1.1.3按条件过滤 因为将表中全部的数据都从数据库中检索出来，所以会有很大的内存消耗以及网络资源消耗。 须要逐条检索每条数据是否符合过滤条件，所以检索速度很慢。...GROUP BY子句负责将数据分成逻辑组，而聚合函数则对每个组进行统计计算。 SELECT FAge FROM T_Employee GROUP BY FAge。...GROUP BY子句将检索结果划分为多个组，每一个组是全部记录的一个子集。GROUP BY子句必须放到SELECT语句的之后，假设SELECT语句有WHERE子句。...比方以下的SQL语句将返回依照工资降序排列的从第二行開始（行号从0開始）的最多五条记录：SELECT * FROM T_Employee ORDER BY FSalary DESC LIMIT 2,5...在SQL中能够使用UNION运算符来将两个或者多个查询结果集联合为一个结果集中。 仅仅要用UNION操作符连接这两个查询语句就能够将两个查询结果集联合为一个结果集。
导出数据表和图以供在R环境以外使用。 1.数据框 数据框（和矩阵）有2个维度（行和列），要想从中提取部分特定的数据，就需要指定“坐标”。和向量一样，使用方括号，但是需要两个索引。...列表的组件命名数据框的列命名使用的函数都是names()。 查看list1组件的名称： names(list1) 创建列表时，将species向量与数据集df和向量number组合在一起。...要以逗号分隔的格式（.csv）将矩阵导出为文件，可以使用write.csv函数。有两个必需参数：要导出的数据结构的变量名称，以及要导出到的路径和文件名。...write.table也是常用的导出函数，允许用户指定要使用的分隔符。此函数通常用于创建制表符分隔的文件。 注意：有时在将具有行名称的数据框写入文件时，列名称将从行名称列开始对齐。...为避免这种情况，可以在导出文件时设置参数col.names = NA，以确保所有列名称都与正确的列值对齐。 将向量写入文件需要与数据框的函数不同。
主成分分析方法可以将多个变量综合为少数几个代表性变量，使这些变量既能够代表原始变量的绝大多数信息又互不相关，这种方法有助于对问题的分析和建模。 ...Madlib提供了两个主成分分析函数：训练函数与投影函数。训练函数以原始数据为输入，输出主成分。投影函数将原始数据投影到主成分上，实现线性无关降维，输出降维后的数据矩阵。 1....PCA的基本思想 主成分分析采取一种数学降维的方法，其所要做的就是设法将原来众多具有一定相关性的变量，重新组合为一组新的相互无关的综合变量来代替原来变量。...val_id：TEXT类型，稀疏矩阵中表示非零元素值的列名。该参数只用于稀疏矩阵。 row_dim：INTEGER类型，矩阵的实际行数，指的是当矩阵转换为稠密矩阵时所具有的行数。...稠密矩阵的各个分组大小可能不同，而稀疏矩阵的每个分组大小都一样，因为稀疏矩阵的‘row_dim’和‘col_dim’是跨所有组的全局参数。
POI是一个开源的Java读写Excel、WORD等微软OLE2组件文档的项目, 使用 NPOI 你就可以在没有安装 Office 或者相应环境的机器上对 WORD/EXCEL 文档进行读写。...">要导出的DataTable列数组 /// 导出后的对应列名 public... /// 工作表标题行所在行号(从0开始) /// /// 工作表标题行所在行号(从0开始) /// <returns...< 1) { throw new Exception("需转换的集合为空"); } //取出第一个实体的所有
COUNT 函数是 SQL 中常用的聚合函数之一，用于快速计算行数。在数据统计和分析中具有广泛应用，通过不同的参数和条件组合，可以灵活地满足各种统计需求。...三、GROUP BY 子句 3.1 分组数据 基本概念 GROUP BY 子句用于将查询结果集按照一个或多个列进行分组，以便对每个组应用聚合函数。...通过将查询结果分组，可以对每个组进行统计、计算，提供更详细的汇总信息，适用于数据分析和报告生成。...3.2 聚合函数与 GROUP BY 结合使用 在 SQL 中，聚合函数与 GROUP BY 子句结合使用，用于对数据进行分组并对每个分组应用聚合函数，从而得到按组计算的结果。...反范式化： 根据实际情况选择合适的范式化级别，有时反范式化可以提高查询性能。 垂直分割和水平分割： 将大型表拆分为更小的表，以减少查询的数据量。
