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MultiQC对FastQC结果的解读

本期解读转录组上游分析中MultiQC对质控软件FastQC处理后的结果。 FastQC是一款能够对高通量测序数据进行质量评估的软件,对每一个样本生成一个报告。...https://www.bioinformatics.babraham.ac.uk/projects/fastqc/ 我们通常使用FastQC对raw_data和clean_data做质控,拿到的结果大致相同...在大多数RNAseq文库制备方法中,前10-15bp碱基分布明显不均匀,这是正常的,具体取决于使用的文库试剂盒的类型。即使序列完全正确,这种碱基组成不均匀的数据也会被认为是不合格。...关于图中的红蓝两条线,知乎大佬对其的解释会更为简单,原文我放在参考资料的3,需要的请自行查看,我在这里概括一下。...MultiQC报告的结果 理想情况下,Illumina序列数据不应存在任何接头序列,然而,当使用较长的读取长度时,一些文库插入可能比读取长度短,从而导致在read的3'末端读取到接头。

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    Jepsen对etcd 3.4.3测试的最新结果

    作者:Xiang Li Jepsen对etcd 3.4.3进行了测试和分析,得到了良好的结果和有用的反馈。 etcd设计的一个关键部分是跨分布式键值存储的强一致性保证。...他们首次测试etcd是在0.4.1版本(五年前),从那时起我们就一直使用这些发现来改进我们的一致性。...当访问依赖于时间的外部资源时,它提供了较弱的保证。使用分布式锁很难防止死锁和锁定失效,因为分布式锁不能保护同一进程甚至同一机器中的资源。...我们感谢社区对这些问题的反馈,并帮助etcd项目变得更好。 ? 未来 Jepsen分析不是一次性的工作。在分析过程中,Jepsen团队专门为etcd项目建立了一个广泛的测试框架。...我们对这次测试的结果感到兴奋,并将保持警惕,同时建立一个良好的工程和正确的产品。 要了解更多,请阅读Jepsen给etcd 3.4.3的完整报告。

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    Excel的sum相关函数使用方法

    Sum_range 是需要求和的实际单元格。  说明  只有在区域中相应的单元格符合条件的情况下,SUM_range 中的单元格才求和。  如果忽略了 SUM_range,则对区域中的单元格求和。 ...例如,如果要计算单元格区域内某个文本字符串或数字出现的次数,则可使用 COUNTIF 函数。  ...如果要让公式根据某一条件返回两个数值中的某一值(例如,根据指定销售额返回销售红利),则可使用 IF 函数。  sumifs 用于计算其满足多个条件的全部参数的总量。...Sum_range :必需,要求和的单元格区域。 Criteria_range1:必需,使用 Criteria1 测试的区域。...Criteria_range1 和 Criteria1 设置用于搜索某个区域是否符合特定条件的搜索对。 一旦在该区域中找到了项,将计算 Sum_range 中的相应值的和。

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    对mysql left join 出现的重复结果去重

    使用left join, A表与B表所显示的记录数为 1:1 或 1:0,A表的所有记录都会显示,B表只显示符合条件的记录。...但如果B表符合条件的记录数大于1条,就会出现1:n的情况,这样left join后的结果,记录数会多于A表的记录数。所以解决办法 都是从一个出发点出发,使A表与B表所显示的记录数为 1:1对应关系。...解决方法: 使用非唯一标识的字段做关联 1 select DISTINCT(id) from a left join b on a.id=b.aid DISTINCT 查询结果是 第一个表唯一的数据...使A表与B表所显示的记录数为 1:1对应关系。...PS: 解释distinct,如下例子: table id name 1 a 2 b 3 c 4 c 5 b 比如想用一条语句查询得到name不重复的所有数据,那就必须使用distinct去掉多余的重复记录

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    中美谈判结果对锂电产生的危机与机遇

    近日,由美国高官组成的谈判团队访华,就近来发生的贸易战与我国展开谈判。中美经贸磋商的结果是,双方在有些领域达成了一些共识,但在一些问题上还存在较大分歧。...时至今日,我国已拥有全球最多的动力电池企业,统计结果显示,目前我国动力电池企业已超200家。据福布斯新闻网报道,预计到2020年全球电池市场,中国将占超7成的份额。...所以,隔膜的品质将直接影响动力锂离子电池的容量、寿命以及安全性能等特性,品质越好,性能越优的隔膜,电池的综合性能就越好。...动力电池制造厂存在比较大的问题就是,实现对每道工序的各个细节都做到精细化把控以达到较高的一致性比较困难。...而且,即便严格控制这些条件,在目前的设备工艺条件下,对流体的力学性质也很难保持一致。 危机与机会并存。一如缺芯的事实被摆出来后,国内对芯片制造的重视程度达到了历史最高。

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    mysql sum函数中对两字段做运算时有null时的情况

    背景 在针对一些数据进行统计汇总的时候,有时会对表中的某些字段进行逻辑运算,如加减乘除,如果要求和的话还可能会用到sum函数,如果两者结合起来应该怎么处理,如果参与运算的字段中出现null值的时候会出现一些什么情况...根据表中的数据,我们知道统计后正确的结果应该是 (2000 - 50) + (1500 - 100) + (500 - 50) + 1000 = 4800 但如果我们这么写,那么得到的结果是错误的。...null) = 3800  因为1000 - null的结果不是1000而是null,因为null与任何值比较和运算的结果都是null,所以我们应该针对null做特殊处理。...需要主要这样写也是没有用的,因为里面1000-null,仍然是一个错误的结果 select ifnull(sum(total_amount - freeze_amount),0) from user ... 正确的写法应该是 select ifnull(sum(total_amount),0) - ifnull(sum(freeze_amount),0) from user

