写在前面:按照本意其实比较想写成“全平台记录”的,但是想了一下感觉自己大概还是没资格那样说,更何况还有最致命的一个问题——我手头没有mac且不会玩黑苹果,于是就emmm,起了这个名字。
有没有遇见想到、聊到某篇文献,却不记得作者信息和文章其他信息?如果能在微信、QQ、搜索框...任何可以输入的地方,都能像 Zotero 在 Word 插件一样引用就好了。
LaTeX 是一套强大的排版系统,在学术论文排版方面应用广泛,很多西方高效和期刊都会提供自己 LaTeX 模板方便论文提交。虽然 LaTeX 有不少相关的 IDE,如 TeXstudio,BaKoMa,LyX 等,但总给人一种笨重的感觉。如今,VSCode 为我们提供了另一种选择。
在使用Latex之前,我们一般会借用已有的论文模板,在模板基础上加入我们自己的文章内容,随后编译成PDF文件,其基本流程就是:Latex->Bibtex->Latext->Latex。
基于 overleaf 在线写 latex 太麻烦了,每次都需要重新编译一下要等很久,本地的话就很快。之前在 windows 上有试过 vscode 插件加上 texlive 进行本地编译,现在主要用的是 MacBook,所以记录一下在 MacBook 上通过 vscode 插件加上 latex 编译器实现本地的编译。
scihub是科研利器,这就不多说了,白嫖文献的法门,一般采用的是网页或者桌面程序,一般都会跳转到网页进行加载出文献,但是这很不方便,毕竟全手动,这里无意中看到一个写好的pip工具scihub2pdf ,于是试一下它手动威力,如果这能够成功,也就是我们以后如果想批量下载也是没问题的。
Nobori and Wang et al Nature Plants (2020)到底是哪一篇文献??
原先都是使用Typora 导出为pdf文档。但是最近由于部分需求,需要将文档导出为word格式。
作为一只大学僧,平常难免要写写作业或者paper啥的,难免要和公式打交道。对于一些简单的小作业,用Markdown也能应付些许公式的编写。比如之前我写过一篇文章:
用好 R 环境下的 BiblioShiny 软件包 ,可以让你在友好的图形化界面,快速扫描科研领域。
BibTex是一种专门用于协调LaTeX的参考文献处理的文件格式,其后缀为.bib。BibTex可以用JabRef,bibtex等软件生成,也可以直接用记事本创建,操作起来非常灵活,这里主要介绍用JabRef来生成BibTex文件。JabRef是一套开放源代码、处理BibTeX格式的文献管理软件,提供了简易操作的界面来编辑BibTeX档案,功能包含从网络上的科学数据库汇入资料,以及整理和搜寻BibTeX档案等。 JabRef主页和下载地址:http://jabref.sourceforge.net/ 以Jabref3.2为例,安装打开后依次选择创建新BibTex数据库,新建文献记录,选择对应记录类型:
取消勾选安装 TeXworks ,这个编辑器太老,使用 VSCOde 即可
科研过程中难免会涉及大量文献的检索下载,还有信息的整合。我们今天给大家介绍一个可以获取文献相关信息甚至全文的R包。Rcrossref可以通过文献doi获得文献的相关信息,crminer可以基于链接直接下载原文,当然这个要看你所在网络的权限了。首先我们看下报道额安装:
手动管理参考文献总是令人抓狂,参考文献的样式需要小心编排,还需要按照引用顺序对参考文献进行排序和编号,以致添加、删除或者修改引用文献后都需要进行大量的修改,耗费大量的时间和精力。
师弟师妹的文章需要修改,所以趁这个机会,把一些科研写作中容易出现的坑整理出来。庄小编打算开个新的系列,整理自己在科研写作方面的笔记。
【注】这样安装 TeXLive 后无法在终端使用 texdoc 工具,会报错:/usr/local/texlive/2020/texmf-dist/doc/generic/pgf/pgfmanual.pdf。
rgee是不是像JavaScript或Python客户端本地地球引擎API。从头开始开发地球引擎 API 将很难维护,尤其是考虑到 API 正在积极开发中。那么,如何使用 R 运行 Earth Engine?答案是网状的。reticulate是一个 R 包,旨在实现 R 和 Python 之间的无缝互操作。当在 R 中创建Earth Engine请求时,reticulate会将这部分转换为 Python。一旦生成了 Python 代码,就会Earth Engine Python API将请求转换为一种JSON格式。最后,GEE 平台通过 Web REST API 接收请求。该反应将遵循同样的路径。
把enable utf-8 format for modes改为*;UTF-8;EDT;INI|UNICODE;UTF-7;ACP;OEM
使用 BibTeX 时,各大参考文献检索网站经常会给出不同的 BibTeX 条目类型,本文便就 BibTeX 的各种条目类型及其说明进行摘录。
https://github.com/nucleic-acid/namedropR
p_cite和p_citation都可以用,包的名称加不加引号都可以用,更人性化一点。
最近在完善一篇学术论文,格式要用到LaTeX,LaTeX比较庞大,只能装在电脑上面,本人经常奔波于宿舍、教室、图书馆和实验室之间,电脑真的很沉。疫情原因必须按照学校规划的路径走,没有代步工具,距离还很远。每次背着电脑跑一趟都要累的休息一会,很影响创作。有时候灵感一来还要打开电脑再记录,可能这个时间灵感都散掉了。今天偶然和朋友抱怨了一下,朋友马上给我推荐了一个方案,就是上次的在线VScose加上LaTeX,这两个完全开源,且搭配起来非常好用,简直神器,那我们接下来赶紧开整吧!
