本文将详细介绍如何在Linux中使用管道将命令的输出传递给其他命令,并提供一些常见的使用示例。图片1. 管道的语法在Linux中,管道使用竖线符号 | 表示,它位于两个命令之间。...管道的工作原理当使用管道连接两个命令时,第一个命令的输出不会直接显示在终端上,而是通过管道传递给第二个命令作为输入。第二个命令将处理第一个命令的输出,并将结果输出到终端上。...以下是一个示例:cat file.txt | grep "pattern" | wc -l在这个示例中,首先使用 cat 命令将文件 file.txt 的内容输出,然后将结果通过管道传递给 grep 命令进行筛选...,找出包含 "pattern" 的行,最后将结果再通过管道传递给 wc -l 命令进行行数统计,最终输出包含 "pattern" 的行数。...总结在Linux中,使用管道将命令的输出传递给其他命令是一种强大且灵活的方式,可以实现多个命令之间的数据传递和处理。通过合理地组合不同的命令,可以实现复杂的数据操作和处理任务。
本文将详细介绍如何在Linux中使用管道将命令的输出传递给其他命令,并提供一些常见的使用示例。 1. 管道的语法 在Linux中,管道使用竖线符号 | 表示,它位于两个命令之间。...管道的工作原理 当使用管道连接两个命令时,第一个命令的输出不会直接显示在终端上,而是通过管道传递给第二个命令作为输入。第二个命令将处理第一个命令的输出,并将结果输出到终端上。...以下是一个示例: cat file.txt | grep "pattern" | wc -l 在这个示例中,首先使用 cat 命令将文件 file.txt 的内容输出,然后将结果通过管道传递给 grep...命令进行筛选,找出包含 "pattern" 的行,最后将结果再通过管道传递给 wc -l 命令进行行数统计,最终输出包含 "pattern" 的行数。...总结 在Linux中,使用管道将命令的输出传递给其他命令是一种强大且灵活的方式,可以实现多个命令之间的数据传递和处理。通过合理地组合不同的命令,可以实现复杂的数据操作和处理任务。
接下来我们将学习和使用purrr包,它提供的函数可以替代很多常见的for循环应用。R基础包中的apply应用函数族也可以完成类似的任务,但purrr包的函数更一致,也更容易学习。...使用purrr,我们可以解决子问题,然后用管道将其组合起来。 映射函数 先对向量进行循环,然后对其每一个元素进行一番处理,最后保存结果。...每种类型的输出都有一个相应的函数: map()用于输出列表 map_lgl()用于输出逻辑型向量 map_dbl()用于输出双精度型向量 map_chr()用于输出字符型向量 每个函数都使用一个向量(注意列表可以作为递归向量看待...purrr提供了pmap()函数,它可以将列表作为参数。...当使用函数的目的是向屏幕提供输出或将文件保存到磁盘——重要的是操作过程而不是返回值,我们应该使用游走函数,而不是映射函数。
感觉purrr 包的函数非常像py 中的匿名函数相关的函数。 而功能上,其起到的作用更像是简化和丰富了apply 家族函数的调用。...除此之外,map 还有其他的变种: modify(),输入一个数据自变量和一个函数, 输出与输入数据同类型的结果; map2()可以输入两个数据自变量和一个函数, 将两个自变量相同下标的元素用函数进行变换..., 输出列表; imap()根据一个下标遍历; walk()输入一个数据自变量和一个函数, 不返回任何结果,仅利用输入的函数的副作用; 输入若干个数据自变量和一个函数, 对数据自变量相同下标的元素用函数进行变换...输入类型和输出类型两两搭配, purrr包提供了27种map类函数。...purrr包的pmap类函数支持对多个列表、数据框、向量等进行向量化处理。pmap不是将多个列表等作为多个自变量, 而是将它们打包为一个列表。
R-Purrr的使用,加速数据处理 Tidyverse中包含一个purrr程序包,之前在看数据处理分析时候,一直看到别人的code中,涵盖purrr,map函数,但是一直不知道这个是干什么的,现在发现purrr...Purrr 主要是替换for循环的使用。 Purrr引入了map函数以及一些用于操纵list的新函数。cheatsheet可以速查一些关于Tidyverse使用方法。...functions: beyond apply map函数是对list或者vector进行统一类似的函数操作,譬如对不同性别求平均年龄等,与apply函数相似。..., 4, 7), addTen) 或者直接 map(c(1, 4, 7), addTen),当然了上面介绍了map函数可以有不同的输出格式: map(c(1, 4, 7), addTen) # list...= addTen(.x))) }) 请注意,在这种情况下,我定义了一个“匿名”函数作为每次迭代的输出。
