastQC软件可以查看NGS数据的质量分布，trim_galore将这两个软件封装到一起，使用起来更加的方便。...官网如下 https://www.bioinformatics.babraham.ac.uk/projects/trim_galore/ 该软件会对数据进行以下4步处理 1....去除reads 3’端的低质量碱基 illumina平台的测序数据，通常3’端质量较差。trim_galore首先会过滤掉3’端的低质量碱基，本质上是调用了cutadapt的质量过滤算法。...下图是过滤前后碱基质量的分布图 ? 可以看到，过滤掉低质量碱基后，序列的整体质量显著提高。 2....其它过滤 对于所有的输入序列，以上3个步骤是肯定会执行的。除此之，trim_galore还支持一些其他的过滤措施，以满足个性化的需求。
其他两个位是保留的，应该设置为零。 对于只有一个标志的TCP头，每一位都有一个字节，字节13包含以下十进制的二进制值。...Push (PSH) = 8 Acknowledgement (ACK) = 16 Urgent (URG) = 32 Reserved = 64 and 128 如果为TCP头设置了多个标志，字节13的值是所有被设置的位的二进制值之和...SYN, ACK = 18 (2 + 16) PSH, ACK = 24 (8 + 16) FIN, PSH = 9 (1 + 8) FIN, PSH, ACK = 25 (1 + 8 + 16) 用过滤...572498397, win 42340, options [mss 1412,sackOK,TS val 2388703754 ecr 0,nop,wscale 8], length 0 假如需要过滤...SYN+ACK的包，则是SYN, ACK = 18 (2 + 16)。
目录 使用场景 使用watch进行监听的具体代码 使用计算属性进行模糊查询 升序降序 使用场景 列表展示的数据比较多，我们想要进行模糊搜索，在这么多的数据里面找到我们需要的。...也就是后端一下子把所有的数据都返回，我们前端进行模糊搜索的时候，不会调用后端的接口，直接进行模糊搜索，如何实现 使用watch进行监听的具体代码 页面遍历过滤后的list数据 使用watch进行监听...}) } } } 使用计算属性进行模糊查询...升序降序 对查询出来的数据进行升序降序，之前我们已经实现了模糊查询，现在就是要对查询出来的数据进行升序降序 直接用计算属性 <!
问题 在这个 问题 里，有人在 评论 里建议不要对malloc返回的值进行转换。...回答 C 中，从 void* 到其它类型的指针是自动转换的，所以无需手动加上类型转换。 在旧式的 C 编译器里，如果一个函数没有原型声明，那么编译器会认为这个函数返回 int。...在实际运行时，malloc 的返回值（一个 void* 指针），会被直接解释成一个 int。如果这时强制转换这个值，实际就是将 int 直接转换为 void* 。...如果这时没有强转 malloc 的返回值，编译器看到要把 int 转换为 int* ，就会发出一条警告。而如果强转了 malloc 的返回值，编译器就不会做警告了，在运行时就可能出问题。...强制转换 malloc 的返回值并没有错，但画蛇添足！
首先，来一个最简单的，过滤掉人群突变位点，做这个分析是基于一个显而易见的假设，如果人群中有不少人都是在某个位点跟参考基因组不一样，那么这个位点，至少不是致命的，一般来说也不会是有害的。...该数据库提供的数据集包括123,136个个体的全外显子组测序数据和15,496个个体的全基因组测序数据，这些数据来源于各种疾病研究项目及大型人群测序项目。 该数据库所有的数据都可免费下载。...根据人群频率来进行过滤 /public/biosoft/ANNOVAR/annovar/convert2annovar.pl -format vcf4old snp.vcf >snp_input/public...-out indel_filter indel_input \/public/biosoft/ANNOVAR/annovar/humandb/ -score_threshold 0.05 这种需要进行格式转换的软件我其实不太喜欢用...个的SNP位点来说，3353921个因为人群频率大于了0.05会被过滤掉，还剩下430304值得我好好研究一下。
如何对矩阵中的所有值进行比较？ (一) 分析需求 需求相对比较明确，就是在矩阵中显示的值，需要进行整体比较，而不是单个字段值直接进行的比较。如图1所示，确认矩阵中最大值或者最小值。 ?...(二) 实现需求 要实现这一步需要分析在矩阵或者透视表的情况下，如何对整体数据进行比对，实际上也就是忽略矩阵的所有维度进行比对。上面这个矩阵的维度有品牌Brand以及洲Continent。...只需要在计算比较值的时候对维度进行忽略即可。如果所有字段在单一的表格中，那相对比较好办，只需要在计算金额的时候忽略表中的维度即可。 ? 如果维度在不同表中，那建议构建一个有维度组成的表并进行计算。...可以通过summarize构建维度表并使用addcolumns增加计算的值列，达到同样的效果。之后就比较简单了，直接忽略维度计算最大值和最小值再和当前值进行比较。...，如果未使用真实表的话，则需要添加all来进行忽略维度进行计算，如果是实际表则可以直接求最大和最小值。
输出打印为: b1=>7.2882 b2=>7.1 7.22-7.0=0.1882
选择的索引值 var maxIndex=$("#select_id option:last").attr("index"); //获取Select最大的索引值 jquery获取Select元素，并设置的.../ 设置Select的Value值为4的项选中 $("#select_id option[text='jQuery']").attr("selected", true); //设置Select的Text...值为jQuery的项选中 jQuery添加/删除Select元素的Option项： $("#select_id").append("Text...=0]").remove(); }//这个表示：假如我们希望当选择选择第三类时：如果第四类中有数据则删除，如果没有数据第四类的商品中的为默认值。在后面学习了AJAX技术后经常会使用到！...).remove(); //删除值为3的Option $("#select_id option[text='4']").remove(); //删除TEXT值为4的Option 清空 Select:
<?xml version="1.0" encoding="utf-8"?> <mx:Application xmlns:mx="http://www.adob...
