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R包安装方式以及Github包安装报错解决

写在开头 最近在疯狂补数据挖掘课以及跟着生信技能树整理的#R语言在补充R语言基础知识 恰好看到了无法在线下载安装GitHub包?...R包安装的方式 之前在学习数据挖掘课程的时候,就按照小洁老师教的方法整理过相应的笔记啦,R包安装与使用 那我们先回顾一下,基本的R包安装方法——配置好镜像,然后按照对应的来源安装需要的R包。...所以可以按照报错信息提供的网址,R包下载到本地之后导入到Rstudio里面 remotes::install_github("genecell/COSGR") #报错信息 Downloading GitHub.../repos/genecell/COSGR/tarball/HEAD' R包安装报错 下载到本地之后再导入Rstudio 根据报错信息中提供的网址,R包下载到本地,保存在你能方便找到的地方。...在使用remotesR包导入Rstudio中 # 括号里填入R包所在的位置 remotes::install_local(".

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截断字符串或二进制数据解决办法_数据字符串转换日期失败

在EF中,使用CodeFirst给实体添加约束的时候,使用NeGut控制台进行更新到数据库中,先使用add-migration migrationName命令进行创建(migrationName是进行更新的名字...),然后使用Update-Database进行更新到数据库,此时报出问题: 截断字符串或二进制数据。...错误原因 为什么会报出这个问题,原因就是添加的限制和数据库中已经存储的数据有了冲突。 例如,限制用户ID只能是数字,但是数据库中用户ID里面有数字意外的符号,此时就会报出这种错误。...解决方法 解决办法就是,在数据库中将所有在限制之外的数据全部修改成符合限制的数据,或者调整限制即可 版权声明:本文内容由互联网用户自发贡献,该文观点仅代表作者本人。...如发现本站有涉嫌侵权/违法违规的内容, 请发送邮件至 举报,一经查实,本站立刻删除。

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2023-11月的马拉松在线互动授课答疑精选

(但是,2024已经没有这个问题了) 该包出自 Y 叔实验室,在 github 上面有相关的 issue:https://github.com/YuLab-SMU/clusterProfiler/issues...6【R包】HPO这个,我下载到本地了还是不行 你下载包括HPO和mpo一起的,你应该先解压出来,里面是两个gz文件,分别安装。 7【R包】请问这种情况需要做什么吗?...19【R包】为什么我是b报错然后引号后就能出结果,但a没引号不报错? 这里是因为a<-1 是程序识别为 a <- 1。<-是赋值符号。 20【R包】每次上课前都要library一遍么?...28【Rstudio】请问内置数据的显示会出现不一致的情况吗?比如volcano这个矩阵。dim显示的是61列,没有问题,但是在数据窗口只能看到50列 更新Rstudio即可,R语言可以不用更新。...可以Days转化为character后合并到原数据框,factor转化这一个新的列。 43【R实战】这个报错是怎么回事啊 多加了一个加号。

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基于R语言的shiny网页工具开发基础系列-07

要通过GitHub共享应用,请在GitHub上创建项目存储库。然后您的app.R文件以及该应用程序使用的所有补充文件存储在存储库中。...Shiny应用程序转换为网页的最简单方法是使用Shinyapps.io,RStudio的Shiny应用程序托管服务。...shinyapps.io使您可以直接R会话应用程序上载到RStudio托管的服务器。您可以完全控制您的应用程序,包括服务器管理工具。...使用RStudio Connect,您可以通过按一下按钮RStudio IDE中进行发布,并计划执行报告和灵活的安全策略。...如果您需要更严格的控制或要管理大量流量,则可以RStudio购买RStudio Connect。 恭喜你 您已经完成了整个Shiny开发过程。您可以构建复杂的反应式应用程序,进行部署并与他人共享。

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eyedroppeR精准获取图片中的颜色代码

欢迎关注R语言数据分析指南 ❝本节来介绍一款R包「eyedroppeR」其最主要的作用就是导入的图片提取其中的颜色并返回十六进制的代码,小编测试后发现准确度非常的高,从此再也不用为颜色搭配而发愁了。...感兴趣的朋友欢迎分享转发,「更多详细内容请参考作者官方文档」 ❞ 官方文档 ❝https://github.com/doehm/eyedroppeR 安装R包 ❝eyedroppeR包的安装包约有30M...,在线下载失败的概率很大,建议压缩包下载到本地进行安装 ❞ remotes::install_local("eyedroppeR-main.zip",upgrade = F,dependencies...extract_pal(5, path, label = "Caye Caulker, Belize", sort = "auto") 可以看到识别结果非常的准确,右侧在图片下面展示出调色板,Rstudio