(df) #查看行名 colnames(df) #查看列名 输出结果： 图片 图片 数据框的操作 #数据框取子集 df$change #按列名取一列，返回一个向量 df[,1] #按列号取一列，返回一个向量...df[1,1] #按坐标取一格 df[1,] #按行号取一行，返回一个数据框 df[c(1,3),1:2] #按坐标范围取多格，返回一个数据框 输出结果： 图片 图片 图片 #数据框的修改 df$score...df[,-ncol(df)] #提取除数据框最后一列之外的列 输出结果: 图片 数据框之间的操作 df1 = data.frame(genes = paste0("gene",1:6),count =...数据框的连接 merge(df,df1,by="genes") #指定列名相同的genes列进行合并 merge(df1,df2,by.x="genes",by.y="GENES") #指定列名不同的列进行合并...输出结果： 图片 两个行数不同的数据框merge()，以交集的数据输出 矩阵 矩阵相当于二维的向量 同向量，矩阵只允许有一种数据类型 矩阵不能用$取列 矩阵可直接转为数据框 #矩阵的新建 m1 = matrix
文件名分别为barcodes.tsv.gz、features.tsv.gz和matrix.mtx.gz。输出文件可以被Seurat::Read10X读入。.../data/selected.tsv", sep="\t", header=None)_selected.index.name = None # 把索引列的列名去掉filtered_index = list...__len__())# 加行名列名rna_count = pd.DataFrame( data=_data, index=_index.index, columns=_col.iloc[:, 0]...(rna_count.shape[1])) ### 获取表达矩阵细胞数# 重新写出 DataFrame 为 10X 格式的 sparse matrix 等相关文件import osimport shutilimport...的方法-CSDN 博客「单细胞转录组系列」如何从稀疏矩阵中提取部分数据进行分析_单细胞稀疏矩阵-CSDN 博客
MADlib提供了两组主成分分析函数：训练函数与投影函数。训练函数以原始数据为输入，输出主成分。投影函数将原始数据投影到主成分上，实现线性无关降维，输出降维后的数据矩阵。...基本思想 主成分分析（Principal Component Analysis，PCA）采取一种数学降维的方法，其所要做的就是设法将原来众多具有一定相关性的变量，重新组合为一组新的相互无关的综合变量来代替原来的变量...与最大特征值相关联的特征向量指示数据具有最大方差的方向。换句话说，就所有可能的方向而言，如果所有数据投影到该向量定义的直线上，则结果值将具有最大方差。...row_id TEXT 输入表中表示行ID的列名。该列应该为整型，值域为1到N，对于稠密矩阵格式，该列应该包含从1到N的连续整数。 col_id TEXT 稀疏矩阵中表示列ID的列名。...稠密矩阵的各分组大小可能不同，而稀疏矩阵的每个分组大小都一样，因为稀疏矩阵的‘row_dim’和‘col_dim’是跨所有组的全局参数。
]; string[] arrColName = new string[dtSource.Columns.Count];//列名 ICellStyle[] arryColumStyle...= new ICellStyle[dtSource.Columns.Count];//样式表 headStyle.Alignment = HorizontalAlignment.Center...format.GetFormat("yyyy-mm-dd"); foreach (DataRow row in dtSource.Rows) { #region 新建表，...没定义直接按字段名输出 } #endregion 列头及样式 } #endregion 新建表，...（数据行号=标题行号+1） /// /// private DataTable
