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    多芯片分析(如何将多个测序、芯片数据集合并为一个数据集)(1)

    这是一个对我有特殊意义的教程,大约在一年半以前,我和朋友开始研究如何将多个数据集合并为一个数据集来分析,但是当时试了很多方法,效果不理想,再加上很多前辈告诉我很多人不认同这样合并多个数据集(因为会导致很多误差...然后最近因为疫情我又重新开始研究这段,终于给摸索出来一个还可以的教程并结合自己的数据集做了实例验证,效果挺满意的,所以想把这段教程写下来并总结以待后用。 移除批次效应前 ? ? ?...因为目前合并多个测序、芯片数据集这一块并没有完全统一的标准,方法大概有五六种。公说公有理婆说婆有理,对于我这样的新手来说,最简单的是跟随顶级文章的文章思路或者分析流程和步骤。

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    mysql sql同一个字段多个行转成一个字段查询

    mysql sql同一个字段多个行转成一个字段查询 如果您想要将MySQL中同一个表的不同行的值合并到一个字段中,您可以使用GROUP_CONCAT()函数。...这个函数可以将多个行的值连接起来,并且可以通过SEPARATOR关键字指定分隔符。...以下是一个简单的例子,假设我们有一个名为users的表,它有一个name字段,我们想要将所有用户的名字合并到一个字段中,用逗号分隔: SELECT GROUP_CONCAT(name SEPARATOR...如果您的合并结果可能会超过这个长度,您可以在查询前通过设置group_concat_max_len会话变量来增加这个限制。...#demo:查询gps表的多个设备序列号,组成一行,中间以逗号分隔 SELECT GROUP_CONCAT(serial_number SEPARATOR ', ') FROM `tbl_gps` WHERE

    12110

    jpa : criteria 作排除过滤、条件中除去查出的部分数据、JPA 一个参数可查询多个字段

    PS : mybatis 中也有对于 criteria 的使用,见另一文章:mybatis :Criteria 查询、条件过滤用法 1. 业务场景: (1) ....按业务条件查到所有数据后,要过滤掉其中 “当前领导自己填报的但不由自己审批的数据” ,本来我一直在想是不是会有和 sql 中类似于 except 效果的实现 ,就一直想找这个方法,但没有点出这个方法来,直到在源码中看到一个...在微信端要求在一个输入框中实现多种类型数据查询。可输入“姓名、项目名称、工作任务、工作类型” 中的任意一种,并作相应条件过滤。...这种只给一个参数却可能代表多种类型数据的实现 如下: Predicate p = cb.or(cb.like(root.get("employeeName"), "%" + search + "%"

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    「Go工具箱」推荐一个Google开发的将结构体快速拼接成url查询参数的工具

    今天给大家推荐的是一个将结构体快速的构造成url查询参数的工具:go-querystring。...函数便能将其构造成url中的查询字符串: type Options struct { Query string `url:"q"` ShowAll bool `url:"all"...下面是一个使用切片的例子,通过在tag中增加comma标签,代表以逗号将值进行连接(实际输出时会有url的转义): type Options struct { Score []int `url...只要定义一个结构体,调用该包的Encode函数就能将结构体中的字段自动拼接成url的查询参数。当然其缺点就是性能差。...下面是一个使用该包和不使用该包的基准测试结果,基本上该包的性能是go内置包的5倍还多。如下图: 更多项目详情请查看如下链接。

    70620

    SQL命令 GROUP BY

    SQL命令 GROUP BY SELECT子句,它根据一个或多个列对查询的结果行进行分组。 大纲 SELECT ......GROUP BY子句接受查询的结果行,并根据一个或多个数据库列将它们分成单独的组。 当将SELECT与GROUP BY结合使用时,将为GROUP BY字段的每个不同值检索一行。...但是,如果在逗号分隔的列表中指定一个字面值作为字段值,则该字面值将被忽略,并且GROUP BY将为指定字段名的每个惟一组合选择任意一行。...例如,如果任何Home_State被8个人共享,查询返回8。 如果查询仅由聚合函数组成且不返回表中的任何数据,则返回%ROWCOUNT=1,并为聚合函数返回一个空字符串(或0)值。...它返回首字母、共享该首字母的姓名计数以及一个Name值的示例。名称使用其SQLUPPER排序规则进行分组,而不考虑实际值的字母大小写。

    3.9K30

    并查集

    并查集是一种动态维护多个不重复集合 在并查集中,每个集合都有自己的代表元素。 一个树 fa 记录每一个元素的归属关系(存储所属集合代表元素的下标)。...具体: 初始状态: 即,每个元素都是一个单独的集合 int fa[10009]; for (int i = 0; i < n; i++) fa[i] = i; 常见操作 Get 查询一个元素属于哪一个集合...(通常题目中会问两个元素是否属于同一集合) int find(int x) { if (fa[x] == x) return x; return find(fa[x]); } (查询某元素所属集合的代表元素...查询两个元素是否属于同一集合的代码也很简单 bool is_in_one_set(int b, int c){ return find(b) == find(c); } Merge 把两个元素...a 、 b 所在的集合合并为一个 随意修改 a 、 b 中一个的父元素为另一个的父元素 void merge(int a, int b) { int fa_ = find(a); int fb

