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表达矩阵换为数据画图

主要介绍使用pivot_longer进行长宽数据转换,这两个函数都是来自于tidyr包 问题背景 现在有一个表达矩阵,要画箱线图 但是,上面表格不满足向ggplot2画箱线图的函数传递参数的需求,要变换成数据把所有数字变成一列传递给...首先行列置 把原来的行名变成第一列 把原来的列名变成第二列 就变成数据形式了。也就是把宽数据变成长数据。 代码如何实现?...先做个示例数据 # 表达矩阵 set.seed(10086) # 设置可重复随机数种子 exp = matrix(rnorm(18),ncol = 6) exp = round(exp,2) # 保留两位小数...,1:6) exp[,1:3] = exp[,1:3]+1 exp library(tidyr) library(tibble) library(dplyr) dat = t(exp) %>% # 先置...as.data.frame() %>% # 变成数据 rownames_to_column() %>% # 行名变成一列 mutate(group = rep(c("control","

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Pandas列表(List)转换为数据(Dataframe)

Python中将列表转换成为数据有两种情况:第一种是两个不同列表转换成一个数据,第二种是一个包含不同子列表的列表转换成为数据。..."b" : b}#列表a,b转换成字典 data=DataFrame(c)#字典转换成为数据 print(data) 输出的结果为 a b 0 1 5 1 2 6 2 3 7 3...4 8 第二种:包含不同子列表的列表转换为数据 from pandas.core.frame import DataFrame a=[[1,2,3,4],[5,6,7,8]]#包含两个不同的子列表...5,6,7,8] data=DataFrame(a)#这时候是以行为标准写入的 print(data) 输出结果: 0 1 2 3 0 1 2 3 4 1 5 6 7 8 data=data.T#置之后得到想要的结果...(List)转换为数据(Dataframe)的文章就介绍到这了,更多相关Pandas 列表转换为数据框内容请搜索ZaLou.Cn以前的文章或继续浏览下面的相关文章希望大家以后多多支持ZaLou.Cn!

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数据矩阵和列表20230202

一、向量、矩阵数据和列表的区别 1)向量:一维 2)矩阵:二维,只允许一种数据类型 3)数据:二维,每列只允许一种数据类型 4)列表:容纳各种数据类型 ps:数据类型的判断:clss()...数据类型的转化:as.data.frame/ as.matrix 二、数据 (1)数据的来源: a 新建 b as.data.frame转化 c 读取表格文件 read.csv() d 内置数据集如...(3)数据的属性 获得行数 nrow() 获得列数 ncol() 获得行名 rownames() 获得列名 colnames() (4)数据取子集 >数据名称 $ 列名 eg. df1$...rownames(数据名称)[行数]<-"重命名" 5、数据的连接 (新建数据) > test1<-data.frame(name=c("jimmy","niker","Damon","Sophie...3,] 7 8 9 (3)矩阵数据的转化 as.data.frame() as.matrix() 最后用class() 明确一下数据类型 (4)矩阵画热图 图片 四、列表

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R语言-03数据矩阵和列表

“向量”——一维 “表格”——二维 matrix 矩阵-二维,只允许一种数据类型 data.frame 数据-二维,每列只允许一种数据类型 list列表:可装万物 1.数据来源 (1)用代码新建 (...2)由已有数据转换或处理得到 (3)读取表格文件 (4)R语言内置数据(没有赋值就可以直接使用的数据,例如iris) 2.新建数据* 读取文件 df2<-read.csv("gene.csv") df2...#读取"gene.csv"文件,赋值df2 3.数据属性 4.数据取子集 df1$gene #"$"前是数据名称 后是列名;提取该列的向量 #按名字取子集 df1 行,列 图片 5.数据修改...按照共同的列名取交集,后连接 两个数据列中有交集时既可以使用,自动连接 矩阵新建和取子集 矩阵画热图 pheatmap::pheatmap(m) #热图结果默认聚类 pheatmap::pheatmap...#逻辑值赋值给k,按逻辑值在df1中取子集**实战中会经常遇到 删除变量 数据结构总结 以上来源,生信技能树

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R语言 数据矩阵、列表的创建、修改、导出

data.frame生成指定数据的列名及列的内容,如代码所示,此时列名不需添加"",df1为变量名,格式为列名=列的向量*matrix矩阵与向量一样只允许同一种数据类型,否则会被转换,可以理解为二维的向量...) #导出数据为txt的函数#最好不要手动修改与直接保存原始文件,可以保证代码的完整性Rdata的运用#soft保存为Rdata并加载。...= ls())load(file = "soft.Rdata") #使Rdata中的向量出现在环境内,本身有名称,无需赋值矩阵和列表矩阵矩阵内所有元素数据类型必须相同*警惕因数据类型不同导致矩阵强制转换引起报错...#取子集方法同数据t(m) #置行与列,数据置后为矩阵as.data.frame(m) #矩阵换为数据列表列表内有多个数据矩阵,可通过list函数将其组成一个列表l <- list(m1...iris最后一列有哪几个取值,每个取值重复了多少次table(iris[,ncol(iris)])# 2.提取内置数据iris的前5行,前4列,并转换为矩阵,赋值给a。

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Day5:R语言课程(数据矩阵、列表取子集)

1.数据 数据(和矩阵)有2个维度(行和列),要想从中提取部分特定的数据,就需要指定“坐标”。和向量一样,使用方括号,但是需要两个索引。在方括号内,首先是行号,然后是列号(二者用逗号分隔)。...list1[[1]] [1] "ecoli" "human" "corn" 引用该向量的第一个元素,使用: list1[[1]][1] [1] "ecoli" 也可以对数据矩阵执行相同的操作...列表的组件命名数据的列命名使用的函数都是names()。 查看list1组件的名称: names(list1) 创建列表时,species向量与数据集df和向量number组合在一起。...要以逗号分隔的格式(.csv)矩阵导出为文件,可以使用write.csv函数。有两个必需参数:要导出的数据结构的变量名称,以及要导出到的路径和文件名。...向量写入文件需要与数据的函数不同。

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LLM2Vec介绍和Llama 3换为嵌入模型代码示例

但是这篇论文LLM2Vec,可以任何的LLM转换为文本嵌入模型,这样我们就可以直接使用现有的大语言模型的信息进行RAG了。...嵌入模型和生成模型 嵌入模型主要用于文本数据换为数值形式的向量表示,这些向量能够捕捉单词、短语或整个文档的语义信息。...LLM2Vec 在论文中提出了一种名为LLM2Vec的方法,用于仅解码器的大型语言模型(LLM)转换为强大的文本编码器。...此外,当LLM2Vec与监督对比学习相结合时,还在仅使用公开可用数据的模型中实现了最先进的性能。...利用LLM2VecLlama 3化为文本嵌入模型 首先我们安装依赖 pip install llm2vec pip install flash-attn --no-build-isolation

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