http://www.ctan.org/tex-archive/macros/latex/contrib/elsarticle
兵马未动粮草先行,写大大小小的各种论文需要做很多思想建设,有一个顺手的写作工具和一个方便的文献管理工具可以给人一些动力和勇气。
LaTeX插入参考文献,简单高效 Latex参考文献的引用 Latex中用Bibtex来引用文献 Latex能改变单独一篇参考文献字体的颜色吗? (通过bib文件将单独一条参考文献高亮,xys亲测可用)
本文用简明的样例,介绍如何使用Markdown和自动化工具帮你处理数学公式、参考文献引用、图片交叉索引等学术论文写作中常见的棘手问题。快来试试吧。
$\LaTeX$ 文档的编译过程通常比较复杂,尤其是有参考文献的情况下, 需要多次编译并调用外部命令。这个问题可以通过 latexmk 工具来解决。
ChainerCV是一个使用Chainer训练和运行神经网络以进行计算机视觉任务的工具集合。
(很多杂志期刊接受LaTeX电子版时会提供自己的模板,只要使用他们的模板即可完美地展现在对应的刊物中)
使用Latex撰写论文时,通常会遇到参考文献格式问题,下面我将与大家分享Latex参考文献规范写作。
其实本来到现在这个东西就是安装好,但是就好像你写C一样,有了编译器,没有一个好的编辑器。怎么办?这里我还是推荐VSCode,因为有强大得补全功能,对于我这种要懒死的人,真的是好感动。
@misc{arxiv号码, Author = {作者}, Title = {文章标题}, Year = {上传年份}, Eprint = {arXiv:arxiv号}, }
文献引用是规范写作的一个重要步骤。文献引用的丢失直接导致作品的抄袭嫌疑,接下来笔者给出了Google学术与百度学术引用文献步骤,与生成BibTeX至LaTeX中的具体操作方法。
Garnett是一个从单细胞表达数据中实现自动细胞类型分类的软件包。Garnett的工作方式是获取单细胞数据和细胞类型定义(marker)文件,并训练一个基于回归的分类器。一旦被训练成一个针对某一组织/样本类型的一个分类器,它就可以应用于从相似组织中对未来的数据集进行分类。除了描述训练和分类功能,这个网站的另一个目标是成为一个存储以前训练出来的分类器仓库。
恰好看到了无法在线下载安装GitHub包?其实答案就隐藏在报错里面,正好之前也遇到了相似的报错,然后就整理一下笔记分享给大家叭!