数据处理 dplyr/rlist/purrr 1. dplyr dplyr包是现在数据流编程的核心,同时支持主流的管道操作 %>%,主要的数据处理方法包括: (1)高级查询操作: select...3. purrr purrr向Scala这样的具有高级类型系统的函数式编程语言学习,为data frame的操作提供更多的函数式编程方法,比如map、lambda表达式。...此外,purrr引入了静态类型,来解决原生的apply函数族类型系统不稳定的情况。 我遇到过一个非常头疼的apply函数的问题:apply内的表达式计算结果不一致。...ggvis最明显的区别就是在作图时直接支持%>%的管道操作,比如: ggplot2与ggvis的关系类似于plyr与dplyr的关系,都是一种演化过程。 六....比如: 这时候broom包就派上用场了,直接将统计结果转化为data frame格式: glance()函数,返回data frame格式的部分参数结果 七.
其中,readr包用于读取数据,tidyr包用于整理数据,dplyr包用于数据转换,ggplot2包用于数据可视化,purrr包用于函数式编程。...1 readr包:快速读写 1-1 readr包提供了几个新函数,能够更快的读取文件 readr包中的主要的函数有: read_csv,read_tsv,read_table,read_delim, write_csv...包:函数式编程 用R写循环从低到高有三种境界:手动 for 循环,apply 函数族,purrr 包泛函式编程。...包讲解 map系列函数的返回值如下: map_chr(.x, .f): 返回字符型向量 map_lgl(.x, .f): 返回逻辑型向量 map_dbl(.x, .f): 返回实数型向量 map_int...f522c9f56cf2d8cca5f7b390aa3f2d7c.html [10] tidyverse简介与管道: https://zhuanlan.zhihu.com/p/243376822 [11
purrr::map,你应该会看到下面一段话: If a formula, e.g. ~ .x + 2, it is converted to a function....公式函数用法 核心是什么 公式函数的优点在于提供了一种构造匿名函数的简洁方式。而核心在于在同一行代码表示如何使用输入构造出输出。...2 次,使用公式函数结合 purrr 可以写出更简洁的代码: df3 purrr::map_df(df, ~ (.x - mean(.x)) / sd(.x)) 我们检查下两种操作是否结果相同:...identical( purrr::map_df(df, ~ (.x - mean(.x)) / sd(.x)), purrr::map_df(df, ~ (. - mean(.)) / sd(...,它并不是必需的技能,直接构造函数在大部分情况下可读性更好,读者千万不要本末倒置。
当只传入一个函数时,pipe()的效果等同于直接用函数对dataframe处理:func(df),与apply()、applymap()、map()等的处理结果是一样的。...这种情况就该pipe()管道函数登场了。...= (df.pipe(np.square) .pipe(np.multiply, 1.5) .pipe(np.add, 8)) pipe链式调用的原理是: pipe将每次执行完的函数结果传递给下一个函数...,即上个输出作为下个函数的输入,以此类推像链子一样可以一直传递下去,这也是管道函数名字的由来。...输入数据的,如果直接将函数传到pipe()中会提示报错。
purrr中有多个迭代函数,可以用于快速解决循环迭代的问题,purrr中常用的迭代函数有map、map2、walk、reduce等等。...map map(.x, .f, ...) map函数接受一个向量、列表,对其每一个元素执行函数。 数据框其实是一种格式化表示的列表,所以也可以使用map迭代。 map函数默认返回列表。...注意:此时的跳过是指的不对跳过的列执行函数mean,直接将其内容返回。...在使用管道时,可以使用%$%: library(magrittr) list(mean=1:3, sd=4:6) %>% tibble::enframe() %$% map2(name, value...[[1]], collapse="")) #[[1]] #[1] "mean1" # #[[2]] #[1] "sd4" pmap pmap(.l, .f, ...) pmap代表对多个列表进行迭代,将多个列表包装为一个列表传给