与JS选择性显示不同，这里是选择性遍历。与JS分页不同的是，这里分页每次跳页修改的是遍历的指针，每次跳页都要进行一次全面查询。同样地，不适合大数据量查询。这里比JS分页优化的地方在于——实时性。...即总记录数 //记算总页数 intPageCount = (int)Math.ceil(intRowCount/(intPageSize*1.0)); //将记录指针定位到待显示页的第一条记录上...(1);//结果为count(*)表，只有一列。...page 列名 from 表名 order by列名) order by列名 4.SQL Server 2005数据库分页 Select * from (select 列名,row_number...() over(order by 列名1) as 别名from 表名) as t where t.列名1>=startrow and t.列名1<=endrow 5.MySQL数据库分页 Select
如源表中有M个变量（M个数字列），则函数输出是一个Mx M的方形对称矩阵，其中的第（i,j）个元素值就是第i个变量与第j个变量的皮尔森相关系数。...输出矩阵对角线上的元素，即变量与自身的相关性总是1.0。 （1）语法 MADlib的皮尔森相关性有两个函数，一个输出相关系数，另一个输出协方差。...variable VARCHAR 包含相关变量的列名。 表剩下的部分是‘source_table’表中数字列的N x N的相关系数矩阵。...row_count BIGINT 目标列的行数。 distinct_values BIGINT 目标列不同值的个数。...bedroom列具有2、3、4三个值，summary函数按每个bedroom的值分三组计算其它5列的汇总统计值，并且会按不分组（表级）计算全部6个列的汇总统计值，因此生成21条结果数据。
,file = "paired_DEG_by_edgeR.csv") 四、增加不同分组条件下的gene平均表达量 TCGAanalyze_LevelTab（）将差异表达基因在正常和肿瘤组织中的表达量数据添加到差异表达分析结果中的主要用法...typeCond1 条件1的分类标签，如对照组 typeCond2 条件2的分类标签，如试验组 TableCond1 条件1对应的表达矩阵，行代表样本名，列代表基因名 TableCond2 条件2对应的表达矩阵...为增加图片的信息量，可增加metadata信息(即行注释和列注释信息)，注意pheatmap()的注释信息的列名必须与表达矩阵的行名、列名一致，演示如下： #增加metadata信息 col.mdat...以上为热图的输出结果，我们可以看到按照行（样本）进行聚类，基本上能够把肿瘤组织与正常组织分类开，说明两种组织的基因表达是具有差异的。相反，在不同存活状态和性别中，暂时未能发现于基因差异表达的相关性。...names 是否在图中标记具有显著性差异的基因名称 names.fill 是否将具有显著性差异的基因名称写入方框内 show.names 展示哪种基因的名称，可设置的选项："significant"（
01 视频数据的读取 虽然视频文件是由多张图片组成的，但是imread()函数并不能直接读取视频文件，需要由专门的视频读取函数进行视频读取，并将每一帧图像保存到Mat类矩阵中，代码清单2-27中给出了...apiPreference：读取数据时设置的属性，例如编码格式、是否调用OpenNI等，详细参数及含义在表2-5给出。...字符代码 CAP_PROP_FRAME_COUNT 7 视频流中图像的帧数 CAP_PROP_FORMAT 8 返回的Mat对象的格式 CAP_PROP_BRIGHTNESS 10 图像的亮度（仅适用于支持的相机...2-27中对比，调用摄像头与读取视频文件相比，只有第一个参数不同。...并且读取视频时VideoCapture类具有的属性同样可以使用。我们将代码清单2-28中的视频文件改成摄像头ID（0），再次运行代码清单2-28的程序，运行结果如图2-7所示。 ? ?