2.解决 查手册，发现setcookie的确是对cookie值进行了urlencode。怎么绕开呢？...值如下，并没有进行编码。...比如，如果cookie中带了分号(http协议中，Set-Cookie用来分隔键值对的关键字)，就会产生bug。...person值打断，后面的sex:male;被协议解析为无法识别的键值对，因而忽略。...get()方法的输出及浏览器中看的person值也变为 name:ball 4.建议 cookie值尽量简单，不含特殊符号，这样即使setcookie进行了urlencode也不会有什么变化。
]]) 定义：应用某一对象的一个方法，用另一个对象替换当前对象。...//各种类型的返回值; call 和 apply 返回值相同; 只是参数不同 console.log("string" +toString.apply(str))// string[object...自己写了两个克隆的函数: cloneOwn：克隆自定义对象的自有属性，不包括继承的属性，属性可以是基本数据类型和数组，自定义的对象，可以制定要克隆的属性名称列表。...== 'object') return obj; //第二个参数是属性名称列表，就采用该列表进行刷选 //否则就克隆所有属性 var attrs = arguments[1];...直接对预定义对象的方法进行扩展*/ ?
package com.fh.util; import java.math.BigInteger; /** * 说明：权限计算帮助类 * 作者：FH Admin * 官网：fhadmin.cn...*/ public class RightsHelper { /** * 利用BigInteger对权限进行2的权的和计算 * @param rights int型权限编码数组 * @...return 2的权的和 */ public static BigInteger sumRights(int[] rights){ BigInteger num = new BigInteger...0; i<rights.length; i++){ num = num.setBit(rights[i]); } return num; } /** * 利用BigInteger对权限进行...2的权的和计算 * @param rights String型权限编码数组 * @return 2的权的和 */ public static BigInteger sumRights(String
# 关于排序：如何根据函数返回的值对dart中的List进行排序 void main(){ List pojo = [POJO(5), POJO(3),POJO(7),POJO(1)
上面的 SQL 语句返回空，这里就出现了第一个问题，首先要明确一下是数据过滤是在 JOIN 之前过滤还是 JOIN 之后过滤的。...JOIN 之前过滤的，放到 on 子句中。 JOIN 之后过滤的，放到 where 子句中。...我们这里是在 JOIN 之前要先过滤单独设置 commisson 的 meta 数据，所以 wp_postmeta.meta_key = 'commission' 要放到 ON 子句中： SELECT...排序 使用了默认值之后，我们就可以使用 commission 进行排序了： SELECT wp_posts.*, COALESCE(wp_postmeta.meta_value, 10) as commission...，相同的商品，则使用发布时间进行排序。
LULU通过序列相似性(sequence similarity)和共发生模式(co-occurrence patterns)对OTU进行判断。...利用丹麦不同环境梯度中的130个位点的维管植物与植物的ITS2数据验证了该方法的准确性。 先利用不同聚类算法得到OTU，在利用LULU进行筛选(curated with LULU)。...建立用于匹配的列表。包含样本中和每个OTU相似的样本中其他OTU信息。这一步可用其他算法计算，如BLASTn 或 VSEARCH。...对每个OTU依次进行检验，最后将所有的子代OTU与对应的父代OTU合并。 几个可以调整的参数： OTU之间相似度的最小阈值：默认84%。低于阈值会被认为是错误的OTU。...共发生率阈值：默认95% 子代OTU与父代OTU丰度的比值。 与LULU相比，dbout3使用未聚类的数据，使用另一种序列相似性矩阵（Levenshtein edit distance）进行序列比对。
=会过滤值为null的数据 在测试数据时忽然发现，使用如下的SQL是无法查询到对应column为null的数据的： 1 select * from test where name !...= 'Lewis'; 本意是想把表里name的值不为Lewis的所有数据都搜索出来，结果发现这样写无法把name的值为null的数据也包括进来。 上面的!...=换成也是一样的结果，这可能是因为在数据库里null是一个特殊值，有自己的判断标准，如果想要把null的数据也一起搜索出来，需要额外加上条件，如下： 1 select * from test where...null值的比较 这里另外说下SQL里null值的比较，任何与null值的比较结果，最后都会变成null，以PostgreSQL为例，如下： 1 2 3 4 select null !...另外有些函数是不支持null值作为输入参数的，比如count()或者sum()等。
同一组数据分组 需求：一个 list 里可能会有出现一个用户多条数据的情况。要把多条用户数据合并成一条。 思路：将相同的数据中可以进行确认是相同的数据，拿来做分组的 key，这样保证不会重。...实际中使用，以用户数据为例，可能用户名和身份证号是不会变的，用这两个条件拼接起来。
这个时候就有点尴尬了，按道理来说没登录的用户只能看login界面不能够通过输入URL进行界面跳转，这显然是不合理的。这里介绍Struts2中Filter实现jsp页面拦截的功能。...（有兴趣的人可以去研究Filter过滤器的其它用法，因为利用过滤器也可以实现action拦截的功能） 下面直接上代码，边看边分析实现步骤和原理。...*.jsp 这里有几点需要注意的是： 1.过滤器要尽量放在Struts2配置代码的上面...*.jsp表示只过滤jsp的界面不会把css，js，action一起给过滤了。如果写成/*就会把所有的东西一起过滤了。包括css，js，action等。所以这个地方一定要看仔细。 2。...再重申一下web.xml中配置的信息，需要好好检查检查因为那里是过滤器是否成功的关键。
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