install.packages会提示R包不存在,这种问题可能是R包未提交到CRAN官方仓库,而安装github上的包则需要知道作者名及仓库名,因此使用packagefinder包在Rstudio内执行代码则会直接跳转到...包写循环时会使得过程极为简洁,但是不利于直观阅读代码过程,而loopurrr内的as_loop函数则可将此过程转换为常见的for循环。...中的哪些函数适用as_loop() #> $map #> [1] "map" "map_at" "map_chr" "map_dbl" "map_df" "map_dfc" "map_dfr...::map(sum) > x %>% purrr::map(sum) [[1]] [1] 1 [[2]] [1] 3 [[3]] [1] 6 循环转换 x %>% purrr::map(sum...) %>% as_loop() # --- convert: `purrr::map(x, sum)` as loop --- # out <- vector("list", length = length
虽然R语言也有“循环”,但有些函数更直接,例如apply()函数map()族和函数族。map()族比apply()更直观,因此主要学习map()。...`map`系列函数 purrr包map()提供了一系列函数,它是tidyverse中的一个包。参阅R for Data Science一书。.../Intro-to-R/lessons/map_purrr.html)。...library(purrr) # Load the purrr samplemeans map_dbl(rpkm_ordered, mean) 可以将这个包含的12个元素的向量作为一列,添加到...将图片导出到文件 有两种方法可以将图输出到文件中(而不是简单地在屏幕上显示)。第一种(也是最简单的)是直接从RStudio“Plots”面板导出,点击绘图面板上方的Export。
purrr替代循环 1 purrr循环 引用知乎张敬信的说法: ❝用 R 写 「循环」 从低到高有三种境界:手动 for 循环,apply 函数族,purrr 包泛函式编程。...❞ R写循环有三个境界: 手动for循环 apply循环 purrr泛函式编程 其中,手动for循环我最常用,apply系列半吊子,purrr函数一窍不通,所以要学习一下。...6.1 直接在函数的函数内部 比如,要计算每一列的平均值,允许缺失值,需要用到参数na.rm = T,可以这样写: > map(dat,~mean(.x,na.rm = T)) $x1 [1] -0.1100182...6.2 直接在函数内部写 这里,因为map函数的用法是:map(.x, .f, ...)...walk,类似map函数 walk2,类似map2函数 pwalk,类似pmap函数 上面的MET数据,我们可以将数据按照品种分组,批量的保存名为地点的数据csv中。
如果 be_join 不为空,进行如下的循环: 如果存在,则将这个子集和 to_join 按共同列合并 如果不存在,使用循环位移一位,将当前 be_join 的第 2 个子集移动为 第 1 个。...2 S1 S2 S2 S1 S2 更新 在后面的一些使用过程中发现基础包的 merge() 函数在进行连接操作时会输出有问题的结果,所以建议使用的小伙伴仔细检查结果。...::map(G, colnames) check_list <- combn(seq_along(cnames), 2, simplify = FALSE) common purrr::map...(check_list, ~ intersect(cnames[[.[1]]], cnames[[.[2]]])) # Index to reduce ri purrr::map_lgl...= 0) if (any(ri)) { purrr::map2(check_list[ri], common[ri], .f = function(x, y) { if (!
