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    R语言ggtree:进化树序列id改成物种名称

    通常我们会使用比对好fasta文件构建进化树,fasta文件中大于号后内容就是最终进化树上文字标签。如果拿到进化树文件后你想替换掉其中一些内容,那该怎么办呢?...本篇推文介绍一下使用R语言ggtree包实现这个目的 这个问题是来源于公众号一位读者提问 ?...大家可以关注我公众号 小明数据分析笔记本 留言相关问题,如果我恰巧会的话,我会抽出时间介绍对应解决办法 首先你已经有了构建好进化树文件 (Synergus:0.1976902387,(((((Periclistus...image.png 第一列x就是进化树中原本序列名称 第二列y是想要替换成id名称 读入进化树文件 library(treeio) tree<-read.newick("ggtree_practice_aligned.fasta.treefile...image.png 把这个新进化树写出到文件里 write.tree(tree1@phylo,file = "pra.nwk") 这样就达成目的了 这里导出进化树文件没有了最初支持率信息,我们再通过一行代码给他加上就好了

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    容器学习笔记之Googlegcr.io、k8s.gcr.io 换为国内镜像

    0x00 添加docker官方国内镜像 sudo tee /etc/docker/daemon.json <<-'EOF' { "registry-mirrors": ["https://registry.docker-cn.co..."] } EOF 0x01 gcr.io镜像换为国内镜像 根据开源项目: https://github.com/anjia0532/gcr.io_mirror 作者gcr.io相关镜像pull下来,...里yaml默认是k8s.gcr.io镜像,为了方便运行我们可以预先拉取相关镜像: pull-google脚本 # vim pull-google.sh image=$1 echo $1...镜像打tag docker tag anjia0532/google-samples.gb-frontend:v4 gcr.io/google-samples/gb-frontend:v4 0x03...利用替换已有的yaml方法 除了预先拉取镜像,我们还可以k8s.gcr.io 替换为可执行镜像 为了方便替换,我们编写一个repair_yaml 脚本: # vim /usr/local/bin/repair_yaml

    2.5K30

    视频结构化平台EasyNVR开发如何将其他用户Docker仓库进行镜像迁移?

    如果有研发人员Docker镜像安装在自己账号,则不方便整个项目的统一管理,因此需要将Docker镜像推送到公有账户。 如何将其他用户Docker仓库存储在另外账号,本文和大家分享一下。...在命令行运行以下命令将对应Docker镜像拉取下来: docker pull xxxx/yyyyy:1.0.31 其中 : 后面的为标签。...2、然后将该镜像标记为新标签: docker image tag xxxx/yyyyy:1.0.31 zhanghu/yyyyyy:1.0.31 其中账号为账号名称。...3、最后镜像推送到账号: docker push zhanghu/yyyyyy:1.0.31 ? 通过上述步骤,我们可以任何一个Docker镜像从一台机器迁移到另一台机器。...总结要点只有两个:首先我们要把容器构建为Docker镜像。其次就是该Docker镜像被作为tar包文件保存到本地。关于EasyNVR开发问题,我们将不定期更新,欢迎大家关注和了解。

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    视频结构化平台EasyNVR开发如何将其他用户Docker仓库进行镜像迁移?

    如果有研发人员Docker镜像安装在自己账号,则不方便整个项目的统一管理,因此需要将Docker镜像推送到公有账户。 如何将其他用户Docker仓库存储在另外账号,本文和大家分享一下。...在命令行运行以下命令将对应Docker镜像拉取下来: docker pull xxxx/yyyyy:1.0.31 其中 : 后面的为标签。...2、然后将该镜像标记为新标签: docker image tag xxxx/yyyyy:1.0.31 zhanghu/yyyyyy:1.0.31 其中账号为账号名称。...3、最后镜像推送到账号: docker push zhanghu/yyyyyy:1.0.31 image.png 通过上述步骤,我们可以任何一个Docker镜像从一台机器迁移到另一台机器。...总结要点只有两个:首先我们要把容器构建为Docker镜像。其次就是该Docker镜像被作为tar包文件保存到本地。关于EasyNVR开发问题,我们将不定期更新,欢迎大家关注和了解。

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    在以 CentOS7.6 为基础镜像 Docker 容器通过 NFS 内存挂载成高速硬盘使用

