❝本节来介绍在 R中如何使用ggplot2结合for循环绘图并保存，下面通过一个案例来看具体操作 ❞ 加载R包 library(tidyverse) library(data.table) library...library(patchwork) 设置文件路径 file_name <- "loop_data.tsv" 读入数据 dat <- fread(file_name, sep="\t") 获取唯一的城市名称进行循环...cities = unique(dat$city) 创建一个空列表来保存创建的图 city_plots = list() 循环遍历并绘图保存 for(city_ in cities) { city_plots...city_]],file=paste0("plot_",city_,".pdf"), width =3.04, height =3.10, units = "in", dpi=300) } 上面我们将每一张图都单独输出了...，下面来介绍如何将其全部组合起来，分别介绍两种R包的方法gridExtra&patchwork grid.arrange(grobs=city_plots,ncol=3) patchwork::wrap_plots
private static boolean writeToTextFileByJson(List<Map<String, Object>> datas, St...
问题 Java 8 中，什么是将流转换为数组的最简单的方式？...String[] stringArray = stringStream.toArray(size -> new String[size])； 其中 IntFunction generator 的目的是将数组长度放到到一个新的数组中去...我们县创建一个带有 Stream.of 方法的 Stream，并将其用 mapToInt 将 Stream 转换为 IntStream，接着再调用 IntStream 的 toArray...; 紧接着也是一样，只需要使用 IntStream 即可； int[]array2 = IntStream.rangeClosed(1, 10).toArray(); 回答 3 利用如下代码即可轻松将一个流转换为一个数组...然后我们在这个流上就可以进行一系列操作了： Stream myNewStream = stringStream.map(s -> s.toUpperCase()); 最后，我们使用就可以使用如下方法将其转换为数组
在 PySpark 中，可以使用SparkContext的parallelize方法将 Python 的列表转换为 RDD（弹性分布式数据集）。...以下是一个示例代码，展示了如何将 Python 列表转换为 RDD：from pyspark import SparkContext# 创建 SparkContextsc = SparkContext.getOrCreate...()# 定义一个 Python 列表data_list = [1, 2, 3, 4, 5]# 将 Python 列表转换为 RDDrdd = sc.parallelize(data_list)# 打印...RDD 的内容print(rdd.collect())在这个示例中，我们首先创建了一个SparkContext对象，然后定义了一个 Python 列表data_list。...接着，使用SparkContext的parallelize方法将这个列表转换为 RDD，并存储在变量rdd中。最后，使用collect方法将 RDD 的内容收集到驱动程序并打印出来。
标签：VBA 这是不是将工作簿中的每个公式转换为值的最快、最有效的方法，请大家评判。 有趣的是，不管工作簿中有多少张表，它都是用一个操作来处理的。...HiddenSheets() As Boolean Dim Goahead As Integer Dim n As Integer Dim i As Integer Goahead = MsgBox("这将不可逆地将工作簿中的所有公式转换为值...,vbOKCancel, "仅确认转换为值") If Goahead = vbOK Then Application.ScreenUpdating = False Application.Calculation...，例如： Sub rangeToValues() Dim r As Range Dim varR As Variant Dim calcState As Long Set r = Selection...r = varR With Application .ScreenUpdating = True .EnableEvents = True .Calculation = calcState