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    同步定时器对性能测试结果的影响分析

    背景说明 在压测过程中我们对添加同步定时器和不添加同步定时器的两个脚本进行测试,分别观察两脚本在相同环境和其余条件一样的情况下的一个运行情况,分析其同步定时器的运行原理和对测试结果的一个影响。...分析 准备脚本,分别为添加同步定时器的请求和未添加同步定时器的请求 分析一:两种方式请求过程分析 1.首先观察添加同步定时器和未添加同步定时器的结果树,线程数设置为20,启动时间为1秒,循环2次 2...,添加了同步定时器的请求会按照组的形式进行请求,每一组的开始时间是一致的,所以,可以瞬间释放出很大的压力对服务器造成压力,同时也可以推测出,通过添加同步定时器的方式,对发压机的压力也是很大的。...分析二:两种方式请求结果分析 通过对过程的分析发现两种请求方式的不同,那我们可以猜测两种请求对的结果会一样吗?...4.通过上面两个结果可以看出相同并发下吞吐量差距有3倍 总结 通过上面测试发现,添加同步定时器对吞吐量影响较大,我们需要根据压测场景来确定是否需要添加同步定时器,在没有并发要求的情况下,

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    对索引的使用

    1、违法最左前缀法则,索引失效2、范围查询右边(后面)的列,不能使用索引 ,则范围查询字段后面的字段索引失效(>、使用覆盖索引(只访问索引的查询(索引列完全包含查询列...=)比较特殊 除主键索引或索引是整数类型外的其它索引都失效。8、索引列上不要使用函数,oracle必须使用函数索引。9、以%开头的Like模糊查询(%xxx),索引失效。...使用explain查看SQL是如何执行查询语句的,从而分析你的索引是否满足需求。...所以我们在数据库设计时不要让字段的默认值为null。2、使用短索引 对串列进行索引,如果可能应该指定一个前缀长度。...3、索引列排序 MySQL查询只使用一个索引,因此如果where子句中已经使用了索引的话,那么order by中的列是不会使用索引的。

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    育种数据分析中转化数据对结果的影响

    问题提出 在模型假定中,数据需要符合正态分布,在动物模型分析中,如果对数据进行转化,对育种值和方差组分变化的情况,进行测试。 2....分析中,虽然数据要求正态分布,但是对于稍微偏态的数据,模型具有强健性,没有必要一定是符合正态分布,数据量大时,一般对异常值进行筛选删除,对数据不做转化。...当数据符合正态分布,强行进行转化,结果转化后的分布不符合正态分布,这是育种值的排名是有变化的(no zuo no die, why you try…) 育种分析中,一般不做数据的转化,只做异常值的剔除。...Box 在终极的分析中,一切知识都是历史;在抽象的意义下,一切科学都是数学;在理性的基础上,所有的判断都是统计学。 C.R.Rao 统计学是对令人困惑费解的问题做出数字设想的艺术。...Francis Galton 对统计学的一知半解常常会造成一些不必要的上当受骗,对统计学的一概排斥往往会造成某些不必要的愚昧无知。 C.R.Rao

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    明明结果是对的,为什么被合并查询后得到的结果却出错了?| Power Query躲坑

    最近,有位朋友在一个实际工作问题中,在表2使用合并查询从表1的结果中匹配最高(阶段)项,眼看着表1的结果是对的,但表2里却得到了错误的返回结果,具体情况如图所示: 为什么会这样?...我们先来看表1的处理情况。 为了合并查询得到最高阶段项,对表1进行降序排序: 然后通过删除重复项保留最高阶段数据: 从表1的结果来看,的确保留了最高阶段的数据。...然后,在表2里使用合并查询获取表1中的结果并展开: 咦!!! 表1的处理结果明明是阶段4(报价),为什么合并查询得到的结果却是阶段2(售前)? 这难道是Power Query的Bug吗?...这里的问题根源其实是表1的处理问题,我以往发布的多篇文章案例中,在涉及Power Query中使用排序的问题时会强调,Power Query的排序需要增加添加索引或Table.Buffer的步骤,使排序的结果真正...所以,回到这个问题,针对表1的排序步骤,我们可以嵌套Table.Buffer函数(图中中间行为原排序操作生成的代码,无所做任何改变): 这时,我们再看表2的结果: 完全正确!

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    使用aPEAR来增强clusterProfiler的GSEA分析结果

    而前面我们演示了:使用topGO增强你的GO数据库注释结果的可视化,是超几何分布检验的结果的可视化,主要是展示GO数据库的有向无环图结构。...接下来我们聊聊使用clusterProfiler的GSEA方法针对GO数据库进行注释后的结果的可视化,所以是需要大家自己提前弄清楚GSEA方法和超几何分布检验方法的区别哦!...:使用topGO增强你的GO数据库注释结果的可视化 然后使用clusterProfiler的GSEA方法针对GO数据库进行注释 前面的DESeq2进行转录组差异分析后的表格里面有两万多个基因,需要对它们根据里面的...log2FoldChange对基因排序后的全部的基因的列表,而前面我们演示了:使用topGO增强你的GO数据库注释结果的可视化,是超几何分布检验的结果的可视化只需要统计学显著的上下调的几百个基因即可。...clusterProfiler的GSEA方法针对GO数据库进行注释,和前面的 :使用topGO增强你的GO数据库注释结果的可视化,是超几何分布检验的结果,差异很多哦!

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