    Docker 容器通过 NFS 内存挂载成高速硬盘使用 文章目录 在以 CentOS7.6 为基础镜像 Docker 容器通过 NFS 内存挂载成高速硬盘使用 一 背景 二 环境 2.1 宿主机...服务容器IP 3.2 修改应用镜像 3.2.1 在应用所在镜像内添加 NFS 服务 3.2.2 重新构建应用镜像 3.3.3 验证是否挂载成功 四 总结及拓展 4.1 本案例缺点 4.2 拓展知识...4.2.1 把内存挂载成高速硬盘有 tmpfs 和 ramdisk 两种方案 4.2.2 Docker 容器互联 4.2.3 在容器其他 NFS 解决方案 一 背景 这是最近项目中遇到一个问题...4.2.2 Docker 容器互联 在同一台主机未指定网络方案情况下,Docker 是通过 bridge 方式进行桥接。如果涉及到跨主机互联,那么可能需要使用其他方案。...4.2.3 在容器其他 NFS 解决方案 nfs-ganesha 也是 NFS 在容器一个比较流行解决方案。

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    vb语法菜鸟教程_VS VB

    本教程是为初学者准备,帮助他们了解基本VB.Net编程。 完成本教程后,您将发现自己在VB.Net编程达到一个中等水平专业知识,你可以从自己通过其他方式学习到下一个级别。...类型转换函数 VB.Net提供以下内联类型转换函数: SN 功能和说明 1 CBool(表达式) 表达式转换为布尔数据类型。...7 CInT(表达式) 表达式转换为整数数据类型。 8 CLng函数(表达式) 表达式转换为长数据类型。 9 CObj(表达式) 表达式转换为对象类型。...13 CStr(表达式) 表达式转换为字符串数据类型。 14 CUInt(表达式) 表达式转换为UInt数据类型。 15 CULng(表达式) 表达式转换为ULng数据类型。...VB.Net可用修饰符列表 下表提供了VB.Net修饰符完整列表: S.N 修饰符 描述 1 Ansi 指定Visual Basic应该所有字符串编组到美国国家标准协会(ANSI)值,而不考虑正在声明外部过程名称

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    【Kubernetes系列】Container(容器)

    容器应用程序从底层主机设施解耦。 这使得在不同云或 OS 环境中部署更加容易。...镜像名称 容器镜像通常会被赋予 pause、example/mycontainer 或者 kube-apiserver 这类名称镜像名称也可以包含所在仓库主机名。...为了确保 Pod 总是使用相同版本容器镜像,你可以指定镜像摘要; : 替换为 @,例如 image@sha256:45b23dee08af5e43a7fea6c4cf9c25ccf269ee113168c19722f87876677c5cb2...Kubernetes 容器环境给容器提供了几个重要资源: 文件系统,其中包含一个镜像和一个或多个卷 容器自身信息 集群其他对象信息 容器信息 一个容器 hostname 是该容器运行所在...通过 hostname 命令或者调用 libc gethostname 函数可以获取该名称。 Pod 名称和命名空间可以通过 下行 API 转换为环境变量。

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    Kubernetes 容器镜像基础

    本文深入探讨 Kubernetes 容器镜像各个方面,从容器镜像基本概念开始,一直到高级主题,如镜像拉取策略、安全性和最佳实践。...为了确保 Pod 总是使用相同版本容器镜像,你可以指定镜像摘要; : 替换为 @,例如 image@sha256:45b23dee08af5e43a7fea6c4cf9c25ccf269ee113168c19722f87876677c5cb2...私有仓库拉取问题: 如果使用私有容器镜像仓库,可能需要提供正确认证信息,如用户名、密码或密钥。 镜像不存在: 如果指定容器镜像在仓库不存在,Kubernetes 无法拉取镜像。...使用 kubectl create secret 命令可以 Docker 配置文件转换为 Kubernetes Secret,如下所示: kubectl create secret generic <...使用环境变量: 配置信息作为环境变量传递给容器,而不是硬编码在容器镜像。这样做可以使应用程序更易于配置和管理。 健康检查和就绪检查: 在容器实现健康检查和就绪检查,以确保容器正常运行。

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    4-Dockerfile And Docker Compose