我们大家在工作中应该都是用过Mybatis吧，有时候我们在本地调试的时候，会打开Mybatis的SQL日志打印，那么打印出来的SQL是下图这样的 你可以看到预编译的SQL条件用占位符（？）...不用MAME麻烦，今天就告诉你如何将mybatis日志的Preparing与Parameters转化为可执行sql。...console.log(parametersStr); for(var i = 0; i < parametersStr.length; i++) { // 如果数据中带括号将使用其他逻辑...tempStr = parametersStr[i].substring(0, parametersStr[i].indexOf("(")); // 获取括号中内容...if(tempStr == ''){ tempStr = "null"; } // 如果数据中带括号需要判断参数类型
及网络路径替换为超链接”前的复选框。...图1 然而，对于文档中已经存在的超链接，则还需要逐个取消。...此时，如果想要将文档中所有已有的超链接转换为普通文本，即取消其超链接，可以使用下面的代码： Sub RemoveHyperlinks() Dim objHyperlink As Hyperlink...ActiveDocument.Hyperlinks.Count To 1 Step -1 ActiveDocument.Hyperlinks(i).Delete Next i End Sub 注意，这里没有使用For Each循环...Range .Delete rngRange.Style = wdStyleHyperlink End With Next i End Sub 此外，上述代码存在一个问题：如果文档中存在目录
一、使用流程 Windows下的程序运行崩溃时，往往可以利用pdb文件快速解析出程序崩溃的具体位置，甚至可以对应到源代码的具体行数。...macOS下的symbolicatecrash也具备相应的功能。对应于Windows下的pdb文件，macOS下的crash文件解析需要用到dSYM文件。...当程序崩溃时，通过symbolicatecrash对crash文件和dSYM文件中的符号进行映射，即可将crash文件中的内存地址转换为可读的字符串。以前的博文中也进行过总结，但是并没有具体实践。...而是解析我们感兴趣的内存地址的符号。其方法是：先找到Image的load address，如下： ? ...这里我的程序在内存中的加载位置为0x10c680000（尖括号中的字符串是程序的UUID）。再次找到我们感兴趣的内存地址，如下： ? 再次运行命令： ?
这种模型被广泛应用于机器学习和统计学中，然而对它们进行变分推理在计算上仍然具有挑战性。 难点在于模型的非共轭部分。...在传统的贝叶斯设置中，当先验分布与似然性共轭时，后验分布是封闭形式的，并且可以通过简单的计算获得。例如，在共轭指数族中，后验分布的计算可以通过简单地把充分的似然统计量加到先验的自然参数上来实现。...在本文中，我们将这种计算称为共轭计算(下一节将给出一个例子)。 这些类型的共轭计算已广泛用于变分推理，主要是由于它们的计算效率。...与这些方法相比，我们的方法有一个天然的优势——我们方法中的梯度步骤可以通过使用共轭计算来实现。 我们在两类非共轭模型上演示了我们的方法。第一类包含可以分成共轭部分和非共轭部分的模型。...对于这样的模型，我们的梯度步骤可以表示为共轭模型中的贝叶斯推断。第二类模型还允许条件共轭项。
通常我们会使用比对好的fasta文件构建进化树，fasta文件中大于号后的内容就是最终进化树上的文字标签。如果拿到进化树文件后你想替换掉其中的一些内容，那该怎么办呢？...本篇推文介绍一下使用R语言的ggtree包实现这个目的 这个问题是来源于公众号的一位读者的提问 ?...大家可以关注我的公众号 小明的数据分析笔记本 留言相关问题，如果我恰巧会的话，我会抽出时间介绍对应的解决办法 首先你已经有了构建好的进化树文件 (Synergus:0.1976902387,(((((Periclistus...image.png 第一列x就是进化树中原本的序列名称 第二列y是想要替换成的id名称 读入进化树文件 library(treeio) tree<-read.newick("ggtree_practice_aligned.fasta.treefile...image.png 把这个新的进化树写出到文件里 write.tree(tree1@phylo,file = "pra.nwk") 这样就达成目的了 这里导出的进化树文件没有了最初的支持率的信息，我们再通过一行代码给他加上就好了