acc=GSE243245 可以看到，作者提供了这个转录组测序的表达量矩阵：GSE243245_RNA_seq_count.csv.gz 3.4 Mb 在R里面读入矩阵 代码很简单： # 魔幻操作，一键清空...：GSE243245_RNA_seq_count.csv.gz 3.4 Mb的列名非常有规律，我就简单的把 hepatocellular carcinoma (HCC) 和 colorectal cancer...然后简单的质量控制，发现分组还是蛮合理的： 质量控制 然后就是转录组测序的表达量矩阵的标准差异分析代码啦， 发现GAPDH基因作为内参确实是“稳如老狗”表达量是不会有差异变化，但是从差异基因居然可以倒推测出来其实是有一些...转移瘤与原发瘤可能存在分子亚型的差异，包括在肿瘤抑制基因和促癌基因的表达上。...) 的两个分组的转录组测序的表达量矩阵很容易差异分析后，使用机器学习算法，比如LASSO，SVM, 随机森林缩小基因数量，来区分两个分组，调整算法和参数可以达到非常好的分类模型。
[] 向量、数据框、矩阵取子集时出现； 向量取子集时 [] 里面写一个维度，数值型向量是下标组成的，...逻辑值向量是逻辑值组成的，并且逻辑值要求与被取子集的向量长度相等且一一对应。...数据框、矩阵取子集，逗号的两边分别表示行和列，要么是行名列名，要么是行号列号，还可以是逻辑值。 [[]] 列表取子集，里面一般放的都是数据。 $ 数据框取列，或者列表取子集。...= ， 与实际参数的连接。 == 判断是否相等， !...class不能识别文件名称，是只能识别数据的函数 判断数据类型的时候不带引号，不带后缀 比如class(c)，class(x) 而class(“exercise.csv”), 就会反馈出来 “character
用户 用户是在实例下建立的。不同实例可以建相同名字的用户。 4. 表空间 表空间是 Oracle对物理数据库上相关数据文件（ORA 或者 DBF 文件）的逻辑映射。...一个数据库在逻辑上被划分成一到若干个表空间，每个表空间包含了在逻辑上相关联的一组结构。每 个数据库至少有一个表空间(称之为 system 表空间)。...但是表不是有表空间去查询的，而是由用户去查的。因为不同用户可以在同一个表空间建立同 一个名字的表！这里区分就是用户了！ ? ? 二、 创建表空间 表空间？ORACLE数据库的逻辑单元。...员工姓名在哪张表，员工领导姓名在哪张表）自连接：自连接其实就是站在不同的角度把一张表看成多张表。...ROWNUM:表示行号，当我们做select操作的时候，每查询出一行记录，就会在该行上加上一个行号。
Dplyr Count the observations count 函数用于统计数据框中各个组的频数，可以对指定变量进行计数，得到每个类别的观测数目，支持根据需要对结果进行排序。...区别在于只用一个变量连接两个表。...Dplyr Rename columns rename 函数用于重命名数据框中的变量名，能够快速修改变量的名称，使得数据的列名更符合用户的需求和习惯。...Dplyr Slice select rows by position slice 函数用于按行数进行切片，能够从数据框中提取特定的行，支持根据行数或行号选择需要的行，也支持使用负数表示从末尾开始计算的行数...Tidyr Pivot Wider from long pivot_wider 函数用于将长格式数据转换为宽格式数据，能够将数据框中的一列分成多个列，根据指定的列名进行展开，使得数据以更直观的宽格式形式呈现
使用locate加文件名便可在根目录下搜索相应文件，如下所示： 命令：cat 在屏幕上显示文件内容，示例如下： 将两个文本文件整合为一个文本文件（行累加），示例如下： cat test1.txt test2...具体参数选项如下： -A：相当于-vET的整合选项，可列出一些特殊字符而不是空格显示； -b：列出行号，仅针对非空白行做行号显示，空白行不标行号； -n：列印出行号，连同空白行也会有行号，与-b的选项不同...； -E：将结尾的断行字节$显示出来； -T：将[tab]按键以^I显示出来； -v：列出一些看不出来的特殊字符。...-b：启动后转入后台执行 -i：从指定文件获取要下载的URL地址，文件中每行指定一个网址 -O：指定下载后的文件路径及保存为的文件名 具体下载方法如下所示： 其中文件名支持使用通配符而进行批量下载。...2.5文件权限 在查看文件的时候，最前面的信息即为文件权限，示例如下： 一共有10位，第一位d代表路径（文件夹），-代表文件，之后每三位一组分别为文件所有者、用户组、其他人的权限，r为可读，w为可写，
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