    在其上可以继续叠加其他镜像,而各个镜像之间文件目录资源等可以相互共享,进一步提高了镜像利用率 统一文件系统(UFS:Union File System):该技术能够将不同层镜像整合为一个文件系统,为这些层提供一个统一对外视角...,开发人员可以利用这个容器对镜像进行个性化修改,这些修改可以更适应生产环境,并且避免了对原镜像影响,使得原镜像功能不受影响 容器转换为镜像 镜像制作有两种方式,一种是直接利用容器转换为镜像,另一种是通过...Dockerfile构建镜像,直接利用容器转换步骤如下: # 容器转换为镜像 docker commit 容器ID 镜像名称:版本号 # 镜像作为压缩文件输出 docker save -o 压缩文件名称...镜像名称:版本号 # 压缩文件读取为镜像 docker load -i 压缩文件名称 # 示例: docker commit bcd554d24cc5 ywrby_tomcat:1.0 docker...命令 但是不影响当前镜像 用处也不怎么大 STOPSIGNAL 发送信号量到宿主机 该STOPSIGNAL指令设置发送到容器系统调用信号以退出。

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    基于SpringBoot项目实现Docker容器化部署

    可以从Docker Hub或其他镜像仓库获取这些镜像。接下来,需要在基础镜像上构建一个包含Spring Boot应用程序镜像。这包括应用程序JAR文件、依赖项和配置文件添加到镜像。...还可以使用其他选项来配置容器,例如挂载卷、设置环境变量等。访问应用程序一旦容器运行,可以通过访问主机端口(在上述示例是8080)来访问运行在Docker容器Spring Boot应用程序。...zhangt表示构建镜像,构建成功后可以使用docker images命令查看镜像。-t 选项用于指定镜像名称和标签,你可以 zhangt 替换为你想要名称和标签。...即使容器因为错误或其他原因而停止,Docker 也会尝试自动重新启动容器。--name zhangt: 这是用于给容器指定一个名称选项。容器名称被设置为 "zhangt"。...如果 "zhangt" 是一个镜像名称,Docker 查找该镜像并在容器运行它。

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    基于GitHubActions同步Docker镜像实践

    通过以上步骤,就可以外网镜像资源同步到国内镜像仓库了。这样不仅可以加快镜像拉取速度,提高应用部署效率,还能规避因网络问题导致镜像拉取失败。...配置同步源和目标镜像: 在 Sync Docker Image 步骤, 和 替换为镜像名称和标签, 和 替换为目标镜像名称和标签。...需要注意是,在实际使用时,您需要根据实际情况修改镜像名称、标签、Docker 仓库等相关信息。同时,如果需要同步多个镜像,可以在工作流添加多个 Sync Docker Image 步骤。...通过使用 GitHub Actions 实现 Docker 镜像同步,您可以轻松地外网镜像同步到国内仓库,提高应用部署效率和可靠性。如果您有任何其他问题,欢迎随时与我交流。

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    微服务 - Day1

    前言 工作已经有两年半,之前是做对vb.net对日软件开发,现在转战国内项目,但深感技术不足,只能够写一些CRUD代码。...最近也离职了,趁着现在有一定时间打算学习并编写一套项目,一方面想要了解一些现在主流技术,其次想要提升一下自己水平。...架构分析 链接 二、环境搭建 服务器环境使用Docker搭建 我镜像 需要部署Redis,Mysql8.0,Nacos 本地环境使用jdk1.8,maven3.6,idea,vscode,node12.16.3...既有的教程,后台系统使用是人人开源renren-fast框架,代码生成器使用也是人人开源renren-generator,我准备后台系统更换为若依前后端分离版,代码生成器打算自己编写一份项目...,实现项目中基本CRUD逆向工程生成。

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    使用Coding与TCR在TKE实现DevOps

    图片(4)推送拉取镜像这里无需推送拉取镜像,我们要通过coding自动推送镜像镜像仓库,直接跳过这一步点击【确认】3、创建镜像仓库在镜像仓库中点击【新建】创建镜像仓库图片命名空间:选择步骤2创建命名空间名称...:自定义镜像仓库名称镜像来源:选择平台构建镜像图片4、创建TKE集群(1)在容器服务控制台点击新建图片集群类型选择标准集群图片集群信息,集群名称自定义,其他全部选择默认图片选择机型:机型选一台4核4G...、TCR域名、命名空间、仓库名称与凭证其中TCR访问凭证选择【一键录入TCR凭证并使用】图片创建构建计划成功,点击立即构建图片可以看到构建已经构建成功,Coding自动生成镜像推送到了TCR镜像仓库...集群】名称:填写您自定义名称部署流程权限:选择您个人账号,设置权限组【管理员】完成后点击【确认】按钮图片首先进行基础配置,选择【添加触发器】图片触发器类型:选择【TCR企业版仓库触发器】实例:选择您在前期准备工作创建...Manifest来源选择【输入内容】对应yaml文件可参考下文yaml文件填写图片注意:您需要将您下面yaml文件image替换为您自己镜像仓库地址。

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