1.使用谷歌的Joiner转换 public static String parseListToStr(List list){ String result = Joiner.on...list.stream().map(String::valueOf).collect(Collectors.joining(",")); return result; } 4.使用for循环遍历集合
平时做开发的时候大多都是在Mac系统下，开发环境用的是MAMP集成的，但是Mac系统原本就带有Apache的。...这种情况下回默认使用系统自带的PHP版本，最近由于项目需要用到PHP7.1的版本，在不升级系统版本的情况下实现切换到MAMP环境的PHP版本！...免去系统版本升级麻烦 1.先查出MAMP下面集成的PHP版本 cd /Applications/MAMP/bin/php ls -ls 2.编辑修改 .bash_profile 文件（...没有.bash_profile 文件的情况下回自动创建） sudo vim ~/.bash_profile 在文件的最后输入以下信息，然后保存退出 PATH="/Applications.../MAMP/bin/php/php7.1.1/bin:$PATH" export PATH 红色的部分就是你要切换的php版本类型，我选择的是7.1的稳定版 (看项目需求选择) 3.执行 .bsah_profile
平时做开发的时候大多都是在Mac系统下，开发环境用的是MAMP集成的，但是Mac系统原本就带有Apache的。...这种情况下回默认使用系统自带的PHP版本，最近由于项目需要用到PHP7.1的版本，在不升级系统版本的情况下实现切换到MAMP环境的PHP版本！...免去系统版本升级麻烦 1.先查出MAMP下面集成的PHP版本 cd /Applications/MAMP/bin/php ls -ls 2.编辑修改 .bash_profile 文件（没有.bash_profile...文件的情况下回自动创建） sudo vim ~/.bash_profile 在文件的最后输入以下信息，然后保存退出 PATH="/Applications/MAMP/bin/php/php7.1.1/...bin:$PATH" export PATH 红色的部分就是你要切换的php版本类型，我选择的是7.1的稳定版 (看项目需求选择) 3.执行 .bsah_profile脚本（很重要） source .
前言 希望修改grib中的变量，用作WRF中WPS前处理的初始场 python对grib文件处理的packages python中对于grib文件的处理方式主要有以下两种库： 1、pygrib 2、xarray...：cf2cdm 将cfgrib样式的Dataset转换为经典的ECMWF坐标命名的形式 >>> import cf2cdm >>> ds = xr.open_dataset('era5-levels-members.grib...，与上述一致 for grb in selected_grbs: grb pygrib.index()读取数据后，不支持通过关键字读取指定的多个变量 问题解决：将滤波后的数据替换原始grib中的数据再重新写为新的...grib文件 pygrib写grib文件的优势在于，写出的grib文件，基本上会保留原始grib文件中的信息，基本的Attributes等也不需要自己编辑，会直接将原始文件中的信息写入 替换的大致思路如下...'.grib','wb') for i in range(len(sel_u_850)): print(i) sel_u_850[i].values = band_u[i] #将原始文件中的纬向风数据替换为滤波后的数据
： 基因表达量预测药物反应的R包pRRophetic近期报错解决方案 预测不同组别患者对化疗药物的敏感性 在包的github中作者给了一个使用示例：https://github.com/paulgeeleher...加载R包： library(pRRophetic) 在预测对某个药物的敏感性前，最好先评估数据的正态性，因为CGP中的许多药物的IC50并不是呈正态分布的，此时是不适合使用线性模型的。...用R包自带的硼替佐米数据做个演示，先看下硼替佐米这个药的IC50是不是符合正态分布： data("bortezomibData") pRRopheticQQplot("Bortezomib") 从这个...0.42，还给出了P值、R^2、预测错误率等信息，可以画个图展示下真实结果和预测结果： plot(cvOut) 使用CCLE示例数据 CCLE中只有24个药物，500+细胞系，用的很少，数据量比CGP...预测全部药物的敏感性 假如我们要对自己的表达矩阵预测所有药物的敏感性，只需要把所有的药物提取出来，写个循环即可，这里以cgp2016的药物为例。