在 \begin{document} 前面的部分称为导言区,导言区通常用来对文档的性质做一些设置,或者自定义一些命令。
当这个文件确定以后,就开始检索里面用到的各种依赖资源input,include,InputIfFileExists,subfile,import和subimport。
中国区域地面气象要素驱动数据年度合成产品,包括近地面气温、近地面气压、近地面空气比湿、近地面全速、地面向下短波辐射、地面向下长波辐射、地面降水率共7个要素。数据为NETCDF格式,时间分辨率为年,水平空间分辨率为0.1°。可为中国区陆面过程模拟提供驱动数据。前言 – 人工智能教程
Theano是一个Python库,允许你定义、优化和有效地求值涉及多维数组的数学表达式。Theano的功能:
第一步:在你要编写的tex文件的同一目录下新建一个文本文档,命名为*.bib(你自由命名,后缀为bib,如nonlinear.bib) 第二步:搜索论文的bib引用内容(如在https://dblp.uni-trier.de/中搜索工程技术类论文,在搜索栏输入要搜索的论文标题(如:Cryptanalysis and improvement of 2 mutual authentication schemes for Session Initiation Protocol)), 将鼠标移至红色方框中的向下
为上一篇介绍MiniGPT-4的文章,在ChatGPT兴起的当下,涌现了一大批围绕着ChatGPT建立的应用项目,通过文章的方式把这些进行一个分类梳理。顺便给关注AI的同学科普一下。
在论文写作的过程中,为了体现论文的科学性、严谨性和规范性,我们常常需要引用大量的参考文献来引证自己的观点。参考文献(Reference)往往都是放在论文的最后,记录了所引用论文的标题、作者、期刊或会议、出版时间等信息,文中还需要明确有顺序的进行引用标注。
DVI 格式文件是目前科研和出版领域广泛应用于书籍、文献、资料、论文、信件等的电子文件格式。
最近读了 Karl Broman[3] 的initial steps toward reproducible research (kbroman.org)[4],颇有感悟,结合自己阅读时候的体验,分享给你们。
本书介绍了计算机的数学基础,内容涉及求和、取整函数、数论、二项式系数、特殊数、母函数(发生函数)、离散概率、渐近等等,面向从事计算机科学、计算数学、计算技术诸方面工作的人员,以及高等院校相关专业的师生。
从搞研究到做项目,模板都是提高生产力的好工具。因为开发者比较注重效率(因为懒),很多细枝末节而又略微繁琐的工作,都会在 GitHub 上放出模板。比如说 Git 用的 gitignore 文件,模板放到 GitHub 上竟然能有 9.6 万的 Star 量,这些小而好用的模板项目,确实能省不少事。
编译四次涉及到 LaTeX 和 BibTeX 协同工作时的原理。本质上,在 \bibliography 命令处出现的参考文献列表,是从后缀为 .bbl 的文件读取的;而 .bbl 文件则是由 BibTeX 编译后缀为 .aux 的文件之后产生的;.aux 文件则是 (pdf/Xe)LaTeX 编译后缀为 .tex 的文件产生的。所以整个流程是这样的。 (pdf/Xe)LaTeX 编译 .tex 文件 读取 \bibliographystyle 的信息,写入 .aux 文件; 读取散落在文中的 \cite 命令,写入 .aux 文件; 读取 \cite 命令的同时,尝试读入 .aux 文件中有关引用的标记,但是因为文件内无相关信息而失败(\cite 处出现问号); 读取 \bibliography 的信息,尝试读入 .bbl 文件,但是因为文件不存在而失败(不输出参考文献列表)。 BibTeX 编译 .aux 文件 读取刚才写入的信息,然后去 .bib 文件中查找相关的参考文献条目,生成 .bbl 文件。 (pdf/Xe)LaTeX 编译 .tex 文件 读取 \bibliographystyle 的信息,写入 .aux 文件(和第一步完全一样); 读取散落在文中的 \cite 命令,写入 .aux 文件(和第一步完全一样); 读取 \cite 命令的同时,尝试读入 .aux 文件中有关引用的标记,但是因为文件内无相关信息而失败(\cite 处出现问号,和第一步完全一样); 读取 \bibliography 的信息,尝试读入 .bbl 文件,此时第二步已经生成 .bbl 文件,读入成功,输出参考文献列表,同时将引用标记写入 .aux 文件。 (pdf/Xe)LaTeX 编译 .tex 文件 读取 \bibliographystyle 的信息,写入 .aux 文件(和第一步完全一样); 读取散落在文中的 \cite 命令,写入 .aux 文件(和第一步完全一样); 读取 \cite 命令的同时,尝试读入 .aux 文件中有关引用的标记,因为第三步最后写入了引用标记,所以文内引用处出现正确的引用记号;
CVPR 是 IEEE Conference on Computer Vision and Pattern Recognition 的缩写,即 IEEE 国际计算机视觉与模式识别会议。该会议是由 IEEE 举办的计算机视觉和模式识别领域的顶级会议。
随着大数据时代的到来,工作中对数据处理能力的要求越来越高。而不管我们使用何种软件,Python, Stata或是R,都要花大量的时间和编辑器打交道。一个好的编辑器能够显著提高编程效率,降低程序出错的概率。因此熟练掌握一款高效的编辑器是大数据时代的必备技能之一。
3.在latex中新建文件,并把字符串粘贴进去,这里可以修改大括号内第一个逗号之前的部分,即红框内的部分(该部分即为文档中要引用的简称),可以修改方便记忆,不会对引用的结果有任何影响。
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