    1.7K10

    如何优化开放数据湖仓一体的性能

    文件大小调整或压缩是数据湖仓一体架构中的一项重要技术,可确保将大小低下的小型文件合并为更大、更优化的文件。如果不定期压缩,文件计数可能会呈指数级增长,随着数据量的增加,系统性能会严重下降。...文件大小调整算法的目标是将这些较小的文件合并为满足系统目标文件大小的较大文件,从而减少文件数量并提高查询效率。...此算法旨在将小文件合并为较大的、接近最佳大小的文件,确保合并的文件接近系统定义的目标大小,而不会超过该大小。...图 2:将较小大小的文件合并为较大的文件的压缩过程 Apache Hudi 架构的一个关键设计特征是其避免创建小文件的内置能力。...图 4:显示字段的最小/最大值及其计数的 Parquet 页脚元数据 Parquet 文件格式是数据跳过的一个常见示例,该格式存储列级统计信息,例如每个文件的最小值和最大值。

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    SQL命令 DISTINCT

    DISTINCT从句有两种形式: SELECT DISTINCT:为选择项值的每个唯一组合返回一行。可以指定一个或多个选择项。...但是,如果将文字指定为逗号分隔列表中的项值,则该文字将被忽略,并且DISTINCT将为指定字段名的每个唯一组合选择一行。 DISTINCT子句在TOP子句之前应用。...DISTINCT和GROUP BY DISTINCT和GROUP BY这两个记录按指定字段(或多个字段)分组,并为该字段的每个唯一值返回一条记录。...AVG(Age) AS AvgAge FROM Sample.Person GROUP BY ROUND(Age,-1) /* Avg(Age)返回每个年龄组的平均年龄 */ DISTINCT子句可以用一个或多个聚合函数字段指定...因此,只有在一个或多个选定字段存在索引时才有意义。它对存储在索引中的字段值进行排序;字母字符串以全部大写字母返回。

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    如何使用python计算给定SQLite表的行数?

    通过建立与 SQLite 数据库的连接、执行 SQL 查询和提取行计数,我们将指导您完成整个过程。无论您是新手还是经验丰富的Python开发人员,掌握这种技术都将提高您的数据处理技能。...建立连接后,需要使用 cursor() 方法创建一个游标对象: cursor = conn.cursor() 您可以使用游标对象运行 SQL 查询并从数据库中提取数据。...fetchone() 函数用于接收查询结果,而 execute() 方法负责运行 SQL 查询。 对查询的响应是一个元组,其中包含与表中的行数对应的单个成员。...使用 result[0] 访问元组的第一个组件以获取行计数。...使用多个表 如果需要计算多个表中的行数,可以使用循环循环访问表名列表,并为每个表执行计数查询: table_names = ['table1', 'table2', 'table3'] for table_name

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    OpenTSDB用户指南-数据查询

    除非使用指定了降采样算法的查询,否则将使用查询中指定的相同聚合函数将数据自动降采样到1秒。这样,如果多个数据点存储在一个给定的秒数,它们将被聚合并正确返回一个正常的查询。...另外,scan命令行工具将返回写入存储的时间戳。 过滤器 每个时间序列由一个指标与一个或多个标签名称/值对组成。...---- OpenTSDB的一个强大功能是能够将多个时间序列的即时聚合集成到一组数据点中。...聚合函数是将单个时间戳的两个或多个数据点合并为单个值的方法。 注意: OpenTSDB默认会聚合数据,并且需要每个查询都有一个聚合运算符。每个聚合器必须处理多个序列的缺失或不同时间戳中的数据点。...然而我们知道,计数器可能会翻转,因此我们可以将最大值设置为65535,现在计算65535 - t0 + t1将会返回给我们2535。   跟踪计数器中数据的系统通常在重新启动时恢复为0。

    2.2K10

    Elasticsearch如何聚合查询多个统计值,如何嵌套聚合?并相互引用,统计索引中某一个字段的空值率?语法是怎么样的?

    本文将详细解释一个聚合查询示例,该查询用于统计满足特定条件的文档数量,并计算其占总文档数量的百分比。这里回会分享如何统计某个字段的空值率,然后扩展介绍ES的一些基础知识。...Bucket Aggregations(桶聚合):将文档分组到不同的桶中。每个桶都可以包含一个或多个文档。例如,terms 聚合将文档根据特定字段的值进行分组。...在上述查询中,脚本用于两个地方:terms 聚合中的 script:将所有文档强制聚合到一个桶中。filtered_count 的条件判断:检查字段 my_field 是否非空且非零。...extended_stats:获取数值字段的多个统计数据(平均值、最大值、最小值、总和、方差等)。value_count:计算字段的非空值数量。...histogram:基于数值字段将文档分组为多个桶。terms:基于字符串或数值字段将文档分组为多个桶。filters:将文档分组为多个桶,每个桶对应一组过滤条件。

    22020

    Netflix:为什么建立专门的媒体数据库?

    为此,我们需要收集ISO BMFF(基本媒体文件格式)格式化比特流的标题的聚合统计数据(包括最小值,最大值,中值,平均值,任意百分数)。...Netflix转码集群为大量内容提供服务,并为每个内容生成大量的比特流(具有不同的编解码器+质量组合)。在过去,我们需要编写一次性脚本,以便在我们分析数据之前,以艰难的方式从比特流中抓取头部信息。...此外,当分析我们的媒体数据的另一个完全不同的维度时,还需要一个新的“一次性”脚本来处理。...在我们的案例中,架构合规性允许我们索引数据,这反过来又可以实现数据搜索和挖掘机会。此外,这就把数据的创造者从需要高端服务的消费者中解脱出来了。...这样的查询可以用于检测视频和字幕中存在的文本之间的冲突。 4、多租户:精心设计的媒体数据库可以用作支持来自多个应用的多个分析数据的平台。 因此,它允许存储任意数据,只要它是结构化的。

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