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生信学习小组Day4笔记—Chocolate Ice

注意:如果电脑用户名是中文,必须改成英文才能安装Rstudio,不然会安装失败。...是当前Rstudio默认的读取和存储位置。因此了解工作目录的概念和并且掌握管理方式非常重要,这样在同时进行多个项目时,每个项目的脚本、文件、图片、数据等才不会乱跑或混杂。...可以将对应的研究数据也移到"test"文件夹,方便数据的读取。...后续新建的脚本、保存的图片,以及记录历史代码的Rhistory文件、记录environment内容的RData文件也都会默认保存在test文件夹内 养成良好的习惯,Rproject打开Rstudio!...图片红圈:浏览...黄圈:一键返回工作目录显示某个目录下的文件列表dir()或者list.files()不设置参数的话,返回的就是工作目录下的文件图片图片加减乘除+:-:减*:乘\:除^:平方sqrt

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利用PyCharm打造高效的R语言开发环境

目前,大多数人仍然使用RStudio进行R语言开发。与RStudio相比,PyCharm具有更多的优势,可以提高开发效率。...PyCharm与RStudio界面对比,同样的代码在PyCharm中更具可读性 ? PyCharm简介 ?...集成Jupyter Notebook:PyCharm集成了Jupyter Notebook,可以在IDE中直接运行和编辑Notebook,无需额外的安装和配置,方便进行数据分析和实验。...3.2、安装方法二:离线安装插件R Language for IntelliJ 如果我们因为网络问题在线安装失败,那可以选择插件下载到本地再进行安装,具体方法如下:     3.2.1、先从jetbrains...3.2.2、安装 安装时选择下载到本地的压缩文件即可 ? 注意:安装完插件后一定要重启一下PyCharm软件!!!

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R沟通|​在Rstudio中运行tex文件

这期主要介绍下如何在Rstudio中运行和使用.tex文件,并给大家安利一个非常nice的模板和根据该模板制作的案例。...使用教程 在ElegantPaper[1]网站中下载整个仓库,可以直接下载到本地github或者下载压缩包。 ?...解压压缩包,找到主要的.tex文件(比如这里的中文文件cn),通过Rstudio打开。 ? 点击Compile PDF即可得到模板对应的paper了。 ? ?...具体如何下载可以参考TinyTeX 中文文档[2] 具体样例 小编研究生一年级期末作业(数据包络分析,复杂网络,回归分析等)就是用这个模板制作的,现在正好出文档沟通系列,就给大家献丑下?。 ? ?...(银行存管)说明: https://github.com/EthanDeng/bank-custody

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“疫”外收获-nCov2019全球疫情之南丁格尔玫瑰图

nCov2019包的安装需要依靠remotes包,同时也要注意RStudio的版本是否适合,否则可能安装失败。...01 安装包 >install.packages("remotes”) >library(remotes) >remotes::install_github("GuangchuangYu/nCov2019...today_gb1其实就相当于我们在excel中将today这个一维数据列表根据cum_confirm列的数据信息转变为二维数据列表,这个二维数据cum_confirm中数值一样的country进行汇总...尽管代码运行,发现Cairo能够安装成功,但是library加载时却失败,倘若盆友知道原因,可以留言告知,谢谢!...版本的Cairo包,试图通过RStudio的Tools手工安装,但是始终无法安装至于System library,具体原因有待深究.....尽管,安装Cairo包失败,但仍想附上使用代码,万一哪天就成功了呢

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2023-08月的马拉松在线互动授课答疑精选

版本不一致,会影响后续学习不 建议R语言升级到4.3,群公告网盘里有4.3的R,直接覆盖安装。 17【准备工作】这正常么?怎么是中文的啊 没关系了,中英文都可以。...而且也可以通过代码设置它临时使用英文给你报错信息哦 18【准备工作】好多安装失败,是不是因为我又装了一次Rstudio啊? 异常的R包,找到前面对应 install的 代码,运行一下。...或者重启一下Rstudio看看能不能解决。 22【GEO】不同的GEO数据大小差别这么大正常吗?...26【R】Day5天的习题5-1中文件保存为Rdata并加载他,为啥提示找不到文件呢 list = 这个是啥,应该是 file =。...我设置了时间,现在删了还是登不上 github失败很正常,但是这个包不需要github安装啊,你直接install即可。

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R分享|玩转数据处理120题

前段时间推了一篇推送:R语言数据处理120题。如今张敬信老师[1]这120题进行重新整理,写了一份基于tidyverse的版本。...该版本所有代码( .Rmd文件),数据以及pdf都发布在张老师的Github[2]和码云[3]上了(链接见文末的参考文献)。 内容十分丰富,可以作为学习《R数据科学》补充作业。...获取方式 这里以github为例,打开文末第二个链接,你会看到如下界面。然后可通过下载压缩包存到本地,也可以直接下载到本地的github桌面版本上。 ?...想学习其他快捷键操作可参考我以前的推文:Rstudio常用快捷键以及窗口操作有用技巧 ?...为了方便大家学习,我已经张老师github中的整个文件放到公众号,在公众号后台回复玩转120题即可获取。