管道函数 %>% 在tidyverse中,管道符号是数据整理的主力,它的功能和Linux上的管道符“|”类似,可以把许多功能连在一起,而且简洁好看,比起R的基本代码更加容易阅读!...%>% 的作用就是将iris数据用于管道后面的head函数。...,将filter函数作用于iris数据) ?...利用管道符,先过滤(filter),然后只保留Petal.Width函数(select) ?...统计:broom broom是一个用于数学建模的包,以回归分析为例,R中的各种回归分析往往不会返回一个整齐的data frame结果,而broom 则帮助我们直接将统计结果转化为data frame格式直接将统计结果转化为
以前我们做了一个Seurat包官方的可视化函数投票:可视化单细胞亚群的标记基因的5个方法,下面的5个基础函数相信大家都是已经烂熟于心了: VlnPlot(pbmc, features = c("MS4A1...SCP-整合流程 端到端的单细胞管道SCP-细胞质控 端到端的单细胞管道SCP-标准流程 端到端的单细胞管道SCP-快速开始 SCP—为单细胞分析设计的端到端解决方案 端到端的单细胞管道SCP-安装 接下来分享另外一个本身珍藏已久的年度爱用包...此外,对于10x Genomics cellranger的输出结果,构建方式如下: 2.2 绘图色板设置: pal <- tibble(var = c("sample", "group","seurat_clusters...自动绘制的条形图: 接着就可以走Seurat的标准流程:标准化,高变基因,CellCycleScoring打分: scRNA_f %% purrr::map(.f = NormalizeData...) %>% purrr::map(.f = FindVariableFeatures) %>% purrr::map(.f = CellCycleScoring,
柯里化允许我们把函数与传递给这个函数的参数相结合,产生出一个新的函数。 如:下列代码中,add1是把1传递给add函数的curry方法后创建的一个新函数。...如果API如,map、filter一样定义,我们可以使用curry函数解决问题。...在函数式编程中,”接受一个参数并返回数据“正是遵循了该条思路。 2、每个程序的输出应该是另一个尚未可知的程序的输入。 管道 管道允许我们通过组合一些函数去创建一个能够解决问题的新函数。...函数式组合 如下示例代码: map(filter(arg,(item)=>item.rating[0]>4.5),(item)=>{ return {} }) 我们看到,上面代码中filter输出的数据被作为输入参数传递给...map函数。
概述 Pipe 语法可以将函数调用按顺序打平。..., arg) 的语法,将任意函数柯里化。这个特性解决 F# 传参复杂问题简直绝配,因为 F# 的每一个 Pipe 都要求是一个函数,我们可以将要传参的地方记为 ?...复用变量 改造一下,将中间变量变成复用的: let $ = inputSet $ = filter($, x => x >= 0) $ = map($, x => x * 2) const resultSet...,而且大部分都是单输入、单输出。...总结 pipe 直译为管道,潜在含义是 “数据像流水线一样被处理”,也可以形象理解为每个函数就是一个不同的管道,显然下一个管道要处理上一个管道的数据,并将结果输出到下一个管道作为输入。
status), vars(rx, sex, age, obstruct, perfor, nodes, differ, extent)) %>% forest_plot() #%>%:dplyr包中的管道传参...可以指定应该根据输出结果中哪些变量排序,默认HR。 forest_plot(aa1) 2. analyse_survival:使用单协变量或无协变量对右删失数据进行生存分析。...risk.table.height = 3, ncensor.plot.height = 1, ) print(kmg)#展示图片 ggsave("kaplan_meier_grid.pdf", kmg)#保存 管道函数...forest_plot()用于做图 forest_plot(am) %>%是dplyr包的管道函数,能够将上一步的结果传递给下一步的函数作为参数,具体用法就是 x %>% f(y)—> f(x, y)...且支持在管道中使用。
通常我们会直接处理数据的输出,可以这么做。...首先过滤器可以用在两个地方:差值表达式 {{ }} 和 v-bind 表达式,然后由管道操作符“ | ”进行指示。 知道在什么地方时候,那我们就再来看看如何定义过滤器。我们有两种方式定义。...我们利用过滤器来修改上面的表格输出格式。...value : "--"; } } 过滤器参数 过滤器会把表达式中的值始终当作函数的第一个参数。由于过滤器是一个函数,所以我们也可以额外的传入参数。...{{ data | filterA | filterB }} 串联使用时,会把第一个产生的结果,作为参数传递给第二个过滤器使用,以此类推。
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