（1）用Student’s t-test 计算差异基因表达、差异甲基化，用GISTIC2方法识别样本的拷贝数扩增和缺失，将样本根据基因的拷贝数状态分组，然后用Student’s t-test 计算差异表达...当ASk+1评分超过（1+r）ASk时没有其他基因增加，或者在当前子通路中任何两个节点之间的距离大于3，以保持局部搜索，搜索算法将停止。...在应用于生物网络的贪心启发式算法中，有证据表明参数r = 0.05是合适的 (Chuang et al., 2007)。...当同一通路中每对子通路之间的Jaccard index大于0.6，将这两个子通路结合，这样确保了识别的子通路包含了更多的信息，减少了冗余。...key subpathways 所用示例数据：zzz，是基因表达P值、校正后P值、z-score数据 require(graphite) #载入graphite包 #graphite包，将通路拓扑转换为基因网络
如何将字符串中的子字符串替换为给定的字符串？ strtr()函数是PHP中的内置函数，用于将字符串中的子字符串替换为给定的字符串。...该函数返回已转换的字符串；如果from和to参数的长度不同，则会被格式化为最短的长度；如果array参数包含一个空字符串的键名，则返回FALSE。 php strtr()函数怎么用？...规定要转换的字符串。 ● from：必需（除非使用数组）。规定要改变的字符（或子字符串）。 ● to：必需（除非使用数组）。规定要改变为的字符（或字符串）。...一个数组，其中的键名是原始字符，键值是目标字符。 返回值 返回已转换的字符串。...如果 from 和 to 参数的长度不同，则会被格式化为最短的长度；如果 array 参数包含一个空字符串（""）的键名，则返回 FALSE。
题目 将一个 二叉搜索树 就地转化为一个 已排序的双向循环链表 。...对于双向循环列表，你可以将左右孩子指针作为双向循环链表的前驱和后继指针，第一个节点的前驱是最后一个节点，最后一个节点的后继是第一个节点。 特别地，我们希望可以 就地 完成转换操作。...当转化完成以后，树中节点的左指针需要指向前驱，树中节点的右指针需要指向后继。 还需要返回链表中最小元素的指针。 示例 1： ?...root = [1] 输出：[1] 提示： -1000 <= Node.val <= 1000 Node.left.val < Node.val < Node.right.val Node.val 的所有值都是独一无二的...} cur->right = head;//最后的尾节点后继是头 head->left = cur;//头节点的前驱是尾节点 return head;//
其实有些R包并不复杂，而且看源码的过程也是一种学习的过程，等以后自己写R包的时候也能用上一些技巧嘛 下面则是我看了MSstats包的几个重要函数后的随笔，记录了个人理解下的其运行的原理（主要其发表的文章中并未提起原理部分...其原理我认为是这样的：在MS分级中，会将样本等量分成N份，对应的就是N个run，从而将不同特性的离子区分开；那么在某个run里鉴定到肽段数目一般相比其他run来说应该是最大的 代码中有个问题，其只循环了样本...SummaryMethod是否为logOfSum决定的，但是默认都是TMP，则对应的就是linear model，个人觉得跟limma中的lm算法可能有点关系；还有种算法则是logsum t-test，...总体上可看出其是根据Protein Group下不同样本的肽段的丰度值来进行差异分析的，我怎么看感觉其是将每个肽段的丰度值看成了一个'取样'来处理了（主要是看logsum t-test算法的，linear...model没这么看懂，所以也就不确定了）；不像一些蛋白组定量中的T-test检验，是针对同一个Protein Group对应不同样本的丰度值（这就是基于蛋白水平的丰度值了） Summary 折腾了一周
今天把之前组团翻译的 Cookbook for R 也放到了 Gitee 上，国内访问和阅读的体验感会上升很多。...https://shixiangwang.gitee.io/cookbook-for-r-chinese/ ?...sleep数据的宽格式版本；下面我们将看看如何处理长格式和宽格式的数据。...默认的不是Student t检验而是使用了Welch t检验。注意Welch t-test结果中df=17.776，这是因为对不同质方差进行了校正。...这种情况中，我们能通过group和ID变量进行排序来确保顺序是一样的。关于排序更多信息参见Sorting。
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