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数据处理必备—R安装

CRAN是R搜索以查找要安装的软件包的默认存储库: install.packages("devtools") require("devtools") ?...可以使用上面安装的“devtools”软件包直接github下载和安装R软件包。...5.1.4 来源 安装包的最终方法是直接源代码。在这种情况下,您必须下载完整构建的源代码文件,通常是packagename.tar.gz,或克隆github存储库并自行重建包。...通常,只有在您自己编辑包时,或者由于因为某种原因之前的方法失败时才会执行此操作。...关于R安装更多详细解读请学习生信技能树和生信菜鸟团的相关教程 一起加个技能-有点儿正经(R和Rstudio安装) 整天说要做数据挖掘,咱先把R安装上好么?保姆级R语言安装指导。

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pdf格式的图片如何插入到word中

太长不看篇 1,在R中将图片保存为pdf格式 2,通过在线网站,pdf转为png 3,png粘贴到word中即可 背景0 今天做了一个相关性分析,以及可视化。...可视化的图我在Rstudio中保存为png格式,放大后很模糊,我就将其保存为pdf格式,放大后也不失真,很满意。 然后我要将其放到word中,问题来了,怎么高清的pdf图片格式放到word中呢?...废话2 pdf复制到word中,双击pdf的图标就可以打开pdf…… ? 操作失败3 据说,word中可以直接插入pdf 「插入 ---> 对象 ----> 对象」 ?...把pdf图片加载到网站上,开始处理。转化为JPG的格式如下: ? 放大一点,也没有失真: ? 如果是直接R中导出的png文件,放大后失真: ?...效果如下:可以看到R中直接导出的png,粘贴到word中(左图),放大之后就模糊了,而R中导出pdf然后再转为png的文件,放大之后还比较清晰。 ?

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R包各大镜像纷纷宕机

本来以为是写了:【紧急通知】下载R包却联网失败?初学者的痛,大家应该是不再发邮件咨询我R包安装问题,没想到的是碰到了R包各大镜像纷纷宕机! ?...2期(两天变三周,实力量),医学生/临床医师首选技能提高课 不过绝大部分(99.99%)的粉丝无缘我们学习班,我只能是通过公众号的方式告知大家这个解决方案了。...关于https和http协议 纯粹是增加我们的认知负担,不建议大家去学习了,如果你感兴趣,可以看:Windows电脑使用Rstudio会有多少错误呢 ,下面的两个代码也会对你有帮助 options(download.file.method...很多朋友之所以学习R语言其实就是为了重复一些简单的数据库挖掘文章,所以我也顺便录制了GEO数据库挖掘课程,代码在:https://github.com/jmzeng1314/geo,如果你网络很差,就下载打包版本的...仓库存放相关学习路线指导资料:https://github.com/jmzeng1314/R_bilibili

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八、R包安装、加载、报错

来源和安装方式是对应的,哪里来/怎么安装 (1)CRAN网站 install.packages() (2)biocounductor....BiocManager::install() (3)github devtools::install_github() ##需要用户名称 安装的时候包的名字需要引号...例如:install.packages("stringr") 安装后需要加载,加载的时候不加引号都可以, 两个都是加载,load是加载数据,library是加载R包 library()...更换网络,设置镜像 6)not writable / permission denied 权限问题:管理员方式重新打开Rstudio,重新运行代码。 7)????? 中文用户名,需要修改环境变量。...(4)解决问题的正确姿势 图片 重启包括1.session的重启;2.Rstudio的重启;3.电脑的重启 #以上内容均来自在生信技能树的学习

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使用CGP数据库的表达矩阵进行药物反应预测

from the CGP website Curve fitting code is now available as an R package – gdscIC50 – available on GitHub...所有的关于这些癌症细胞系的各种数据,都可以在 ftp://ftp.sanger.ac.uk/pub4/cancerrxgene/releases 下载到。...所以研究者通常认为我们要想预测药物作用就得收集尽可能的的信息,比如使用全基因组范围的snp信息来预测复杂性状,但是癌症患者有个特性,就是他们的染色体通常是非整倍体,所以肿瘤样本里面测序得到可靠的基因型其实是比较困难的...作者选取了Cancer Genome Project (CGP) 数据库里面收录的 700多种细胞系的 138 种药物的作用情况,开发了算法,而且在 4 个符合要求的数据集里面验证了可靠性。 ?...首先需要R, RStudio, Latex相应组件,RStudio里的kintr包。

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R语言基础教程——第2章:R下载安装和环境搭建

点击新建,刚刚安装的R地址粘贴到框中,我这里的安装地址是:D:\Program Files\R\R-3.6.0\bin,点击确定。 ? 在dos命令行窗口输入R,回车就进入R环境。 ?...Rstudio安装 R语言是用于统计分析,图形表示和报告的编程语言和软件环境;Rstudio是编辑、运行R语言的最为理想的工具之一。...如果在安装Rstudio之前已经安装R,那么Rstudio会自动配置好R环境。...主要内容包括:包的内置所有函数,是更为详细的帮助文档 2 查看当前环境哪些包加载 find.package() 或者 .path.package() 3 移除包出内存 detach() 4 把其它包的数据载到内存中...data(dsname, package="package_name") 5 查看这个包里的包有数据 data( package="package_name") 6 列出所有安装的包 library

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